초록 ▼

제 1 세 부과제 : 무 웅성불임 유기유전자 및 회복유전자 연관 분자표지 개발
무 웅성불임 유기 유전자인 orfl38의 flanking region 에 존재하는 변이를 이용하여 세포질 판별용 분자표지 개발하고자 하였다. 또한, 최근 보고된 RID를 바탕으로 무 웅성불입 회복 계통별로 RID 유전자의 염기서열을 밝히고 이를 이용하여 회복유전자 유전자형을 판별할 수 있는 분자표지를 개발하고자 하였다. 개발이 완료되면 웅성불임 세포질 판별 표지와 회복인자형 판별 표지를 이용하여 무 유전자원과 웅성불임 육성계통들을 분석하고 MAS

제 1 세 부과제 : 무 웅성불임 유기유전자 및 회복유전자 연관 분자표지 개발
무 웅성불임 유기 유전자인 orfl38의 flanking region 에 존재하는 변이를 이용하여 세포질 판별용 분자표지 개발하고자 하였다. 또한, 최근 보고된 RID를 바탕으로 무 웅성불입 회복 계통별로 RID 유전자의 염기서열을 밝히고 이를 이용하여 회복유전자 유전자형을 판별할 수 있는 분자표지를 개발하고자 하였다. 개발이 완료되면 웅성불임 세포질 판별 표지와 회복인자형 판별 표지를 이용하여 무 유전자원과 웅성불임 육성계통들을 분석하고 MAS 적용성을 검토하고자 하였다.

Abstract ▼

1. Development of molecular marker associated with cytoplasm type and fertility restorer gene in radish
1.1. Development of molecular markers for classification of cytoplasm types in radish (Raphanus setivus L.)
Plant mitochondrial genome IS characterized by its complex configurations. Multipa

1. Development of molecular marker associated with cytoplasm type and fertility restorer gene in radish
1.1. Development of molecular markers for classification of cytoplasm types in radish (Raphanus setivus L.)
Plant mitochondrial genome IS characterized by its complex configurations. Multipartite structures and highly rearranged substoichiometric molecules created by repeat sequences are mainly attributable to its complexity. For reliable and fast classification of cytoplasm types of diverse radish (Raphanus sativus L.) gerrnplasm, we tried to develop reliable molecular markers while considering the complex nature of radish mitochondrial genomes. The orf138 gene responsible for Ogura male-sterility was also detected in normal cultivars as low-copy-number substoichiometric molecules. In addition to the orf138-atp8 organization present as dominant one in Ogura mitochondrial DNA (mtDNA), three novel substoichiometric organizations linked to the atp8 gene were isolated in this study. PCR amplification profiles of seven atpS:- and atp6-linked sequences could be divided into three major groups. Interestingly, the normal cytoplasm type, which had been previously considered as a single group, showed two distinct patterns of PCR amplification. The most prominent difference between the two normal mtDNAs was the size variation of an array of four short repeat sequences linked to the atp6 gene. This variation seemed to result from double crossover which had been mediated by homologous short repeat sequences. The specific PCR amplification profiles reflecting stoichiometry of different mtDNA fragments were shown to be conserved within cultivars and even across generations. Therefore, the specific profiles were utilized as molecular makers for classification of diverse radish gerrnplasrn. A total of 90 radish cultivars or accessions were successfully classified into three mitotypes,

