$\require{mediawiki-texvc}$

연합인증

연합인증 가입 기관의 연구자들은 소속기관의 인증정보(ID와 암호)를 이용해 다른 대학, 연구기관, 서비스 공급자의 다양한 온라인 자원과 연구 데이터를 이용할 수 있습니다.

이는 여행자가 자국에서 발행 받은 여권으로 세계 각국을 자유롭게 여행할 수 있는 것과 같습니다.

연합인증으로 이용이 가능한 서비스는 NTIS, DataON, Edison, Kafe, Webinar 등이 있습니다.

한번의 인증절차만으로 연합인증 가입 서비스에 추가 로그인 없이 이용이 가능합니다.

다만, 연합인증을 위해서는 최초 1회만 인증 절차가 필요합니다. (회원이 아닐 경우 회원 가입이 필요합니다.)

연합인증 절차는 다음과 같습니다.

최초이용시에는
ScienceON에 로그인 → 연합인증 서비스 접속 → 로그인 (본인 확인 또는 회원가입) → 서비스 이용

그 이후에는
ScienceON 로그인 → 연합인증 서비스 접속 → 서비스 이용

연합인증을 활용하시면 KISTI가 제공하는 다양한 서비스를 편리하게 이용하실 수 있습니다.

파라핀조직을 이용한 미토콘드리아 DNA 돌연변이 확인
Identification of a Mitochondrial DNA Mutation in Paraffin-Embedded Muscle Tissues 원문보기

생명과학회지 = Journal of life science, v.14 no.2 = no.63, 2004년, pp.296 - 300  

김상호 (대구대학교 사범대학 생물교육전공) ,  유석호 (한국과학기술원 의과학연구센터)

초록
AI-Helper 아이콘AI-Helper

환자의 생조직, 얼린 조직 혹은 혈액이 없는 경우에, formalin으로 고정된 파라핀조직을 이용하여 미토콘드리아 돌연변이를 확인할 수 있는지를 조사하였다. MELAS 환자 4명의 파라핀조직을 택해 이들 조직으로부터 DNA를 추출하여 대부분의 MELAS 환자 미토콘드리아 DNA의 tRN $A^{Leu(UUR)}$ gene의 3243지역에서 발견되는 Adenine의 Cuanine으로의 염기치환을 확인하고자 하였다. 실험결과 3명의 환자에게서 이 점 돌연변이를 확인할 수 있어 이들 파라핀조직의 상태가 좋은 것으로 여겨져 미토콘드리아 DNA 돌연변이 연구에 파라핀조직을 활용할 수 있을 것으로 보인다.다.

Abstract AI-Helper 아이콘AI-Helper

We investigated feasibility of using the formalin-fixed and paraffin-embedded tissue to study mitochondrial mutations in the case that fresh or frozen tissue, or blood samples are not available. Four paraffin blocks of muscle biopsies in Korean MELAS (mitochondrial myopathy, encephalopathy, lactic a...

주제어

AI 본문요약
AI-Helper 아이콘 AI-Helper

* AI 자동 식별 결과로 적합하지 않은 문장이 있을 수 있으니, 이용에 유의하시기 바랍니다.

제안 방법

  • Another notable finding in this study is that we could identify PCR-amplified fragments on DNAs extracted from the paraffin-embedded samples and we can use paraffin- blocks for molecular genetic study. Most laboratories prefer to use fresh muscle samples than paraffin blocks, because DNA in paraffin blocks is partially degraded into smaller fragments due to the extensive and possibly deleterious interaction between fixative and nucleic acids.
  • In an attempt to study the molecular nature of Korean MELAS patients and also to study further feasibility of using formalin-fixed and paraffin-embedded tissue to study mitochondrial DNA mutations, especially point mtDNA mutations, PCR (polymerase chain reaction)/RFLP (restriction fragment length polymorphism) analysis and mtDNA sequencing were performed. We could identify the 3243 (A to G) point mutation in three paraffin-embedded tissues of MELAS patients.
  • 2. Schematic representation of the PCR amplification strategy to study the 3243 mutation in MELAS. The A to G transition mutation at 3243 will create a new Hae Ⅲ restriction enzyme site which is diagnostic for the 3243 MELAS mutation.
  • The diagnosis of MELAS patients was made by clinical presentations, neurological examinations combined with enzyme histochemistry and characteristic electron microscopic findings (data not shown).
  • With six DNAs, PCR amplifications were carried out in a volume of 100 jil using 20 μM of each dNTP, 2 units Taq DNA polymerase, 10 X Taq buffer, 30 pM of each primer (a forward primer, 3116-3134 and a reverse primer, 3353- 3333) and 50 n응 of template DNA. After a single predenaturation step (10 min, at 95℃), PCR was done by 1 min.

