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[해외논문] Rapid identification of Armillaria species by PCR-DGGE

Journal of microbiological methods, v.107, 2014년, pp.63 - 65  

Longa, C.M.O. ,  La Porta, N.

Abstract AI-Helper 아이콘AI-Helper

The molecular approach has been used to distinguish between Armillaria species because of the ambiguity when using morphological traits. PCR-DGGE using the fungal primers ITS3GC-ITS4 enables a selective separation of amplicons and results in a simple and rapid approach to discriminate in one-step th...

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참고문헌 (14)

  1. World J. Microbiol. Biotechnol. Ascher 26 1721 2010 10.1007/s11274-010-0349-z Evaluation of the denaturing gradient gel electrophoresis-apparatus as a parameter influencing soil microbial community fingerprinting 

  2. Mol. Ecol. Gardes 2 113 1993 10.1111/j.1365-294X.1993.tb00005.x ITS primers with enhanced specificity for basidiomycetes - application to the identification of mycorrhizae and rusts 

  3. Can. J. Plant Pathol. La Porta 30 2 177 2008 10.1080/07060661.2008.10540534 Forest pathogens with higher damage potential due to climate change in Europe 

  4. Fungal Biol. Mavragani 115-169 2001 Species-specific PCR e DGGE markers to distinguish Pyrenophora species associated to cereal seeds 

  5. For. Pathol. Mulholland 42 229 2012 10.1111/j.1439-0329.2011.00747.x Development and verification of a diagnostic assay based on EF-1a for the identification of Armillaria species in Northern Europe 

  6. Appl. Environ. Microbiol. Muyzer 59 695 1993 10.1128/AEM.59.3.695-700.1993 Profiling of complex microbial populations by denaturing gradient gel electrophoresis analysis of polymerase chain reaction-amplified genes coding for 16S rRNA 

  7. Eur. J. Plant Pathol. Prospero 127 165 2010 10.1007/s10658-010-9594-0 Eight microsatellite markers for Armillaria cepistipes and their transferability to other Armillaria species 

  8. Mycoscience Ross-Davis 53 161 2012 10.1007/S10267-011-0148-X Advances toward DNA-based identification and phylogeny of North American Armillaria species using elongation factor-1 alpha gene 

  9. For. Pathol. Rytkonen 42 22 2012 10.1111/j.1439-0329.2011.00716.x PCR-DGGE method for in planta detection and identification of Phytophthora species 

  10. For. Pathol. Sicoli 33 287 2003 10.1046/j.1439-0329.2003.00330.x Development of species-specific PCR primers on rDNA for the identification of European Armillaria species 

  11. Mycologia Vainio 92 436 2000 10.2307/3761502 Genetic differentiation between European and North American populations of Phlebiopsis gigantea 

  12. Plant Soil Environ. Vala?kova 55 413 2009 10.17221/132/2009-PSE Denaturing gradient gel electrophoresis as a fingerprinting method for the analysis of soil microbial communities 

  13. White 315 1990 PCR Protocols. A Guide to Methods and Applications Amplification and direct sequencing of fungal ribosomal RNA genes for phylogenetics 

  14. J. Microbiol. Meth. Yergeau 60 143 2005 10.1016/j.mimet.2004.09.006 A PCR-denaturing gradient gel electrophoresis approach to assess Fusarium diversity in asparagus 

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