$\require{mediawiki-texvc}$

연합인증

연합인증 가입 기관의 연구자들은 소속기관의 인증정보(ID와 암호)를 이용해 다른 대학, 연구기관, 서비스 공급자의 다양한 온라인 자원과 연구 데이터를 이용할 수 있습니다.

이는 여행자가 자국에서 발행 받은 여권으로 세계 각국을 자유롭게 여행할 수 있는 것과 같습니다.

연합인증으로 이용이 가능한 서비스는 NTIS, DataON, Edison, Kafe, Webinar 등이 있습니다.

한번의 인증절차만으로 연합인증 가입 서비스에 추가 로그인 없이 이용이 가능합니다.

다만, 연합인증을 위해서는 최초 1회만 인증 절차가 필요합니다. (회원이 아닐 경우 회원 가입이 필요합니다.)

연합인증 절차는 다음과 같습니다.

최초이용시에는
ScienceON에 로그인 → 연합인증 서비스 접속 → 로그인 (본인 확인 또는 회원가입) → 서비스 이용

그 이후에는
ScienceON 로그인 → 연합인증 서비스 접속 → 서비스 이용

연합인증을 활용하시면 KISTI가 제공하는 다양한 서비스를 편리하게 이용하실 수 있습니다.

차세대 염기서열 분석을 위한 정보기술 동향 원문보기

정보과학회지 = Communications of the Korean Institute of Information Scientists and Engineers, v.29 no.4, 2011년, pp.33 - 41  

이태훈 (고려대학교) ,  김한주 (고려대학교) ,  윤성로 (고려대학교)

초록이 없습니다.

참고문헌 (35)

  1. Adams, M. D. et al., "Complementary DNA sequencing: expressed sequence tags and human genome project", Science, Vol. 252, No. 5013, pp. 1651-1656, Jun 1991. 

  2. Sanger, F., Nicklen, S., and Coulson, A. R., "DNA sequencing with chain-terminating inhibitors", Proc. Natl. Acad. Sci., Vol. 74, No. 12,, pp. 5463-5467, Dec 1977. 

  3. Metzker, M. L., "Sequencing technologies - the next generation", Nature Reviews - Genetics, Vol. 11, pp. 31-46, Jan 2010. 

  4. Mardis, E. R., "The impact of next-generation sequencing technology on genetics", Trends in Genetics, 2008. 

  5. Mardis, E. R., "Next-Generation DNA Sequencing Methods", Annual Review of Genomics and Human Genetics, Vol. 9, pp 387-402, Sep 2008. 

  6. Shendure, J. A., "Next-generation DNA sequencing", Nature Biotechnology, 2008. 

  7. Bentley, D. R. et al., "Accurate whole human genome sequencing using reversible terminator chemistry", Vol. 456, pp. 53-59, Nov 2008. 

  8. Shendure, J. A., Porreca, G., Church, G., "Overview of DNA Sequencing Strategies", Current Protocols in Molecular Biology. Jan 2008. 

  9. McLachlan, G. J. and Krishnan, T., The EM algorithm and extensions, 2nd Ed., pp. 3-26, John Wiley and Sons, 2008. 

  10. Garey, M. R., and Johnson, D. S., "Computers and Intractability: A Guide to the Theory of NP-Completeness. Freeman", W.H., p.228, 1979. 

  11. Li, R. et al., "De novo assembly of human genomes with massively parallel short read sequencing", Genome Res., vol. 20, pp.265-272, 2010. 

  12. Krzysztofcyran, "Algorithms in Bioinformatics.08 - DNA mapping and sequencing", BioInfoBank, http://lib.bioinfo.pl/files/courses/pdfcache/lecture_495.pdf, 2010. 

  13. Miller, J. R.., Korena, S., and Sutton, G., "Assembly algorithms for next-generation sequencing data", Genomics, Vol. 95, Issue 6, pp. 315-327,June 2010. 

  14. Khaja, R. et al., "Genome assembly comparison identifies structural variants in the human genome", Nature Genetics, vol. 38, pp.1413-1418, 2006. 

