선택한 단어 수는 입니다.
최소 단어 이상 선택하여야 합니다.
최소 단어 이상 선택하여야 합니다.
선택한 단어 수는 30입니다.
최대 10 단어까지만 선택 가능합니다.
최대 10 단어까지만 선택 가능합니다.
문제 정의
- 이러한 후보 유전자들 중 특히 MC4R(melanocortin- 4 receptor), PRKAG3(protein kinase adenosine mono phosphate-activated / 3-subimit), FABP3(fatty acid binding protein) 및 ESR(estrogen receptor)은 여 러경제형질과의 유의한 연관성이 많은 연구를 통해 보고되고 있다(Huang 등, 2004; Hernandez-Sanchez 등, 2003; Gerbens 등, 2001; Gerbens 등, 1999; Short 등, 1997). 본 연구는 앞에 제시한 4개의 후보 유전자들에 대해 국내에서 사육되고 있는 듀록품종 집단과 재래 돼지 집단에서의 경제 형질과 의연 관성을 검증하기 위하여 실시하였다.
- 또한 이 유전자는 근육내에서 글라이코겐 합성에 관여하고 있는 것으로 보고되고 있다(Milan 등, 2000). 본 연구에서는 PRKAG3 유전자내에 존재하는 R200Q(A/G) 변이지역과 경제형질간의 연관성을 규명하기 위한 분석을 실시하였다. PRKAG3 유전자의 변이 효과는 듀록 품종에서는 등지방 두께에서 유의한 것으로 검출되었고, 재래 돼지에서는 일당 증체 량과 70 kg 도달 일령에서 유의한 차이를 보였다.
제안 방법
- 반응 조건은 94°C에서 2분간 de naturation 한 후 94 °C 에서 30초(denaturation), 62 °C 에서 1분간 annealing, 72 °C 에서 1분 20초 extention 을 35cycle 수행한 후 마지막으로 72°C에서 10분간 최종 extention 과정을 주면서 GeneAmp PCR System 9600(Perkin-Elmer Co, USA) 기기에서 수행하였다. PCR 증폭 산물은 단편의 크기가 예측되는 대립 유전자 크기 범위 내에 존재하도록 증폭되었는지 PCR 조건의 적정성 여부를 확인하기 위하여 1% TBE Agarose gel을 이용하여 UV상에서 전기영동하였다. 각 유전자의 다형성 분석은 각각의 제한 효소를 이용하여 적정 반응 온도(Tag/ : 65°C, BsaHI : 37°C, Hinfl : 37°C, PvuII : 37°C)에서 6시간동안 처리한 후 전기영동을 실시한 후 유전자형을 결정하였다.
- 각 유전자를 증폭하기 위한 PCR 반응액은 약50~80 ng의 주형 DNA, primer 각 10 pmol, dNTPs 50 μM, 10X reaction buffer 10 mM Tris-HCl, pH 8.3, 50 mM KC1, 1.5 mM MgClz 및 1 unite Taq polymerase(IBS, Korea)를 혼합하여 최종 부피를 50 ㎕로 하였다. 반응 조건은 94°C에서 2분간 de naturation 한 후 94 °C 에서 30초(denaturation), 62 °C 에서 1분간 annealing, 72 °C 에서 1분 20초 extention 을 35cycle 수행한 후 마지막으로 72°C에서 10분간 최종 extention 과정을 주면서 GeneAmp PCR System 9600(Perkin-Elmer Co, USA) 기기에서 수행하였다.
- PCR 증폭 산물은 단편의 크기가 예측되는 대립 유전자 크기 범위 내에 존재하도록 증폭되었는지 PCR 조건의 적정성 여부를 확인하기 위하여 1% TBE Agarose gel을 이용하여 UV상에서 전기영동하였다. 각 유전자의 다형성 분석은 각각의 제한 효소를 이용하여 적정 반응 온도(Tag/ : 65°C, BsaHI : 37°C, Hinfl : 37°C, PvuII : 37°C)에서 6시간동안 처리한 후 전기영동을 실시한 후 유전자형을 결정하였다.
