초록 ▼

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1. 분석자 서문
시스템 생명공학 기법을 이용한 산업용 균주의 개량은 대사공학의 새로운 연구 방향으로서, 최근 이론 및 실험적 기초가 다져지고 있는데, 크게 다음과 같은 두 가지 연구방법에 기초하고 있다. 첫째로 High-throughput measurements tools에 의한 세포내 biomolecules (DNA, RNA, protein, and metabolite)의 시스템 레벨에서의 분석을 활용하며, 둘째로 화학양론에 근거한 대사반응 모델을 이용한 시스템 레

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1. 분석자 서문
시스템 생명공학 기법을 이용한 산업용 균주의 개량은 대사공학의 새로운 연구 방향으로서, 최근 이론 및 실험적 기초가 다져지고 있는데, 크게 다음과 같은 두 가지 연구방법에 기초하고 있다. 첫째로 High-throughput measurements tools에 의한 세포내 biomolecules (DNA, RNA, protein, and metabolite)의 시스템 레벨에서의 분석을 활용하며, 둘째로 화학양론에 근거한 대사반응 모델을 이용한 시스템 레벨의 대사량 계산을 위한 전산 모사가 이용된다. 하지만 아직까지도 다양한 high throughput분석 방법의 효과적인 integration을 위한 framework은 개발되지 못하였고, 전산 모사에 쓰이는 대사모델이 대사량의 정상 상태 (steady-state)를 가정한 것이기 때문에, 실제 세포 내에서 일어나는 복잡한 kinetic 또는 regulatory interactions을 효과적으로 표현할 수 없다는 문제점이 있다. 이러한 문제점들이 해결된다면, 또는 완벽하게 해결되지는 않더라도 세포 내에서 일어나는 현상들을 시스템 레벨에서 어느 정도 분석, 예측할 수 있다면, 이는 산업적으로 유용한 미생물의 발효능 개선을 위한 대사공학적 접근을 아주 용이하게 할 것이다.

2. 목차
분석자 서문
1. 서론
2. 균주개량을 위한 high through -put measurements 연구
2.1. 유전체 서열 분석
2.2. 전사체 분석
2.3. 단백질체 분석
2.4. 대사체 및 대사량체 분석
2.5. 통합적인 분석
3. In silico modeling 및 전산모사
3.1. In silico 모델의 구축
3.2. In silico 대사 예측
3.3. 균주 개량을 위한 통합적 전략
3.4. 전망

3. 원문정보
Sang Yup Lee, Dong-Yup Lee and Tae Yong Kim, Systems biotechnology for strain improvement, Trends in Biotechnology, 2005. 7.

※ 이 자료의 분석은 MIT의 진용수님께서 수고해 주셨습니다.