목차 Contents

• 표지...1
• 제출문...3
• 요약문...5
• SUMMARY...18
• Contents...29
• 목차...30
• 제 1세부연구과제:무 웅성불임 유기유전자 및 회복유전자 연관 분자표지 개발...35
• SUMMARY...37
• 제 1 장 서 론...39
• 제 2 장 국내외 기술개발 현황...40
• 제 3 장 연구개발 수행 내용 및 결과...41
• 제 1 절 연구내용 및 방법...41
• 1. 무 웅성불임 세포질 판별 분자표지 개발...41
• 2. 무 웅성불임 회복유전자, Rfo 유전자형 판별 분자표지 개발...42
• 제 2 절 연구결과...42
• 제 4 장 연구개발목표 달성도 및 대외기여도...60
• 제 5 장 연구개발결과의 활용계획...61
• 제 6 장 기타 중요 변동사항...61
• 제 7 장 참고문헌...62
• 제 1협동연구과제:박, 가지과 작물의 병저항성 유전자와 연관된 분자표지 개발...67
• SUMMARY...69
• 제 1 장 서 론...71
• 제 2 장 국내외 기술개발 현황...74
• 제 3 장 연구개발수행 내용 및 결과...77
• 제 1 절 연구개발수행 내용 및 방법...77
• 제 2 절 연구개발내용 수행 결과...78
• 1. 매론 흰가루병 저항성 연관 분자표지 개발...78
• 2. 토마토에서의 주요 내병성 연관 표지 개발...85
• 제 4 장 연구개발목표 달성도 및 대외기여도...89
• 제 5 장 연구개발결과의 활용계획...92
• 제 6 장 기타 중요 변동사항...92
• 제 7 장 참고문헌...93
• 제 2협동연구과제:무 위황병 저항성 유전자와 연관된 분자표지 개발...97
• SUMMARY...99
• 제 1 장 서 론...100
• 제 2 장 국내외 기술개발 현황...103
• 제 3 장 연구개발수행 내용 및 결과...105
• 제 1 절 1차년도 수행 내용 및 결과...105
• 제 2 절 2차년도 수행 내용 빛 결과...108
• 제 3 절 3차년도 수행 내용 및 결과...112
• 제 4 장 연구개발목표 달성도 및 대외기여도...120
• 제 5 장 연구개발 결과의 활용계획...121
• 제 6 장 기타 중요 변동사항...122
• 제 7 장 참고문헌...123
• 제 3협동연구과제:배추 섬부증(tipburn)과 소포자 배 발생관련 분자표지 개발...127
• SUMMARY...129
• 제 l 장 서 론...131
• 제 2 장 국내외 연구동향...134
• 제 1 절 심부증 마커 개발...134
• 제 2 절 소포자 배 발생능 마커 개발...134
• 제 3 장 연구개발 수행 내용 및 결과...135
• 제 1 절 수행 내용...135
• 제 2 절 연구 결과...136
• 1. 심부증(Tip burn) marker 개발...136
• 2. 소포자 배양 배 발생 능 marker 개발...141
• 제 4 장 목표 달성도 및 대외 기여도...143
• 제 5 장 개발 결과의 활용 계획...144
• 제 6 장 기타 중요 변경사항...144
• 제 7 장 참고문헌...145
• 제 4협동연구과제:고추의 웅성불임 회복유전자(Rf) 연관 분자표지 개발...147
• SUMMARY...149
• 제 1 장 서 론...150
• 제 2 장 국내외 기술개발 현황...155
• 제 3 장 연구개발수행 내용 및 결과...157
• 제 1 절 1차년도 수행 내용 및 결과...157
• 1. 분석 집단 육성...157
• 2. Genome Walking을 이용한 신규 Rf 연관 분자 표지 개발...157
• 3. AFLP, ISSR primer 다형성 조합 선발...160
• 4. Candidate homologue 탐색...161
• 제 2 절 2차년도 수행 내용 및 결과...162
• 1. 제 3의 회복 유전자 인자형 선발용 분자표지 개발...162
• 2. 고추에 존재하는 2 종의 retrotransposon 및 homologue의 발견...163
• 3. Southern blot analysis...169
• 4. 분자표지를 이용한 고추 육종계통의 웅성불임 관련 유전자의 인자형 Database 구축...171
• 5. 다양한 유전자원 및 상용품종을 대상으로 고추 회복 유전자의 인자형 분포조사...172
