토양에 서식하는 다양한 미생물 중에서 식물 근권에 서식하는 미생물들은 식물과 상호작용하며 독특한 군집을 형성한다고 알려져 있다. 본 연구에서는 비료 연용 논토양과 무비 논토양에서 재배된 벼(Oryza sativa L.)의 근권으로부터 배양적 접근을 통해 다양한 방선균을 분리하여 항균활성을 조사하였다. 방선균의 선택적 배양을 위해서 4종류의 선택 배지를 이용하였고, 전체 152균주를 분리할 수 있었다. 분리된 균주들의 분류를 위해서 16S rRNA 유전자의 염기서열을 결정하여 표준균주와의 상동성을 비교하였다. 모든 균주들이 기존에 보고된 표준균주들과 99.0~100.0%의 높은 상동성을 나타내었으며, Dactylosporangium, Micromonospora, Kitasatospora, Promicromonospora, Streptomyces, Streptosporangium 등의 6개 속(genus)로 분류되었다. 그 중 Streptomyces 속에 포함되는 균주가 143균주 (94%)로 가장 많았다. 항균활성을 조사한 결과 대다수의 분리 균주들이 식물병원균에 항균성을 나타내는 것을 확인할 수 있었다. 특히 벼 도열병균(Magnaporthe oryzae)에 우수한 항균활성을 보였다. 이와 같은 연구 결과는, 벼의 근권이 다양한 방선균을 분리할 수 있는 우수한 분리원이며, 분리된 방선균에서 다양한 생리활성 물질을 생산할 수 있음을 제시하여 준다. 또한 추후 연구를 통해 친환경 농업을 위한 유용한 미생물 제제로 활용할 수 있을 것으로 기대한다.
토양에 서식하는 다양한 미생물 중에서 식물 근권에 서식하는 미생물들은 식물과 상호작용하며 독특한 군집을 형성한다고 알려져 있다. 본 연구에서는 비료 연용 논토양과 무비 논토양에서 재배된 벼(Oryza sativa L.)의 근권으로부터 배양적 접근을 통해 다양한 방선균을 분리하여 항균활성을 조사하였다. 방선균의 선택적 배양을 위해서 4종류의 선택 배지를 이용하였고, 전체 152균주를 분리할 수 있었다. 분리된 균주들의 분류를 위해서 16S rRNA 유전자의 염기서열을 결정하여 표준균주와의 상동성을 비교하였다. 모든 균주들이 기존에 보고된 표준균주들과 99.0~100.0%의 높은 상동성을 나타내었으며, Dactylosporangium, Micromonospora, Kitasatospora, Promicromonospora, Streptomyces, Streptosporangium 등의 6개 속(genus)로 분류되었다. 그 중 Streptomyces 속에 포함되는 균주가 143균주 (94%)로 가장 많았다. 항균활성을 조사한 결과 대다수의 분리 균주들이 식물병원균에 항균성을 나타내는 것을 확인할 수 있었다. 특히 벼 도열병균(Magnaporthe oryzae)에 우수한 항균활성을 보였다. 이와 같은 연구 결과는, 벼의 근권이 다양한 방선균을 분리할 수 있는 우수한 분리원이며, 분리된 방선균에서 다양한 생리활성 물질을 생산할 수 있음을 제시하여 준다. 또한 추후 연구를 통해 친환경 농업을 위한 유용한 미생물 제제로 활용할 수 있을 것으로 기대한다.
Various microorganisms live in soil, of which those colonizing rhizosphere interact with nearby plants and tend to develop unique microbial communities. In this study, we isolated diverse actinomycetes from rhizosphere of rice (Oryza sativa L.) cultivated in fertilized (APK) and non-fertilized (NF) ...
