딸기 흰가루병 저항성 계통 선발을 위한 분자마커 개발 Development of Cleaved Amplified Polymorphic Sequence (CAPS) Marker for Selecting Powdery Mildew-Resistance Line in Strawberry (Fragaria×ananassa Duchesne)원문보기
딸기 흰가루병은 Podosphaera aphanis에 의해 발병되며 수확기에 가장 큰 피해를 주는 병으로 현재 유황, 농약으로 주로 방제 되고 있는 실정이다. 본 연구에서는 딸기 흰가루병 저항성 품종 육성을 위한 흰가루병 저항성 특이마커 개발로 내병성 육종효율을 높이고자 하였다. 흰가루병 저항성 계통 선발을 위한 분자마커를 개발하기 위해 아키히메${\times}$설향 집단을 대상으로 자가수분을 통해 후대 양성 후 병저항성을 검정하였다. 마커분석은 RAPD primer 200 세트 중 OPE10 331bp에서부터 흰가루병 저항성 특이 마커 선발하였다. 흰가루병 저항성 특이밴드만 선발하기 위하여 클로닝 후 유전자정보 분석하여 SP1F/R의 Primer를 제작하였다. 그러나 SP1F/R을 이용하여 PCR한 결과 저항성, 감수성간에 다형성이 확인되지 않아 염기서열을 정렬한 후 SNP, In/del의 다형성 유무를 확인한 결과 6개의 SNP를 확인하였다. 이들 PCR 산물을 해당 사이트와 연관된 제한효소로 절단한 결과 그 중 Eae I(Y/GGCCR)의 절단으로 231bp 위치에서 저항성과 감수성간의 다형성을 확인함으로써 흰가루병 저항성 계통선발을 위한 분자마커를 선발하였다. 이러한 과정을 통해 딸기 흰가루병 저항성 품종 육성을 위한 MAS(marker assisted selection) 체계 확립으로 내병성 육종효율 증진에 기여를 할 수 있을 것으로 기대된다.
딸기 흰가루병은 Podosphaera aphanis에 의해 발병되며 수확기에 가장 큰 피해를 주는 병으로 현재 유황, 농약으로 주로 방제 되고 있는 실정이다. 본 연구에서는 딸기 흰가루병 저항성 품종 육성을 위한 흰가루병 저항성 특이마커 개발로 내병성 육종효율을 높이고자 하였다. 흰가루병 저항성 계통 선발을 위한 분자마커를 개발하기 위해 아키히메${\times}$설향 집단을 대상으로 자가수분을 통해 후대 양성 후 병저항성을 검정하였다. 마커분석은 RAPD primer 200 세트 중 OPE10 331bp에서부터 흰가루병 저항성 특이 마커 선발하였다. 흰가루병 저항성 특이밴드만 선발하기 위하여 클로닝 후 유전자정보 분석하여 SP1F/R의 Primer를 제작하였다. 그러나 SP1F/R을 이용하여 PCR한 결과 저항성, 감수성간에 다형성이 확인되지 않아 염기서열을 정렬한 후 SNP, In/del의 다형성 유무를 확인한 결과 6개의 SNP를 확인하였다. 이들 PCR 산물을 해당 사이트와 연관된 제한효소로 절단한 결과 그 중 Eae I(Y/GGCCR)의 절단으로 231bp 위치에서 저항성과 감수성간의 다형성을 확인함으로써 흰가루병 저항성 계통선발을 위한 분자마커를 선발하였다. 이러한 과정을 통해 딸기 흰가루병 저항성 품종 육성을 위한 MAS(marker assisted selection) 체계 확립으로 내병성 육종효율 증진에 기여를 할 수 있을 것으로 기대된다.
Powdery mildew (PM) caused by Podosphaera aphanis is a major disease that can result in significant yield losses in strawberry (Fragaria ${\times}$ ananassa Duchesne). For preventing PM, pesticides are usually applied in strawberry. In this study, molecular markers were developed to incre...
