초록 ▼

□ 연구개발 목표 및 내용
○ 최종 목표
본 연구의 목적은 간암에서 정상조직과 암조직에서의 후성유전체 분석을 수행하고 암 이질성과 후성유전체 특징들 사이에 어떤 연관관계가 있는지를 밝히고 이를 기반으로 간암 이질성 기전을 이해하고 진단에 유용한 타겟을 발굴하고자 함.

○ 전체 내용
간암시료를 확보하고 이를 이용하여 miRNA-Seq 및 RNA-seq 데이터를 생산하였으며, NMF 알고리즘을 이용하여, MC19 및 MC14 특성을 지닌 아형을 발굴하였으며, 각 아형마다 분자적 특성을 규명하기 위해, miR

□ 연구개발 목표 및 내용
○ 최종 목표
본 연구의 목적은 간암에서 정상조직과 암조직에서의 후성유전체 분석을 수행하고 암 이질성과 후성유전체 특징들 사이에 어떤 연관관계가 있는지를 밝히고 이를 기반으로 간암 이질성 기전을 이해하고 진단에 유용한 타겟을 발굴하고자 함.

○ 전체 내용
간암시료를 확보하고 이를 이용하여 miRNA-Seq 및 RNA-seq 데이터를 생산하였으며, NMF 알고리즘을 이용하여, MC19 및 MC14 특성을 지닌 아형을 발굴하였으며, 각 아형마다 분자적 특성을 규명하기 위해, miRNA-mRNA 간의 상관관계 분석 수행 및 타겟 유전자 후보군을 확인함. 또한, TCGA 데이터를 이용하여 분석 검증을 수행하였으며 cell line을 이용하여 검증을 진행함.

○ 1단계
● 목표
[1차년도]: miRNA-seq 및 RNA-seq 데이터생산 및 멀티오믹스 데이터 통합분석 기술 개발
[2차년도]: MC19 및 MC14 분자특성 규명 및 분자조절 기전 발굴
[3차년도]: 공개유전체 데이터 를 활용한 타겟 검증
● 내용
[1차년도]: 58개 간암샘플을 확보하고 데이터생산 및 통합분석을 위한 분석파이프라인을 최적화함.
[2차년도]: NMF 분석을 통해, MC19 및 MC14 아형을 확인하고, miRNA-mRNA 상관관계 분석을 통해, 아형 특이적으로 X-CTA 및 imprinting 유전자들과 관련 있음을 확인하고, 이들 유전자들은 epigenomic regulation됨을 확인함.
[3차년도]: 공개유전체인 TCGA 데이터를 활용한 검증 및 세포 실험을 통한 타겟유전자의 검증을 진행함.

□ 연구개발성과
○ 간암시료 및 임상정보 확보를 통한 간암의 유전체데이터를 생산함.
○ 간암의 데이터 분석을 통한 miRNA 기반의 간암의 아형을 분류함.
○ miRAN-mRNA 상관관계 분석을 통한 아형 특이적으로 발현하는 유전자 군들을 확인함.
○ public data인 TCGA-LIHC 데이터를 활용 및 검증을 수행함.
○ 임상적으로 관련성이 있는 타겟 miRNA-mRNA pair를 확인하고, 타겟 miRNA는 HCC cell line을 이용하여 실험적 검증을 수행함.

□ 연구개발성과 활용계획 및 기대 효과
○ 본 연구를 통해 생산된 데이터 및 임상 데이터는 향후 암의 발달, 진행, 전이 등의 기전 연구를 위한 기반이 될 것으로 기대됨.
○ 구축된 타겟 발굴 파이프라인은 이후 연구진들의 유전체분석을 위한 원천기술로 활용될 것으로 보임.
○ 검증된 타겟 정보를 활용하여 암 환자의 예후 예측 및 치료 방법을 선택하는데 활용이 될 것으로 기대됨. 또한, 검증된 타겟의 진단키트 개발에 따라 맞춤 의료의 실현을 가속화 시킬 것으로 기대되며, 나아가 암 치료율의 증가에 따른 개인 삶의 질 향상이 될 것으로 예상됨.

(출처 : 요약문 2p)

목차 Contents

• 표지 ... 1
• 요약문 ... 2
• 1. 연구개발과제의 개요 ... 4
• 2. 연구개발과제의 수행 과정 및 수행 내용 ... 4
• 3. 연구개발과제의 수행 결과 및 목표 달성 정도 ... 5
• 1) 연구수행 결과 ... 5
• 2) 목표 달성 수준 ... 7
• 4. 연구개발성과의 관련 분야에 대한 기여 정도 ... 8
• 5. 연구개발성과 및 활용 계획 ... 8
• 1) 연구성과 ... 8
• 2) 연구성과 활용계획 ... 8
• 6. 참고문헌 ... 9
• 끝페이지 ... 9