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문제 정의
- montanum을 발표하였다. 따라서 우리나라에 존재하는 울릉미역취 녹병균에 대한 재검토가 필요하다고 판단하였고, 이에 고려 대학교 진균표본실에 보존된 울릉미역취 녹병균을 형태적으로 검토하고 분자적으로 분석하여 종수준으로 동정하여 보고한다.
제안 방법
- 보존된 표본시료를 맨눈으로 관찰하여 발병 부위와 표징을 파악하였고, 때로는 해부현미경으로 정확한 관찰을 도왔다. 녹병균의 분류학적 특성을 파악하고 크기를 측정하기 위해서 명시야광학 현미경(BX51; Olympus, Tokyo, Japan)을 사용하였다. 광학현미경 사진은 미분간섭현미경(Axio Imager; Carl Zeiss, Oberkochen, Germany)을 이용하여 촬영하였다.
- 녹병균의 분류학적 특성을 파악하고 크기를 측정하기 위해서 명시야광학 현미경(BX51; Olympus, Tokyo, Japan)을 사용하였다. 광학현미경 사진은 미분간섭현미경(Axio Imager; Carl Zeiss, Oberkochen, Germany)을 이용하여 촬영하였다. 또한, 녹병균의 미세구조를 관찰 하기 위해서 주사전자현미경(JSM-5410LV; JEOL, Japan)을 이용하여 사진을 촬영하였다.
- 광학현미경 사진은 미분간섭현미경(Axio Imager; Carl Zeiss, Oberkochen, Germany)을 이용하여 촬영하였다. 또한, 녹병균의 미세구조를 관찰 하기 위해서 주사전자현미경(JSM-5410LV; JEOL, Japan)을 이용하여 사진을 촬영하였다.
- 고려대학교 표본실에 보존되어 있는 울릉미역취 녹병균 시료 3점(KUS-F23658, F24582, F24664)의 시료를 대상으로 28S large subunit (LSU) 영역의 염기서열을 분석하였다.
- Aime [11]의 방법에 따라 건조 시료에서 채취한 여름포자에서 genomic DNA를 추출하였고, LR0R와 LR6 프라이머를 사용하여 PCR로 증폭시켰다[12]. 증폭된 각각의 PCR 산물을 전기영동을 통하여 확인한 후에 염기서열을 분석하기 위하여 마크로젠(Macrogen, Seoul, Korea)에 의뢰하였다. 분석된 염기서열은 DNASTAR computer package 7.
- 증폭된 각각의 PCR 산물을 전기영동을 통하여 확인한 후에 염기서열을 분석하기 위하여 마크로젠(Macrogen, Seoul, Korea)에 의뢰하였다. 분석된 염기서열은 DNASTAR computer package 7.1(Lasergene; DNASTAR, Madison, WI, USA)를 이용하여 정리하였으며, 이들을 NCBI (National Center for Biotechnology Information)의 GenBank에 등록하였다(기탁번호 MH725264, MH725265, MH725266). 이들의 염기서열을 비교한 결과, GenBank에 등록되어 있는 미국의 C.
대상 데이터
- 고려대학교 식물표본보관소(KUS)에 총 3점의 울릉미역취 녹병균이 보존되어 있다. 보존된 시료는 KUS-F23658 (18 Sep 2008, 수원, 농촌진흥청 약용작물전시포장), F24582 (14 Sep 2009, 평창, 한국 자생식물원 전시포장), F24664 (24 Sep 2009, 인천, 인천수목원 전시포장) 등 3점이었다.
이론/모형
- 고려대학교 표본실에 보존되어 있는 울릉미역취 녹병균 시료 3점(KUS-F23658, F24582, F24664)의 시료를 대상으로 28S large subunit (LSU) 영역의 염기서열을 분석하였다. Aime [11]의 방법에 따라 건조 시료에서 채취한 여름포자에서 genomic DNA를 추출하였고, LR0R와 LR6 프라이머를 사용하여 PCR로 증폭시켰다[12]. 증폭된 각각의 PCR 산물을 전기영동을 통하여 확인한 후에 염기서열을 분석하기 위하여 마크로젠(Macrogen, Seoul, Korea)에 의뢰하였다.
