[논문]부안갯벌 생태계 복원을 위한 칠면초와 해홍나물의 내생진균류에 대한 유전학적 다양성 분석

유영현; 윤혁준; 서영교; 김미애; 신재호; 이인중; 추연식; 김종국

doi:10.4014/kjmb.1207.07025

[국내논문] 부안갯벌 생태계 복원을 위한 칠면초와 해홍나물의 내생진균류에 대한 유전학적 다양성 분석
Analysis of Genomic Diversity of Endophytic Fungal Strains Isolated from the Roots of Suaeda japonica and S. maritima for the Restoration of Ecosystems in Buan Salt Marsh 원문보기

한국미생물·생명공학회지 = Korean journal of microbiology and biotechnology, v.40 no.4, 2012년, pp.287 - 295

유영현 (경북대학교 생명과학부) , 윤혁준 (경북대학교 생명과학부) , 서영교 (경북대학교 생명과학부) , 김미애 (경북대학교 생명과학부) , 신재호 (경북대학교 응용생명과학부) , 이인중 (경북대학교 응용생명과학부) , 추연식 (경북대학교 생물학과) , 김종국 (경북대학교 생명과학부)

초록
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부안갯벌에서 채집된 염생식물 칠면초와 해홍나물의 뿌리로부터 84종의 내생진균을 분리 및 동정하였다. 염생식물 샘플은 칠면초와 해홍나물이 부안갯벌로부터 분리되었다. 모든 내생진균류들은 ITS1, 5.8s와 ITS2를 포함하는 ITS영역의 서열에 의해 분석되었다. 내생진균류들은 Pleosporales (45%), Eurotiales (27%), Incertae sedis (11%), Dothideales (6%), Capnodiales (5%), Hypocreales (5%), 및 Agaricales (1%)에 해당하는 것을 확인하였다. 내생진균류는 자낭균문과 담자균문의 Alternaria속, Ascomycota속, Aspergillus속, Aureobasidium속, Cladosporium속, Eupenicillium속, Fusarium속, Gibberella속, Hocrea속, Lewia속, Macrophoma속, Penicillium속, Peyronellaea속, Phoma속, Pleospora속, Pleosporales속, Pseudeurotium속, Schizophyllum속, 그리고 Talaromyces속이 포함되는 것을 확인하였다. 그리고 alternaria (21%)와 Penicillium (13%)이 우점종인 것을 확인하였다. 본 연구에서는 칠면초와 해홍나물로부터 내생진균을 분리한 결과 Pleosporales 목과 Eurotiales 목의 Alternaria (21%)와 Penicillium (13%)이 가장 많이 분포하는 것으로 나타났다.

Abstract ▼ AI-Helper

Eighty-four endophytic fungal strains were isolated and identified from the roots of halophytes collected in Buan salt marsh. All halophyte samples, such as Suaeda japonica, and Suaeda maritima were isolated from Buan salt marsh. All endophytic fungi isolated were analyzed by sequences of internal transcribed spacer (ITS) containing ITS1, 5.8s and ITS2 region. All endophytic fungi expressed that fungal strains belong to eight orders; Pleosporales (45%), Eurotiales (27%), Incertae sedis (11%), Dothideales (6%), Capnodiales (5%), Hypocreales (5%), and Agaricales (1%). All endophytic fungi were confirmed at the genus level of Ascomycota and Basidiomycota, containing Alternaria, Ascomycota, Aspergillus, Aureobasidium, Cladosporium, Eupenicillium, Fusarium, Gibberella, Hypocrea, Lewia, Macrophoma, Penicillium, Peyronellaea, Phoma, Pleospora, Pleosporales, Pseudeurotium, Schizophyllum, and Talaromyces. Alternaria (21%) and Penicillium (13%) were the dominant endophytic fungal strains. In this study, endophytic fungal strains analyzed from S. japonica and S. maritime, Alternaria (21%), and Penicillium (13%) of Pleosporales and Eurotiales in halophytes were very abundant.

주제어

AI 본문요약
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문제 정의

Table 2. The identificatino of endophytic fungi isolated in this study.
본 연구는 우리나라 전라북도 서해안 곰소만에 있는 부안 갯벌에 자생하고 있는 염생식물의 뿌리로부터 다양한 내생 진균들을 분리·동정 하였다.

