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젖소 국제유전능력 평가를 위한 종모우별 다형질 Effective Daughter Contribution 추정
Approximation of Multiple Trait Effective Daughter Contribution by Dairy Proven Bulls for MACE 원문보기

한국동물자원과학회지 = Journal of animal science and technology, v.55 no.5, 2013년, pp.399 - 403  

조광현 (농촌진흥청 국립축산과학원) ,  최태정 (농촌진흥청 국립축산과학원) ,  조충일 (농촌진흥청 국립축산과학원) ,  박경도 (국립한경대학교 유전정보연구소) ,  도경탁 (국립한경대학교 유전정보연구소) ,  오재돈 (국립한경대학교 유전정보연구소) ,  이학교 (국립한경대학교 유전정보연구소) ,  공홍식 (국립한경대학교 유전정보연구소) ,  이준호 (국립한경대학교 유전정보연구소)

초록
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국가간 유전능력평가를 위하여 5산차 다형질 모형을 적용한 다형질유효 딸소 기여도를 추정하기 위하여 농협중앙회 젖소개량부에서 수집한 한국형 보증종모우 및 수입 씨수소 2,046두의 딸소에 대한 산유량 검정기록 및 관련된 혈통을 수집하였으며, 수집된 산유량 검정기록 중 산차는 5산차, 누적착유일은 75~307일로 제한하였고, 305일 보정유량이 15,000 kg이 넘는 기록은 국제평가기준에 맞추기 위하여 제거하여, 총 301,551두 딸소의 681,860개 기록을 이용하였다. EDC 계산을 위하여 모든 개체의 육종가 추정 신뢰도를 부모 육종가 평균 (Parents average), 개체의 기록(Yield deviation) 및 배우자의 신뢰도가 보정된 후손의 육종가 기여도(Progeny contribution) 부분으로 분리하였으며, 1~5산차 유생산 유전상관을 고려하여 다형질 유효 딸소 기여도를 추정하였다. 씨수소 2,046두의 유생산 기록을 가지는 딸소 두수의 산차별 평균은 1~5산에서 각 140.57, 94.24, 55.14, 29.20 및 14.06두로 나타났으며, 추정된 MTEDC는 113.49, 89.28, 73.56, 54.02 및 35.08로 나타나 3산 이후의 기록이 부족함에도 유전상관을 고려한 EDC 추정치는 높게 형성되어 검정자료의 활용도가 높아진 것을 확인하였다. 또한 EDC 계산은 국제유전능력평가 적용을 위한 필수항목으로 정확한 국제유전능력평가를 위해서는 관련 알고리즘에 대한 이해가 필요하며, 지속적인 EDC 검증 및 종모우당 딸소 검정 두수 증가 등의 노력이 필요하다고 사료된다.

Abstract ▼ AI-Helper 아이콘AI-Helper

This study was conducted to investigate the basic concept of multiple trait effective daughter contribution (MTEDC) for dairy cattle sires and calculate effective daughter contribution (EDC) by applying a five lactation multiple trait model using milk yield test records of daughters for the Multiple...

주제어

#유효딸소기여도   #국제유전능력평가   #다형질모형   #육종가   #산유량  

AI 본문요약
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문제 정의

  • 현재 우리나라는 국제유전능력평가를 위하여 산차를 서로 다른 형질로 고려한 5산차 다형질 개체모형을 사용하고 있기 때문에 종모우의 EDC를 추정하기 위해서는 다형질 모형을 사용해야 한다. 따라서 본 연구의 목적은 다형질 모형에서의 EDC 계산 방법을 소개하고 실제 자료를 이용한 각 종모우의 MTEDC를 계산하여 산차별 딸소 기록과 비교하는데 있다.

가설 설정

  • 1) Effective daughter contribution.
  • 여기서, R*sire 과 R*dam 은 현재까지 누적 계산된 개체 각 부모의 육종가 신뢰도이며, 부모 사이에 혈연관계는 없다고 가정한다.
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질의응답