Powdery mildew (PM) caused by Podosphaera aphanis is a major disease that can result in significant yield losses in strawberry (Fragaria ${\times}$ ananassa Duchesne). For preventing PM, pesticides are usually applied in strawberry. In this study, molecular markers were developed to increase breeding efficiency of PM-resistance cultivars by marker-assisted selection (MAS). An $F_2$ population derived from a cross between PM-resistance 'Seolhyang' and PM-susceptibility 'Akihime' was evaluated for disease resistance to PM and RAPD (random amplification of polymorphic DNA)-BSA (bulked segregant analysis). Among 200 RAPD primers tested, OPE10 primer amplified a 311bp-band present in with 331bp. Sequence alignment performed for searching polymorphisms and six single nucleotide polymorphism (SNP) were found in amplified regions. To develop polymorphic marker for distinguishing between resistant and susceptible, RAPD was converted to cleaved amplified polymorphic sequence (CAPS) marker. Among restriction enzymes associated with six SNPs, Eae I (Y/GGCCR) was successfully digested to 231bp in susceptible. The results suggest that the selected CAPS marker could be used for increasing efficiency of selecting powdery mildew resistant strawberry in breeding system.
Powdery mildew (PM) caused by Podosphaera aphanis is a major disease that can result in significant yield losses in strawberry (Fragaria ${\times}$ ananassa Duchesne). For preventing PM, pesticides are usually applied in strawberry. In this study, molecular markers were developed to increase breeding efficiency of PM-resistance cultivars by marker-assisted selection (MAS). An $F_2$ population derived from a cross between PM-resistance 'Seolhyang' and PM-susceptibility 'Akihime' was evaluated for disease resistance to PM and RAPD (random amplification of polymorphic DNA)-BSA (bulked segregant analysis). Among 200 RAPD primers tested, OPE10 primer amplified a 311bp-band present in with 331bp. Sequence alignment performed for searching polymorphisms and six single nucleotide polymorphism (SNP) were found in amplified regions. To develop polymorphic marker for distinguishing between resistant and susceptible, RAPD was converted to cleaved amplified polymorphic sequence (CAPS) marker. Among restriction enzymes associated with six SNPs, Eae I (Y/GGCCR) was successfully digested to 231bp in susceptible. The results suggest that the selected CAPS marker could be used for increasing efficiency of selecting powdery mildew resistant strawberry in breeding system.
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문제 정의
본 연구는 딸기 흰가루병 저항성 품종 육성을 위한 흰가루병 저항성 특이적 마커 개발로 육종 초기세대에 선발함으로써 기존의 육종기술과 같이 접목을 통해 내병성 육종효율을 높이고자 하였다.
제안 방법
‘설향’과 ‘아끼히메’, 그리고 이들 간 F2 128 개체를 대상으로 유묘기에 병원균을 접종 후 흰가루병 저항성 검정을 수행하였다.
‘설향’과 저항성 F1 6개체로부터 흰가루병 저항성과 연관된 것으로 추정되는 OPE10-331bp 단편을 클로닝 후 염기서열을 분석하였다.
‘아끼히메’ × ‘설향’의 F1개체를 대상으로 흰가루병 저항성 검정 결과 저항성(DSI = 0)과 감수성(DSI = 4) 각각 6개체씩 선발하여 genomic DNA를 추출한 후 bulking 하였다.
저항성 및 감수성 bulked DNA 샘플에 대해 총 200종의 Operon RAPD primer를 검정한 결과 총 46개 primer들에서 샘플 간 다형성을 확인하였다. 46개의 primer들을 이용하여 저항성과 감수성 개체를 pooling하여 분석한 결과 이 중 primer OPE10에서 저항성 bulked DNA 샘플에서 특이적으로 증폭되는 약 331bp 크기의 PCR band(OPE10-331bp)를 확인하였으며 이를 대상으로 공우성 마커전환을 수행하였다(Fig. 3). 딸기의 RAPD분석 결과 부모본 및 bulked DNA sample간 다형성 밴드의 출현빈도가 낮았는데(23%), 이는 ‘아끼히메’와 ‘설향’을 비롯하여 현재 재배되고 있는 품종들 대부분이 한정된 재배종간 교배선발 되어졌기 때문에 유전적 배경이 매우 좁고 다양성이 크지 않기 때문인 것으로 추정된다.
PCR 조건은 95°C에서 5분간 반응시키고, 95°C에서 30초, 55°C에서 30초, 72°C에서 1분간 35회 반복하고 72°C에서 10분간 처리하였다. Agarose gel 상에서 단편을 확인 후 염기서열을 위에서 기술한 바와 같이 분석하였다. CAPS 마커 개발은 저항성, 감수성 개체간 분석된 염기서열의 비교 및 SNP, In/Del 다형성 유무는 ClustalW(Chenna et al.
BSA를 통해 저항성과 감수성 집단에서 다형성을 보이는 RAPD 단편을 찾아내고 이를 agarose gel에서 GeneAll Expin Gel SV kit(General Biosystem, Seoul, Korea)을 사용하여 회수였다. 회수된 DNA 단편은 cloning 하기 위해 pGEM-T easy Vector(Promega, Madison, WI, USA)에 insert로 ligation하고 E.