제안 방법

Dendogram analysis of endophytic fungi using rDNA-ITS sequences. A phylogenetie tree was constructed using 84 taxa with neighbor joining (10000 bootstrap replications). Phylogenetic tree expressed that all isolated endophytic fungi belong to the Genus.
1 unit의 Ex-Taq DNA polymerase (Takara, Japan)를 사용하였다[25]. PCR 반응조건은 predenaturation (2 min, 95℃), denaturation (30 sec, 95℃), annealing (1 min, 54.5℃), extension (1 min, 72℃), total cycles (35 cycles), final extension (7 min, 720)으로 수행하였다.[24].
그리고 PCR 반응을 위하여 universal primer, ITS1 (S-TCC GTA GGT GAA CCT GCG G-3')과 ITS4 (5'-GGA AGT AAA | AGT CGT AAC AAG G-3')를 사용하여 DNA-ITS 영역을 증폭하여 PCR을 수행하였다.
1 program, neighbor-joining(NJ) 방법으로 분석하였다 [19]. 그리고 내생균류의 동정을 위하여 rDNA-ITS 영역의 염기서열을 NCBI의 blastn으로 확인하였다. 또, 내생균류의 다양성 분석을 위하여 균주들의 목(Order)과 속(Genus)을 확인하였고, 다양성지수를 확인하기 위하여 Shannon's diversity index(H')를 적용하였고[14], 각 식물군에 대한 내생균류의 다양성지수를 분석하였다.
본 연구는 우리나라 전라북도 서해안 곰소만에 있는 부안 갯벌에 자생하고 있는 염생식물의 뿌리로부터 다양한 내생 진균들을 분리·동정 하였다. 그리고 부안갯벌의 다양한 지역에 자생하는 내생진균의 분포와 다양성지수(diversity index)를 확인하여 내생균류의 계통관계를 확인하였다.
본 연구는 부안갯벌에 자생하고 있으며, 우점종으로 알려진 칠면초와 해홍나물을 다양한 지역에서 채취하여 공생관계에 있는 내생진균류를 분리·동정하였다. 그리고 분리된 내생균류들간의 유연관계를 확인하기 위하여 계통분석을 확인하였고, 다양한 지역의 칠면초와 해홍나물에 따른 내생진균류의 다양성을 확인하였다[24, 25]. 내생진균은 자낭균문에 속하는 Pleosporales (45%), Eurotiales (27%), Incertae sedis (11%), Dothideales (6%), Capnodiales (5%), Hypocreales (5%), 그리고 Agaricales (1%)에 속하는 다양한 목의 내생진균류들이 분포하는 것을 확인 할 수 있었고, 속수준에서 Alternaria속, Ascomycota속, Aspergillus속, Aureobasidium속, Cladosporium속, Lupercilium속, Fecser속, Gibberella속.
, Germany)를 사용하여 정제하였다. 그리고 염기서열 결정을 위하여 ABI PRISM BigDye Terminator Cycle Sequencing Kit (PE Biosystems, Foster City, CA, USA)를 사용하였고, DNA 단편들은 ABI 310 DNA sequencer (Perkin Elmer, Foster City, CA, USA)를 사용하여 내생균류들의 염기서열들을 결정하였다.
[23, 24]. 그리고 증폭된 PCR 산물은 1.5% agarose gel에서 전기영동 후, ethidium bromide(EtBr)을 사용하여 15분 염색 후, UV transilluminator로 전기영동밴드를 확인하였다 [23, 24]. 전기영동 단편들은 QIAquick PCR purification kit (Qiagen Inc.
본 연구는 부안갯벌에 자생하고 있으며, 우점종으로 알려진 칠면초와 해홍나물을 다양한 지역에서 채취하여 공생관계에 있는 내생진균류를 분리·동정하였다.
SJIV에서는 Capnodiales목에 속하는 Cladosporiumm속과 Eurotiales목에 속하는 Penicillium속과 Pleosporales목에 속하는 Alternaria속, Phoma속, Pleasporales속이 확인되었으며, 분류체계가 명확하지 않은 Pseudeurotium속이 확인되었다. 본 연구에서 분리 동정된 내생진균류의 계통학적 유연관계를 확인하기 위하여 균류들간의 계통수를 작성하였다(Fig. 2).
부안갯벌에서 채취한 칠면초와 해홍나물의 뿌리에 토양을 제거하고, 계면활성제 (Tween 80)를 10분 처리한 후에 멸균 증류수(sterile distilled water)로 세척하였으며, 과염소산 (Perchloric acid 1%)을 10분간 2회 처리하였다[24]. 그리고 염생식물의 뿌리는 전처리 후, 3~4cm 길이로 절단하여 수분을 제거하였다[18].
배양된 염생식물 뿌리의 끝 단면에서 내생진균을 HM배지에 획선도말법(Streaking)을 이용하여 다시 25℃ 조건에서 배양하고, potato dextrose agar (PDA)에 계대배양하여 순수 분리하였다[9, 11, 23, 24]. 염생식물의 뿌리에서 순수 분리한 내생균류들을 potato dextrose broth (PDB) 배지에 7~14일 동안, 120 pm, 280 조건으로 진탕배양(Shake culture) 하였으며[25], 내생균류의 균체(Mycobiont)를 여과하여 5일 동안 동결건조하여 동정을 위한 시료로 사용하였다.

