그람 음성의 검은 콜로니를 형성하는 편성 혐기성 간균의 특성을 갖는 신종 세균이 개의 치석에서 분리되었다. 비슷한 형태학적 특징으로 인해 신종 세균은 개에서 가장 흔하게 발견되는 검은 집락을 형성하는 치주질환 원인균인 Porphyromonas gingivalis 혹은 Porphyromonas gulae일 것으로 예측되었다. 콜로니 형태의 유사성과 더불어 신종 세균은 Porphyromonas spp.의 배양적 특징과 강한 단백질 분해능력 및 당 분해성이 없는 생화학적 특징을 공통적으로 갖고 있는 것으로 나타났다. 16S rRNA 유전자 시퀀싱을 통해 신종세균에 대한 동정을 진행했을 때, 세균의 분류학적 위치를 속과 종 단계로는 확인할 수 없었다. Illumina MiSeq와 Oxford Nanopore MinION 을 이용한 전장유전체 분석을 진행하였고 신종세균의 ...
그람 음성의 검은 콜로니를 형성하는 편성 혐기성 간균의 특성을 갖는 신종 세균이 개의 치석에서 분리되었다. 비슷한 형태학적 특징으로 인해 신종 세균은 개에서 가장 흔하게 발견되는 검은 집락을 형성하는 치주질환 원인균인 Porphyromonas gingivalis 혹은 Porphyromonas gulae일 것으로 예측되었다. 콜로니 형태의 유사성과 더불어 신종 세균은 Porphyromonas spp.의 배양적 특징과 강한 단백질 분해능력 및 당 분해성이 없는 생화학적 특징을 공통적으로 갖고 있는 것으로 나타났다. 16S rRNA 유전자 시퀀싱을 통해 신종세균에 대한 동정을 진행했을 때, 세균의 분류학적 위치를 속과 종 단계로는 확인할 수 없었다. Illumina MiSeq와 Oxford Nanopore MinION 을 이용한 전장유전체 분석을 진행하였고 신종세균의 게놈은 3.0 Mb의 크기이고 G+C content는 46.9%인 것으로 나타났다. 세균의 120개 orthologous gene을 이용한 계통분석을 통해 신종 세균이 Bacteroidales 목(order)에서 특징적인 계통을 나타내는 것을 확인하였다. 이번 연구에서 발견된 신종세균은 Bacteroidales 목에 속하는 세균들과 16S rRNA 유전자의 유사성이 낮았고(<86.5%) 계통유전학적 거리가 먼 것으로 나타났기 때문에, 이 세균은 Bacteroidales 목 내에 속하는 새로운 과(family)의 새로운 속(genus)에 분류될 것으로 생각된다. 철 획득과 저장, 단백질 분해, 용혈, type IX secretion system(T9SS)의 역할을 하는 유전자들이 신종세균의 유전체에서 확인되었고, 이러한 유전자들은 P. gingivalis 의 질병 발생에서 중요한 역할을 담당한다. 신종세균이 P. gingivalis 가 갖는 병원성 인자들을 갖고 있고 치주염이 걸린 개의 치석에서 일반적으로 분리가 되기 때문에, 병원균으로써 치주질환과 강한 연관성이 있는 것으로 추정된다.
그람 음성의 검은 콜로니를 형성하는 편성 혐기성 간균의 특성을 갖는 신종 세균이 개의 치석에서 분리되었다. 비슷한 형태학적 특징으로 인해 신종 세균은 개에서 가장 흔하게 발견되는 검은 집락을 형성하는 치주질환 원인균인 Porphyromonas gingivalis 혹은 Porphyromonas gulae일 것으로 예측되었다. 콜로니 형태의 유사성과 더불어 신종 세균은 Porphyromonas spp.의 배양적 특징과 강한 단백질 분해능력 및 당 분해성이 없는 생화학적 특징을 공통적으로 갖고 있는 것으로 나타났다. 16S rRNA 유전자 시퀀싱을 통해 신종세균에 대한 동정을 진행했을 때, 세균의 분류학적 위치를 속과 종 단계로는 확인할 수 없었다. Illumina MiSeq와 Oxford Nanopore MinION 을 이용한 전장유전체 분석을 진행하였고 신종세균의 게놈은 3.0 Mb의 크기이고 G+C content는 46.9%인 것으로 나타났다. 세균의 120개 orthologous gene을 이용한 계통분석을 통해 신종 세균이 Bacteroidales 목(order)에서 특징적인 계통을 나타내는 것을 확인하였다. 이번 연구에서 발견된 신종세균은 Bacteroidales 목에 속하는 세균들과 16S rRNA 유전자의 유사성이 낮았고(<86.5%) 계통유전학적 거리가 먼 것으로 나타났기 때문에, 이 세균은 Bacteroidales 목 내에 속하는 새로운 과(family)의 새로운 속(genus)에 분류될 것으로 생각된다. 철 획득과 저장, 단백질 분해, 용혈, type IX secretion system(T9SS)의 역할을 하는 유전자들이 신종세균의 유전체에서 확인되었고, 이러한 유전자들은 P. gingivalis 의 질병 발생에서 중요한 역할을 담당한다. 신종세균이 P. gingivalis 가 갖는 병원성 인자들을 갖고 있고 치주염이 걸린 개의 치석에서 일반적으로 분리가 되기 때문에, 병원균으로써 치주질환과 강한 연관성이 있는 것으로 추정된다.