- solidaginis (MF769689, MF769688)와 100%의 상동성을 보였다. Solidago-Coleosporium의 분자계통학 적인 관계를 명확하게 확인하기 위하여 MEGA7 프로그램[13]을 이용하여 maximum likelihood 방법 으로 계통수를 작성하였다(Fig. 2). 그 결과, 한국의 울릉미역취 녹병균 시료 3점은 Back 등[4]이 보고한 C.
성능/효과
- 여름포자더미(uredinia)는 대부분 잎 뒷면에 형성되었지만 드물게 잎 앞면과 어린 줄기에서도 발견되었으며, 노란색 내지 주황색이었으며, 다소 돌출되었으며, 직경은 대부분 100~300 µm의 범주에 들지만 때로는 2개의 여름포자더미가 붙은 듯이 길게 형성된 경우에는 길이가 600 µm에 이를 정도로 변이의 폭이 컸다.
- 보존된 표본시료를 맨눈으로 관찰하여 발병 부위와 표징을 파악하였고, 때로는 해부현미경으로 정확한 관찰을 도왔다. 녹병균의 분류학적 특성을 파악하고 크기를 측정하기 위해서 명시야광학 현미경(BX51; Olympus, Tokyo, Japan)을 사용하였다.
- 1(Lasergene; DNASTAR, Madison, WI, USA)를 이용하여 정리하였으며, 이들을 NCBI (National Center for Biotechnology Information)의 GenBank에 등록하였다(기탁번호 MH725264, MH725265, MH725266). 이들의 염기서열을 비교한 결과, GenBank에 등록되어 있는 미국의 C.solidaginis (MF769689, MF769688)와 100%의 상동성을 보였다. Solidago-Coleosporium의 분자계통학 적인 관계를 명확하게 확인하기 위하여 MEGA7 프로그램[13]을 이용하여 maximum likelihood 방법 으로 계통수를 작성하였다(Fig.
- serotina)가 귀화식물로서 널리 분포한다[15]. 따라서 남한에는 자생식물로서 미역취(subsp. asiatica), 울릉미역취(subsp.gigantea), 나래미역취(var. coreana)가 분포하며, 귀화식물로는 미국미역취와 양미역취가 분포하므로 총 5개 분류군이 존재한다.
- solidaginis로 해석되어[5, 6] 혼동을 일으킬 수 있다. 따라서 저자들에 의해 내륙에서 채집된 3점의 울릉미역취 녹병균 시료에 대한 형태적 특징 및 분자적 분석을 통하여 우리 나라 울릉미역취 녹병균은 현재의 분류학적 개념에 따른 C. solidaginis로 확인되었다. 이는 일본, 중국, 한국을 포함하는 동아시아 지역에서 C.
후속연구
- 이러한 상황은 울릉미역취 녹병을 일으키는 녹병균의 정체성에 혼란을 줄 수 있다. 게다가, 한국 에서 분석되어 GenBank에 등재된 울릉미역취 녹병균 시료 2점이 모두 울릉도에서 채집된 것이므로 내륙에서 재배되거나 식재된 울릉미역취의 녹병균에 대한 추가적인 검토가 필요하다고 판단된다. 또한 Back 등[4]이 채집한 시료는 표본보관소에 수장되지 않았으므로 추적이 불가능한 상태이다.
- 의 녹병균에 대한 연구가 뒤따라야 하며, 일본과 중국에서 Solidago spp.를 감염하는 더 많은 시료의 녹병균이 연구되어야 한다. 즉, 동아시아에 분포하는 Solidago spp.
- 즉, 동아시아에 분포하는 Solidago spp.의 녹병균에 대한 종합적인 정보가 축적되어야 전세계의 Solidago-Coleosporium 관계를 정확하게 파악할 수 있을 것으로 생각된다.
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