대상 데이터

그리고 염생식물의 뿌리는 전처리 후, 3~4cm 길이로 절단하여 수분을 제거하였다[18]. 내생진균의 순수분리와 배양을 위하여 스트렙토마이신(Streptomycin 80 ppm)이 포함된 Hagem minimal (HM) 배지를 사용하였고[25], 염생식물의 뿌리를 25℃ 조건에서 배양하였다 [20, 22]. 배양된 염생식물 뿌리의 끝 단면에서 내생진균을 HM배지에 획선도말법(Streaking)을 이용하여 다시 25℃ 조건에서 배양하고, potato dextrose agar (PDA)에 계대배양하여 순수 분리하였다[9, 11, 23, 24].
본 연구에서는 부안갯벌에 자생하고 있는 염생식물을 채집하여 실험재료로 사용하였고, 식물시료는 칠면초(Suaeda japonica), 해홍나물(Stuaeda maritima)을 다양한 지역에서 채집하였으며, 채집한 지역은 Table 1에 나타내었다. 그리고 채집한 염생식물은 지역에 따라서 식물코드(plant code)로 분류하여 나타내었다.
부안갯벌에 자생하고 있는 2종류(7개체)의 염생식물로부터 형태학적으로 다른 내생균류 87종을 분리 및 선발하였다. 선발된 내생균류는 염생식물 SJI로부터 9주, SJII 로부터 16주, SMI 으로부터 16주, SJIII으로부터 7주, SMII로부터 17주, SMIII12주 및 SJIV로부터 7주를 동정하였으며, NCBI의 GenBANK로부터 모든 내생균류에 대하여 accession number [JX041913-JX041051]를 제공받았다(Table 2).
부안갯벌에서 채집된 염생식물 칠면초와 해홍나물의 뿌리로부터 84종의 내생진균을 분리 및 동정하였다. 염생식물 샘플은 칠면초와 해홍나물이 부안갯벌로부터 분리되었다.
부안갯벌에 자생하고 있는 2종류(7개체)의 염생식물로부터 형태학적으로 다른 내생균류 87종을 분리 및 선발하였다. 선발된 내생균류는 염생식물 SJI로부터 9주, SJII 로부터 16주, SMI 으로부터 16주, SJIII으로부터 7주, SMII로부터 17주, SMIII12주 및 SJIV로부터 7주를 동정하였으며, NCBI의 GenBANK로부터 모든 내생균류에 대하여 accession number [JX041913-JX041051]를 제공받았다(Table 2).

데이터처리

염생식물로부터 분리된 내생균류의 염기서열을 ClustalX program을 사용하여 다중정렬을 수행하였고, Lasergene 7 program과 BioEdit program을 사용하여 염기서열을 정리 및 확인하였다.

