초록 ▼

Ⅳ. 개발결과
검역대상 곰팡이, 세균, 바이러스를 포함한 식물병원체를 효과적으로 진단하기 위하여, 많은 종류의 검역 대상 병원체들의 시료를 확보하였다. 확보한 시료와 기존에 알려진 병원체의 염기서열 정보들을 바탕으로 다양한 방법의 분자생물학적 기법들을 이용하여 진단키트를 개발하였다. 곰팡이의 경우 곡류, 채소류, 화훼류 수입 식물에서 빈번히 검출될 가능성이 있는 검역종과 근연종 곰팡이의 검출과 동정을 위해 총 32종 PCR 증폭용 프라이머를 개발하였으며, 과수 및 수목류 검역대상 주요 곰팡이의 진단 기술 개발을 위해 분자적 마

Ⅳ. 개발결과
검역대상 곰팡이, 세균, 바이러스를 포함한 식물병원체를 효과적으로 진단하기 위하여, 많은 종류의 검역 대상 병원체들의 시료를 확보하였다. 확보한 시료와 기존에 알려진 병원체의 염기서열 정보들을 바탕으로 다양한 방법의 분자생물학적 기법들을 이용하여 진단키트를 개발하였다. 곰팡이의 경우 곡류, 채소류, 화훼류 수입 식물에서 빈번히 검출될 가능성이 있는 검역종과 근연종 곰팡이의 검출과 동정을 위해 총 32종 PCR 증폭용 프라이머를 개발하였으며, 과수 및 수목류 검역대상 주요 곰팡이의 진단 기술 개발을 위해 분자적 마커를 만들어 PCR을 이용하여 쉽고 빠르게 검출 할 수 있는 방법을 개발하였다. 병원성 세균의 경우 국내 식물검역대상 병원세균 5종에 대한 전체 염기서열을 결정하였으며, PCR 및 Taqman PCR용 프라이머를 개발하였다. 식물바이러스의 경우 총 22종의 RNA바이러스에 대한 RT-PCR를 이용한 동정 기법을 개발하였고, 검역용 10종의 식물 바이러스를 대상으로 ELISA와 RT-PCR을 이용한 동정방법을 개발하였다. 식물병원균 정보, 분자 표지 정보를 포함한 각종 실험적 결과, 계통분류학적 정보 등을 웹에서 입력, 수정, 삭제 기능을 포함하는 관리 시스템을 구축하였으며, 유전체 정보를 활용하여 상동성 검색 프로그램인 BLAST와 다중서열정렬을 수행하는 ClustalW 및 다중서열 정렬에 기반한 계통분류학적 분석을 수행할 수 있는 QIMS 시스템을 개발하였다.

Abstract ▼

Ⅳ. The results
For efficient development of detecting quarantine plant pathogens including fungi, bacteria, and viruses, many plant samples infected with plant pathogens were obtained. With obtained samples, we developed detection kits using diverse molecular biological methods based on known seq

Ⅳ. The results
For efficient development of detecting quarantine plant pathogens including fungi, bacteria, and viruses, many plant samples infected with plant pathogens were obtained. With obtained samples, we developed detection kits using diverse molecular biological methods based on known sequences for pathogens. In case of fungi, we developed a total of 32 primer pairs for PCR to detect fungi which could be frequently identified in crops, vegetables, and flowering plants. For fungi infecting trees, molecular markers based on PCR were developed. In case of pathogenic bacteria, whole genome sequences for five bacteria were determined and detection methods based on PCR and Taqman PCR were developed. In case of quarantine plant viruses, RT-PCR based detection tools were developed for a total of 22 different viruses. In addition, we developed detection methods for 10 quarantine plant viruses based on ELISA and RT-PCR. Moreover, the development of QIMS turned out to be functionally well operating as the detection of 100% homogeny based on molecular marker sequences, from the internally stored molecular marker database, had been proved. For the blind test, the result retrieved in link with NCBI non-redundant database showed a genus level accuracy and provided basis for the identification. This would be improved to yield more accurate information with consistent updates of the corresponding database.

목차 Contents

• 표지 ... 1
• 제 출 문 ... 3
• 요 약 문 ... 5
• SUMMARY(영문요약문) ... 6
• CONTENTS(영문목차) ... 7
• 목 차 ... 8
• 제 1 장 개발과제의 개요 ... 9
• 제 1절 연구개발의 목적 및 필요성 ... 9
• 제 2 절 연구개발의 범위 ... 10
• 제 2 장 국내외 기술개발 현황 ... 11
• 제 1 절 국내외 관련 특허 분석 ... 11
• 제 2 절 국내외 관련 논문 분석 ... 13
• 제 3 절 국내외 기타 데이터베이스 분석 ... 13
• 제 3 장 개발수행 내용 및 결과 ... 18
• 제 1 절 주요 검역대상 식물 바이러스의 RT-PCR 진단기법 및 진단용 표준시료개발 ... 18
• 제 2 절 식물병원균 검역 정보 관리 시스템 (QIMS) 구축을 위한 데이터베이스 구축 및 관리 시스템 개발 ... 46
• 제 3 절 곡류, 채소, 화훼류 작물 검역대상 주요 곰팡이의 진단기술 개발 ... 63
• 제 4 절 과수 및 수목류 검역대상 주요 곰팡이의 진단기술 개발 ... 121
• 제 5 절 주요 검역대상 식물 병원성 세균의 진단기법 및 진단용 표준시료개발 ... 190
• 제 6 절 식물검역용 바이러스 진단용 ELISA Kit 개발 ... 262
• 제 4 장 목표달성도 및 관련분야에의 기여도 ... 331
• 제 1 절 연차별 연구목표 및 평가착안점에 입각한 연구개발목표의 달성도 ... 331
• 제 5 장 개발 성과 및 성과활용 계획 ... 346
• 제 1절 실용화·산업화 및 교육지도 계획 ... 346
• 제 2 절 특허, 논문 추가 확보 계획 ... 347
• 제 3 절 추가연구, 타연구에 활용 계획 ... 347
• 제 4 절 기타 기대 효과 ... 347
• 제 6 장 개발과정에서 수집한 해외과학기술정보 ... 349
• 제 1 절 ... 349
• 제 2 절 최신 수목병원 진균 진단 기술 개발 동향 ... 349
• 제 3 절 유럽의 침입력이 강한 수목병원 진균 최신 연구 동향 ... 350
• 제 4 절 응용된 PCR 방법의 확대 ... 350
• 제 7 장 개발시설 장비 현황 ... 353
• 제 8 장 참고문헌 ... 354
• 끝페이지 ... 364