Various microorganisms live in soil, of which those colonizing rhizosphere interact with nearby plants and tend to develop unique microbial communities. In this study, we isolated diverse actinomycetes from rhizosphere of rice (Oryza sativa L.) cultivated in fertilized (APK) and non-fertilized (NF) paddy soils, and investigated the diversity and antimicrobial activity of them. Using four kinds of selective media, 152 isolates were obtained from the soil samples and identified by determining 16S rRNA gene sequence. All of the isolates showed 99.0%~100.0% similarities with type strains and were classified into six genera: Dactylosporangium, Micromonospora, Kitasatospora, Promicromonospora, Streptomyces and Streptosporangium. Most of the isolates, 143 isolates, were classified into the genus Streptomyces. Additionally, many isolates had antimicrobial activity against plant pathogens, especially Magnaporthe oryzae (rice blast pathogen) in fungi. These findings demonstrated that rice rhizosphere can be a rich source of antagonistic actinomycetes producing diverse bioactive compounds.
Various microorganisms live in soil, of which those colonizing rhizosphere interact with nearby plants and tend to develop unique microbial communities. In this study, we isolated diverse actinomycetes from rhizosphere of rice (Oryza sativa L.) cultivated in fertilized (APK) and non-fertilized (NF) paddy soils, and investigated the diversity and antimicrobial activity of them. Using four kinds of selective media, 152 isolates were obtained from the soil samples and identified by determining 16S rRNA gene sequence. All of the isolates showed 99.0%~100.0% similarities with type strains and were classified into six genera: Dactylosporangium, Micromonospora, Kitasatospora, Promicromonospora, Streptomyces and Streptosporangium. Most of the isolates, 143 isolates, were classified into the genus Streptomyces. Additionally, many isolates had antimicrobial activity against plant pathogens, especially Magnaporthe oryzae (rice blast pathogen) in fungi. These findings demonstrated that rice rhizosphere can be a rich source of antagonistic actinomycetes producing diverse bioactive compounds.
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문제 정의
분리된 방선균들을 대상으로 계통학적 방법으로 다양성을 조사하였다. 또한 식물병원성 곰팡이와 세균들을 대상으로 항균활성을 분석하여, 유용한 균주를 확보하여 친환경 농업에 활용 가능한 생물소재로서 활용하고자 하였다.
본 연구에서는 벼 근권에 존재하는 방선균의 다양성과 기능성을 조사하기 위해서, 근권으로부터 가능한 한 많은 방선균을 직접 분리하였다. 분리된 방선균들을 대상으로 계통학적 방법으로 다양성을 조사하였다.
제안 방법
순수 분리한 방선균의 16S rDNA 염기서열을 분석하여 표준균주와 비교하였다. EzBioCloud에서 염기서열이 표준 균주와 99.0% 이상의 상동성을 나타낸 서열들만을 선별하여 계통분석을 수행하였다. 표준균주들의 계통도를 작성하기 위해서 EzBioCloud로 부터 염기서열을 얻어 CLASTAL W (Thompson et al.
5 µl, DNA 시료 (20 ng/µl)를 PCR tube에 넣고 혼합하였다. PCR 반응은 95℃, 5분간 initial denaturation 후에, 30 cycle 반복수행으로 95℃에서 1분 denaturation, 55℃에서 45초 annealing, 72℃에서 1분 extension 수행한 후 72℃에서 5분간 final extension하는 조건으로 실시하였다. 증폭된 PCR 산물은 정제 후에 Genotech사 (Korea)에 의뢰하여 염기서열을 결정하였고, EzBioCloud (http://www.
같은 종에 해당하는 분리 균주들을 대상으로, 항균활성을 나타내는 균주수를 계산하여 균주들의 분류학적 위치와 항균활성능의 연관성을 분석하였다(Fig. 1). 가장 많이 분리된 S.
계대배양하여 순수 분리한 방선균 균주들을 Trypic Soy Broth (TSB) 3 ml에 3일간 배양하여 PureHelixTM Genomic DNA Prep Kit (NanoHelix, Korea) 로 genomic DNA를 추출하였다. 추출한 genomic DNA를 주형으로 하여 27F (5'-AGAGTTTGATCCTGGCTCAG-3')와 1492R (5'-AAGGA GGTGATCCAGCCGC-3') primer를 사용한 PCR 반응을 실시하였다.