이론/모형

염생식물로부터 분리된 내생균류의 염기서열을 ClustalX program을 사용하여 다중정렬을 수행하였고, Lasergene 7 program과 BioEdit program을 사용하여 염기서열을 정리 및 확인하였다. 내생균류의 유연관계 분석은 MEGA 4.1 program, neighbor-joining(NJ) 방법으로 분석하였다 [19]. 그리고 내생균류의 동정을 위하여 rDNA-ITS 영역의 염기서열을 NCBI의 blastn으로 확인하였다.
또, 내생균류의 다양성 분석을 위하여 균주들의 목(Order)과 속(Genus)을 확인하였고, 다양성지수를 확인하기 위하여 Shannon's diversity index(H')를 적용하였고[14], 각 식물군에 대한 내생균류의 다양성지수를 분석하였다.
배양된 염생식물 뿌리의 끝 단면에서 내생진균을 HM배지에 획선도말법(Streaking)을 이용하여 다시 25℃ 조건에서 배양하고, potato dextrose agar (PDA)에 계대배양하여 순수 분리하였다[9, 11, 23, 24].
부안갯벌에 자생하는 염생식물들의 뿌리로부터 분리 및 동정된 내생진균류의 다양성을 확인하기 위하여 Shannon's diversity index를 적용하였다.