- 돼지의 경제형질과 연관성이 보고된 4개의 후보 유전자를 대상으로 PCR-RFLP 기법을 이용하여 유전자형을 조사하였다. Table 2는 이렇게 분석된 유전자형을 듀록 품종과 한국 재래 돼지 집단으로 나누어 제시한 것이다.
- 5 mM MgClz 및 1 unite Taq polymerase(IBS, Korea)를 혼합하여 최종 부피를 50 ㎕로 하였다. 반응 조건은 94°C에서 2분간 de naturation 한 후 94 °C 에서 30초(denaturation), 62 °C 에서 1분간 annealing, 72 °C 에서 1분 20초 extention 을 35cycle 수행한 후 마지막으로 72°C에서 10분간 최종 extention 과정을 주면서 GeneAmp PCR System 9600(Perkin-Elmer Co, USA) 기기에서 수행하였다. PCR 증폭 산물은 단편의 크기가 예측되는 대립 유전자 크기 범위 내에 존재하도록 증폭되었는지 PCR 조건의 적정성 여부를 확인하기 위하여 1% TBE Agarose gel을 이용하여 UV상에서 전기영동하였다.
대상 데이터
- 검증에 활용된 4개의 후보 유전자는 MC4R, PA- KAG3, FABP3 그리고 ESR 유전자였다. 각 후보 유전자들의 유전자형 분석 결과 두 집단 간에 유전적특성의 차이가 분명히 나타나고 있음을 확인하였다.
- 본 연구는 후보 유전자의 경제형질에 미치는 염기 변이 효과를 검증하기 위해 국내에서 사육된 듀록 품종 96두와 한국 재래 돼지 86두를 활용하였다. 검증에 활용된 4개의 후보 유전자는 MC4R, PA- KAG3, FABP3 그리고 ESR 유전자였다.
- 본 연구를 위해 축산연구소에서 사육된 한국 재래 돼지 86두와 듀록 96두의 혈액이 채취되었고, 형질 자료는 일당 증체 량(ADG), 등지방 두께 (BF), 듀록은 90 kg 도달일령, 한국 재래 돼지는 70 kg 도달 일령이 조사되었다.
데이터처리
- 조사된 경제형질 측정치에 대한 유전자형의 효과를 추정하기 위해 SAS 8.1 Package/PC를 이용하여 다음과 같은 일반 선형 모형(GLM) 분석을 하였으며, 유전자형의 효과를 알아보기 위해 최소 제곱 평균치간의 유의성 검정을 실시하였다.
이론/모형
- 공시축의 혈액으로부터 DNA의 분리 및 정제는 Genomic DNA Extraction Kit(Bioneer「M)으로 지침서에 따라 실행되었고, 분리된 DNA는 TE Buffer(10 mM Tris-HCl, pH 7.4, 1 mM EDTA)에 용해하였다.
성능/효과
- 4개의 후보 유전자의 경제형질에 미치는 염기 변이효과 분석 결과를 정리하면 MC4R 유전자의 A 대립 유전자는 두 집단 모두에서 성장 형질과의 유의한 연관성이 검출되었고. 듀록 품종에서는 지방 대사와 관련된 등지방 두께에 연관이 있음을 확인하였다.
- PAKAG3 유전자의 B 대립 유전자는 듀록 품종의 등지방 두께와 재래 돼지 집단의 성장형질에서 유의성이 검출되었다. FABP3 유전자의 A 대립 유전자는 듀록 품종에서 등지방 두께, 재래 돼지 집단에서 성장 형질과의 연관성이 유의한 것으로 나타났다. 본 연구를 통해 얻어진 결과는 추가적인 분석을 통하여 선발 지수식에 적용을 한다면 우수한 개체를 선발하는데 있어 정확도를 높이는데 유용하게 활용될 것으로 사료되며 국내의 재래 품종들에 대한 유전 자원 보존과 개량을 위한기초 자료로 유용하게 활용될 것으로 기대된다.
