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HIV-l 유래 렌티바이러스 벡터의 복제가능 바이러스 검출과 역가측정 분석방법 비교
Comparison of Analysis Methods for Detection of Replication Competent Virus and Functional Titers of HIV-l Based Lentivirus Vector 원문보기

약학회지 = Yakhak hoeji, v.49 no.3, 2005년, pp.217 - 224  

장석기 (식품의약품안전청 생명공학의약품과) ,  오일웅 (식품의약품안전청 생명공학의약품과) ,  정자영 (식품의약품안전청 생명공학의약품과) ,  안광수 (식품의약품안전청 생명공학의약품과) ,  손여원 (식품의약품안전청 생명공학의약품과)

Abstract AI-Helper 아이콘AI-Helper

Human Immunodeficiency Virus type 1 (HIV-l) based lentivirus vector has demonstrated great potential as gene therapy vectors mediating efficient gene delivery and long-term transgene expression in both dividing and nondividing cells. However, for clinical studies it must be confirmed that vector pre...

주제어

AI 본문요약
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문제 정의

  • 먼저 벡터를 처리한 후 3주간에 걸쳐 amplification 기간을 설정함으로써 RCL 이 생성될 수 있는 충분한 배양기간을 확보하였고 마지막 배양 일(21일)에서 얻은 배양 상등액을 2차 transduction에 사용하였 다. 2차 transduction 후에는 추가적으로 6일간의 indication 기 간을 설정하였으며 특정 바이러스 유전자의 이동에 의한 RCL 형성 가능성에 대해 확인 하고자 하였다.17)
  • 현재 RCL의 생성을 검토하기 위한 다양한 방법들이 사용되고 있는데 대표적인 방법으로 p24 detection assay, PCR assay, syncitia formation assay 그리고 marker rescue assay 등■이 시" 용되고 있다.8)본 연구에서는 그 중 가장 용⑴하게 접근할 수 있 는 방법인 p24 ELISA와 PCR 분석법을 선택하여 RCL 검출방 법을 확립하고자 하였다. p24 ELISA는 배양상등액을 재료로 하 여 HIV-1 gag 유전자의 전달과 발현을 모니터 하는 방법이며9) PCR의 경우는 transduction된 세포의 genomic DNA를 이용하여 바이러스 서열의 특정부분에 대한 primerf- 제작하고 이 서열들 의 이동을 검토함으로써 RCL曰 유무를 판정하는 방법이다.
  • RCL에 관한 안전성 평가에 있어서 본 연구에서는 PCR과 P24 ELISA를 함께 사용하여 이를 확립하고자 하였다. Wild type 바 이러스와 달리 RCL은 그 특성상 아주 느린 속도로 증폭된다고 가정할 수 있다.
  • 본 실험에 덧붙여 3주간의 amplification 기간 동안 진행되는 계대배양의 빈도가 RCL 검출시험의 결과에 어떠한 영향을 미치 는지 알아보고자 하였다. 각각 3회와 5회로 나누어 계대기간을 설정하고 amplification 배양을 진행하였다.
  • 1°)한 편, 벡터의 기능적 역가를 측정하는 방법에 있어서도 DNA titer 나 RNA titer와 같이 real-time PCR을 이용하는 방법과 flow cytometer나 적절한 염색 등을 통하여 특정 표식 유전자의 발현 을 분석함으로써 기능적 역가를 결정하는 방법들이 사용되고 있 다. 본 실험에서는 Green Fluorescent Protein(GFP)의 발현정 도를 flow cytometer로 분석 함으로써 벡터의 GFP titer를 결 정하고자 하였고, 또한 real-time PCR을 이용하여 DNA titer를 측정함으로써 두 역가측정법을 상호 비교하여⑵ 유전자치료용 렌티바이러스 벡터의 효율적인 역가측정법을 조사하고자 하였다.
  • 본 실험에서는 렌티바이러스 벡터에 의한 유전자 전달과 RCL 의 존재여부를 확인하기 위하여 일반 PCR과 real-time PCR을 사 용하였으며 이를 비교하고자 하였다. 두 PCR 간의 민감도 차이를 알아보고자 transfer 벡터 DNA와 envelope 플라스미드 DNA의 copy 수에 따른 PCR을 수행하였다.
  • 2). 위의 primer* 이용하여 PCR을 수행하였을 때 PCR의 검출 민 감도가 어느 정도 인지를 알아보고자 하였다. 먼저 각각의 버旧 를 10배씩 단계별 희석하여 준비하였으며 1XPCR buffer, 2.
  • 이러한 결과로 볼 때 copy수에 따른 두 PCR 간의 민감도는 큰 차 이를 나타내지 않았으며 따라서 본 실험에서는 RCL 검출을 위하 여 두 PCR을 모두 사용하여 진행하였다. 이러한 검출 민감도를 토대로 amplification3]- indicator 기간에서 얻은 genomic DNA에 대한 PCR 분석을 통하여 RCL의 존재여부를 확인하고자 하였다.
  • 추가적으로 벡터 상등액 내의 p24 단백질의 양을 측정하여 벡 터의 물리적 역가를 측정할 수 있다. 이를 기능적 역가인 GFP titei; DNA titer와 비교하여 둘 사이의 관계를 알아보고자 하였 다. 먼저 벡터 상등액에 대한 p24 ELISA를 실시하고 벡터 상등 액 내의 p24 양을 측정한 결과 262.

