초록 ▼

제1세부과제: 우리나라 벼 도열병균주의 유전체 염기서열 분석 및 특성 분석
● Fosmid library 제작과 Fosmid map 작성
● Map-based shotgun sequencing
● Whole genome shotgun sequencing
● Assembly 및 게놈 비교 분석
제1협동과제 : 우리나라 도열병균들의 유전체 다양성 분석 및 병원성 유전자 특성 규명
● Whole genome chip을 이용한 Comparative Genomic Hybridization
● Whole

제1세부과제: 우리나라 벼 도열병균주의 유전체 염기서열 분석 및 특성 분석
● Fosmid library 제작과 Fosmid map 작성
● Map-based shotgun sequencing
● Whole genome shotgun sequencing
● Assembly 및 게놈 비교 분석
제1협동과제 : 우리나라 도열병균들의 유전체 다양성 분석 및 병원성 유전자 특성 규명
● Whole genome chip을 이용한 Comparative Genomic Hybridization
● Whole genome chip을 이용한 유전자 발현 패턴 분석
● 기주 특이성 및 병원성 유전자 기능분석
제2협동과제 : 우리나라 도열병균들의 기주범위 및 병원성 특성 규명
● 벼 및 바랭이 도열병 균주의 병원성 및 기주범위 특성 분석
● 바랭이 도열병균의 집단 유전분석
● 병원성 변이 형질전환체의 병원성 및 기주범위 분석

Abstract ▼

The genome of Magnaporthe oryzae KJ201 was sequenced for comparative genome analysis with that of international standard strain 70-15. Fosmid library map based shotgun sequencing strategy accompanied with whole genome shotgun sequencing strategy was applied to capture the whole genome information. G

The genome of Magnaporthe oryzae KJ201 was sequenced for comparative genome analysis with that of international standard strain 70-15. Fosmid library map based shotgun sequencing strategy accompanied with whole genome shotgun sequencing strategy was applied to capture the whole genome information. Genome coverage of 8X was obtained from the sequencing process and genome comparison between Korean strain KJ201 and international standard 70-15 is being conducted.
The differences in genome-wide structure composition and gene expression pattern among isolates of M. oryzae were evaluated with new technology called "Comparative Genome Hybridization" and general DNA chip hybridization, respectively, using DNA chips with elements of M. oryzae genome. A number of pathogenicity related genes was analyzed for their roles during infection and disease development. MoCIH2 affected the process of early infection process and the lack of the gene resulted in suppressed infection at early stage. Another fungal specific gene, COD62 , identified from T-DNA insertional mutant analysis showed its role in disease development and fungal protection against plant defense system. The phenotype from lack of COD62 in the deletion mutant confirmed the role of COD62 in conidial morphology and pathogenicity in M. oryzae. The host range of the isolates of M. oryzae from rice and different weeds plants was evaluated to figure out the relationship among the isolates in the sense of pathogenicity. Mostly the isolates showed inter-host pathogenicity and the patterns of host range is variable. Instead, the genetic background among M. oryzae isolates was mostly seperated into two groups:Digitaria origin and non-Digitaria origin including rice origin. The cross-infectivity between rice and Digitaria was confirmed with GFP-tagged isolates.

목차 Contents

• 표지 ...1
• 제출문 ...3
• 요약문 ...5
• SUMMARY ...8
• CONTENTS ...9
• 목차 ...10
• 제 1 장 서론 ...13
• 제 1절 연구개발의 목적 ...13
• 제 2절 연구개발의 필요성 ...13
• 제 3절 연구개발의 범위 ...15
• 제 2 장 국내외 기술개발 현황 ...16
• 제 1절 개요 ...16
• 제 2절 국외 기술개발 현황 ...16
• 제 3절 국내 기술개발 현황 ...16
• 제 3 장 연구개발수행 내용 및 결과 ...18
• 제 1절 1세부과제의 연구개발수행 내용 및 결과 ...18
• 1. 서론 ...18
• 2. 재료 및 방법 ...19
• 3. 결과 및 고찰 ...22
• 가. M. oryzae KJ201 균주의 Fosmid library 제작 ...22
• 나. Fosmid clone의 양말단 염기서열 결정 ...25
• 다. Fosmid 말단 서열을 이용한 게놈 지도작성 ...25
• 라. Fosmid map based shotgun sequencing ...33
• 마. GS454 FLX system을 이용한 sequencing ...39
• 바. KJ201 유전체 정보의 combined analysis ...43
• 제 2절 1협동과제의 연구개발수행 내용 및 결과 ...103
• 1. 서론 ...103
• 2. 재료 및 방법 ...104
• 3. 결과 및 고찰 ...106
• 가. CGH를 이용한 유전체 비교분석 ...106
• 나. 유전자 발현 패턴 비교 분석 ...124
• 다. 병원성 관련 유전자 상세 분석 ...131
• 제 3절 2협동과제의 연구개발수행 내용 및 결과 ...142
• 1. 서론 ...142
• 2. 재료 및 방법 ...143
• 3. 결과 및 고찰 ...144
• 가. 도열병균 균주 분리 및 확보 ...144
• 나. 벼 및 바랭이 도열병 균주의 병원성 검정 분석 ...147
• 다. 벼 및 바랭이 도열병 균주의 기주범위 검정 분석 ...156
• 라. 바랭이 도열병균의 집단유전 분석 ...158
• 마. 다른 잡초 도열병균의 집단유전 분석 ...158
• 바. 새로운 그룹에 대한 집단 유전 분석 ...158
• 사. 벼 및 잡초 분리균의 기주 상호감염 여부 구명 ...162
• 제 4 장 연구개발목표 달성도 및 대외기여도 ...164
• 제 1절 1세부과제 ...164
• 제 2절 1협동과제 ...164
• 제 3절 2협동과제 ...165
• 제 5 장 연구개발결과의 활용계획 ...166
• 제 6 장 기타 중요 변동사항 ...167
• 제 7 장 참고문헌 ...168