- PAKAG3 유전자의 B 대립 유전자는 듀록 품종의 등지방 두께와 재래 돼지 집단의 성장 형질에서 유의성이 검출되었다. FABP3 유전자의 A 대립 유전자는 듀록 품종에서 등지방 두께, 재래 돼지 집단에서 성장 형질과의 유의한 연관성을 발견하였다. 본 연구를 통해 얻어진 결과는 추가적인 분석을 통하여 선발 지수식에 적용을 한다면 우수한 개체를 선발하는데 있어 정확도를 높이는데 유용하게 활용될 것으로 사료되며, 국내의 재래품종들에 대한 유전자원 보존과 개량을 위한 기초자료로 유용하게 활용될 것으로 기대된다.
- FABP3의 유전적 다양성은 돼지의 근내 지방 함량, 등지방 두께 및 성장 형질과 연관성이 있음이 보고된 바 있다(Gerbens 등, 1998). FABP3 유전자의 변이 효과는 듀록 품종에서는 등지 방 두께에 대해 유의 한 차이 가 나타났으며, 일당증체량은 재래 돼지에서만 유의한 결과가 검출되었다. 듀록 품종의 등지방 두께에서 FABP3 유전자의 AA 유전자형(1.
- 따라서 FABP3 유전자의 A 대립 유전자는 듀록 품종에서는 등지방 두께가 두꺼운 것과 재래 돼지 집단에서는 일당 증체량이 높은 것에 영향을 미치고 있음을 확인하였다. FABP3 유전자의 변이 효과분석 결과에 따르면 같은 유전자내의 변이가 품종이나 집단간에 영향력을 미치는 형질이 차이가 있을 수 있음을 확인하였다.
- 각 후보 유전자들의 유전자형 분석 결과 두 집단 간에 유전적특성의 차이가 분명히 나타나고 있음을 확인하였다. MC4R 유전자의 A 대립 유전자는 두 집단 모두에서 성장 형질과의 유의한 연관성이 검출되었고, 듀록 품종에서는 등지방 두께와도 관련이 있음을 확인하였다. PAKAG3 유전자의 B 대립 유전자는 듀록 품종의 등지방 두께와 재래 돼지 집단의 성장형질에서 유의성이 검출되었다.
- MC4R 유전자는 돼지의 성장(growth rate)과 체조성(body compo-sition)에 영향을 미칠 수 있는 매우 중요한 후보유전자로 보고되고 있으며 유전자내에 존재하는 G/A DNA 변이(Asp298Asn)가 사료 섭취, 도체 지방 및 성장 형질에 유의한 영향을 미치고 있음이 보고되었다(Kim 등, 2004; Park 등, 2002; Kim 등, 2000). MC4R 유전자의 경제형질과의 연관성 분석 결과, 듀록 품종의 AA 유전자형은 일당 증체량이0.950±0.014로 나타났고 이는 BB 유전자형의 0.912 ±0.014보다 높은 것으로 나타났으며, 두 유전자형간의 차이가 유의한(p<0.05) 것으로 검출되었다. 또한 등지방 두께에 있어서도 AA 유전자형(1.
- Table 2에 제시된 결과에 따르면 두 품종간의 유전적 특성의 차이가 있음을 알 수가 있다. MC4R 유전자의 유전자형빈도는 듀록 품종에서 AA, AB 그리고 BB가 각각 0.2396, 0.4792 그리고 0.2813으로 나타난 반면, 재래 돼지의 AA 유전자형은 0.0192로 그 빈도가 듀록 품종과 현저하게 차이가 있음을 확인하였다. Kim 등(2000)의 보고에 따르면 랜드레이스 품종의 경우, AA유전자형의 빈도가 0.
