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NTIS 바로가기Research in plant disease = 식물병연구, v.22 no.3, 2016년, pp.178 - 183
배대현 (경북대학교 응용생명과학부) , 박충열 (경북대학교 응용생명과학부) , 김봉섭 (경북대학교 응용생명과학부) , 이영훈 (농촌진흥청 국립식량과학원 남부작물부 생산기술개발과) , 윤영남 (농촌진흥청 국립식량과학원 남부작물부 생산기술개발과) , 강항원 (농촌진흥청 국립식량과학원 남부작물부 생산기술개발과) , 오종희 (경북대학교 응용생명과학부) , 이수헌 (경북대학교 응용생명과학부)
Soybean yellow mottle mosaic virus (SYMMV) is a new emerging plant virus detected in soybean (Glycine max) in Korea. Reverse transcription loop-mediated isothermal amplification (RT-LAMP) assay for rapid detection of SYMMV has been developed. In this study, we have designed primers (SYMM-F3/B3/FIP/B...
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핵심어 | 질문 | 논문에서 추출한 답변 |
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. SYMMV의 게놈이란? | 이 중에서, Kim (2006)에 의해서 최초 보고된 콩황화모틀모자이크바이러스(Soybean yellow mottle mosaic virus, SYMMV)는 Carmovirus속, Tombusviridae과에 속하는 바이러스이다. SYMMV의 게놈은 양성-극성 외가닥 RNA (positive sense single stranded RNA) 바이러스로 여섯 개의 열린 해독틀(open reading frame)과 비번역영역(untranslated region)으로 구성되어 있다(Nam 등, 2009). SYMMV는 콩, 돌콩(Glycine soja), 새팥(Vigna angularis var. | |
현장에서 전기영동없이 증폭산물의 반응유무를 육안으로 간편하게 확인 가능한 이유는? | RT-LAMP는 RT-PCR과 달리 등온에서 증폭이 가능하고 시간을 단축할 수 있는 장점을 가지고 있으며, 이와 같은 장점을 이용하여 농업현장에 RT-LAMP 방법을 적용하기 위해서는항온수조나발열블럭등의장비와같이이동성과휴대성이 간편한 장비가 필수적으로 요구된다. RT-LAMP 방법의 중요한 요소 중의 하나인 등온조건을 유지할 수 있는 다양한 기기(유전자증폭기, 항온수조, 발열블록)를 이용하여 재현성을확인한결과, 모든기기에서동일한 RT-LAMP 결과를확인 할 수 있었다(Fig. 6). 또한, 반응 후 전기영동이 아닌 SYBR green I을 이용하여 육안확인이 가능한지 알아보기 위해서 튜브 속 변색 또는 발광유무 통하여 반응 여부를 육안으로 확인한 결과 일반 광, 자외선 모두에서 양성 및 음성 대조군의 구분이 가능하였다(Fig. 7). | |
RT-PCR 방법의 단점은? | ELISA 방법의 경우 대량의 시료를 비교적 저렴한 비용으로 신속하게 진단이 가능하지만 검출민감도가 낮고 검사결과를판독하는과정에서오류발생에대한한계가있다 (Lee 등, 2010). RT-PCR 방법은 검사 대상의 양적증가에 따른 진단비용과소요시간또한증가하고, 기술숙련자와고가의 장비가 필요하다는 단점이 있다(Li와 Mock, 2005). 위와 같은 기존 진단법들의 단점을 극복하기 위해 개발된 LAMP 방법은 이미 많은 저널의 논문을 통하여 보고되었으며, 신속성 및정확성그리고비용적인부분에서효율이높은방법으로평가되고있다(Mori와 Notomi, 2009; Parida 등, 2004). |
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