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문제 정의
- 현재 15개국 이상의 국가에서 유전체 육종가를 이용하여 씨수소를 선발하고 있으며, 세계 각국의 젖소 유전능력평가 컨소시엄인 인터불(interbull)을 통하여 국제적으로 유전체 육종가 추정을 검증하고 있다(Eggen, 2012). 따라서, 호주, 네덜란드 및 미국 등의 낙농 선진국에서의 유전체육종가의 정확도 결과를 살펴보았다. Table 3에서 보는바와 같이, 호주의 경우 3가지 형질에 대해서 혈통정보기반 육종가 보다 유전체육종가의 정확도가 2-17% 높게 추정 되었고, 북미의 경우 2배가량 차이를 보였다.
- 본 총설은 유전체선발방법의 기초, 유전체선발에 있어서 참조축군의 특성 및 한우참조집단을 이용한 유전체육종가추정에 관한 내용을 중심으로 한우에 있어서 유전체선발 방법 적용에 관하여 고찰하였다.
가설 설정
- 두 번째 요인으로 개개의 SNP 마커가 설명하는 전체 유전분산값의 비율에 대해서, 작은 유효집단크기(effective population size; Ne)에서, 전체 유전체상에 독립적으로 존재하는 대립유전자의 수는 매우 적을 것이다(Goddard, 2009). 그 이유는 유효집단크기가 작다는 것은 집단의 연관불평형의 구조가 커지게 되고, 결과적으로 QTL과 연관되어 있는 독립된 염색체 영역의 수가 작아지게 된다.
제안 방법
- 모의실험에 사용된 염색체는 총 3개였고, 각 염색 체당 1M씩 전체 유전체 크기는 3M 였다. 1세대 집단에서, 300,000개의 SNP 마커를 0.001cM 간격으로 배치하였다. de Roos et al(2009)에 제시한대로, 모의실험에서 유효집단의 크기는 100으로 하여 Table 1과 같이 모의실험 자료를 생성하였다.
- Table 2에서 보는바와 같이, 첫 번째 참조집단(Highly related animals; HR)은 집단의 가계구조가 매우 연관되어 있는 집단(relationship; 0.09)으로 적어도 425마리의 후대를 가지고 있는 씨수소(sire)를 선발하여, 그 중 5마리의 씨수소의 후대(n=400)를 무작위 추출하여 집단을 구성하였다. 두 번째 참조집단(Moderated related animals; MR)은 약간 연관된 집단(relationship; 0.
- 4에서 보는바와 같이 한우집단을 대표할 수 있고, 표현형 및 고밀도 스닙칩 유전자형 결정이 완료된 참조집단(large reference population)이 구축되어야 한다. 그 후 참조집단을 이용하여 한우 경제형질에 대한 SNP 마커가 가지고 있는 효과를 추정 할 수 있는 통계모델(statistical model; GBLUP and BayesB)을 개발 하고, 이를 활용한 SNP 마커 효과를 기반으로 예측모델(prediction equation)을 통하여 선발집단의 SNP 마커 유전자형 정보만을 가지고 유전체육종가(GEBV)를 추정하게 된다(Fig. 4). Fig.
- 09)으로 적어도 425마리의 후대를 가지고 있는 씨수소(sire)를 선발하여, 그 중 5마리의 씨수소의 후대(n=400)를 무작위 추출하여 집단을 구성하였다. 두 번째 참조집단(Moderated related animals; MR)은 약간 연관된 집단(relationship; 0.05)으로 무작위 추출된 20 마리의 씨수소의 후대(n=100)를 이용하여 구성하였으며, 세 번째 참조집단(Lowly related animal; LR)은 낮게 연관된 집단(relationship; 0.049)으로 무작위 추출된 40 마리의 씨수소의 후대(n=50)를 이용하여 구성하였다. 마지막으로 무작위 참조집단(Randomly selected animals; RND)으로 2,000마리의 후대를 무작위로 추출하여 구성하였다(relationship; 0.
- 049)으로 무작위 추출된 40 마리의 씨수소의 후대(n=50)를 이용하여 구성하였다. 마지막으로 무작위 참조집단(Randomly selected animals; RND)으로 2,000마리의 후대를 무작위로 추출하여 구성하였다(relationship; 0.048). 그 결과, 참조집단의 평균 혈연관계(average relationship)가 낮을수록 유전체 육종가의 정확도(reliability)는 증가하는 것으로 나타났다.