성능/효과

내생진균은 자낭균문에 속하는 Pleosporales (45%), Eurotiales (27%), Incertae sedis (11%), Dothideales (6%), Capnodiales (5%), Hypocreales (5%), 그리고 Agaricales (1%)에 속하는 다양한 목의 내생진균류들이 분포하는 것을 확인 할 수 있었고, 속수준에서 Alternaria속, Ascomycota속, Aspergillus속, Aureobasidium속, Cladosporium속, Lupercilium속, Fecser속, Gibberella속. Hypocrea속, Lewia속, Macrophoma속, Penicillium속, Peyronellaea속, Phoma속, Pleospora속, Pleosporales속, Pseudeurotiunt속, Schizophyllum속, 그리고 Talaromyces속이 확인되었으며, 모두 19속에 해당하는 것을 확인하였다. 그리고 특이하게 담자균문 Agaricales목, Schizophyllian commemaine(치마버섯)에 속하는 균주가 확인되었고, 분류체계가 명확하지 않은 Incertae sedis에 속하는 Ascomesea속, Macrophome속, Pseudeurorium속의 균류가 확인되었으며, 이들 균주와 분류체계가 명확하지 않은 균류에 대하여 많은 연구가 필요할 것으로 생각된다.
Cladosporium속, Eupenicillium속, Fusarium속, Lewia속, Macrophoma속, Penicillium속, Phoma속, Pleosporales속. Peyronellaea속, Pleospora속, Schizophyllumn속, Talaromyres속이 확인되었다. 고창갯벌과 무안갯벌에 자생하는 염생식물에 따른 내생진균류의 차이점은 조금씩 나타났고, 자낭균문인 Penicillium속에 포함되는 균류들이 공통적으로 많은 것을 확인하였으며, 부안갯벌에서도 Penicilium속이 많이 확인되었다.
SMI에서는 Capnodiales목에 속하는 Cladosporium속과 Eurotiales목에 속하는 Aspergillus속, Penicillium속 및 Talaromyces속이 확인되었고, Pleosporales 목에 속하는 Alternaria속, Phoma속, Pleosporales속이 확인되었다. SJIII에서는 Eurotiales목에 속하는 Penicillium속과, Hypocreales목에 속하는 Fusarium속이 확인되었고, Pleosporales 목에 속하는 Alternaria속, Phoma속, Pleosporales속이 확인되었다. SMII에서는 Capnodiales목에 속하는 Cladosporiumm속과 Eurotiales목에 속하는 Eupenicillimm속과 Pleosporales 목에 속하는 Alternaria, Phoma속, Peyronellaea, Pleospora속이 확인되었고, 분류체계가 명확하지 않은 Macrophoma이 확인되었으며, 담자균문(Basidiomycota)의 Agaricales목에 속하는 Schizophyllum속이 확인되었다.
내생균류의 계통분석은 SJI에서 자낭균문(Ascomycota), Eurotiales목에 속하는 Penicillium속과 Hypocreals목에 속하는 Gibberella속과 Pleosporales목에 속하는 Alternaria속, Phoma속과 분류체계가 명확하지 않은 Incertae sedis에 속하는 Macrophoma속이 확인되었다. SJII에서는 자낭균문, Capnodiales목에 속하는 Cladosporium속과 Dothideales목에 속하는 Aureobasidium속과 Eurotiales목에 속하는 Penicillium속, Aspergillus속이 확인되었고, Hypocreales목에 속하는 Hypocrea속과 Pleosporales목에 속하는 Alternaria속, Pleosporales속이 확인되었다.
SMIII에서는 Dothideales목에 속하는 Aureobasidiumm속과 Eurotiales목에 속하는 Aspergillus속이 확인되었고, Hypocreales목에 속하는 Fusarium속과 Pleosporales목에 속하는 Alternaria속, Phoma속, Levia속, 그리고 Pleosporales속이 확인되었다. SJIV에서는 Capnodiales목에 속하는 Cladosporiumm속과 Eurotiales목에 속하는 Penicillium속과 Pleosporales목에 속하는 Alternaria속, Phoma속, Pleasporales속이 확인되었으며, 분류체계가 명확하지 않은 Pseudeurotium속이 확인되었다. 본 연구에서 분리 동정된 내생진균류의 계통학적 유연관계를 확인하기 위하여 균류들간의 계통수를 작성하였다(Fig.
SMIII에서는 Dothideales목에 속하는 Aureobasidiumm속과 Eurotiales목에 속하는 Aspergillus속이 확인되었고, Hypocreales목에 속하는 Fusarium속과 Pleosporales목에 속하는 Alternaria속, Phoma속, Levia속, 그리고 Pleosporales속이 확인되었다.