부모본과 F1개체들의 DNA 추출은 DNeasy plant mini kit(Qiagen, Valencia, CA, USA)을 이용하여 수행하였다. Bulked segregant analysis(BSA)를 위해 흰가루병 검정결과 저항성(DSI = 0) 및 감수성(DSI = 4) 각각 6 개체에 대한 DNA sample을 bulking 하여 RAPD 분석에 사용하였다. RAPD 분석을 위한 PCR은 template DNA 40ng, RAPD 10-mer OPERON primer 1.
CAPS 마커 SP1-Eae I의 흰가루 저항성 연관과 MAS 적용 가능성을 검정하기 위해 F2 집단에서 임의로 선발한 36개체를 대상으로 유전자형을 분석하였다. F1 개체의 마커검정 결과와 마찬가지로 331bp의 밴드는 저항성, 감수성 모두에서 강하게 나타났으며, 흰가루 감수성 특이적 마커인 231bp 밴드는 개체에 따라 강약의 차이가 관찰 되었다(Fig.
OPE10-331bp 단편만을 특이적으로 증폭하는 SCAR 마커를 개발하기 위하여 OPE10 primer 염기서열로부터 3’ 방향으로 10bp 연장된 primer set(SP1F/R)을 제작하였다(Table 1 and Fig. 4).
RAPD 분석을 위한 PCR은 template DNA 40ng, RAPD 10-mer OPERON primer 1.25μM, dNTP 0.2mM, MgCl2 2.5mM, Taq DNA polymerase 1 unit(Solgent, Deageon, Korea)으로 구성된 PCR mixture 총 20μL로 수행하였다(Je et al., 2009).
SCAR 마커의 PCR은 template DNA 40ng, forward와 reverse primer 각각 1.25μM, dNTP 0.2mM, MgCl2 2.5mM, Taq DNA polymerase 1 unit(Solgent, Korea)를 총 20μL 반응액으로 하여 수행하였다.
Sequence alignment of PCR fragments amplified by a SCAR marker SP1F/R from powdery mildew(PM)-resistant ‘Seolhyang’ and six F1 plants (7 lines from the top) and PM-susceptible ‘A kihime’ and six F1 plants (7 lines from the bottom) used for bulked segregant analysis (BSA) in strawberry (Fragaria × ananassa Duchesne).
개발된 CAPS 마커의 분석은 PCR product 5μL를 이용하여 총 10μL의 반응액에 0.5U의 제한효소를 처리한 후 1.5% Agarose gel상에서 확인하였다.
2010년 2월에 각 F1 개체들을 자가 수분하여 총 450 개체의 F2 집단을 양성하였다. 그 중 자식약세 현상 및 발아율이 낮은 개체를 제외한 128 개체를 선발 후 흰가루병 저항성 검정시험을 수행하였다.
발병 조건은 식물생장상에서 병발생율을 높이기 위해서 온도는 주간(22 ± 2°C), 야간(15 ± 2°C)에 따라 변온을 주었으며, 습도는 포자의 발아율을 높이기 위해 고습(80 ± 10%)으로 1일간 유지시키고 이후는 40 ± 10%으로 유지하였으며, 광도는 50,000lux로 일정 환경조건을 유지하였다.
1). 발병조사는 주당 발병 엽면적률(%)을 기준으로 발병지수(DSI ; disease severity index)를 0에서 4까지 5단계로 다음과 같이 설정하여 수행하였다; 0 = 병징이 전혀 나타나지 않음, 1 = 잎 표면적의 0.1-5% 발병, 2 = 5.1-20% 발병, 3 = 20.1-40% 발병, 4 = 40.1%.
부모본과 F1개체들의 DNA 추출은 DNeasy plant mini kit(Qiagen, Valencia, CA, USA)을 이용하여 수행하였다. Bulked segregant analysis(BSA)를 위해 흰가루병 검정결과 저항성(DSI = 0) 및 감수성(DSI = 4) 각각 6 개체에 대한 DNA sample을 bulking 하여 RAPD 분석에 사용하였다.