가설 설정

  • RCL에 관한 안전성 평가에 있어서 본 연구에서는 PCR과 P24 ELISA를 함께 사용하여 이를 확립하고자 하였다. Wild type 바 이러스와 달리 RCL은 그 특성상 아주 느린 속도로 증폭된다고 가정할 수 있다. 따라서 RCL이 증폭될 수 있는 충분한 배양 기간이 요구되는데 본 연구에서는 3주간의 amplification 기간을 두고 실험을 진행하였다.
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참고문헌 (18)

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  6. Herry, I. S., Yoo, E. S. and Sutton, R E. : Characterization and detection of artificial replication-competent lentivirus of altered host range. Mol. Ther. 8, 118 (2003) 

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  9. Farson, D., Witt, R., McGuinness, R., Dull, T., Kelly, M., Song, J., Radeke, R., Bukovsky, A., Consiglio, A. and Naldini, L. : A new generation stable inducible packaging cell line for lentiviral vectors. Hum. Gene. Ther. 12, 981 (2001) 

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  11. Wu, X., Wakefield, J. K., Liu, H., Xiao, H., Kralovics, R., Prchal, J. T. and Kappes, J. C. : Development of a novel trans-lentiviral vector that affords predictable safety. Mol. Ther. 2, 47 (2000) 

  12. Sastry. L., Johnson, T., Hobson, M. J., Smucker, B. and Cornetta, K. : Titering lentiviral vectors: comparison of DNA, RNA and marker expression methods. Gene Ther. 9, 1155 (2002) 

  13. Gatlin, J., Ohlmayer, M. I. and Garcia, J. V. : Detection and titration of lentivirus vector preparations. In Lentivirus gene engineering protocols Vol. 229, M. Federico, Humana Press. Totowa, New Jersey, p57 (2003) 

  14. Evans, J. T. and Garcia, J. V. : Lentivirus vector mobilization and spread by human immunodeficiency virus. Hum. Gene. Ther. 11, 2331 (2000) 

  15. Armin, B. : Lentiviral and MLV based retroviral vectors for ex vivo and in vivo gene transfer. Methods 33, 164 (2004) 

  16. Guidance for industry : Supplemental guidance on testing for replication competent retrovirus in retroviral vector based gene therapy products and during follow-up of patients in clinical trials using retroviral vectors, U.S. Department of health and human services, FDA, CBER (1999) 

  17. Wilson, C. A., Ng, T. H. and Miller, A. E. : Evaluation of recommendations for replication-competent retrovirus testing associated with use of retroviral vector. Hum. Gene Ther. 8, 869 (1997) 

  18. Klein, S. A., Karsten, S., Ruster, B., Klebba, C., Pape, M., Ottmann, O. G., Hoelzer, D. and Roth, W. K. : Comparison of TaqMan real-time PCR and p24 ELISA for quantification of in vitro HIV-1 replication. J. Virol. Methods 107, 169 (2003) 

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