식물병원성 곰팡이는 상추 균핵병균(Sclerotinia sclerotiorum KACC 40457), 고추 탄저병균(Colletotrichum acutatum KACC 40804), 호박 덩굴마름병균(Didymella bryoniae KACC 40938), 잿빛곰팡이균(Botrytis cinerea KACC 40573), 시들음병균(Fusarium oxysporum KACC 40037), 벼 도열병균(Magnaporthe oryzae KACC 40435), 오이 잘록병균(Pythium ultimum KACC 40705), 벼 깨씨무늬병균(Bipolaris oryzae KACC 41025), 뿌리썩음병균(Fusarium solani KACC 44891), 인삼 잘록병균(Rhizoctonia solani KACC 40123) 등으로 총 10균주이다. 곰팡이의 항균활성 검정은 Potato Dextrose Agar (PDA; Difco) 배지에 검정균주를 각각 접종한 후 분리된 방선균 균주를 대치배양하여 균체 주위에 형성된 생육저지대 (clear zone) 의 크기에 따라 항균 활성을 측정하였다.
선택배지는 Humic-acid vitamin agar (HV), Starch casein agar (SCA), Streptomyces isolation media (SIM), Tap water-yeast extract agar (TWYE) 를 사용하였다. 도말한 배지를 28℃에서 14일 동안 배양하였고, 배지상에 형성된 콜로니중 방선균으로 추정되는 것을 무작위로 선별하여 oatmeal agar 배지에 계대하였다. 계대한 균주들은 14일간 더 배양하여 개별 콜로니들을 최종적으로 순수 분리하였다.
본 연구에서는 벼 근권에 존재하는 방선균의 다양성과 기능성을 조사하기 위해서, 근권으로부터 가능한 한 많은 방선균을 직접 분리하였다. 분리된 방선균들을 대상으로 계통학적 방법으로 다양성을 조사하였다. 또한 식물병원성 곰팡이와 세균들을 대상으로 항균활성을 분석하여, 유용한 균주를 확보하여 친환경 농업에 활용 가능한 생물소재로서 활용하고자 하였다.
carotovorum KACC 11130 등을 사용하였다. 세균의 항균활성 검정은 LB broth 배지(Difco)에 검정균주 배양액 1 ml을 각각 접종하여 분주한 후에 분리균주와 대치 배양하여 균체 주위에 형성된 생육저지대의 크기에 따라 항균활성을 측정하였다.
순수 분리한 방선균의 16S rDNA 염기서열을 분석하여 표준균주와 비교하였다. EzBioCloud에서 염기서열이 표준 균주와 99.
전체 분리된 방선균 152균주를 대상으로 여러 가지 식물 병원성 곰팡이에 대한 항균활성을 검정하였다(Fig. 1, 2). 전체 검정균주 10개 중 벼 도열병균(Magnaporthe oryzae KACC 40435)에 항균활성을 나타내는 균주가 전체 152균주 중 106균주(70%)로 가장 많았으며, 인삼 잘록병균(Rhizoctonia solani KACC 40123)에 항균활성을 보이는 균주가 94균주(62%), 벼 깨씨무늬병균(Bipolaris oryzae KACC 41025)에 항균활성을 보이는 균주가 69균주(45%)로 그 뒤를 이었다(Fig.
PCR 반응은 95℃, 5분간 initial denaturation 후에, 30 cycle 반복수행으로 95℃에서 1분 denaturation, 55℃에서 45초 annealing, 72℃에서 1분 extension 수행한 후 72℃에서 5분간 final extension하는 조건으로 실시하였다. 증폭된 PCR 산물은 정제 후에 Genotech사 (Korea)에 의뢰하여 염기서열을 결정하였고, EzBioCloud (http://www.ezbiocloud.net; Kim et al., 2012b)에서 표준균주들과 염기서열의 상동성을 비교하였다.
) 의 뿌리를 근권 토양과 함께 채취하였다. 채취한 벼의 뿌리를 3회에 걸쳐 멸균 증류수로 세척한 후 최종적으로 세척한 증류수를 원심분리하여 근권 토양을 분리하였다. 같은 시험 포장에서 분리한 근권 토양과는 혼합하여 실험을 위한 재료로 사용하였다.
