초록 ▼

1. 폐렴구균 혈청형 6D에 대한 분석
- 혈청형 6D의 균주에 대해 MLST 분석을 실시하여 국내에는 ST282가 주로 분포하고 있음을 밝혀냄.
- 혈청형 6D 균주의 cps locus 분석을 통하여 이들 균주가 국내에 존재하는 다른 clone과의 recombiation에 의해 출현했음을 밝혀냈음.
2. 폐렴구균의 새로운 혈청형으로 추정되는 "serotype 6E"에 대한 분석
- MLST 및 cps locus를 통하여 기본적으로 다른 균주들과는 다른 유전적 배경을 지닌 'putative serotype 6E

1. 폐렴구균 혈청형 6D에 대한 분석
- 혈청형 6D의 균주에 대해 MLST 분석을 실시하여 국내에는 ST282가 주로 분포하고 있음을 밝혀냄.
- 혈청형 6D 균주의 cps locus 분석을 통하여 이들 균주가 국내에 존재하는 다른 clone과의 recombiation에 의해 출현했음을 밝혀냈음.
2. 폐렴구균의 새로운 혈청형으로 추정되는 "serotype 6E"에 대한 분석
- MLST 및 cps locus를 통하여 기본적으로 다른 균주들과는 다른 유전적 배경을 지닌 'putative serotype 6E"가 존재함을 밝혀냈음.
- 국내에서의 "putative serotype 6E"의 분포를 조사한 결과, polysaccharide conjugate vaccine 7 (PCV7)의 사용에도 불구하고 감소추세를 나타내지 않던 serotype 6B가 실은 "putative serotype 6E"였음을 밝혀냄.
- "Putative serotype 6E"는 대부분 CC90에 포함되었으며, 항생제 내성률이 높았음
- 아시아 전 지역에 걸쳐서 "putative serotype 6E"가 존재했으며, clonal spread에 의해서 퍼졌음을 알 수 있었음.
3. 폐렴구균에서 "putative serotype 6E"의 탐지 방법 개발 및 새로운 serotype인지 여부 확인
- cps locus의 염기서열을 바탕으로 "putative serotype 6E"를 detection할 수 있는 PCR 방법을 개발하고, 이를 국내와 아시아 지역의 균주에 적용하여 "putative serotype 6E"의 불포를 확인할 수 있었음.
- serological analysis, mouse의 mAb를 이용한 Flow cytometric serotyping, QC serum을 이용한 opsonophagocytosis,1H-NMR anormeri proton peaks, 1H- 13C NMR spectra overlay를 이용하여 "putative serotype 6E"가 새로운 serotype인지를 확인- 기존의 Quellung method를 이용한 serotype과 같은 결과를 보여 새로운 serotype인지 여부를 최종적으로 확인하지 못하였으나, 상당한 cps locus의 변이에도 불구하고 이러한 결과가 나온 것은 이례적인 것으로 추후 연구할 가치가 있음.

Abstract ▼

1. To characterize the Streptococcus pneumoniae ‘ serotype 6E’ , complete cps loci were sequenced. The capsular genes of the ‘ serotype 6E’ isolates differed much from those of serotypes 6A and 6B. We identified ten additional ‘ serotype 6E’ isolates, which are not confined to a restricted geographi

1. To characterize the Streptococcus pneumoniae ‘ serotype 6E’ , complete cps loci were sequenced. The capsular genes of the ‘ serotype 6E’ isolates differed much from those of serotypes 6A and 6B. We identified ten additional ‘ serotype 6E’ isolates, which are not confined to a restricted geographic locality. Most of ‘ serotype 6E’ isolates belonged to ST90 and its single-locus variants. Homogeneity of genetic background and cps loci suggests a recent origin of the ‘ serotype 6E’ isolates.
2. The prevalence of serogroup 6 was investigated among 1,206 Streptococcus pneumoniae clinical isolates collected from Korean hospitals over three periods (1996-2001, 2004-2006, and 2008-2009). The number of serogroup 6 isolates increased from 9.7% to 17.5% over the three periods.Twenty-four isolates (2.0%) were typed as the recently identified ‘ putative serotype 6E’ or genetic variants of serotype 6B. The results suggest that the lack of change in frequency of serotype 6B, in spite of the introduction of the PCV7 vaccine as seen in previous studies in South Korea, might be mainly due to the improper inclusion of ‘ putative serotype 6E’ into serotype 6B. All but three “ serotype 6E” isolates belonged to CC90, indicating their clonal expansion.
3. The prevalence, antimicrobial susceptibility, and genotypes of Streptococcus pneumoniae “ putative serotype 6E” isolates from Asian countries were investigated. A total of 244 S. pneumoniae serogroup 6 isolates obtained from 11 Asian countries were included in this study. Multilocus sequence typing revealed that CC90, including ST90 and itsvariants, was the most prevalent clonal group of “ putative serotype 6E” isolates (n = 63; 62.4%). CC146 and CC315 were also found frequently in some of the countries. Our results indicate that “ putative serotype 6E” is prevalent in Asian countries. The clonal dissemination of “ putative serotype 6E” isolates was also identified.
4. We investigated whether "putative serotype 6E" really represents a new serotype by method of serological analysis, Flow cytometric serotyping, opsonophagocytosis, 1H-NMR anormeri proton peaks, and 1H- 13C NMR spectra overlay. As a result, the "putative serotype 6E" showed the similar characteristics with the results with Quellung method in spite of large sequence variation of cps locus. This results is abnormal, which is worth to studying.