- 모의실험 자료를 근간으로 3개의 다른 평가 집단(1세대, 2세대 및 3세대)을 구성하였고, 각 평가 집단내에서 3개의 다른 참조집단(n=2,000)을 구축하였다.
- 따라서, 국가단위 한우개량사업, 즉 후대검정사업에서 생산되는 후대검정우 집단이 한우 모집단을 유전적으로 대표할 수 있는 축군 일 것이다. 본 연구에서는 1,000여두의 한우 후대검정우를 참조집단으로 선발하였고, 이들 개체들을 Illumina 50K Beadchip을 이용하여 유전자형 결정을 수행 하였다. 참조집단에 포함된 개체들의 표현형은 국가단위 한우 개량사업의 선발지수에 포함된 등심단면적(eye muscle area; EMA), 등지방두께(back fat thickness; BF), 근내지방도(marbling score; MS), 그리고 도체중(carcass weight; CWT)을 측정치로 하였다.
- Goddard et al(2011)이 제안한 아래의 수식을 이용하여 참조집단 크기에 따른 육종가의 정확도를 분석하였다. 수식은 아래와 같고, 한우에 있어서 유효집단크기, 유전력을 고려하여 시뮬레이션을 수행하였다.
- 본 연구에서는 1,000여두의 한우 후대검정우를 참조집단으로 선발하였고, 이들 개체들을 Illumina 50K Beadchip을 이용하여 유전자형 결정을 수행 하였다. 참조집단에 포함된 개체들의 표현형은 국가단위 한우 개량사업의 선발지수에 포함된 등심단면적(eye muscle area; EMA), 등지방두께(back fat thickness; BF), 근내지방도(marbling score; MS), 그리고 도체중(carcass weight; CWT)을 측정치로 하였다. 한우 참조집단(1,000두)은 씨수소(n=118) 반형매 집단으로 구성되었고, 각 씨수소당 약 10두의 자손으로 구성되어 있다.
- 마지막으로 검정집단 3은 참조집단과 혈연관계가 매우 낮은 236두의 암소를 선발하여 공시 하였다. 한우 참조집단과 3개의 검정집단간의 혈연관계에 따른 추정 유전체육 종가의 정확도를 알아보기 위하여, 혈통을 기반으로 한 BLUP방법과 VanRaden et al (2008)이 제시한 대로 유전자형을 이용하여 genomic relationship matrix(GRM)를 설정하여 REML방법을 이용하여 유전모수를 추정하고, 유전체 육종가를 추정하였다. 추정된 유전체 육종가의 정확도는 아래의 함수식과 같이, REML 분석에서 제시하고 있는 육종가의 표준편차를 이용하여 분석 하였다.
대상 데이터
- Fig. 7에서 보여주는 것과 같이, 유전체육종가의 정확도를 분석하기 위하여, 한우 참조집단(1,000두; 유전자형, 혈통 및 표현형 보유)를 기반으로 유전자형만 보유한 검정집단 1은 한우 참조집단의 개체들의 sire 118두 중 106두를 선발하여 유전체육종가를 추정하였으며, 검정집단 2는 참조집단의 개체 1,000두 중에서 무작위로 176두를 선발하였다. 마지막으로 검정집단 3은 참조집단과 혈연관계가 매우 낮은 236두의 암소를 선발하여 공시 하였다.
- 7에서 보여주는 것과 같이, 유전체육종가의 정확도를 분석하기 위하여, 한우 참조집단(1,000두; 유전자형, 혈통 및 표현형 보유)를 기반으로 유전자형만 보유한 검정집단 1은 한우 참조집단의 개체들의 sire 118두 중 106두를 선발하여 유전체육종가를 추정하였으며, 검정집단 2는 참조집단의 개체 1,000두 중에서 무작위로 176두를 선발하였다. 마지막으로 검정집단 3은 참조집단과 혈연관계가 매우 낮은 236두의 암소를 선발하여 공시 하였다. 한우 참조집단과 3개의 검정집단간의 혈연관계에 따른 추정 유전체육 종가의 정확도를 알아보기 위하여, 혈통을 기반으로 한 BLUP방법과 VanRaden et al (2008)이 제시한 대로 유전자형을 이용하여 genomic relationship matrix(GRM)를 설정하여 REML방법을 이용하여 유전모수를 추정하고, 유전체 육종가를 추정하였다.