이론/모형

  • Total DNA was extracted from paraffin blocks with xylene by a modified method of Love et al. (1993). Small amounts of tissues were cut from paraffin blocks using a sterile scalpel blade and incubated with 400㎕ xylene and 500 pl mineral oil for 2 h at room temperature under gentle agitation.
본문요약 정보가 도움이 되었나요?

참고문헌 (18)

  1. Anderson, S., Bankier, A. T., Barrell, B. G., de Bruijn, M. H. L., Coulson, A. R., Drouin, J., Eperon, I. C., Nierlich, D. P., Roe, B. A., Sanger, F., Schreier, P. H., Smith, A. J. H., Staden, R., Young, I. G.. Sequence and organization of the human mitochondrial genome. Nature, vol.290, no.5806, 457-465.

  2. 10.1136/jcp.44.11.924 

  3. J. Clinical Pathology 34 401 2001 

  4. Chinnery, Patrick F., Turnbull, Douglas M.. Mitochondrial DNA mutations in the pathogenesis of human disease. Molecular medicine today, vol.6, no.11, 425-432.

  5. Goto, Yu-ichi, Nonaka, Ikuya, Horai, Satoshi. A mutation in the tRNALeu(UUR) gene associated with the MELAS subgroup of mitochondrial encephalomyopathies. Nature, vol.348, no.6302, 651-653.

  6. Biochimical et Biophysica Acta 1097 238 1991 

  7. Goto, Y.I., Tsugane, K., Tanabe, Y., Nonaka, I., Horai, S.. A New Point Mutation at Nucleotide Pair-3291 of the Mitochondrial Transfer-RNALeu(Uur) Gene in a Patient with Mitochondrial Myopathy, Encephalopathy, Lactic-Acidosis, and Stroke-Like Episodes (MELAS). Biochemical and biophysical research communications, vol.202, no.3, 1624-1630.

  8. Histol Histopathol 12 595 1997 

  9. J. Life Science. 9 1 1999 

  10. Mol cells 7 726 1997 

  11. Biochimica et Biophysica Acta 1360 193 1997 

  12. Mol. Cell. Biol. 12 480 1992 

  13. K�sel, S., Graeber, M. B.. Use of neuropathological tissue for molecular genetic studies: parameters affecting DNA extraction and polymerase chain reaction. Acta neuropathologica, vol.88, no.1, 19-25.

  14. Legrand, Beatrice, Mazancourt, Philippe de, Durigon, Michel, Khalifat, Véronique, Crainic, Karine. DNA genotyping of unbuffered formalin fixed paraffin embedded tissues. Forensic science international, vol.125, no.2, 205-211.

  15. Love, S., Nicoll, J. A. R., Kinrade, E.. Sequencing and quantitative assessment of mutant and wild‐type mitochondrial DNA in paraffin sections from cases of MELAS. The Journal of pathology : a journal of the Pathological Society of Great Britain and Ireland, vol.170, no.1, 9-14.

  16. 10.1136/mp.51.1.48 

  17. TIBS 25 555 2000 

  18. Siwoski, Arek, Ishkanian, Adrian, Garnis, Cathie, Zhang, Lewei, Rosin, Miriam, Lam, Wan L.. An Efficient Method for the Assessment of DNA Quality of Archival Microdissected Specimens. Modern pathology, vol.15, no.8, 889-892.

관련 콘텐츠

오픈액세스(OA) 유형

BRONZE

출판사/학술단체 등이 한시적으로 특별한 프로모션 또는 일정기간 경과 후 접근을 허용하여, 출판사/학술단체 등의 사이트에서 이용 가능한 논문

이 논문과 함께 이용한 콘텐츠

저작권 관리 안내
섹션별 컨텐츠 바로가기

AI-Helper ※ AI-Helper는 오픈소스 모델을 사용합니다.

AI-Helper 아이콘
AI-Helper
안녕하세요, AI-Helper입니다. 좌측 "선택된 텍스트"에서 텍스트를 선택하여 요약, 번역, 용어설명을 실행하세요.
※ AI-Helper는 부적절한 답변을 할 수 있습니다.

선택된 텍스트

맨위로