최소 단어 이상 선택하여야 합니다.
최대 10 단어까지만 선택 가능합니다.
다음과 같은 기능을 한번의 로그인으로 사용 할 수 있습니다.
NTIS 바로가기다음과 같은 기능을 한번의 로그인으로 사용 할 수 있습니다.
DataON 바로가기다음과 같은 기능을 한번의 로그인으로 사용 할 수 있습니다.
Edison 바로가기다음과 같은 기능을 한번의 로그인으로 사용 할 수 있습니다.
Kafe 바로가기주관연구기관 | 서울대학교 Seoul National University |
---|---|
보고서유형 | 최종보고서 |
발행국가 | 대한민국 |
언어 | 한국어 |
발행년월 | 2014-12 |
과제시작연도 | 2014 |
주관부처 | 환경부 Ministry of Environment |
과제관리전문기관 | 국립생물자원관 National Institute of Biological Resources |
등록번호 | TRKO201500011394 |
과제고유번호 | 1485012803 |
사업명 | 생물자원발굴및분류연구 |
DB 구축일자 | 2015-07-18 |
5. 연구결과 및 결론
○ 난분해성 물질 분해능 우수 균주의 게놈 복잡도 분석해독된 버섯균의 paired-end library 데이터를 사용하여 5종 버섯균의 genome size를 예측하였다 (표 3).
난분해성 환경오염 물질 분해능이 우수한 버섯균 버섯균의 지놈 사이즈는
• IUM0470의 경우 34,410,224 bp ~ 36,771,336 bp,
• IUM1277의 경우 70,037,542 bp ~ 71,412,845 bp,
• IUM1343의 경우 36,079,007 bp ~ 36,637,907
5. 연구결과 및 결론
○ 난분해성 물질 분해능 우수 균주의 게놈 복잡도 분석해독된 버섯균의 paired-end library 데이터를 사용하여 5종 버섯균의 genome size를 예측하였다 (표 3).
난분해성 환경오염 물질 분해능이 우수한 버섯균 버섯균의 지놈 사이즈는
• IUM0470의 경우 34,410,224 bp ~ 36,771,336 bp,
• IUM1277의 경우 70,037,542 bp ~ 71,412,845 bp,
• IUM1343의 경우 36,079,007 bp ~ 36,637,907 bp,
• IUM4004의 경우 71,047,842 bp ~ 76,392,113 bp,
• IUM4122의 경우 60,178,739 bp ~ 64,340,778 bp 로 예측되어진다.
○ 식물내생균 등 환경적 가치가 높은 진균(자낭균) 3종의 게놈 지도(draft map) 작성진균 3종에 대한 contig/sccaffold assembly를 수행하여 다음 표 4와 같은 draft assembly 결과를 얻을 수 있었다.
본 연구를 통하여 자생 생물의 주권주장과 활용기반 마련을 위한 유전적 근거 확보를 위한 노력으로 자생 생물과 해외 근연종, 종내 개체군의 비교 분석을 통해 우리나라 생물자원의 특이성 규명을 위한 유전자 표지 개발의 일환으로 환경 오염 물질 분해 능력이 뛰어난 버섯균과 식물내생균 등 환경적 가치가 높은 진균의 genome의 유전자 기능 및 유전자 지도를 연구⦁분석하여 집단 / 원산지간 구별 표지 개발을 위한 simple sequence repeat (SSR) 후보를 탐색하고 primer 서열을 발굴하여 우리나라 자생생물 유전자원의 생물적 주권과 국내 생물 다양성 관리를 위한 연구를 진행하였다.
We analyzed 8 genome of five mycophagists strains ( IUM0470, IUM1277, IUM1343, IUM4004, IUM4122) which have catabolic ability of oil and artificial dye wastes and three plant endomycorrhizae ( JS573, JS626, JS1030 ) which produce metabolite available against virus hephtitis.
We used next generati
We analyzed 8 genome of five mycophagists strains ( IUM0470, IUM1277, IUM1343, IUM4004, IUM4122) which have catabolic ability of oil and artificial dye wastes and three plant endomycorrhizae ( JS573, JS626, JS1030 ) which produce metabolite available against virus hephtitis.
We used next generation sequencing technology of whole genome shotgun sequencing and de novo assembly to reveal fungal genetic properties. Also we designed simple sequence repeat(SSR) genetic marker from NGS data, that made use of distinguish population.
The sequence data of five strains of mycophagists was collected with Illumina Hiseq 2500 highoutput and to analyze genome complexity with k-mer analysis method. Genome size of five mycophagists strains were estimated 34Mbp, 70Mbp,36Mbp, 71Mbp, 60Mbp each. We made various span size ( 400bp, 500bp, 5kb, 10kb)NGS library to draft genome map on three starins of plant endomycorrhizae. The whole genome de novo assembly made out that JS573 is 98 scaffold with 399 contigs,JS626 is 64 scaffold with 217 contigs, JS1030 is 76 scaffold with 311 contigs.
This study suggest basic genetic information of hardly-biodegradable pollutants degradable strains isolated from local bio-resources. Arrange a base of scientific researches and industrial gene analysis research, and management system by collecting gene information resources for future industries related to organisms.Also, The genome sequence will be used for the mechanism and functional studies of useful metabolite, catabolic synthesis and high-throughput produce.
과제명(ProjectTitle) : | - |
---|---|
연구책임자(Manager) : | - |
과제기간(DetailSeriesProject) : | - |
총연구비 (DetailSeriesProject) : | - |
키워드(keyword) : | - |
과제수행기간(LeadAgency) : | - |
연구목표(Goal) : | - |
연구내용(Abstract) : | - |
기대효과(Effect) : | - |
Copyright KISTI. All Rights Reserved.
※ AI-Helper는 부적절한 답변을 할 수 있습니다.