4). 이 중 제한효소 Eae I의 인식서열(Y/GGCCR)에 위치한 SNP를 타겟으로 저항성 계통(TGGCAG)에서는 Eae I 처리시 절단되지 않은 316bp 크기의 밴드가 관찰되는 반면, 감수성 계통(T/GGCCG)에서는 절단되어 231bp와 85bp 크기의 두 밴드가 나타나도록 CAPS 마커 SP1-Eae I을 제작하였다(Fig. 5). 부모본 계통 및 BSA에 사용된 12개의 F1 개체에 SP1-Eae I 마커를 검정한 결과, 예상과는 다르게 모든 개체에서 316bp의 밴드가 확인되었으며, 감수성 개체에서는 231bp와 예상치 못한 150bp 정도 크기의 밴드가 추가적으로 관찰되었다.
회수된 vector의 insert DNA에 대한 염기서열을 분석은 Macrogen(Seoul, Korea)에 의뢰하였다. 이와 같이 선발된 RAPD 마커의 염기서열분석 결과를 토대로 하여 RAPD primer의 10개 염기를 포함하거나 포함하지 않는 20-mer 정도 크기의 SCAR 마커 primer를 Primer3(http://frodo.wi.mit.edu/primer3)를 이용하여 제작하였다. SCAR 마커의 PCR은 template DNA 40ng, forward와 reverse primer 각각 1.
발병 조건은 식물생장상에서 병발생율을 높이기 위해서 온도는 주간(22 ± 2°C), 야간(15 ± 2°C)에 따라 변온을 주었으며, 습도는 포자의 발아율을 높이기 위해 고습(80 ± 10%)으로 1일간 유지시키고 이후는 40 ± 10%으로 유지하였으며, 광도는 50,000lux로 일정 환경조건을 유지하였다. 접종방법으로는 잎을 포개어 접착한 후 감염시키는 압착접종법과 균을 붓으로 떨어뜨리거나 묻혀 전염시키는 타락접종법으로 접종 후 5주간 1주일간격으로 발병조사를 수행하였다(Fig. 1). 발병조사는 주당 발병 엽면적률(%)을 기준으로 발병지수(DSI ; disease severity index)를 0에서 4까지 5단계로 다음과 같이 설정하여 수행하였다; 0 = 병징이 전혀 나타나지 않음, 1 = 잎 표면적의 0.
회수된 DNA 단편은 cloning 하기 위해 pGEM-T easy Vector(Promega, Madison, WI, USA)에 insert로 ligation하고 E. coli 균주(DH5α)로 transformation 한 후, LB 배지에 증식 후 GeneAll Exprep plasmid SV kit(General Biosystem, Seoul, Korea)으로 miniprep 하여 recombinant vector를 회수하였다.
coli 균주(DH5α)로 transformation 한 후, LB 배지에 증식 후 GeneAll Exprep plasmid SV kit(General Biosystem, Seoul, Korea)으로 miniprep 하여 recombinant vector를 회수하였다. 회수된 vector의 insert DNA에 대한 염기서열을 분석은 Macrogen(Seoul, Korea)에 의뢰하였다. 이와 같이 선발된 RAPD 마커의 염기서열분석 결과를 토대로 하여 RAPD primer의 10개 염기를 포함하거나 포함하지 않는 20-mer 정도 크기의 SCAR 마커 primer를 Primer3(http://frodo.
흰가루병 저항성 계통 선발을 위한 분자마커를 개발하기 위해 흰가루병에 저항성을 가지는 ‘설향’(Fragaria × ananassa cv. Seolhyang, 2n = 8x = 56)과 감수성을 가지는 ‘아끼히메’(Fragaria × ananassa cv. Akihime, 2n = 8x = 56)를 교배하여 F1 66 개체를 양성하였다.
대상 데이터
Akihime, 2n = 8x = 56)를 교배하여 F1 66 개체를 양성하였다. 2010년 2월에 각 F1 개체들을 자가 수분하여 총 450 개체의 F2 집단을 양성하였다. 그 중 자식약세 현상 및 발아율이 낮은 개체를 제외한 128 개체를 선발 후 흰가루병 저항성 검정시험을 수행하였다.
병리검정을 위한 흰가루 병원균은 경남 진주지역을 중심으로 딸기재배포장에서 자연발병한 병원균을 수집하여 사용하였으며, 2010년 5월에 파종한 F2 집단의 실생은 육묘 포트(32cm × 54cm, 24공)에 이식하여 본엽 6-10매 정도의 생육단계까지 하우스 내에서 키운 후 식물생장상 내에서 발병시켰다.
