초록 ▼

본 발명은 액체 환경에서의 생체분자, 특히 단백질의 응집(aggregation) 가능성 예측방법 및 미스폴딩(misfolding) 가능성 예측방법에 관한 것이다.본 발명의 방법은 생체분자의 용매화 자유에너지를 척도로 하여 생체분자의 폴딩, 중합체화 및 응집 등의 시계열적이고 연속적인 변화에 대한 신뢰도 높은 정보를 수득할 수 있다. 본 발명의 방법은 단백질의 응집 또는 미스폴딩이 어떠한 에너지 요인에 의해, 또는 단백질의 어떠한 잔기에 의해 일어났는지를 밝힐 수 있는 정확한 위치 지향적 열역학적 분석(site-directed the

본 발명은 액체 환경에서의 생체분자, 특히 단백질의 응집(aggregation) 가능성 예측방법 및 미스폴딩(misfolding) 가능성 예측방법에 관한 것이다.본 발명의 방법은 생체분자의 용매화 자유에너지를 척도로 하여 생체분자의 폴딩, 중합체화 및 응집 등의 시계열적이고 연속적인 변화에 대한 신뢰도 높은 정보를 수득할 수 있다. 본 발명의 방법은 단백질의 응집 또는 미스폴딩이 어떠한 에너지 요인에 의해, 또는 단백질의 어떠한 잔기에 의해 일어났는지를 밝힐 수 있는 정확한 위치 지향적 열역학적 분석(site-directed thermodynamics)을 제공한다. 이에, 본 발명은 다양한 단백질 변성질환(protein conformational disorder)을 치료 또는 예방하는 의약의 개발 및 생물학적 치료제로서 응집-내성 단백질을 설계하는 전략 수립에 유용하게 이용될 수 있다.

대표청구항 ▼

하기 수학식을 이용하여 제 1 상태 및 제 2 상태의 생체분자에서의 용매화 자유에너지(solvation free energy)의 변화량을 측정하는 단계를 포함하는 액체 환경에서의 생체분자의 응집(aggregation) 가능성 예측방법:상기 식에서, Gsolv(ru)는 상기 생체분자의 특정 배위(configuration, ru)에서의 용매화 자유에너지이고, uij는 상기 생체분자의 구성원자 및 물 분자의 구성원자 간의 상호작용 전위(interaction potential)이며, λ는 상기 상호작용이 없는 상황(λ=0)에서 총(full

하기 수학식을 이용하여 제 1 상태 및 제 2 상태의 생체분자에서의 용매화 자유에너지(solvation free energy)의 변화량을 측정하는 단계를 포함하는 액체 환경에서의 생체분자의 응집(aggregation) 가능성 예측방법:상기 식에서, Gsolv(ru)는 상기 생체분자의 특정 배위(configuration, ru)에서의 용매화 자유에너지이고, uij는 상기 생체분자의 구성원자 및 물 분자의 구성원자 간의 상호작용 전위(interaction potential)이며, λ는 상기 상호작용이 없는 상황(λ=0)에서 총(full) 상호작용(λ=1)에 이르기까지 점차적으로 전환되는 전하 파라미터(charging parameter)이고, gij(r;ru;λ)는 상기 전하 파라미터가 λ일 때의 평형 방사방향 분배 함수(equilibrium radial distribution function)이며, ρ는 물의 평균 개수밀도이다.