초록 ▼

□ 연구결과
- 1차년도에서는 RNA-seq을 사용하여 대장균 내 발현되는 총 전사체들의 정량, 정성분석을 진행하여 각 유전자에 대한 발현양을 분석하였으며, ChIP-exo를 위한 조건 및 프로토콜을 최적화 하여, 전사 억제제, 리팜피신 (Rifampicin) 의 첨가 유무에 따른 RNA 중합효소에 대한 ChIP-exo 를 진행하였고, 이를 통하여, 전체 RNA중합효소의 결합부위를 유전체 수준에서 규명하고 비교 분석함으로써, 전사시작위치에서의 RNA 중합효소의 역학 메커니즘을 제시하였음.
- 2차년도에서는 RNA중합효소의

□ 연구결과
- 1차년도에서는 RNA-seq을 사용하여 대장균 내 발현되는 총 전사체들의 정량, 정성분석을 진행하여 각 유전자에 대한 발현양을 분석하였으며, ChIP-exo를 위한 조건 및 프로토콜을 최적화 하여, 전사 억제제, 리팜피신 (Rifampicin) 의 첨가 유무에 따른 RNA 중합효소에 대한 ChIP-exo 를 진행하였고, 이를 통하여, 전체 RNA중합효소의 결합부위를 유전체 수준에서 규명하고 비교 분석함으로써, 전사시작위치에서의 RNA 중합효소의 역학 메커니즘을 제시하였음.
- 2차년도에서는 RNA중합효소의 특이성을 결정하는 시그마인자, 시그마인자 70과 시그마인자 32 에 의한 RNA 중합효소 프로모터의 인지부위를 차세대 시퀀싱 기반 ChIP-exo를 통해 규명함. 특히 기본 성장조건과 함께, 단기간 열처리에 의한 sigma 70과 sigma 32의 결합부위 및 인지과정에 대한 비교실험을 진행하여, 열에 의해 특이적으로 변화하는 프로모터들을 추가적으로 규명함. 또한 1차년도에 진행했던, RNA 중합효소와 시그마인자가 결합되어 있는 RNA 중합효소들의 역학을 단일염기 수준의 분해능으로 비교 분석하여 전사시작단계에서의 이들의 역학적 메커니즘을 제시함.
- 3차년도에서는 1차년도와 2차년도에서 규명하였던 전사체들의 정량분석 및 프로모터의 규명을 통해 프로모터 라이브러리를 데이터베이스화 하고, 벡터 시스템에서 다양한 프로모터에 대한 단백질 합성의 조절에 대한 플랫폼을 제시함.
(출처 : 한글요약문 4p)

Abstract ▼

□ Result
○ The quantitative and qualified analysis of total transcriptome expressed in cellular conditions were performed using stranded specific RNA-seq in genome-scale. Then, the regions bound by the RNA polymerase were discovered with single-nucleotide resolution through optimized ChIP-exo pro

□ Result
○ The quantitative and qualified analysis of total transcriptome expressed in cellular conditions were performed using stranded specific RNA-seq in genome-scale. Then, the regions bound by the RNA polymerase were discovered with single-nucleotide resolution through optimized ChIP-exo protocol³² were identified using ChIP-exo in 30℃ and heat shocked condition of 42℃ with high resolution of single base-pair. Taken together with the recognition profiles of RNA polymerase, integrated interpretation of all results suggested the dynamic model of RNA polymerase during transcription initiation. Especially, we discovered that the RNA polymerase is stalled in the upstream of promoter and prepares the transcription initiation as scrunching the DNA of the downstream of promoter into their active site.
○ The promoters recognized by σ⁷⁰ and σ³² were determined from ChIP-exo, and especially the promoters recognized by σ³² responded by heat-shock, were classified in special.
○ From the sum of the promoter database information and transcriptome analysis, the vector system to control the protein expression according to the promoter strength was constructed and examined the correlation of promoter strength in vector system.
(출처 : SUMMARY 5p)

목차 Contents

• 표지 ... 1
• 목차 ... 2
• 연구계획요약 ... 3
• 연구결과 요약문 ... 4
• 한글요약문 ... 4
• SUMMARY ... 5
• 연구내용 및 결과 ... 6
• 1. 연구개발과제의 개요 ... 6
• 2. 국내외 기술개발 현황 ... 8
• 3. 연구수행 내용 및 결과 ... 11
• 4. 목표달성도 및 관련분야에의 기여도 ... 52
• 5. 연구결과의 활용계획 ... 53
• 6. 연구과정에서 수집한 해외 과학기술정보 ... 53
• 7. 참고문헌 ... 54
• 8. 연구성과 ... 55
• 9. 국가과학기술지식정보서비스에 등록한 연구시설.장비 현황 ... 58
• 10. 연구개발과제 수행에 따른 연구실 등의 안전조치 이행실적 ... 58
• 11. 기타사항 ... 60
• 끝페이지 ... 60