- 최근 Pszczola et al(2012)은 모의실험을 통하여 참조집단 내 가계 구조(family structure)가 유전체육종가에 미치는 영향을 분석하였다. 모의실험에 사용된 염색체는 총 3개였고, 각 염색 체당 1M씩 전체 유전체 크기는 3M 였다. 1세대 집단에서, 300,000개의 SNP 마커를 0.
- 참조집단에 포함된 개체들의 표현형은 국가단위 한우 개량사업의 선발지수에 포함된 등심단면적(eye muscle area; EMA), 등지방두께(back fat thickness; BF), 근내지방도(marbling score; MS), 그리고 도체중(carcass weight; CWT)을 측정치로 하였다. 한우 참조집단(1,000두)은 씨수소(n=118) 반형매 집단으로 구성되었고, 각 씨수소당 약 10두의 자손으로 구성되어 있다. Fig.
데이터처리
- 한우 참조집단과 3개의 검정집단간의 혈연관계에 따른 추정 유전체육 종가의 정확도를 알아보기 위하여, 혈통을 기반으로 한 BLUP방법과 VanRaden et al (2008)이 제시한 대로 유전자형을 이용하여 genomic relationship matrix(GRM)를 설정하여 REML방법을 이용하여 유전모수를 추정하고, 유전체 육종가를 추정하였다. 추정된 유전체 육종가의 정확도는 아래의 함수식과 같이, REML 분석에서 제시하고 있는 육종가의 표준편차를 이용하여 분석 하였다.
이론/모형
- Goddard et al(2011)이 제안한 아래의 수식을 이용하여 참조집단 크기에 따른 육종가의 정확도를 분석하였다. 수식은 아래와 같고, 한우에 있어서 유효집단크기, 유전력을 고려하여 시뮬레이션을 수행하였다.
성능/효과
- 한우 참조집단(1,000두)은 씨수소(n=118) 반형매 집단으로 구성되었고, 각 씨수소당 약 10두의 자손으로 구성되어 있다. Fig. 7에서 보는바와 같이, 각 씨수소 가계의 유전적 분지를 확인하기 위하여 Fst(가계의 분화, 유전적 다양성) 분석을 수행한 결과, 대부분의 씨수소는 유전적으로 거리가 있으며, 이들 중 약 20여 씨수소가계는 유전적으로 매우 가까운 집단임을 확인 하였다. 이상적인 참조집단은 가계의 유전적 다양성을 유지하는 것이므로, 본 연구에 활용한 한우 참조집단은 매우 이상적인 참조집단으로 분석 되었다.
- Fig. 9에서 보는바와 같이, 유효집단크기가 100이고 유 전력이 0.5인 경우 참조집단 5,000두에서 정확도가 0.6(60%)을 보였고, 유효집단 크기가 200, 유전력이 0.3인 경우 참조집단 5,000두에서 정확도가 0.4(40%)로 나타났다. 현재, 한우에 있어서 유효집단은 약 100 - 150인점을 감안할 때, 정확도는 50%를 상회할 것으로 분석되었다.
- Table 3에서 보는바와 같이, BayesB와 GBLUP간 정확도는 GBLUP으로 추정한 유전체 육종가에서 약 1%정보 높게 추정되었으며, 근내지방도에서는 GBLUP으로 추정한 유전체 육종가에서 2% 높게 추정 되었다. 현재, 한우 후대 검정사업을 통하여 선발되는 씨수소의 육종가 정확도는 0.
- Table 4에서 보는 바와 같이, 기존 20여 년간 축적되어온 혈통정보 및 표현형 정보를 이용한 전통육종방법으로 선발된 개체들의 정확도에 비해 약 900여두의 참조집단을 이용하여 추정된 유전체 육종가의 정확도가 약간 낮게 분석되었지만, 가축을 선발함에 있어서 얻어지는 연간 유전적 개량량(annual genetic gain)의 관점에서 살펴본다면, 유전체 선발 방법이 매우 효과적임을 알 수 있다(Table 4). 즉, 가축에 있어서 인위적 선발(artificial selection)이 진행되는 집단에서의 유전적 변화에 영향을 미치는 아래의 함수식의 4가지 모수(parameters)를 이용하여 계산 할 수 있다.
- 048). 그 결과, 참조집단의 평균 혈연관계(average relationship)가 낮을수록 유전체 육종가의 정확도(reliability)는 증가하는 것으로 나타났다. 즉, 유전력이 0.