이론/모형
Agarose gel 상에서 단편을 확인 후 염기서열을 위에서 기술한 바와 같이 분석하였다. CAPS 마커 개발은 저항성, 감수성 개체간 분석된 염기서열의 비교 및 SNP, In/Del 다형성 유무는 ClustalW(Chenna et al., 2003)을 이용하여 확인하였다. 개발된 CAPS 마커의 분석은 PCR product 5μL를 이용하여 총 10μL의 반응액에 0.
성능/효과
집단에서 임의로 선발한 36개체를 대상으로 유전자형을 분석하였다. F1 개체의 마커검정 결과와 마찬가지로 331bp의 밴드는 저항성, 감수성 모두에서 강하게 나타났으며, 흰가루 감수성 특이적 마커인 231bp 밴드는 개체에 따라 강약의 차이가 관찰 되었다(Fig. 6). 이는 위에서 설명된 이형접합성과 gene dosage의 영향과 동일한 맥락으로 설명 가능할 것으로 사료된다.
Tested 36 F2 plants were derived from PM-susceptible cultivar ‘Akihime’ × PM-resistant cultivar ‘Seolhyang’ in strawberry (Fragaria × ananassa Duchesne).
감수성(DSI > 1) 21 개체는 모두 이형접합(H) 또는 감수성(S)의 마커형을 보여, SP1-Eae I 마커를 통해 저항성(R) /중도저항성(H), 감수성(S) 판별이 가능함을 확인하였다(Table 2).
6개체로부터 흰가루병 저항성과 연관된 것으로 추정되는 OPE10-331bp 단편을 클로닝 후 염기서열을 분석하였다. 그 결과 모든 클론으로부터 331bp 길이의 동일 염기서열이 확인 되었다. OPE-331bp의 염기서열 정보를 NCBI BlastN에서 sequence similarity를 본 결과 2배체 딸기인 Fragaria vesca subsp.
그 결과, ‘설향’과 ‘아끼히메’는 흰가루병에 각각 높은 수준의 저항성(DSI = 0)과 감수성(DSI = 4)를 지님을 확인하였으며, 주당 발병 엽면적률(%) 분포가 10-80%(DSI = 0-4)로 연속변이의 정규분포양상을 보여(Fig. 1, 2), 본 연구에서는 흰가루 저항성이 다수의 유전자에 의해 조절되는 양적형질임을 확인할 수 있었다.
따라서, 저항성, 감수성 개체간의 단일 염기서열 변이(single nucleotide polymorphism, SNP)를 확인하기 위하여 ‘아끼히메’와 흰가루 감수성 F1 6 개체로부터 SCAR 마커의 증폭산물을 클로닝하여 저항성 개체의 염기서열과 비교 분석한 결과, 두 집단 간에 총 6개의 SNP가 존재하였다. 그 중 133bp(T/C), 231bp(A/C), 272bp(A/T) 위치의 SNP에서 각각 제한효소 Mnl I, Eae I, Sal I의 처리로 CAPS 마커 전환이 가능함을 확인하였다(Fig. 4). 이 중 제한효소 Eae I의 인식서열(Y/GGCCR)에 위치한 SNP를 타겟으로 저항성 계통(TGGCAG)에서는 Eae I 처리시 절단되지 않은 316bp 크기의 밴드가 관찰되는 반면, 감수성 계통(T/GGCCG)에서는 절단되어 231bp와 85bp 크기의 두 밴드가 나타나도록 CAPS 마커 SP1-Eae I을 제작하였다(Fig.
따라서, 저항성, 감수성 개체간의 단일 염기서열 변이(single nucleotide polymorphism, SNP)를 확인하기 위하여 ‘아끼히메’와 흰가루 감수성 F1 6 개체로부터 SCAR 마커의 증폭산물을 클로닝하여 저항성 개체의 염기서열과 비교 분석한 결과, 두 집단 간에 총 6개의 SNP가 존재하였다.
5). 부모본 계통 및 BSA에 사용된 12개의 F1 개체에 SP1-Eae I 마커를 검정한 결과, 예상과는 다르게 모든 개체에서 316bp의 밴드가 확인되었으며, 감수성 개체에서는 231bp와 예상치 못한 150bp 정도 크기의 밴드가 추가적으로 관찰되었다. 85bp 절편은 매우 작은 단편으로 Agarose gel 상에서 확인이 어려웠다.