SMII에서는 Capnodiales목에 속하는 Cladosporiumm속과 Eurotiales목에 속하는 Eupenicillimm속과 Pleosporales 목에 속하는 Alternaria, Phoma속, Peyronellaea, Pleospora속이 확인되었고, 분류체계가 명확하지 않은 Macrophoma이 확인되었으며, 담자균문(Basidiomycota)의 Agaricales목에 속하는 Schizophyllum속이 확인되었다.
SMI에서는 Capnodiales목에 속하는 Cladosporium속과 Eurotiales목에 속하는 Aspergillus속, Penicillium속 및 Talaromyces속이 확인되었고, Pleosporales 목에 속하는 Alternaria속, Phoma속, Pleosporales속이 확인되었다. SJIII에서는 Eurotiales목에 속하는 Penicillium속과, Hypocreales목에 속하는 Fusarium속이 확인되었고, Pleosporales 목에 속하는 Alternaria속, Phoma속, Pleosporales속이 확인되었다.
Peyronellaea속, Pleospora속, Schizophyllumn속, Talaromyres속이 확인되었다. 고창갯벌과 무안갯벌에 자생하는 염생식물에 따른 내생진균류의 차이점은 조금씩 나타났고, 자낭균문인 Penicillium속에 포함되는 균류들이 공통적으로 많은 것을 확인하였으며, 부안갯벌에서도 Penicilium속이 많이 확인되었다. 그리고 고창갯벌은 Fuerrium속, 무안갯벌과 부안갯벌은 Aspergillians속, 분포비율이 Penicillium 다음으로 높은 것을 확인할 수 있었다[24, 25].
그리고 Shannon's diversity index는 칠면초와 해홍나물 중에서 SMII에서 분리된 내생진균류의 다양성이 2,095로 가장 높은 지수를 나타내었고, SJII에서 분리된 내생진균류의 다양성지수가 1.550으로 가장 낮은 지수로 확인되었다.
내생진균류는 자낭균문과 담자균문의 Altermaria속, Ascomycota속, Aspergillaus속, Aureobasidium속, Cladosporiun속, Eupenicilliun속, Fusarium속, Gibberella속, Hocrea, Levia속, Macrophoma속, Penicillium속, Peyronellaea속, Phoma속, Pleospora속, Pleosporales속, Pseudeurotium속, Schizophyllum속, 그리고 Talaromyces속이 포함되는 것을 확인하였다. 그리고 aliternaria (21%)와 Penicillium (13%)이 우점종인 것을 확인하였다. 본 연구에서는 칠면초와 해홍나물로부터 내생진균을 분리한 결과 Pleosporales 목과 Eurotiales 목의 Alternaria (21%)와 Penicillium (13%)이 가장 많이 분포하는 것으로 나타났다.
그리고 부안갯벌의 칠면초 뿌리에서는 Alternaria속, Aureobasicdium속, Aspergillius속, Claudiosporiium속, Hypocrea속, Gibberella속, Macrophoma속, Penicillium속, Phoma속, Pleosporales속, Pseudeurotium속이 확인되었다. 그리고 고창갯벌에 자생하는 해홍나물로부터 Alternaria속, Pleasporales속이 확인되었고, Apergillius속, Gibberella속, Aeremonium속, Phoma속, Cladosporium속, Cryptococcus속, Macrophoma속, Epicoccum속, Dothideomycetes속이 무안갯벌에서 확인되었다. 부안갯벌에 자생하는 해홍나물의 뿌리로부터 Alternaria속, Aureosbasidium속, Aspergillus속.
부안갯벌에 자생하는 염생식물들의 뿌리로부터 분리 및 동정된 내생진균류의 다양성을 확인하기 위하여 Shannon's diversity index를 적용하였다. 그리고 내생진균은 SJI에서 6속 5종, SJII에서 7속 9종, SMI에서 7속 12종, SJIII에서 5속 5종, SMII에서 8속 9종, SMIII에서 9속 7종, SJIV에서 6속 6종에 해당하는 내생균류들을 확인하였고, 분리된 균류들의 목과 속에 대한 구성비(%)를 나타내었다(Fig. 2). 그리고 부안갯벌에 자생하는 염생식물에 따른 내생진균류의 다양성 지수는 SJI (1.
그리고 부안갯벌에 자생하는 염생식물에 따른 내생진균류의 다양성 지수는 SJI (1.735), SJII (1.787), SMI (1.717), SJIII (1.550), SMII (1.840), SMIII (2.095), SJIV (1.748)로 확인되었다(Table 3).
다른 갯벌지역에 자생하는 염생식물의 뿌리로부터 분리된 내생진균류를 비교하기 위하여 속 수준에서 분석하였을 때, 고창갯벌 칠면초 뿌리의 내생진균류에서는 Pleasporales속, Comiotprium속, Pseudozyma속, Cladosporiun속, Talaromyces속, Gibberella속, Fiusarium속이 확인되었으며, 무안갯벌 칠면초에서는 Aureobasidiumn속, Nigraspora속이 확인되었다. 그리고 부안갯벌의 칠면초 뿌리에서는 Alternaria속, Aureobasicdium속, Aspergillius속, Claudiosporiium속, Hypocrea속, Gibberella속, Macrophoma속, Penicillium속, Phoma속, Pleosporales속, Pseudeurotium속이 확인되었다. 그리고 고창갯벌에 자생하는 해홍나물로부터 Alternaria속, Pleasporales속이 확인되었고, Apergillius속, Gibberella속, Aeremonium속, Phoma속, Cladosporium속, Cryptococcus속, Macrophoma속, Epicoccum속, Dothideomycetes속이 무안갯벌에서 확인되었다.