- 반면에, 무작위 집단(RND)에서는 보다 다양한 LD 구조를 포함하고 있고, 여러 가지 다양한 종류의 유전분산을 이용할 수 있어서, 충분한 갯수의 SNP 마커를 이용한다면 가축의 형질의 QTL과 연관된 보다 많은 연관 불평형 정보를 이용할 수 있어 보다 정확한 육종가 추정이 가능할 것이다(Calus et al, 2010; Pszczola et al, 2012). 따라서, Fig. 6에서 보는바와 같이, 유전체선발에 있어서 참조집단의 구조가 유전체 육종가에 미치는 영향은, 참조집단을 구성하고 있는 개체들의 평균 혈연관계는 낮을수록, 그리고 선발을 기다리는 후보 씨수소(juvenile candidate bulls) 집단은 참조집단과 평균 혈연관계가 높을수록 보다 정확한 유전체 육종가 추정이 가능할 것이다.
- Table 3에서 보는바와 같이, 호주의 경우 3가지 형질에 대해서 혈통정보기반 육종가 보다 유전체육종가의 정확도가 2-17% 높게 추정 되었고, 북미의 경우 2배가량 차이를 보였다. 아울러, 네덜란드와 북미의 자료를 합하여 분석한 결과에서도 약 1.7배 이상 높은 결과를 보였다. 호주의 경우, 참조집단의 크기가 다른 두 나라(북미, 네덜란드)보다 월등히 적어 유전체 육종가의 정확도가 상대적으로 낮게 추정되었다(Hayes et al, 2009).
- 유전체선발을 당대검정우에 직접 적용한다는 것을 가정할 때, 연간 얻을 수 있는 유전적 개량량에 대한 간단한 계산은, 선발강도는 기존 전통적 선발방식과 유전체선발방식 공히, 0.8로 설정하였고(40두->20두 선발), 육종가의 정확도는(기존 0.7, 그리고 유전체 0.5)로 설정하였고, 상가적 유전효과의 편차는 두 방법(전통방법 및 유전체)이 동일한 근친도 조절효과가 있다고 가정하고 설정하였으며, 선발간격에 있어서는 기존 한우 씨수소 선발까지 전통방법 5.5년이 소요되나, 서두에서도 가정하였듯이, 당대 검정시유전체 선발을 적용한다면, 약 2.5년이 소요될 것으로 추정하여 계산한 결과, 유전체 선발방법에 있어서 연간 유전적 개량량은 기존 방법보다 약 24% 상회 하는 것으로 분석되었다(Table 5).
- 따라서, 작은 수의 SNP 마커로 형질과 연관된 QTL 효과를 검출해 낼 수 있기 때문이다(Goddard, 2010). 이러한 결과를 종합하여 볼 때, Lee et al(2011)이 보고한 바와 같이, 한우 집단의 연관불평형 정보를 이용한 한우의 유효집단(Ne)의 크기는 약 98두로 젖소의 유효집단의 크기와 매우 유사하게 추정되었다. 아울러, 국가단위 한우 후대검정사업에서 생산되고 있는 씨수소 가계별 후대의 수는 약 10두로, Pszczola et al(2012)이 보고한 대로 후대검정 각 차수별로 무작위적으로 씨수소 가계를 추출하여 큰 참조집단(large reference population)을 구축한다면 향후 유전체선발의 참조집단으로 매우 유용한 집단을 구성 할 수 있을 것이다.
- 7에서 보는바와 같이, 각 씨수소 가계의 유전적 분지를 확인하기 위하여 Fst(가계의 분화, 유전적 다양성) 분석을 수행한 결과, 대부분의 씨수소는 유전적으로 거리가 있으며, 이들 중 약 20여 씨수소가계는 유전적으로 매우 가까운 집단임을 확인 하였다. 이상적인 참조집단은 가계의 유전적 다양성을 유지하는 것이므로, 본 연구에 활용한 한우 참조집단은 매우 이상적인 참조집단으로 분석 되었다. 이러한 씨수소의 가계는 육량 및 육질로 선발되는 씨수소 가계 내에서 새로운 QTL이 가계내에서 발생할 것이며 이러한 QTL 효과와 연관되어 있는 다양한 연관불평형(LD) 구조를 가지고 있을 것으로 사료된다.
- 그 결과, 참조집단의 평균 혈연관계(average relationship)가 낮을수록 유전체 육종가의 정확도(reliability)는 증가하는 것으로 나타났다. 즉, 유전력이 0.3인 형질에 대해서, 매우 연관된 집단 (HR)에서는 정확도가 0.47이었으나, 무작위 집단(RND)에서는 0.6으로 나타났다. 이러한 이유는 HR 집단에서와 같이 유전적으로 매우 가까운 개체들은 연관 불평형(LD) 구조가 비슷하여 같은 종류의 유전분산만을 설명할 것이다.