추출한 genomic DNA를 주형으로 하여 27F (5'-AGAGTTTGATCCTGGCTCAG-3')와 1492R (5'-AAGGA GGTGATCCAGCCGC-3') primer를 사용한 PCR 반응을 실시하였다.
항온수조에서 55℃, 20분간 처리 후 멸균 생리식염수로 10배 단위로 10−7까지 단계적으로 희석(serial dilution) 하였다.
항진균 활성 분석과 마찬가지로 전체 방선균 152균주를 대상으로 식물 병원성 세균(Xanthomonas oryzae KACC 10331, Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum KACC 11130)에 대한 항세균 활성을 조사하였다(Fig. 1, 2). 벼 흰잎 마름병을 유발하는 병원성 세균인 X.
대상 데이터
세균은 Xanthomonas oryzae KACC 10331, Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum KACC 11130 등을 사용하였다. 세균의 항균활성 검정은 LB broth 배지(Difco)에 검정균주 배양액 1 ml을 각각 접종하여 분주한 후에 분리균주와 대치 배양하여 균체 주위에 형성된 생육저지대의 크기에 따라 항균활성을 측정하였다.
채취한 벼의 뿌리를 3회에 걸쳐 멸균 증류수로 세척한 후 최종적으로 세척한 증류수를 원심분리하여 근권 토양을 분리하였다. 같은 시험 포장에서 분리한 근권 토양과는 혼합하여 실험을 위한 재료로 사용하였다.
본 연구에 이용할 벼 근권 토양 시료를 채취하기 위해서 경기도 수원시 서둔동 소재 국립농업과학원 장기 연용 시험 포장(37 16' N, 126, 59' E)을 선정하였다.
희석액 중 10−2~10−7까지 6개의 희석액을 선택배지에 100 µl씩 도말하였다. 선택배지는 Humic-acid vitamin agar (HV), Starch casein agar (SCA), Streptomyces isolation media (SIM), Tap water-yeast extract agar (TWYE) 를 사용하였다. 도말한 배지를 28℃에서 14일 동안 배양하였고, 배지상에 형성된 콜로니중 방선균으로 추정되는 것을 무작위로 선별하여 oatmeal agar 배지에 계대하였다.
ultimum에는 항균활성을 나타내는 균주의 수가 각각 0개, 1개로 가장 낮았다. 세균 항균활성의 경우 X. oryzae과, P. carotovorum 에 항균활성을 나타내는 균주가 각각 19개, 8개로 대체로 적었다. 이 결과는 전체 분리 균주 152균주의 경향성과 대체로 일치하는 결과이다.
, 2012a). 시료를 채취한 시기는 2012년 2월이었으며 각 시험 포장 안에서 세 군데를 무작위적으로 선택하여 벼(삼광벼, Oryza sativa L.) 의 뿌리를 근권 토양과 함께 채취하였다. 채취한 벼의 뿌리를 3회에 걸쳐 멸균 증류수로 세척한 후 최종적으로 세척한 증류수를 원심분리하여 근권 토양을 분리하였다.
시험 포장은 1954년 이후로 각기 다른 조합의 비료 성분을 구획(6.3 × 8.3 m)별로 시용하여 왔으며, 이들 처리구 중 3요소구(APK)와 무비구(NF)에서 시료를 채취하였다.
이론/모형
, 1997)를 사용하여 alignment를 수행하였다. 계통수의 작성은 MEGA program version 4.0 (Tamura et al., 2007)을 사용하였고, 알고리즘으로 UPGMA (Sneath and Sokal, 1973) 방법을 사용하였다.
0% 이상의 상동성을 나타낸 서열들만을 선별하여 계통분석을 수행하였다. 표준균주들의 계통도를 작성하기 위해서 EzBioCloud로 부터 염기서열을 얻어 CLASTAL W (Thompson et al., 1997)를 사용하여 alignment를 수행하였다. 계통수의 작성은 MEGA program version 4.