내생균류의 계통분석은 SJI에서 자낭균문(Ascomycota), Eurotiales목에 속하는 Penicillium속과 Hypocreals목에 속하는 Gibberella속과 Pleosporales목에 속하는 Alternaria속, Phoma속과 분류체계가 명확하지 않은 Incertae sedis에 속하는 Macrophoma속이 확인되었다. SJII에서는 자낭균문, Capnodiales목에 속하는 Cladosporium속과 Dothideales목에 속하는 Aureobasidium속과 Eurotiales목에 속하는 Penicillium속, Aspergillus속이 확인되었고, Hypocreales목에 속하는 Hypocrea속과 Pleosporales목에 속하는 Alternaria속, Pleosporales속이 확인되었다.
내생진균류들은 Pleosporales (45%), Eurotiales (27%), Incertae sedis (11%), Dothideales (6%), Capnodiales (5%), Hypocreales (5%), Agaricales (1%)에 해당하는 것을 확인하였다. 내생진균류는 자낭균문과 담자균문의 Altermaria속, Ascomycota속, Aspergillaus속, Aureobasidium속, Cladosporiun속, Eupenicilliun속, Fusarium속, Gibberella속, Hocrea, Levia속, Macrophoma속, Penicillium속, Peyronellaea속, Phoma속, Pleospora속, Pleosporales속, Pseudeurotium속, Schizophyllum속, 그리고 Talaromyces속이 포함되는 것을 확인하였다. 그리고 aliternaria (21%)와 Penicillium (13%)이 우점종인 것을 확인하였다.
8s와 ITS2를 포함하는 ITS영역의 서열에 의해 분석되었다. 내생진균류들은 Pleosporales (45%), Eurotiales (27%), Incertae sedis (11%), Dothideales (6%), Capnodiales (5%), Hypocreales (5%), Agaricales (1%)에 해당하는 것을 확인하였다. 내생진균류는 자낭균문과 담자균문의 Altermaria속, Ascomycota속, Aspergillaus속, Aureobasidium속, Cladosporiun속, Eupenicilliun속, Fusarium속, Gibberella속, Hocrea, Levia속, Macrophoma속, Penicillium속, Peyronellaea속, Phoma속, Pleospora속, Pleosporales속, Pseudeurotium속, Schizophyllum속, 그리고 Talaromyces속이 포함되는 것을 확인하였다.
내생진균은 자낭균문에 속하는 Pleosporales (45%), Eurotiales (27%), Incertae sedis (11%), Dothideales (6%), Capnodiales (5%), Hypocreales (5%), 그리고 Agaricales (1%)에 속하는 다양한 목의 내생진균류들이 분포하는 것을 확인 할 수 있었고, 속수준에서 Alternaria속, Ascomycota속, Aspergillus속, Aureobasidium속, Cladosporium속, Lupercilium속, Fecser속, Gibberella속.
352, 해홍나물은 1,956으로 확인되었다. 다른 갯벌지역에 자생하는 염생식물의 뿌리로부터 분리된 내생진균류를 비교하기 위하여 속 수준에서 분석하였을 때, 고창갯벌 칠면초 뿌리의 내생진균류에서는 Pleasporales속, Comiotprium속, Pseudozyma속, Cladosporiun속, Talaromyces속, Gibberella속, Fiusarium속이 확인되었으며, 무안갯벌 칠면초에서는 Aureobasidiumn속, Nigraspora속이 확인되었다. 그리고 부안갯벌의 칠면초 뿌리에서는 Alternaria속, Aureobasicdium속, Aspergillius속, Claudiosporiium속, Hypocrea속, Gibberella속, Macrophoma속, Penicillium속, Phoma속, Pleosporales속, Pseudeurotium속이 확인되었다.
그리고 aliternaria (21%)와 Penicillium (13%)이 우점종인 것을 확인하였다. 본 연구에서는 칠면초와 해홍나물로부터 내생진균을 분리한 결과 Pleosporales 목과 Eurotiales 목의 Alternaria (21%)와 Penicillium (13%)이 가장 많이 분포하는 것으로 나타났다.

