초록 ▼

종양세포와 관련된 신규 유전자의 발굴을 위하여 연차별로 다음과 같은 연구내용을 중심으로 추진하였다.1차년도(1997년) : 인체 세포분화 관련 신규 유전자 탐색한국인 유래 암세포 조직(위암, 간암, 자궁암, 난소암, 면역종양)으로부터 암세포 분화에 관련된 유전자분리 및 분석2차년도(1998년) : 한국인 유래 암세포 조직(위암, 간암)으로부터 암세포 분화에 관련된 유전자분리 및 분석3차년도(1999년) : 분리된 암세포 분화 관련 유전자들의 게놈구조분석 및 기능분석 1차년도 연구에서는 한국인의 위암, 간암, 자궁암, 난소암, 면역

종양세포와 관련된 신규 유전자의 발굴을 위하여 연차별로 다음과 같은 연구내용을 중심으로 추진하였다.1차년도(1997년) : 인체 세포분화 관련 신규 유전자 탐색한국인 유래 암세포 조직(위암, 간암, 자궁암, 난소암, 면역종양)으로부터 암세포 분화에 관련된 유전자분리 및 분석2차년도(1998년) : 한국인 유래 암세포 조직(위암, 간암)으로부터 암세포 분화에 관련된 유전자분리 및 분석3차년도(1999년) : 분리된 암세포 분화 관련 유전자들의 게놈구조분석 및 기능분석 1차년도 연구에서는 한국인의 위암, 간암, 자궁암, 난소암, 면역종양암을 대상으로 관련 신규 유전자 탐색을 주 연구내용으로 진행하였으며 2, 3차년도에서는 좀더 효율적인 연구를 추진하기 위하여 한국인에 많은 위암, 간암을 집중대상으로 선정하여 분리된 신규 유전자들에 대한 구조분석과 초기단계 기능분석연구에 집중하였다. 그러므로 자궁암/난소암, 면역종양 관련된 신규 유전자 발굴은 1차년도 연구후 종료하였다. 제4세부과제로 따로 진행되었던 "게놈기능분석 시스템"에 관한 연구과제는 2차년도부터 본 세부과제로 통합되어 본 과제에서 발굴된 신규 유전자의 체계적 기능분석을 위한 시스템 구축이 촉진되었다.

Abstract ▼

A direct identification of genetic alterations in tumor cells might be useful for finding novel cellular genes. involved in growth control and for the development of potential diagnostic or prognostic clinical markers. This direct approach has proven quite difficult however, because the DNA regions

A direct identification of genetic alterations in tumor cells might be useful for finding novel cellular genes. involved in growth control and for the development of potential diagnostic or prognostic clinical markers. This direct approach has proven quite difficult however, because the DNA regions are usually too large for routine molecular analysis. Restriction landmark genome scanning (RLGS) was developed as a method of human genome analysis that is based on the concept that restriction enzyme sites can be used as landmarks. This technique allows analysis of approximately 2,000 landmarks distributed throughout a human genome on a two-dimensional gel. Copy-number changes of unknown and known DNA spots can be easily detected in the electrophoresis profiles. Furthermore, the methylation status on CpG islands, which are abundant in the 5' region of genes, can be detected. Recently, several studies indicate that the methylation of CpG islands can be correlated with transcriptional silencing of tumor suppressor genes, sugesting that the epigenetic alteration of DNA could represent a common mechanism for gene inactivation during tumor progression. Using RLGS technique, a profile for genomic alterations were constructed from primary gastric tumors from 57 Korean patients, which included benign, EGC and AGC. In total, eight-one DNA spots that were often decreased heterozygousely in primary tumor cells, were putatively assigned to each chromosome, showing that these change may be due to LOH or methylation on CpG islands in cancer cells. Some DNA spots of them were confirmed to be homozygousely lost in those of cell lines. Thirty-four DNA spots of which copy numbers were increased, were also assigned to each chromosome. We have succesfully performed cloning of spot DNAs of which the intensity was often changed in gastric cancer cells. Genomic change of a spot from chromosome 3, which is decreased frequently in many primary-tumors and decreased homozygously in all cancer cell lines, was proven to be due to methylation on a CpG islands, suggesting that the DNA fragment may be a flanking region of a candidate gene of tumor suppressor gene in stomach. And we found a novel gene which is highly expressed in cancer cell, but not in normal cell. This was proven to be due to de-methylation on NotⅠsequence from centromeric repetitive component. Finally, we conclude that positional cloning based on the RLGS method can be effectively used to identify the candidate genes associated with gastric carcinogenesis.

목차 Contents

• 제1 공동연구과제 : 위암발생 관련 유전자의 분리 및 기능분석에 관한 연구...13
• 제2 공동연구과제 : 간암관련 유전자군의 체계적 분석에 관한 연구...71
• 제3 공동연구과제 : 자궁암/난소암 관련 유전자 탐색 및 특성 분석...121
• 제4 공동연구과제 : 면역 종양 세포로부터 질병 관련 유전자 분리 및 동정...157
• 제5 공동연구과제 : 종양 관련 유전자의 체계적 기능 분석...187
• 위탁과제 : 종양관련 유전자의 염색체상 위치결정...221