초록 ▼

BLM RQC 도메인은 DNA 와 결합하는 부위로 G-quadruplex 와 특이적으로 결합함.
WRN, BLM RQC 도메인의 duplex DNA 결합 구조는 규명되어 있지만 G-quadruplex 와의 결합 기작은 정확히 밝혀져 있지 않아 연구를 수행함.
tetramolecular quadruplex 를 형성하는 T2G4 서열과 unimolecular quadruplex 를 형성하는 Myc-2345 서열을 합성, quadruplex 를 형성하고 1D NMR 관측을 통해 확인.
15N 표지된 BLM RQC 도메인에

BLM RQC 도메인은 DNA 와 결합하는 부위로 G-quadruplex 와 특이적으로 결합함.
WRN, BLM RQC 도메인의 duplex DNA 결합 구조는 규명되어 있지만 G-quadruplex 와의 결합 기작은 정확히 밝혀져 있지 않아 연구를 수행함.
tetramolecular quadruplex 를 형성하는 T2G4 서열과 unimolecular quadruplex 를 형성하는 Myc-2345 서열을 합성, quadruplex 를 형성하고 1D NMR 관측을 통해 확인.
15N 표지된 BLM RQC 도메인에 Myc-2345 를 적정하여 Backbone amide NH 의 chemical shifts perturbation 을 측정하여 접합면을 매핑함. 이를 통해 duplex DNA 와 결합시 사용되는 BLM RQC 의 접합면과 quadruplex 와 결합시 사용되는 접합면이 다름을 보임.
BLM RQC 도메인에 T2G4, Myc-2345 를 각각 적정하여 ITC 로 Microcalories 를 측정하여 결합반응이 흡열이며 엔트로피가 증가한다는 것을 보임.

Abstract ▼

BLM (Bloom syndrome protein) is one of the five members of RecQ helicase family. It binds various DNA structures such as duplex, bubble, fork, junction and G-quadruplex via RQC (RecQ C-terminal) domain. BLM RQC domain has binding preference with G-quadruplex. However, the accurate binding mechanism

BLM (Bloom syndrome protein) is one of the five members of RecQ helicase family. It binds various DNA structures such as duplex, bubble, fork, junction and G-quadruplex via RQC (RecQ C-terminal) domain. BLM RQC domain has binding preference with G-quadruplex. However, the accurate binding mechanism of BLM RQC domain for G-quadruplex is still elusive. In this study, we prepared two types of G-quadruplex, T2G4 and Myc-2345. G-quadruplex formation was confirmed with 1D NMR spectra. Each DNA was titrated into BLM RQC domain for measuring binding enthalpy and entropy. For both cases, binding enthalpies were positive (endothermic) and entropies were also increased. The Myc2345 titration into ¹⁵N labeled BLM RQC domain was performed for monitoring the chemical shift perturbation. The data shows that the binding surfaces for Myc2345 are different from those for the duplex DNA.

목차 Contents

• 제출문 ... 1
• 보고서 초록 ... 2
• 요약문 ... 3
• SUMMARY ... 4
• CONTENTS ... 5
• 목차 ... 6
• 제 1 장 연구개발과제의 개요 ... 7
• 제 2 장 국내외 기술개발 현황 ... 8
• 제 3 장 연구개발수행 내용 및 결과 ... 9
• 제 4 장 목표달성도 및 관련분야에의 기여도 ... 12
• 제 5 장 연구개발결과의 활용계획 ... 13
• 제 6 장 연구개발과정에서 수집한 해외과학기술정보 ... 13
• 제 7 장 참고문헌 ... 13
• 끝페이지 ... 14