초록 ▼

Ⅳ. 연구개발결과
- 메모리 0.5테라, 하드용량 11테라 수준의 TG 전용서버 구축 완료 (총 7200 만원)
- 데이터베이스 연동 비교유전체 분석 시스템 개발
- M. truncatula-A. thaliana 환경스트레스 유전자를 이용한 비교유전체 분석
- 두과 표준유전체 가용 5종의 정보를 이용 기본 G-browser 구축
- Ortholg 동정을 위한 알고리즘 개발 및 TOGBD 구축
- MCSCAN 프로그램을 활용한 comparative G-browser 구축
- 1.4K ABS 반응

Ⅳ. 연구개발결과
- 메모리 0.5테라, 하드용량 11테라 수준의 TG 전용서버 구축 완료 (총 7200 만원)
- 데이터베이스 연동 비교유전체 분석 시스템 개발
- M. truncatula-A. thaliana 환경스트레스 유전자를 이용한 비교유전체 분석
- 두과 표준유전체 가용 5종의 정보를 이용 기본 G-browser 구축
- Ortholg 동정을 위한 알고리즘 개발 및 TOGBD 구축
- MCSCAN 프로그램을 활용한 comparative G-browser 구축
- 1.4K ABS 반응 유전자 발굴 및 환경 스트레스 반응 중심 유전자 발굴
- 문헌 기반 459개 환경스트레스 내재해성 엘리트 유전자 발굴 및 유전자 발현, 네트웍 분석
- 종간장벽극복 유전자마커 디자인 프로그램 개발 및 특허출원
- Trait-associated 유전자마커 개발(120개)
- G-browser: TOGDB: CGB: CSGM Designer 연동 인터페이스 개발

Abstract ▼

Recent accumulation of genomic information have greatly facilitated the discovery of trait-associated genes and application of the knowledge for the molecular breeding of important crop plants. In this study, we aimed to develop translational genomics interface and/or platform for the legume crops.

Recent accumulation of genomic information have greatly facilitated the discovery of trait-associated genes and application of the knowledge for the molecular breeding of important crop plants. In this study, we aimed to develop translational genomics interface and/or platform for the legume crops. For this purpose, we constructed genome browser employing five legume species whose genomes were fully sequenced. To efficiently translate genomic information between different legume species, we developed algorithm by which can search ortholgous genes and constructed tentative ortholgous gene database(TOGDB). Based on the TOGDB, comparative genomic analyses were performed and comparative genomic map for M. truncatula and Arabidopsis was constructed. In addition, we developed a program with which one can design cross-species genic markers, which was named the CSGM designer and linked with corresponding genomic information. We anticipate that this interface and database should be useful for breeders to search genomic information of breeding interest and to design molecular genic markers that are associated with crop traits.