‘아끼히메’ × ‘설향’의 F1개체를 대상으로 흰가루병 저항성 검정 결과 저항성(DSI = 0)과 감수성(DSI = 4) 각각 6개체씩 선발하여 genomic DNA를 추출한 후 bulking 하였다. 저항성 및 감수성 bulked DNA 샘플에 대해 총 200종의 Operon RAPD primer를 검정한 결과 총 46개 primer들에서 샘플 간 다형성을 확인하였다. 46개의 primer들을 이용하여 저항성과 감수성 개체를 pooling하여 분석한 결과 이 중 primer OPE10에서 저항성 bulked DNA 샘플에서 특이적으로 증폭되는 약 331bp 크기의 PCR band(OPE10-331bp)를 확인하였으며 이를 대상으로 공우성 마커전환을 수행하였다(Fig.
제작된 SCAR 마커(SP1F/R primer set)을 이용하여 ‘설향’과 ‘아끼히메’, 흰가루 저항성 F1 개체 및 감수성 F1 개체들을 대상으로 PCR 검정한 결과 316bp 크기의 DNA 단편을 얻었으나 단편의 크기 다형성은 확인되지 않았다.
이는 위에서 설명된 이형접합성과 gene dosage의 영향과 동일한 맥락으로 설명 가능할 것으로 사료된다. 흰가루병 저항성 표현형과 마커형을 비교한 결과 높은 저항성(DSI=0)을 보이는 F2 10 개체는 모두 마커형이 저항성(R)으로 나타났으나, 중도저항성(DSI = 1) 5 개체 중 3 개체가 저항성의 마커형이, 2 개체는 이형접합(H) 또는 감수성(S)으로 나타났다. 감수성(DSI > 1) 21 개체는 모두 이형접합(H) 또는 감수성(S)의 마커형을 보여, SP1-Eae I 마커를 통해 저항성(R) /중도저항성(H), 감수성(S) 판별이 가능함을 확인하였다(Table 2).
후속연구
따라서, 본 연구에서 개발된 CAPS 마커는 비록 우성의 마커 특성을 지니고 있지만, ‘아끼히메’ × ‘설향’ 후대집단에서 흰가루병 저항성 계통 선발을 위한 분자마커로 활용될 가능성이 기대된다, 하지만, 보다 폭넓은 육성집단의 MAS에 적용하기 위해서는 다양한 계통 및 품종에서의 본 마커의 다형성 확인이 요구되며, 향후 공우성의 마커로 전환할 수 있는 추가적인 연구가 필요하다.
딸기와 동일한 장미과(Rosaceae)작물인 사과에서도 흰가루병 저항성은 다수의 유전자좌와 유전자간 상호작용에 의해 영향을 받는 복합적 유전형질로 보여진다고 보고되었다(James, 2004). 하지만, 현재까지는 딸기 흰가루병 저항성의 유전양상에 대한 연구가 충분히 진행되지 않은 상황이며, 정확한 흰가루병 저항성의 유전적 기작을 파악하고 관여 유전자를 찾아내기 위해서는 보다 다양한 교배집단에서의 표현형 분석이 필요할 것이다.
질의응답
핵심어
질문
논문에서 추출한 답변
RAPD마커의 장단점은?
MAS를 이용한 병 저항성 계통 선발방법은 기존 생물검정법으로는 어려운 동형접합자와 이형접합자의 식별, 생육후기 형질의 발현을 탐색할 수 있으며, 농업적으로 중요한 형질의 조기선발이 가능함에 따라 육종 연한과 비용을 효율적으로 감소 시킬 수 있는 기술이다. 분자마커로는 PCR 기법을 이용한 RAPD(Ramdom Amplified Polymorpic DNA)는 가격이 저렴하고 분석이 간편하지만 재현성이 떨어지며, PCR조건에 민감하므로 MAS 적용을 위해 공우성 SCAR(Sequence Characterized Amplified Region) 마커로 전환이 필요하다(Paran et al., 1993).
딸기 흰가루병이란?
딸기 흰가루병은 Podosphaera aphanis에 의해 발병되며 수확기에 가장 큰 피해를 주는 병으로 현재 유황, 농약으로 주로 방제 되고 있는 실정이다. 본 연구에서는 딸기 흰가루병 저항성 품종 육성을 위한 흰가루병 저항성 특이마커 개발로 내병성 육종효율을 높이고자 하였다.
딸기 흰가루병 방제를 위한 효율적인 방법은?
딸기 흰가루병 방제를 위한 효율적인 방법으로는 저항성 품종을 육성하는 것이며, 저항성 계통선발의 정확성과 효율성을 높이기 위해 분자마커 개발이 시도되고 있다(Korbin, 2011; Lifshitz et al., 2008; Yamamoto et al.
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