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치매환자에서 transposable elements에 의한 유전자 발현조절의 생물정보 분석
Bioinformatics Analysis of Gene Expression Regulation by Transposable Elements in Dementia Patients 원문보기

생명과학회지 = Journal of life science, v.16 no.7 = no.80, 2006년, pp.1188 - 1194  

김대수 (부산대학교 자연과학대학 생물정보학협동과정) ,  허재원 (부산대학교 자연과학대학 생명과학부) ,  하홍석 (부산대학교 자연과학대학 생명과학부) ,  김태홍 (부산대학교 자연과학대학 생명과학부) ,  조운종 (부산대학교 자연과학대학 생물정보학협동과정) ,  김희수 (부산대학교 자연과학대학 생물정보학협동과정)

초록
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노년에 나타나는 정신병적 증상의 가장 흔한 원인 질환으로 만성적이고 서서히 악화되는 진행성이면, 기억력, 사고력, 학습능력 및 판단력 등의 손상을 포함한 인지기능의 장애이다. 고령화 사회가 도래하면서 노인성 치매환자가 매년 급격히 늘고 있으며 매년 수만 명이 노인성치매에 걸려 본인뿐 아니라 가족까지도 많은 고통에 시달리고 있다. 특히 노인성 치매의 경우는 환자 본인의 문제가 아니라 젊은 노동력을 환자의 보호자로 필요함으로 국가적 노동력의 손실로 이어지고 있다. 현재 연구에서 우리는 노인성 치매와 transposable elements와의 상호관계를 밝히기 위하여 공개된 유전자 데이터베이스에서 EST (expressed sequence tags)를 이용하여 생물정보학적 인 분석방법과 프로그램을 이용하여 치매의 원인으로 추정되는 후보유전자들을 찾아내었다. 이러한 분석을 통하여 치매환자에서 transposable elements의 발현으로 인해 유전자의 발현에 변화를 가지는 98개의 후보 유전자를 찾아내었다. 노인성질환인 치매와 transposable elements의 분석방법을 이용하면 치매의 원인을 규명하는데 많은 도움이 될 것이다.

Abstract AI-Helper 아이콘AI-Helper

Dementia is a progressive disease of increasing the dysfunction of intellectual and physical ability. In the aging society, many families are suffering from the caring the patients who are diagnosed with dementia. However, dementia is a complex disease affected by the genetic and environmental agent...

주제어

참고문헌 (28)

  1. Alfredo, A. S. 1988. Assessing vision in patients with Alzheimer's disease. West. J. Med. 148, 693 

  2. Ball, M.J., M. Fisman, V. Hachinski, W. Blume, A. Fox, V. A. Kral, A. J. Kirshen, H. Fox and H. Merskey. 1985. A new definition of Alzheimer's disease: a hippocampal dementia. Lancet 8419, 14-16 

  3. Borchelt, D.R., G. Thinakaran, C. B. Eckman, M. K. Lee, F. Davenport, T. Ratovitsky, C. M. Prada, G. Kim, S. Seekins and D. Yager. 1996. Familial Alzheimer's disease-linked presenilin 1 variants elevate Abeta1-42/1-40 ratio in vitro and in vivo. Neuran. 17, 1005-1013 

  4. Christensen, T. 2005. Association of human endogenous retroviruses with multiple sclerosis and possible interaction with herpes viruses. Rev. Med. Virol. 15, 179-211 

  5. Deng, G., C. J. Pike and C. W. Cotman. 1996. Alzheimer-associated presenilin-2 confers increased sensitivity to apoptosis in PC12 cells. FEBS Lett. 397, 50-54 

  6. Farrer, L.A., L. A. Cupples, J. L. Haines, B. Hyman, W. A. Kukull, R Mayeux, R. H. Myers, M. A. Pericak-Vance, N. Risch and C. M. Van Duijn. 1997. Effects of age, sex, and ethnicity on the association between apolipoprotein E genotype and Alzheimer disease. A meta-analysis. APOE and Alzheimer Disease Meta Analysis Consortium. J. Am. Med. Assoc. 278, 1349-1356 

  7. Florea, L., G. Hartzell, Z. Zhang, G. M. Rubin and W. Miller. 1998. A computer program for aligning a cDNA sequence with a genomic DNA sequence. Genome Res. 8, 967-974 

  8. Graveley, B.R. 2001. Alternative splicing: increasing diversity in the proteomic world. Trends Genet. 17,100-107 

  9. Halling, K.C., C. R. Lazzaro, R. Honchel, J. A. Bufill, S. M. Powell, C. A. S. Arndt and N. M. Lindor. 1999. Hereditary desmoid disease in a family with a germline Alu I repeat mutation of the APC gene. Hum. Hered. 49, 97-102 

