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PDB 한글 뷰어
PDB Korean Viewer 원문보기

한국정보과학회 02 가을 학술발표논문집(3), 2003 Apr., 2003년, pp.373 - 375  

구형서 (울산대학교 컴퓨터정보통신공학부) ,  주영준 (울산대학교 컴퓨터정보통신공학부) ,  박양수 (울산대학교 컴퓨터정보통신공학부) ,  이명준 (울산대학교 컴퓨터정보통신공학부)

초록
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단백질의 3차 구조를 보여주는 다양한 뷰어가 존재한다. 본 논문에서PDB(Protein Data Bank) 파일을 분석하여 단백질의 3차 구조를 보여주는 PDB 한글 뷰어단백질의 기능은 3차 구조(tertiary structure)에 의해 결정된다는 것이 밝혀짐으로써 단백질의 3차 구조에 대한 연구가 보다 활발하게 진행되고 있다. 단백질의 기능을 효과적으로 파악하기 위해서는 단백질의 3차 구조를 보여주는 도구가 필수적이며, 현재 단백질의 3차원 구조정보를 바탕으로 에 대해 기술한다. PDB 한글 뷰어는 기존 뷰어의 스테레오뷰(stereo view) 기능을 보완하여한 단백질의 2가지 구조를 동시에 보여주는 기능을 제공한다. 또한, 아미노산 원자들에 대한 분석 기능과 PDB 데이터의 이해를 돕는 도움말을 제공함으로써 효과적으로 단백질의 3차구조를 파악할 수 있다.

AI 본문요약
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문제 정의

  • 본 논문에서는 기존 뷰어들의 기능을 보완하여 PDB 파일에서 읽은 정보를 바탕으로 아미노산 원자간의 거리와 각도를 계산하고, 각 아미노산을 특성별로 분류할 수 있는 PDB 한글 뷰어에 대해 기술한다. PDB 한글 뷰어는 한 단백질의 두 가지 구조를 동시에 보여주는 기능을 제공함으로써 단백질의 구조를 보다 효과적으로 파악할 수 있다.
  • 본 논문에서는 단백잘의 3차원 구조정보를 담고 있는 PDB 파일을 분석하여 단백질의 3차 구조를 보다 효과적으로 파악할 수 있는 자바 기반의 PDB 한글 뷰어에 대해 기술하였다. PDB 한글 뷰어는 원격 또는 지역파일시스템에서 단백질의 3차원 구조정보를 읽올 수 있다.
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