초록 ▼

연구의 목적 및 내용
T1 병기 신세포암에서의 적절한 개별 맞춤 치료를 위해, 기존의 예후 바이오마커로 알려진 VHL, PBRM1, SETD2, BAP1, KDM5C, mTOR 및 본 연구진들이 새로이 제시한 FOXC2와 CLIP4의 발현을 임상 양상과 비교 분석하여, 예후 바이오마커로서의 FOXC2와 CLIP4의 유효성을 평가하고 이를 바탕으로 술 후 및 술 전 고위험군 예측 모형을 개발하고자 함.

연구개발성과
1. 수술조직 FFPE를 기반으로 한 분자학적 술 후 고위험군 예측 모형의 개발: 공격적인 신세포

연구의 목적 및 내용
T1 병기 신세포암에서의 적절한 개별 맞춤 치료를 위해, 기존의 예후 바이오마커로 알려진 VHL, PBRM1, SETD2, BAP1, KDM5C, mTOR 및 본 연구진들이 새로이 제시한 FOXC2와 CLIP4의 발현을 임상 양상과 비교 분석하여, 예후 바이오마커로서의 FOXC2와 CLIP4의 유효성을 평가하고 이를 바탕으로 술 후 및 술 전 고위험군 예측 모형을 개발하고자 함.

연구개발성과
1. 수술조직 FFPE를 기반으로 한 분자학적 술 후 고위험군 예측 모형의 개발: 공격적인 신세포암에서 FOXC2, PBRM1,BAP1의 발현이 유의하게 낮은 것을 확인함.logistic regression method와 deep-learning method를 이용하여 각각 0.760 및 0.796의 AUC를 나타내는 예측 모형을 개발함.
2. 환자 임상 데이터를 활용한 혈액 기반의 술 전 예측 모델의 가능성 확인: 술 전 채혈한 혈액에서의 controlling nutritional status (CONUT) score 및 monocyte-lymphocyte ratio가 생존과 연관됨을 확인하였고, neutrophil-lymphocyte ratio가 병리적인 renal sinus fat invasion과 연관됨을 확인하여 혈액 기반의 고위험군 예측 모형의 가능성을 확인함.
3. 신세포암의 진행과 연관되는 것으로 알려진 기존의 유전자들을 검증하고, 신세포암의 공격성을 반영하는 새로운 바이오마커 유전자 후보군을 발견함
(MOCOS, RGPD8, BAIAP2L1, DDX11, SLC16A9, FRAS1, NPR3, AQP1, TMEM38B, PRUNE2).
4. 높은 악성도를 나타내는 신세포암을 예측하기 위해 술 전 혈액에서 PBRM1, BAP1, SETD2, KDM5C, FOXC2, CLIP4, AQP1, DDX11, BAIAP2L1, 및 TMEM38B의 mRNA 발현을 분석한 결과 SETD2, DDX11의 발현이 유의하게 연관되는 것으로 나타나 이를 기반으로 AUC 0.971 및 97.14%의 accuracy의 고등급 신세포암을 예측하는 술 전 예측 모형을 개발함.

연구개발성과의 활용계획 (기대효과)
1. 기술적 측면: 실제 임상에 적용할수 있는 고등급 신세포암을 예측하는 술 전 유전자 검사 키트 개발
2. 경제적 산업적 측면:
- T1 병기 신세포암에서의 적절한 고위험군 선정에 따른 치료 및 추적검사 시행으로 저위험군의 경우, 불필요한 과도한 수술 및 추적 검사의 자제 및 고위험군에서의 적극적인 치료 및 추적 검사를 통해 환자의 생명 연장 및 삶의 질 개선 가능.

