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mtDNA GeneExtractor: A computer tool for mtDNA gene/region information extraction

Mitochondrion, v.9 no.1, 2009년, pp.36 - 40  

Freitas, F. (Instituto de Patologia e Imunologia Molecular da Universidade do Porto (IPATIMUP), R. Dr. Roberto Frias s) ,  Oliveira, S. ,  Rocha, R. ,  Pereira, L.

Abstract AI-Helper 아이콘AI-Helper

The analysis of considerable numbers of DNA sequences is largely dependent on the development of simple software tools for automatically process the genetic data deposited on public databases. However, there are some difficulties in the automation process due to diverse synonyms being used as qualif...

주제어

참고문헌 (26)

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  2. Bandelt 2006 Mitochondrial DNA and the Evolution of Homo sapiens Estimation of mutation rates and coalescence times: some caveats 

  3. Am. J. Hum. Genet. Behar 82 1130 2008 10.1016/j.ajhg.2008.04.002 The dawn of human matrilineal diversity 

  4. Gene Belle 355 58 2005 10.1016/j.gene.2005.05.019 An investigation of the variation in the transition bias among various animal mitochondrial DNA 

  5. Evolution. Bioinformatics Excoffier 1 47 2005 10.1177/117693430500100003 Arlequin ver. 3.0: an integrated software package for population genetics data analysis 

  6. Mitochondrion Goios 6 218 2006 10.1016/j.mito.2006.06.001 RepeatAround: a software tool for finding and visualizing repeats in circular genomes and its application to a human mtDNA database 

  7. Genome Res. Goios 17 293 2007 10.1101/gr.5941007 mtDNA phylogeny and evolution of laboratory mouse strains 

  8. Nucleic Acids Symp. Ser. Hall 41 95 1999 BioEdit: a user-friendly biological sequence alignment editor and analysis program for Windows 95/98/NT 

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