성능/효과
근권 토양 분리원을 3요소구(APK)와 무비구(NF)로 나누어서 분석한 결과 3요소구와 무비구로부터 분리된 방선균은 각각 102균주와 50균주였다(Table 1, 2). 16S rRNA 유전자 분석을 통해 동정한 결과, 3요소구와 무비구로부터 분리된 균주들은 각각 22종과 12종의 표준균주와 높은 상동성을 나타내어, 분리 균주의 다양성에 있어서 3요소구가 두 배 정도 높았다. 두 분리원에서 공통적으로 나타난 종은 7종이었으며, 각각 S.
colombiensis와 높은 상동성을 나타냈다. SCA, SIM 배지로부터 분리된 균주는 두 분리원간에 비교적 큰 차이가 없었지만, TWYE의 경우에는 뚜렷한 차이를 보였다. 즉, HV 배지는 벼 근권 방선균 분리배지로서는 적절한 배지가 아니며, TWYE 배지는 분리원에 따라서 매우 큰 차이를 보이는 선택배지라고 판단되었다.
1). 가장 많이 분리된 S. anulatus 종(53 균주)의 경우 곰팡이 항균활성은 M. oryzae, R. solani, B. oryzae에 항균활성을 나타내는 균주의 수가 가장 많았고, F. oxysporum, P. ultimum에는 항균활성을 나타내는 균주의 수가 각각 0개, 1개로 가장 낮았다. 세균 항균활성의 경우 X.
결과적으로 Streptomyces 속의 균주들이 다른 속에 해당하는 균주들보다 항균활성이 더 높았고, Streptomyces 속 내에서도 몇몇 특정 종에 속하는 분리 균주들이 항균 활성이 높은 것을 조사하였다. 이 결과들은 분리 균주들의 분류학적 위치와 항균 활성능이 일정 정도 연관성이 있음을 제시한다.
근권 토양 분리원을 3요소구(APK)와 무비구(NF)로 나누어서 분석한 결과 3요소구와 무비구로부터 분리된 방선균은 각각 102균주와 50균주였다(Table 1, 2). 16S rRNA 유전자 분석을 통해 동정한 결과, 3요소구와 무비구로부터 분리된 균주들은 각각 22종과 12종의 표준균주와 높은 상동성을 나타내어, 분리 균주의 다양성에 있어서 3요소구가 두 배 정도 높았다.
16S rRNA 유전자 분석을 통해 동정한 결과, 3요소구와 무비구로부터 분리된 균주들은 각각 22종과 12종의 표준균주와 높은 상동성을 나타내어, 분리 균주의 다양성에 있어서 3요소구가 두 배 정도 높았다. 두 분리원에서 공통적으로 나타난 종은 7종이었으며, 각각 S. anulatus, S. cinereorectus, S. cirratus, S. colombiensis, S. griseoplanus, S. olivochromogenes, S. rishiriensis 등으로 모두 Streptomyces 속에 포함되었다. 분리배지에 따라 비교해 보았을 때, HV 배지로부터는 두 분리원에서 각각 두 균주만이 분리되었고, 이들 균주들은 모두 S.
anulatus와 상동성이 높은 균주들이 가장 많이 분리되었다. 따라서 이런 결과는 적절한 분리원을 대상으로 여러가지 선택배지를 사용해야 다양한 방선균의 선택적 분리 배양이 가능하다는 점을 보여준다.
즉, HV 배지는 벼 근권 방선균 분리배지로서는 적절한 배지가 아니며, TWYE 배지는 분리원에 따라서 매우 큰 차이를 보이는 선택배지라고 판단되었다. 또한 분리원이나 분리배지와 관계없이 S. anulatus와 상동성이 높은 균주들이 가장 많이 분리되었다. 따라서 이런 결과는 적절한 분리원을 대상으로 여러가지 선택배지를 사용해야 다양한 방선균의 선택적 분리 배양이 가능하다는 점을 보여준다.
2). 반면 항균효과를 상대적으로 적게 보였던 검정균주는 오이 잘록병균(Pythium ultimum KACC 40705)과 시들음병균(Fusarium oxysporum KACC 40037)으로 항균활성을 나타낸 분리 균주는 각각 12균주(8%)와 28균주(18%) 이었다. 흥미로운 점은 분리된 균주들이 가장 큰 항균 활성을 보인 M.