  10. Kazazian, Jr.HH. 2004. Mobile elements: drivers of genome evolution. Science, 303, 1626-1632 

  11. Kim, D.S., T. H. Kim, J. W. Huh, I. C. Kim, S. W. Kim, H. S. Park and H. S. Kim. 2006. LINE FUSION GENES: a database of LINE expression in human genes. BMC Genomics. 2006, 7, 139 

  12. Kim, T.H., Y. J. Jeon, W. Y. Kim and H. S. Kim. 2005. HESAS: HERVs Expression and Structure Analysis System. Bioinformatics. 15, 21, 1699-700 

  13. Lander, E.S., L. M. Linton, B. Birren, C. Nusbaum, M. C. Zody, J. Baldwin, K. Devon, K. Dewar, M. Doyle and W. FitzHugh. 2001. Initial sequencing and analysis of the human genome. Nature 409, 860-921 

  14. Makalowski, W., G. A. Mitchell and D. Labuda. 1994. Alu sequences in the coding regions of mRNA: a source of protein variability. Trends Genet. 10, 188-193 

  15. Marin, D.B., M. C. Sewell and A. Schlechter. 2002. Alzheimer's disease. Accurate and early diagnosis in the primary care setting. Geriatrics 57, 36-40 

  16. Mattson, M.P. 1997. Cellular actions of beta-amyloid precursor protein and its soluble and fibrillogenic derivatives. Physiol. Rev. 77, 1081-1132 

  17. Nigumann, P., K. Redik, K. Matlik and M. Speek. 2002. Many human genes are transcribed from the antisense promoter of L1 retrotransposon. Genomics 79, 628-634 

  18. Rajendran, L., M. Honsho, T. R. Zahn, P. Keller, K. D. Geiger, P. Verkade and K. Simons. 2006. Alzheimer's disease beta-amyloid peptides are released in association with exosomes. Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 25, 11172-11177 

  19. Rall, S.C.Jr., K. H. Weisgraber and R. W. Ahley. 1982. Human Apolipoprotein E. J. Biol. Chem. 257, 4171-4178 

  20. Selkoe, D. J. 1996 Amyloid -protein and the genetics of Alzheimer's disease. J. Biol. Chem. 271, 18295-18298 

  21. Simons, C., M. Pheasant, I. V. Makunin and J. S. Mattick. 2005. Transposon-free regions in mammalian genomes. Genome Res. 16,164-172 

  22. Sin, H.S., J. W. Huh, D. S. Kim, D. W. Kang, D. S. Min, T. H. Kim, H. S. Ha, H. H. Kim, S. Y. Lee and H. S. Kim. 2006. Transcriptional control of HERV-H LTR element of GSDML gene in human tissues and cancer cells. Arch. Virol. (in press) 

  23. Smit, A.F. 1999. Interspersed repeats and other mementos of transposable elements in mammalian genomes. Curr. Opin. Genet. Dev. 9, 657-663 

  24. Sorek, R., G. Ast and D. Graur. 2002. Alu-containing exons are alternatively spliced. Genome Res. 12, 1060-1067 

  25. Stromberg, K., E. M. Hansson, H. Laudon, S. Bergstedt, J. Naslund, J. Lundkvist and U. Lendahl. 2005. gamma-Secretase complexes containing N- and C-terminal fragments of different presenilin origin retain normal gama-secretase activity. J. Neurochem. 95, 880-890 

  26. Tanzi, R.E., J. F. Gusella, P. C. Watkins, G. A. P. Bruns, P. St George-Hyslop, M. L. Van Keuren, D. Patterson, S. Pagan, D. M. Kurnit and R. L. Neve. 1987. Amyloid beta protein gene: cDNA, mRNA distribution, and genetic linkage near the Alzheimer locus. Science 235, 880-884 

  27. Ye, S., Y. Huang, K. Mullendorff, L. Dong, G. Giedt, E. C. Meng, F. E. Cohen, I. D. Kuntz, K. H. Weisgraber and R. W. Mahley. 2005. Apolipoprotein (apo) E4 enhances amyloid beta peptide production in cultured neuronal cells:apoE structure as a potential therapeutic target. Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 20.18700-18705 

  28. Zhang, Z., S. Schwartz, L. Wagner and W. Miller. 2000. A greedy algorithm for aligning DNA sequences. J. Comput. BioI. 7, 203-214 

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