후속연구

본 연구에서는 우리나라의 부안갯벌에 우점종인 칠면초와 해홍나물의 뿌리로부터 내생진균류의 분포 및 다양성을 확인하였고, 본 연구를 토대로 다른 응용 연구 및 분류체계가 명확하지 않은 균류의 연구가 필요할 것으로 생각되며, 비배양적 방법인 메타지노믹스(Metagenomics)에 대한 연구까지 수행된다면 보다 더 우수한 결과가 도출될 것으로 생각된다. 그리고 염농도가 높은 갯벌 환경에서의 균류자원과 미생물 다양성연구 및 갯벌 생태계의 복원을 위하여 식물에 공생 또는 상호관계에 있는 균류연구에 기초자료가 될 것이다.
Hypocrea속, Lewia속, Macrophoma속, Penicillium속, Peyronellaea속, Phoma속, Pleospora속, Pleosporales속, Pseudeurotiunt속, Schizophyllum속, 그리고 Talaromyces속이 확인되었으며, 모두 19속에 해당하는 것을 확인하였다. 그리고 특이하게 담자균문 Agaricales목, Schizophyllian commemaine(치마버섯)에 속하는 균주가 확인되었고, 분류체계가 명확하지 않은 Incertae sedis에 속하는 Ascomesea속, Macrophome속, Pseudeurorium속의 균류가 확인되었으며, 이들 균주와 분류체계가 명확하지 않은 균류에 대하여 많은 연구가 필요할 것으로 생각된다. 그리고 Shannon's diversity index는 칠면초와 해홍나물 중에서 SMII에서 분리된 내생진균류의 다양성이 2,095로 가장 높은 지수를 나타내었고, SJII에서 분리된 내생진균류의 다양성지수가 1.
그리고 고창갯벌은 Fuerrium속, 무안갯벌과 부안갯벌은 Aspergillians속, 분포비율이 Penicillium 다음으로 높은 것을 확인할 수 있었다[24, 25]. 본 연구에서는 우리나라의 부안갯벌에 우점종인 칠면초와 해홍나물의 뿌리로부터 내생진균류의 분포 및 다양성을 확인하였고, 본 연구를 토대로 다른 응용 연구 및 분류체계가 명확하지 않은 균류의 연구가 필요할 것으로 생각되며, 비배양적 방법인 메타지노믹스(Metagenomics)에 대한 연구까지 수행된다면 보다 더 우수한 결과가 도출될 것으로 생각된다. 그리고 염농도가 높은 갯벌 환경에서의 균류자원과 미생물 다양성연구 및 갯벌 생태계의 복원을 위하여 식물에 공생 또는 상호관계에 있는 균류연구에 기초자료가 될 것이다.

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	습지는 무엇인가?	습지(Marsh)는 물에 의해 주변환경이 결정되는 지역으로서, 일년에 일정기간 이상 물에 잠겨있는 지역을 말하며, 다양한 생물 종이 서식하는 것으로 알려져 있다[13]. 국제습지 보호협약인 람사르(Ramsar) 협약의 조항 1.
	람사르(Ramsar) 협약에서 규정하는, 습지의 정의는?	국제습지 보호협약인 람사르(Ramsar) 협약의 조항 1.1에서 습지는 자연적이든 인공적이든, 영구적이든 임시적이든, 물이 정체되어 있든 흐르고 있든, 담수이든 기수이든 염수이든 관계없이 소택지, 습원, 이탄지 또는 물로 된 지역”이라고 규정하고 있다. 그리고 일반적으로 습지는 크게 내륙습지, 인공습지, 해안 염습지(갯벌)로 분류 및 구분된다.
	부안갯벌의 칠면초와 해홍나물의 뿌리에서 분리 및 동정한 내생진균류 중, 우점종은 무엇인가?	내생진균류는 자낭균문과 담자균문의 Alternaria속, Ascomycota속, Aspergillus속, Aureobasidium속, Cladosporium속, Eupenicillium속, Fusarium속, Gibberella속, Hocrea속, Lewia속, Macrophoma속, Penicillium속, Peyronellaea속, Phoma속, Pleospora속, Pleosporales속, Pseudeurotium속, Schizophyllum속, 그리고 Talaromyces속이 포함되는 것을 확인하였다. 그리고 alternaria (21%)와 Penicillium (13%)이 우점종인 것을 확인하였다. 본 연구에서는 칠면초와 해홍나물로부터 내생진균을 분리한 결과 Pleosporales 목과 Eurotiales 목의 Alternaria (21%)와 Penicillium (13%)이 가장 많이 분포하는 것으로 나타났다.

참고문헌 (26)

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저자의 다른 논문 :

표제어: PCR

동의어: Packet Collision Rate

용어 설명 출처 목록 (6)

용어 설명: PCR은 세균 특이성이 있는 primer를 이용하여 적은 수의 세균이 있을지라도 쉽게 검출할 수 있는 유용한 방법이며, 이를 이용하여 구강 내 치면세균막이나 타액에서 직접 세균을 검출할 수 있게 되었다[8].

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