1, 2). 벼 흰잎 마름병을 유발하는 병원성 세균인 X. oryzae KACC 10331 균주에 대해서 활성(34%)을 보이는 경향이 P. carotovorum KACC 11330 에 대한 활성(12%)보다 크게 나타났다. 이를 통해 볼 때 벼 근권 내에 서식하는 방선균이 벼에 감염하는 유해 곰팡이 및 세균의 발생을 억제시키는 효과를 나타내고 있을 가능성이 높다고 판단된다.
본 연구에서 벼 근권 토양으로부터 분리된 방선균 전체 균주의 수는 152균주였으며, 각 균주들의 16S rRNA 유전자 염기서열은 표준균주 27종과 99.0%~100.0%의 높은 상동성을 나타내는 것으로 확인되었다(Fig. 1). 표준균주 27종은 각각 Streptomyces 속(20종), Micromonospora 속(3종), Dactylosporangium 속(1종) Kitasatospora 속(1종), Promicromonospora 속(1종), Streptosporangium 속(1종) 등의 6개 속(genus)으로 분류되었다.
rishiriensis 등으로 모두 Streptomyces 속에 포함되었다. 분리배지에 따라 비교해 보았을 때, HV 배지로부터는 두 분리원에서 각각 두 균주만이 분리되었고, 이들 균주들은 모두 S. colombiensis와 높은 상동성을 나타냈다. SCA, SIM 배지로부터 분리된 균주는 두 분리원간에 비교적 큰 차이가 없었지만, TWYE의 경우에는 뚜렷한 차이를 보였다.
결과적으로 Streptomyces 속의 균주들이 다른 속에 해당하는 균주들보다 항균활성이 더 높았고, Streptomyces 속 내에서도 몇몇 특정 종에 속하는 분리 균주들이 항균 활성이 높은 것을 조사하였다. 이 결과들은 분리 균주들의 분류학적 위치와 항균 활성능이 일정 정도 연관성이 있음을 제시한다. 이러한 사실은 이전에 보고된 다른 연구결과에서도 이미 확인된 바 있다(Anzai et al.
표준균주 27종은 각각 Streptomyces 속(20종), Micromonospora 속(3종), Dactylosporangium 속(1종) Kitasatospora 속(1종), Promicromonospora 속(1종), Streptosporangium 속(1종) 등의 6개 속(genus)으로 분류되었다. 이 중 Streptomyces 속에 속하는 것이 전체 분리 균주의 94%에 해당하는 143균주이였다. 그 외에 Micromonospora 속에 5균주(3%) 가 속하였고, 나머지 4속에는 각각 1균주 밖에 분리되지 않았다.
carotovorum KACC 11330 에 대한 활성(12%)보다 크게 나타났다. 이를 통해 볼 때 벼 근권 내에 서식하는 방선균이 벼에 감염하는 유해 곰팡이 및 세균의 발생을 억제시키는 효과를 나타내고 있을 가능성이 높다고 판단된다.
1, 2). 전체 검정균주 10개 중 벼 도열병균(Magnaporthe oryzae KACC 40435)에 항균활성을 나타내는 균주가 전체 152균주 중 106균주(70%)로 가장 많았으며, 인삼 잘록병균(Rhizoctonia solani KACC 40123)에 항균활성을 보이는 균주가 94균주(62%), 벼 깨씨무늬병균(Bipolaris oryzae KACC 41025)에 항균활성을 보이는 균주가 69균주(45%)로 그 뒤를 이었다(Fig. 2). 반면 항균효과를 상대적으로 적게 보였던 검정균주는 오이 잘록병균(Pythium ultimum KACC 40705)과 시들음병균(Fusarium oxysporum KACC 40037)으로 항균활성을 나타낸 분리 균주는 각각 12균주(8%)와 28균주(18%) 이었다.
이 결과는 전체 분리 균주 152균주의 경향성과 대체로 일치하는 결과이다. 전체 검정균주에 우수한 항균활성을 나타낸 균주들은 S. humidus, S. shenzhenensis에 포함되는 균주들이었으며, S. colombiensis, S. rishiriensis, S. scopuliridis로 분류된 균주들은 항진균 활성은 높았으나, 항세균 활성은 낮았다. S.