  15. Zerbino, D. R., and Birney, E., "Velvet: Algorithms for de novo short read assembly using de Bruijn graphs", Genome Res., vol. 18, pp. 821-829, 2008. 

  16. "MIRA", http://mira-assembler.sourceforge.net/ 

  17. Bruce Carlson, "SNPs-A Shortcut to Personalized Medicine", BioMarket Trends, Vol. 28, No. 12, p. 12, Jun 2008. 

  18. Cormen, Leiserson, and Rivest, Introduction to Algorithms, Chapter 16 "Greedy Algorithms" p. 329, 1990. 

  19. Iwamoto, C., and Toussaint, G., "Finding Hamiltonian circuits in arrangements of Jordan curves is NPcomplete", Information Processing Letters, Vol. 52, pp. 183-189, 1994. 

  20. Pevzner, P. A., Tang, H., Waterman, M. S., "An Eulerian trail approach to DNA fragment assembly", PNAS, vol. 98, no. 17, pp. 9748-9753, 2001. 

  21. "Center for Bioinformatics & Computational Biology", http://www.cbcb.umd.edu/research/assembly_primer.shtml 

  22. Warren, R. L., Sutton, G. G., Jones, S. J., Holt, R. A., "Assembling millions of short DNA sequences using SSAKE", Bioinformatics, Vol. 23, pp. 500-501, 2007. 

  23. Dohm, J. C. et al., SHARCGS, "a fast and highly accurate short-read assembly algorithm for de novo genomic sequencing", Genome Res., Vol. 17, pp. 1697-1706, 2007. 

  24. Jeck, W. R. et al., "Extending assembly of short DNA sequences to handle error", Bioinformatics, Vol. 23, pp. 2942-2944, 2007. 

  25. Margulies, M. et al., "Genome sequencing in microfabricated high-density picolitre reactors", Nature, Vol. 437, pp. 376-380, 2005. 

  26. Myers, E. W. et al., "A whole-genome assembly of Drosophila", Science, Vol. 287, pp. 2196-2204, 2000. 

  27. Hernandez, D. et al., "De novo bacterial genome sequencing: millions of very short reads assembled on a desktop computer", Genome Res., Vol. 18, pp. 802-809, 2008. 

  28. Hossain, M. S., Azimi, N., Skiena, S., "Crystallizing short-read assemblies around seeds", BMC Bioinformatics, Vol. 10 (Suppl 1) S16, 2009. 

  29. de Bruijn, N. G., "A Combinatorial Problem", Koninklijke Nederlandse Akademie v. Wetenschappen, Vol. 49, pp. 758-764, 1946. 

  30. White III, R. A., Blainey, P. C., Fan, H. C., and Quake, S. R., "Digital PCR provides sensitive and absolute calibration for high throughput sequencing", BMC Genomics, Vol. 10, Nov 2009. 

  31. Meyer, M. et al, "From micrograms to picograms: quantitative PCR reduces the material demands of high-throughput sequencing", Nucleic Acids Res., Vol. 36, Jan 2008. 

  32. "Helicos BioSciences", http://www.helicosbio.com/ 

  33. "Pacific Biosciences", http://www.pacificbiosciences.com/ 

  34. 김남신, 추인선, "차세대 시퀀싱 기술의 활용", 한국생화학분자생물학회 웹진, 2009년 10월. 

  35. "Science News, Technology, Physics, Nanotechnology, Space Science, Earth Science, Medicine", http://www.physorg.com/ 

저자의 다른 논문 :

LOADING...
섹션별 컨텐츠 바로가기

AI-Helper ※ AI-Helper는 오픈소스 모델을 사용합니다.

AI-Helper 아이콘
AI-Helper
안녕하세요, AI-Helper입니다. 좌측 "선택된 텍스트"에서 텍스트를 선택하여 요약, 번역, 용어설명을 실행하세요.
※ AI-Helper는 부적절한 답변을 할 수 있습니다.

선택된 텍스트

맨위로