• 제 3 절 3차년도 수행 내용 및 결과...176
• 1. 제 3의 Rf allele과 연관된 Rfls7701 haplotype 개체의 표현형 특성 분석...176
• 2. 분자표지를 이용한 선발(marker assisted selection)의 정확도 향상을 위한 flanking marker 개발...177
• 3. Rf 연관 flanking 마커의 거리 산출...178
• 4. 웅성 불임 세포질을 식별하는 분자표지 개발...178
• 제 4 장 연구개발 목표 달성도 및 대외기여도...183
• 제 5 장 연구개발결과의 활용계획...186
• 제 6 장 기타 중요 변동사항...187
• 제 7 장 참고문헌...188
• 제 5협동연구과제:토마토 역병 저항성 연관 분자표지 개발...193
• SUMMARY...195
• 제 1 장 서 론...196
• 제 2 장 국내외 기술개발 현황...198
• 제 3 장 연구개발 수행 내용 및 결과...200
• 제 1 절 저항성 주동 유전자와 연관된 마커의 탐색...200
• 1. 저항성 주동 유전자와 연관된 RFLP등의 Marker를 선발...200
• 2. 저항성 주동유전자와 연관된 마커의 탐색...200
• 3. 저항성 주동 유전자와 연관된 것으로 밝혀진 Marker를 이병성과 저항성에서 sequencmg한 후 sequence 차이를 이용하여 CAPs primer를 디자인...202
• 4. 저항성 주동 유전자 연관마커 인접서열결정 및 CAPs 마커개발...210
• 제 2 절 AFLP를 이용한 미동유전자와 연관된 마커의 탐색...214
• 제 3 절 토마토 역병균에 대한 저항성 검정 분석...217
• 1. 기존에 우리나라에서 발병한 역병균의 확보 및 병원성 분석...217
• 2. 토마토 역병 저항성 line의 저항성검정...220
• 제 4 절 분리집단 육성 및 국내균주에 대한 저항성 검정분석...225
• 제 4 장 연구개발 목표 달성도 및 대외기여도...229
• 제 5 장 연구개발결과의 활용계획...229
• 제 6 장 기타 중요 변동사항...229
• 제 7 장 참고문헌...230
• 제 6협동연구과제:고추 웅성불임 불안정성 및 병 저항성 분자표지 개발...235
• SUMMARY...237
• 제 1 장 서 론...239
• 제 1 절 고추 세포질웅성불임성의 불안정성에 관한 연구...239
• 제 2 절 고추 병(흰가루병과 역병) 저항성에 관한 연구...240
• 제 2 장 국내외 기술개발 현황...241
• 제 1 절 고추 세포질웅성불임성에 관한 연구...241
• 제 2 절 고추 흰가루병 및 역병 저항성에 관한 연구...242
• 제 3 장 연구개발수행 내용 및 결과...244
• 제 1 절 고추 세포질웅성불임 불안정성 연관 분자표지 개발...244
• 1. 불완전 임성회복 (partial restoration, pr) 유전자좌에 연관된 분자표지 개발...244
• 2. BAC end sequences를 통해 새로운 분자표지 개발...247
• 3. Rf locus와 pr locus의 연관분석...247
• 4. OPP13-CAPS와 PR-CAPS 염기서열의 다양성 분석...252
• 5. OPP13-CAPS 및 PR-CAPS의 haptotype과 Rf 유전자좌의 유전형 간의 연관분석...252
• 제 2 절 고추 흰가루병 저항성 연관 분자표지 개발...256
• 1. 고추 흰가루병 저항성 유전자와 연관된 분자표지 개발을 위한 QTL 분석...256
• 2. 흰가루병 저항성 주동유전자 (Pmr1)와 연관 AFLP 표지의 STS 분자표지 전환...258
• 3. 신규 저항성 유전자원(C. annuum)을 이용한 새로운 분자표지 개발...261
• 제 3 절 고추 역병 저항성 연관 분자표지 개발...263
• 1. 고추 역병 접종균의 농도와 이병성친에 따른 고주 역병 저항성의 유전분석...263
• 2. 고추 역병 저항성 유전자와 연관된 분자표지 개발...263
• 3. 고추 역병 병원균 접종 농도에 따른 역병 저항성 QTL 분석...268
• 제 4 장 연구개발목표 달성도 및 대외기여도...270
• 제 5 장 연구개발결과의 활용계획...271
• 제 6 장 기타 중요 변동사항...271
• 제 7 장 참고문헌...272