SCA, SIM 배지로부터 분리된 균주는 두 분리원간에 비교적 큰 차이가 없었지만, TWYE의 경우에는 뚜렷한 차이를 보였다. 즉, HV 배지는 벼 근권 방선균 분리배지로서는 적절한 배지가 아니며, TWYE 배지는 분리원에 따라서 매우 큰 차이를 보이는 선택배지라고 판단되었다. 또한 분리원이나 분리배지와 관계없이 S.
그 외에 Micromonospora 속에 5균주(3%) 가 속하였고, 나머지 4속에는 각각 1균주 밖에 분리되지 않았다. 특히 Streptomyces 속의 균주 중에서는 S. anulatus 종에 포함되는 균주가 53균주로 가장 많았으며 그 외에 S. colombiensis, S. olivochromogenes, S. cinereorectus, S. rishiriensis 에 해당되는 균주들이 10균주 이상으로 많았다. Streptomyces가 근권 방선균중에서 우점종으로 분리된 이번 연구 결과는 이전에 보고된 다른 연구와도 일치하는 결과이다(Lee et al.
olivochromogenes를 제외한 대부분의 우점종이 이전에 보고되지 않은 종들이었다. 특히, S. anulatus에 포함되는 균주가 이전 연구들과는 달리 전체 Streptomyces 중에서도 가장 많이 존재하여 벼 근권 내 방선균에서는 가장 우점하고 있는 종으로 확인되었다.
1). 표준균주 27종은 각각 Streptomyces 속(20종), Micromonospora 속(3종), Dactylosporangium 속(1종) Kitasatospora 속(1종), Promicromonospora 속(1종), Streptosporangium 속(1종) 등의 6개 속(genus)으로 분류되었다. 이 중 Streptomyces 속에 속하는 것이 전체 분리 균주의 94%에 해당하는 143균주이였다.
후속연구
, 2008). 따라서 본 연구를 통해 분리된 미생물들 중에서 높은 항균 활성을 갖는 균주들은 다양한 생리활성 물질을 생산할 가능성이 높고, 추후에 유용한 미생물 제제로 활용될 가능성이 충분하다고 판단된다.
질의응답
핵심어
질문
논문에서 추출한 답변
식물 근권이란 무엇인가?
식물 근권은 식물의 뿌리가 직접적으로 토양과 접촉하는 영역으로, 식물 뿌리와 토양 미생물의 직·간접적인 상호작용이 다양하게 이루어지고 있는 곳이다(Dennis et al., 2009).
토양 환경에서 서식하는 방선균의 수와 종은 무엇에 영향 받는가?
호기성 그램 양성 세균인 방선균은 토양 환경에 널리 분포하는 주요한 토양 미생물 분류군이다. 토양 환경에서 서식하는 방선균의 수와 종은 토양의 온도, pH, 유기물함량, 경작상태, 통기 및 습도 등에 영향을 받는다(Goodfellow, 2010). 방선균은 풍부한 이차 대사산물들을 생산하는 것으로 잘 알려져 있으며, 다양한 기능성을 가지고 있어 식품, 환경 및 농산업 분야에도 널리 활용될 수 있는 유용한 생물 소재 자원이다(Morales et al.
식물 근권에 서식하는 미생물들의 특징은 무엇인가?
, 2009). 근권에 서식하는 미생물은 식물로부터 유래된 뿌리 삼출물 속의 키틴, 셀룰로즈, 펙틴과 같은 양분에 쉽게 접할 수 있고 일부는 이를 통해 빠르게 성장하여 군집을 형성한다. 이러한 근권 미생물들은 식물 근권 부위에서 양분과 수분의 흡수를 촉진하여 식물 뿌리의 신장에 관여하며, 근권 내 병원성 유해미생물 및 병해충의 발생을 억제함으로써 작물의 생육을 조절하는 매우 중요한 역할을 수행한다(Zhang et al.
참고문헌 (30)
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