핵심어 질문 논문에서 추출한 답변
젖소 종축의 특징은? 젖소 종축은 수입과 수출에 의하여 빈번한 국가간 교류가 이루어지고 있어 이러한 혈연적 연결을 이용할 경우 종축 능력을 객관적으로 비교할 수 있는 국제 유전능력 평가를 실시할 수 있다. 각 나라별로 자국의 개량 환경에 적합한 유전능력 평가 체계가 구축되어 있어 경제형질, 사육환경 및 육종가 추정 모형이 서로 다르기 때문에 Schaeffer (1994)는 다형질 종모우 모형(Multiple-trait sire model)을 활용하여 각 국가별 유전능력평가결과를 서로 다른 형질로 취급하는 국가간 유전능력 비교 방법을 제안하였고, 현재 다형질 국가간 유전능력평가(MACE; Multiple-trait Across Country Evaluation) 기술로 정립되어 우리나라를 포함한 32개국이(2013년 3월 생산형질 기준) 젖소 국제 유전능력평가에 참여하고 있다 (Interbull, 2013).
유효 딸소 기여도의 장점은? Fiske와 Banos (2001)에 의하여 제안된 유효 딸소 기여도(EDC; Effective Daughter Contribution)는 현재 국제유전능력평가에서 각 국가별 씨수소에 대한 능력 표준화하는 역회귀치(DRP; Deregressed proof) 계산을 위한 가중치로 이용되고 있으며, 또한 육종가 추정 신뢰도를 간접적으로 측정하기 위하여 활용되고 있다. 과거에 종모우당 딸소 수를 이용한 가중치를 이용하였을 경우 국제 유전능력평가에서 종모우 분산추정치의 편의(Bias)가 발생하여 새로운 가중치 개발의 필요성이 대두되었고, 이에 따라 동기군 구조, 관련된 반복자료 및 종빈우의 신뢰도를 고려하여 더 정확한 가중치를 생성할 수 있는 EDC가 개발되어 이용되고 있다. 젖소 국제 유전능력평가기구(Interbull)는 종모우 평가 기준으로 EDC가 10 이하인 종모우에 대해서는 유전능력평가에 포함시키지 않으며, 평가 결과에 EDC와 이를 이용한 신뢰도를 평가 결과에 표기하고 있다.
EDC의 기본 개념은? 젖소 국제 유전능력평가기구(Interbull)는 종모우 평가 기준으로 EDC가 10 이하인 종모우에 대해서는 유전능력평가에 포함시키지 않으며, 평가 결과에 EDC와 이를 이용한 신뢰도를 평가 결과에 표기하고 있다. EDC의 기본 개념은 VanRanden과 Wiggans (1991)에 의하여 Daughter equivalents (DE) 개념이 처음 제안된 이후 Information source 방법(Harris and Johnson, 1998) Effective Number of Progeny (Jamrozik et al., 2000) 개념으로부터 확장되었으며, 중심 개념은 모든 방법에서 DE와 유사하다. 종모우의 경우 자기 자신의 표현형 자료가 없으므로 자손의 표현형 정보를 통하여 육종가를 추정하게 되며, 이러할 경우 추정된 종모우의 육종가 신뢰도는 표현형 정보를 소유하는 자손의 수와 유전모수에 의하여 영향 받게 된다.
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참고문헌 (11)

  1. Cho, K. H., Park, B. H., Choi, J. K., Choi, T. J., Choy, Y. H., Lee, S. S. and Cho, C. I. 2013a. Development of International Genetic Evaluation Models for Dairy Cattle. J. Anim. Sci. & Tech., 55(1) 1-6. 

  2. Cho, C. I., Cho, K. H., Choy, Y. H., Choi, J. K., Choi, T. J., Park, B. H. and Lee, S. S. 2013b. Estimation of Genetic Parameters for Milk Production Traits in Holstein Dairy Cattle. J. Anim. Sci. & Tech. 55(1) 7-11. 

  3. Fikse, W. F. and Banos, G. 2001. Weighting Factors of Sire Daughter Information in International Genetic Evaluations. J. Dairy Sci. 84:1759-1767. 

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  4. Harris, B. and Johnson D. 1998. Approximate Reliability of Genetic Evaluations Under an Animal Model. J. Dairy Sci. 81:2723-2728. 

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  5. Jamrozik, J., Schaeffer, L. R. and Jansen, G. B. 2000. Approximate Accuracies of Prediction from Random Regression Models. Livest. Prod. Sci. 66:85-92. 

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  6. Liu, Z., Reinhardt, F. and Reents, R. 2001. The Effective Daughter Contribution Concept Applied to Multiple Trait Models For Approximating Reliability of Estimated Breeding Values. Interbull Bulletin 27, 41-47. 

  7. Liu, Z., Reinhardt, F. and Reents, R. 2004. Derivation and Calculation of Approximate Reliabilities and Daughter Yield-Deviations of a Random Regression Test-Day Model for Genetic Evaluation of Dairy Cattle. J. Dairy Sci. 87:1896-1907. 

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  8. Schaeffer, L. R. 1994. Multiple-Country Comparison of Dairy Sires. J. Dairy Sci. 77:2671-2678. 

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  9. VanRaden, P. M. and Wiggans, G. R. 1991. Derivation, Calculation, and Use of National Animal Model Information. J. Dairy Sci. 74:2737-2746. 

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  10. VanRaden, P. M. 2001. Methods to Combine Estimated Breeding Values Obtained from Separate Sources. J. Dairy Sci. 84(E. Suppl.):E47-E55. 

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  11. Interbull. 2013. Interbull Routine Genetic Evaluation for Dairy Production Traits. http://www-interbull.slu.se/eval/framesida-prod.htm 

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