(출처 : 요약문 12p)

Abstract ▼

Purpose&Contents
For appropriate personalized treatment in T1 stage renal cell carcinoma, the purpose of this study is to compare the expression of VHL, PBRM1, SETD2, BAP1, KDM5C, mTOR, known as prognostic biomarkers and the newly presented FOXC2 and CLIP4 with clinical features, evaluate the eff

Purpose&Contents
For appropriate personalized treatment in T1 stage renal cell carcinoma, the purpose of this study is to compare the expression of VHL, PBRM1, SETD2, BAP1, KDM5C, mTOR, known as prognostic biomarkers and the newly presented FOXC2 and CLIP4 with clinical features, evaluate the effectiveness of FOXC2 and CLIP4 as prognostic biomarkers, and develop a postoperative and preoperative model for high risk group in T1 renal cell carcinoma.

Results
1. Development of High Risk Group Prediction Model Based on Surgical Tissue FFPE: In aggressive renal cell carcinoma, expression of FOXC2, PBRM1, BAP1 was found to be significantly low. Using the logistic regression method and the deep-learning method, we developed a predictive model representing the AUC of 0.760 and 0.796, respectively.
2. Check the possibility of blood-based preoperative predictive model using patient clinical data: The control nutritional status (CONUT) score and the monocyte-lymphocyte ratio in the blood taken before surgery were correlated with survival, and neutrophil-lymphocyte ratio is associated with pathological renal sinus fat invasion. So we confirmed the possibility of a blood-based high risk group prediction model
3. We validated existing genes known to be associated with the progression of renal cell carcinoma and discovered new biomarker candidate genes that reflect renal cell cancer aggressiveness (MOCOS, RGPD8, BAIAP2L1, DDX11, SLC16A9, FRAS1, NPR3, AQP1, TMEM38B, PRUNE2).
4. To predict high grade renal cell carcinoma, we analyzed the mRNA expression of PBRM1, BAP1, SETD2, KDM5C, FOXC2, CLIP4, AQP1, DDX11, BAIAP2L1, and TMEM38B in preoperative blood. As a result, expression of SETD2 and DDX11 was significantly correlated, and based on this, we developed a preoperative prediction model to predict high grade renal cell carcinoma with AUC 0.971 and accuracy of 97.14%.

Expected Contribution
1. Technical aspects: Development of preoperative genetic test kits for predicting high grade renal cell carcinoma applicable to actual clinical practice
2. Economic and industrial aspects
- According to appropriate selection of high-risk group for stage 1 renal cell carcinoma, in case of low-risk group, unnecessary excessive surgery and follow-up examination can be avoided, and active treatment and surveillance in high-risk group can improve patient survival and quality of life.

(source : SUMMARY 13p)

목차 Contents

• 표지 ... 1
• 보고서요약 ... 2
• 제출문 ... 10
• 보고서 요약서 ... 11
• 국문 요약문 ... 12
• SUMMARY ... 13
• Table of contents ... 14
• 목차 ... 15
• 1. 연구개발과제의 개요 ... 17
• 2. 국내외 기술개발 현황 ... 18
• 3. 연구 수행 내용 및 결과 ... 19
• 가. 수술 조직 FFPE 표본에서의 바이오마커 발현 분석을 바탕으로 한 술 후 분자학적 고위험군 예측 모형의 개발 ... 19
• 나. 환자 임상 데이터를 활용한 혈액 기반의 술 전 예측 모델의 가능성 확인 ... 21
• 다. 신세포암의 진행과 연관되는 것으로 알려진 기존의 유전자들의 검증 및 신세포암의 공격성을 반영하는 새로운 바이오마커 유전자 후보군의 발굴 ... 25
• 라. 고등급 신세포암을 예측하는 술 전 혈액 기반의 예측 모형의 개발 ... 27
• 4. 목표 달성도 및 관련 분야 기여도 ... 30
• 5. 연구 결과의 활용 계획 등 ... 31
• 6. 연구 결과에서 수집한 해외 과학기술 정보 ... 32
• 7. 연구개발성과의 보안등급 ... 33
• 8. 국가과학기술종합정보시스템에 등록한 연구시설, 장비 현황 ... 34
• 9. 연구개발과제 수행에 따른 연구실 등의 안전조치 이행 실적 ... 35
• 10. 연구 개발 과제의 대표적 연구 실적 ... 36
• 11. 기타 사항 ... 38
• 12. 참고 문헌 ... 39
• 끝페이지 ... 40