A novel Gram-negative black-pigmented obligate anaerobic rod-shaped bacterium was isolated from canine dental plaque. Because of the similar morphological characteristics, the strain was first assumed to be one of the most commonly isolated black-pigmented anaerobic periodontal pathogens in dogs, Po...
A novel Gram-negative black-pigmented obligate anaerobic rod-shaped bacterium was isolated from canine dental plaque. Because of the similar morphological characteristics, the strain was first assumed to be one of the most commonly isolated black-pigmented anaerobic periodontal pathogens in dogs, Porphyromonas gingivalis and Porphyromonas gulae. In addition to the similarity of colony morphology, the novel bacterium had shared cultural and biochemical characteristics including proteolytic activity and asaccharolytic properties. However, using comparative analyses of 16S rRNA gene sequences, it was unable to identify the novel isolate to the genus and species levels. Whole genome sequencing (WGS) was performed using the Illumina MiSeq and Oxford Nanopore MinION sequencing and the genome of the novel isolate had a size of 3.0 Mb with a DNA GC-content of 46.9%. Phylogenetic analyses using 120 bacterial orthologous genes revealed that the novel isolate represented a distinct phylogenetic lineage in the order Bacteroidales. On the basis of the low 16S rRNA sequence similarities (<86.5%) and distant relationships between the novel isolate and members of the order, the isolate is considered as a novel genus within the novel family in the order Bacteroidales. The genes involved in iron uptake and storage, proteolysis, hemolysis, type IX secretion system (T9SS) were found in genome annotation and these genes play an important role in the pathogenesis of P. gingivalis. Given the fact that the novel isolate contains the known virulence factors of P. gingivalis and is regularly found in subgingival plaque of dogs, it can be inferred that the novel strain is strongly associated with periodontal diseases.
A novel Gram-negative black-pigmented obligate anaerobic rod-shaped bacterium was isolated from canine dental plaque. Because of the similar morphological characteristics, the strain was first assumed to be one of the most commonly isolated black-pigmented anaerobic periodontal pathogens in dogs, Porphyromonas gingivalis and Porphyromonas gulae. In addition to the similarity of colony morphology, the novel bacterium had shared cultural and biochemical characteristics including proteolytic activity and asaccharolytic properties. However, using comparative analyses of 16S rRNA gene sequences, it was unable to identify the novel isolate to the genus and species levels. Whole genome sequencing (WGS) was performed using the Illumina MiSeq and Oxford Nanopore MinION sequencing and the genome of the novel isolate had a size of 3.0 Mb with a DNA GC-content of 46.9%. Phylogenetic analyses using 120 bacterial orthologous genes revealed that the novel isolate represented a distinct phylogenetic lineage in the order Bacteroidales. On the basis of the low 16S rRNA sequence similarities (<86.5%) and distant relationships between the novel isolate and members of the order, the isolate is considered as a novel genus within the novel family in the order Bacteroidales. The genes involved in iron uptake and storage, proteolysis, hemolysis, type IX secretion system (T9SS) were found in genome annotation and these genes play an important role in the pathogenesis of P. gingivalis. Given the fact that the novel isolate contains the known virulence factors of P. gingivalis and is regularly found in subgingival plaque of dogs, it can be inferred that the novel strain is strongly associated with periodontal diseases.
AI-Helper
※ AI-Helper는 부적절한 답변을 할 수 있습니다.