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제안 방법
- 먼저 염기서열 분석을 진행하고자 하는 유전체의 일부분을 선정하고, 그 위치와 상보적으로 결합할 수 있는 DMA탐침 (probe)S 디자인한다. 이 DNA탐침을 DNA마이크로이레이(DNA Microarray) 위에 위치시킨다.
- 이 연구계획에는 급성골수성백혈병과 연관된 주요 유전자와 유전체 들의 염기서열 분석과 microRNA의 발현 양상의 분석 그리고 미세결실(microdeletion) 현상에 대한 Paired end 분석이 포함된다. 좀 더 자세히 말하자면, 연구진들은 Roche NimbleGen의 Sequence Capture Array를 이용하여 FLT3 (fms-like tyrosine kinase 3)와 MLL (Mixed Lineage Leukemia)과 같은 급성골수성 백혈병에서 알려진 돌연변이와 SNP 유전형 분석을 통한 잠재적인 돌연변이 대상의 규명을 우I해 일련의 유전入厚을 포착할 계획이다.
- 이 DNA탐침을 DNA마이크로이레이(DNA Microarray) 위에 위치시킨다. 준비한 Genomic DNA를 물리적인 처리를 통해 절편으로 만들고, DMA 절편들과 준비한 마이크로 어레이로 혼성화 반응을 진행한다. 아무리 특이적으로 결합하는 DNA탐침과 혼성화 반응을 진행하더라도 비 특이적인 결합이 일어날 수 있으므로 혼성화 반응 후비특이적으로 결합된 DMA절편들을 제거한 뒤 원하는 DNA절편들만을 선택적으로 추출해낸다.
이론/모형
- 이미 암과 연관된 것으로 밝혀진 많은 유전자들이 있지만 아직도 더 많은 내용들이 밝혀질 수 있기에, London Medical School과 Barts의 암 유전체 연구그룹은 이 혁신적인 기술을 앞서서 채택하게 되었습니다. 우리는 백혈병을 유발하고 진행시키는 유전체 변이를 규명하기 위해 이 454 Sequencing의 대량 염기서열 분석법을 적용하려고 합니다."
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