- 특히, SNP 마커의 효과를 추정하는 참조집단의 크기 및 참조집단내 유전적 구조는 추정된 유전체육종가의 정확도에 영향을 주는 매우 중요한 요소이다. 참조집단내 개체의 혈연관계가 높을수록 추정된 육종가의 정확도는 낮았고, 참조집단내 개체의 혈연관계가 낮을수록(무작위 집단) 추정된 유전체 육종가의 정확도가 증가 하였다. 한우에 있어서 근내지방도 및 근내지방함량의 유전체 육종가 추정에 있어서, 참조집단의 구조는 국가단위 후대검정우 사업을 통하여 매년 생산되는 씨수소 가계를 중심으로 매우 다양한 반 형매 집단으로 구성 하였으며(개체간 평균혈연관계, 0.
- 참조집단내 개체의 혈연관계가 높을수록 추정된 육종가의 정확도는 낮았고, 참조집단내 개체의 혈연관계가 낮을수록(무작위 집단) 추정된 유전체 육종가의 정확도가 증가 하였다. 한우에 있어서 근내지방도 및 근내지방함량의 유전체 육종가 추정에 있어서, 참조집단의 구조는 국가단위 후대검정우 사업을 통하여 매년 생산되는 씨수소 가계를 중심으로 매우 다양한 반 형매 집단으로 구성 하였으며(개체간 평균혈연관계, 0.057), 이를 활용한 유전체 육종가 추정결과, 근내지방도 에서 GBLUP 과 BayesB에서 각각 0.60 및 0.62였으며, 근내지방함량에 있어서 GBLUP과 BayesB에서 각각 0.50 및 0.51로 두 방법간 약 2% 및 1%의 차이를 보였다. 향후, 한우의 참조집단의 크기를 지속적으로 증가시킴으로 한우도체형질의 유전체 육종가의 정확도를 향상 할 수 있을 것으로 사료 된다.
- 현재, 한우 후대 검정사업을 통하여 선발되는 씨수소의 육종가 정확도는 0.65 - 0.8 사이로 본 연구에서 추정한 유전체 육종가의 정확도가 약간 낮게 추정 되었지만, 향후, 한우 참조집단의 크기가 커지고, 참조집단의 유전적 조성 등을 개선한다면 유전체 육종가의 정확도 역시 0.7 – 0.8정도로 개선 될 것이다.
- 4(40%)로 나타났다. 현재, 한우에 있어서 유효집단은 약 100 - 150인점을 감안할 때, 정확도는 50%를 상회할 것으로 분석되었다.
후속연구
- 이러한 씨수소의 가계는 육량 및 육질로 선발되는 씨수소 가계 내에서 새로운 QTL이 가계내에서 발생할 것이며 이러한 QTL 효과와 연관되어 있는 다양한 연관불평형(LD) 구조를 가지고 있을 것으로 사료된다. 따라서, 고밀도 SNP 마커 정보를 이용한다면, 한우 씨수소 가계 내에서 존재하고 있는 다양한 QTL 효과를 검출 할 수 있는 가능성이 증가하여 보다 정확한 유전체 육종가 추정이 가능할 것이다.
- 이러한 단점을 개선하기 위하여 구미 축산 선진국에서는 가축의 유전체정보(Genomic information)를 이용한 가축 조기선발기술(유전체선발; Genomic selection)을 개발하여 가축이 태어나자마자, 즉 송아지 때 유전자정보만을 이용하여 유전능력을 평가하고 선발에 이용하고자 많은 노력을 기울이고 있다(Meuwissen et al, 2001; VanRaden et al, 2008). 따라서, 기 개발된 유전체선발을 한우개량에 적용하기 위해서는 한우집단에서 경제형질(도체중, 등심단면적, 근내지방도 및 등지방두께)에 대한 유전자효과를 정확히 검출하여 유전체육종가(GEBV)를 정확히 추정하기 위한 유전모수(Genetic parameters)를 파악하기 위한 한우집단의 구조 및 생산체계가 매우 중요할 것이다.
