보고서 정보
주관연구기관 |
가톨릭관동대학교 |
연구책임자 |
김유진
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보고서유형 | 최종보고서 |
발행국가 | 대한민국 |
언어 |
한국어
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발행년월 | 2017-08 |
과제시작연도 |
2016 |
주관부처 |
미래창조과학부 Ministry of Science, ICT and Future Planning |
등록번호 |
TRKO201800003495 |
과제고유번호 |
1711041764 |
사업명 |
개인연구지원 |
DB 구축일자 |
2018-04-21
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키워드 |
위선종.위암.바이오마커.microRNA.gastric adenocarcinoma.gastric adenoma.biomarker.
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초록
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연구의 목적 및 내용
위암은 우리나라 조사망율 3위의 질환으로, 조기위암은 5년 생존율이 우수하나, 진행위암은 다른 암종과 크게 다르지 않다. 조기진단, 조기치료가 중요한 질환으로, 조기질환의 바이오마커를 발굴하는 것이 필요하다. 내시경 점막하박리술을 시행한 위암 및 위선종 조직과 환자 혈청에서 microRNA 발현을 분석하여, microRNA 조절장애가 발생하는 암화과정의 단계을 규명하고, 이를 토대로 바이오마커를 발굴하고자 하였다.
연구결과
위선종, 조기위암으로 내시경 점막하 박리술을 시행 받은 환자 12
연구의 목적 및 내용
위암은 우리나라 조사망율 3위의 질환으로, 조기위암은 5년 생존율이 우수하나, 진행위암은 다른 암종과 크게 다르지 않다. 조기진단, 조기치료가 중요한 질환으로, 조기질환의 바이오마커를 발굴하는 것이 필요하다. 내시경 점막하박리술을 시행한 위암 및 위선종 조직과 환자 혈청에서 microRNA 발현을 분석하여, microRNA 조절장애가 발생하는 암화과정의 단계을 규명하고, 이를 토대로 바이오마커를 발굴하고자 하였다.
연구결과
위선종, 조기위암으로 내시경 점막하 박리술을 시행 받은 환자 12명을 등록하였다. 시술전 microRNA 분석에 대해 동의한 환자에 한하여 등록하고 샘플 채취를 하였다. 시술직전 조직생검 겸자로 정상 점막에서 2 조각, 종양조직에서 2조각을 채취하였다. 채취한 조직은 바로 질소탱크에 보관하였다. 전체 RNA는 mirVana PARIS Kit (Ambion, USA)를 이용하여 추출하였다.Affymetrix Gene-Chip miRNA 4.0 array (Homo sapiens)을 이용하여 miRNA expression profile을 분석하였다. Affymetrix GCS 3000 canner (Affymetrix, Santa Clara, California, United States)을 이용하여 scan하였고, Affymetrix GeneChip™ Command Console software를 이용하여 signal value를 수치화하였다. cDNA는 TaqMan MicroRNA Reverse Transcription Kit를 이용하여 역전사되었다. miR-421, miR-29b_1_5p, and miR-27b_5p expression level을 확인하기 위하여 TaqMan MicroRNA Assays (Applied Biosystems)을 이용하여 qRT-PCR을 시행하였다. U6 sn RNA가 internal control로 사용되었다. 발현된 miRNA의 absolute number는 GeneChip miRNA 4.0 arrays의 표면에 합성된 2578개의 human nature miRNA의 oligonucleotide의 intensity value를 토대로 측정하였다. present value는 statistical present/absent calls method로 Expression Console Software (Affymetrix)를 이용하여 계산하였다. 2578 mature miRNA probe set에서 ~1600은 모든 조직샘플에서 positive value를 보였다. detected probe 수에 있어서, 정상 control, low grade dysplasia, high grade dysplasia 그룹간 통계적 유의한 차이는 없었다. up-regulation된 miRNA는 28개, down-regulation된 miRNA는 10개가 정상조직 group 과 low-/high-grade dysplasia group에서 유의하게 다른 발현을 보였다. microarray data의 정확도와 신뢰도를 확인하기 위하여 microarray를 시행한, 같은 조직의 RNA 샘플을 이용하여 TaqMan MicroRNA Assays를 이용하여 qRT-PCR을 시행하였다. microarray에서 변화를 보인 miRNA를 선정하여, RT-PCR를 발현 양상을 분석하였다. 3개의 miRNA (miR-421, miR-29b-1-5p, miR-27b-5p)는 정상, low grade dysplasia, high grade dysplasia에서 upregulation되어 있었다.
연구결과의 활용계획
기존 연구는 전이가 일어난 위암에서 miRNA 변화를 분석한 것이 많았다. 본 연구에서는 전암단계인 위선종에서의 miRNA 변화를 발견해 냈으며, 내시경적 변화가 나타나기전, 암발생을 예측할 수 있는 조기진단의 예후인자, 바이오마커로 이용을 기대할 수 있다.
( 출처 : 한글요약문 5p )
Abstract
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Purpose&contents
Gastric cancer the 3rd leading cause of cancer-related death in Korea. Five-year survival in patients with early gastric cancer exceed 90%, however, that of advanced gastric cancer is still poor. It is important to detect and treat gastric cancer in early stage. We aim
Purpose&contents
Gastric cancer the 3rd leading cause of cancer-related death in Korea. Five-year survival in patients with early gastric cancer exceed 90%, however, that of advanced gastric cancer is still poor. It is important to detect and treat gastric cancer in early stage. We aim to investigate the alterations in miRNA expressions in gastric carcinogenesis, by miRNA microarray and real-time PCR, and discover the biomarkers for early diagnosis.
Result
In this study, we have carried out a high throughput screening of microRNA expression alterations by microarray analysis and normal control tissues and paired low-/high-grade dysplasia samples. We report here a study of the levels of 2578 mature miRNA in normal, low- and high-grade dysplasia samples by GeneChip miRNA 4.0 Arrays. Besides the previously described miRNAs in normal and gastric carcinoma lesions, we also identified new, less known miRNAs(miR-421, miR-29b-1-5p, miR-27b-5p), with altered expression in different grade dysplasia compare with normal samples. Our data also showed that miRNA expression alteration by TaqMan RT-PCR could be observed also in other patients and may serve as valuable early diagnostic markers. Correlations of miRNA expression and predicted target mRNA could be explored further in functional analysis of gastric adenocarcinoma development related alterations.
Expected Contribution
We found that three miRNAs (miR-421, miR-29b_1_5p, and miR-27b_5p) were continually upregulated in normal, low- and high grade dysplasia tissues. We expect that detection of these three miRNAs in gastric juice or blood will help to detect early gastric cancer, not only by upper gastrointestinal endoscopy.
( 출처 : SUMMARY 6p )
목차 Contents
- 표지 ... 1
- 목차 ... 3
- 연구계획 요약문 ... 4
- 연구결과 요약문 ... 5
- 한글요약문 ... 5
- SUMMARY ... 6
- 연구내용 및 결과 ... 7
- 1. 연구개발과제의 개요 ... 7
- 2. 연구수행 내용 및 결과 ... 7
- 3. 목표달성도 및 관련분야에의 기여도 ... 11
- 4. 연구결과의 활용계획 ... 12
- 5. 주관연구책임자 대표적 연구실적 ... 13
- 6. 참고문헌 ... 13
- 7. 연구성과 ... 14
- 8. 국가과학기술지식정보서비스에 등록한 연구시설‧장비 현황 ... 14
- 9. 기타사항 ... 14
- 별첨1 대 표 연 구 성 과 ... 15
- 별첨2 세부 목표 관련 증빙 ... 29
- 끝페이지 ... 39
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