- 이러한 이유는 HR 집단에서와 같이 유전적으로 매우 가까운 개체들은 연관 불평형(LD) 구조가 비슷하여 같은 종류의 유전분산만을 설명할 것이다. 반면에, 무작위 집단(RND)에서는 보다 다양한 LD 구조를 포함하고 있고, 여러 가지 다양한 종류의 유전분산을 이용할 수 있어서, 충분한 갯수의 SNP 마커를 이용한다면 가축의 형질의 QTL과 연관된 보다 많은 연관 불평형 정보를 이용할 수 있어 보다 정확한 육종가 추정이 가능할 것이다(Calus et al, 2010; Pszczola et al, 2012). 따라서, Fig.
- 이러한 결과를 종합하여 볼 때, Lee et al(2011)이 보고한 바와 같이, 한우 집단의 연관불평형 정보를 이용한 한우의 유효집단(Ne)의 크기는 약 98두로 젖소의 유효집단의 크기와 매우 유사하게 추정되었다. 아울러, 국가단위 한우 후대검정사업에서 생산되고 있는 씨수소 가계별 후대의 수는 약 10두로, Pszczola et al(2012)이 보고한 대로 후대검정 각 차수별로 무작위적으로 씨수소 가계를 추출하여 큰 참조집단(large reference population)을 구축한다면 향후 유전체선발의 참조집단으로 매우 유용한 집단을 구성 할 수 있을 것이다.
- 2에서 보는바와 같이, 한우개량 및 생산 체계는 국가 단위 한우 후대검정사업을 통하여 선발된 우량 씨수소(KPN) 가계의 다양한 반 형매(Large half-sib) 집단으로 규정할 수 있을 것이다. 이러한 씨수소 가계의 반 형매 구조는 한우 집단에서 다양한 연관 불평형 구조를 갖게 함으로 고밀도 SNP 마커를 이용한다면, 경제형질연관 유전자 검출을 가능하게 함으로 추정육종가의 정확도를 향상 시킬수 있을 것이다.
- 이상적인 참조집단은 가계의 유전적 다양성을 유지하는 것이므로, 본 연구에 활용한 한우 참조집단은 매우 이상적인 참조집단으로 분석 되었다. 이러한 씨수소의 가계는 육량 및 육질로 선발되는 씨수소 가계 내에서 새로운 QTL이 가계내에서 발생할 것이며 이러한 QTL 효과와 연관되어 있는 다양한 연관불평형(LD) 구조를 가지고 있을 것으로 사료된다. 따라서, 고밀도 SNP 마커 정보를 이용한다면, 한우 씨수소 가계 내에서 존재하고 있는 다양한 QTL 효과를 검출 할 수 있는 가능성이 증가하여 보다 정확한 유전체 육종가 추정이 가능할 것이다.
- 한우에 있어서 유전체선발 적용은 잘 짜여진 국가단위 사업의 당대검정우 선발(pre-screening)에 적용하여 큰 효과를 볼 수 있을 것으로 생각된다. 현행, 혈통지수로 당대검정우를 선발하는 방식에서 유전체정보를 활용하여 좀 더 큰 유전자 풀에서 당대검정우를 선발한다면, 기존의 정확도보다 향상된 정확도와 선발강도를 유지하면서 후대검정을 수행할 수 있을 것으로 생각되며, 아울러, 후대검정에서 매년 생산되는 검정우(표현형, 혈통보유)를 참조집단으로 유전자형 결정하여, 기존 BLUP과 GBLUP 방법을 비교하고 검증할 수 있는 시스템을 확립할 수 있을 것이다.
- 51로 두 방법간 약 2% 및 1%의 차이를 보였다. 향후, 한우의 참조집단의 크기를 지속적으로 증가시킴으로 한우도체형질의 유전체 육종가의 정확도를 향상 할 수 있을 것으로 사료 된다.
- 한우에 있어서 유전체선발 적용은 잘 짜여진 국가단위 사업의 당대검정우 선발(pre-screening)에 적용하여 큰 효과를 볼 수 있을 것으로 생각된다. 현행, 혈통지수로 당대검정우를 선발하는 방식에서 유전체정보를 활용하여 좀 더 큰 유전자 풀에서 당대검정우를 선발한다면, 기존의 정확도보다 향상된 정확도와 선발강도를 유지하면서 후대검정을 수행할 수 있을 것으로 생각되며, 아울러, 후대검정에서 매년 생산되는 검정우(표현형, 혈통보유)를 참조집단으로 유전자형 결정하여, 기존 BLUP과 GBLUP 방법을 비교하고 검증할 수 있는 시스템을 확립할 수 있을 것이다.
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