- 듀록 품종에서는 지방 대사와 관련된 등지방 두께에 연관이 있음을 확인하였다. PAKAG3 유전자의 B 대립 유전자는 듀록 품종의 등지방 두께와 재래 돼지 집단의 성장 형질에서 유의성이 검출되었다. FABP3 유전자의 A 대립 유전자는 듀록 품종에서 등지방 두께, 재래 돼지 집단에서 성장 형질과의 유의한 연관성을 발견하였다.
- 듀록 품종에서는 지방 대사와 관련된 등지방 두께에 연관이 있음을 확인하였다. PAKAG3 유전자의 B 대립 유전자는 듀록 품종의 등지방 두께와 재래 돼지 집단의 성장 형질에서 유의성이 검출되었다. FABP3 유전자의 A 대립 유전자는 듀록 품종에서 등지방 두께, 재래 돼지 집단에서 성장 형질과의 유의한 연관성을 발견하였다.
- 211 로 본 연구의 듀록 품종의 유전자형빈도와 유사한 양상을 나타내고 있었다. PRKAG3 유전자의 경우, 듀록 품종은 AA 유전자형 빈도는 0.052로 아주 낮게 나타났으며, BB 유전자형의 빈도는 0.635로 매우 높게 나타났다. 반면 한국 재래돼지는 AA, AB 및 BB 각각의 유전자형 빈도가 0.
- 본 연구에서는 PRKAG3 유전자내에 존재하는 R200Q(A/G) 변이지역과 경제형질간의 연관성을 규명하기 위한 분석을 실시하였다. PRKAG3 유전자의 변이 효과는 듀록 품종에서는 등지방 두께에서 유의한 것으로 검출되었고, 재래 돼지에서는 일당 증체 량과 70 kg 도달 일령에서 유의한 차이를 보였다. 먼저 듀록품종에서는 BB(1.
- 검증에 활용된 4개의 후보 유전자는 MC4R, PA- KAG3, FABP3 그리고 ESR 유전자였다. 각 후보 유전자들의 유전자형 분석 결과 두 집단 간에 유전적특성의 차이가 분명히 나타나고 있음을 확인하였다. MC4R 유전자의 A 대립 유전자는 두 집단 모두에서 성장 형질과의 유의한 연관성이 검출되었고, 듀록 품종에서는 등지방 두께와도 관련이 있음을 확인하였다.
- 01)간의 유의적 인 차이가 나타났다. 그러나 등지방 두께에 미치는 MC4R 유전자의 염기변이 효과는 재래 돼지 집단에서 유의적인 차이가 없는 것으로 나타났다. 듀록 품종과 재래 돼지 모두에서 일당 증체 량에 있어 MC4R 유전자 변이 효과가 유의한 것으로 나타났으며, 등 지방 두께는 듀록 품종에서만 유의한 결과가 검출되었고, 재래 돼지에서 70 kg 도달 일령에 대한 유의한 차이가 나타났다.
- 그러나 등지방 두께에 미치는 MC4R 유전자의 염기변이 효과는 재래 돼지 집단에서 유의적인 차이가 없는 것으로 나타났다. 듀록 품종과 재래 돼지 모두에서 일당 증체 량에 있어 MC4R 유전자 변이 효과가 유의한 것으로 나타났으며, 등 지방 두께는 듀록 품종에서만 유의한 결과가 검출되었고, 재래 돼지에서 70 kg 도달 일령에 대한 유의한 차이가 나타났다. 분석 결과 AA 유전자형이 성장 형질에 있어 듀록과 재래 돼지 집단 모두에서 우수한 연관성을 나타내고 있으며 유전자형 빈도는 각각 0.
- FABP3 유전자의 대립 유전자 빈도 역시 듀록 품종과 재래 돼지 품종간의 차이가 확연하게 나타나고 있다. 듀록 품종의 경우 AA, AB 그리고 BB 유전자형의 빈도가 각각 0.129, 0.397 그리고 0.473으로 나타난 반면 재래 돼지에서는 AA 유전자형의 빈도가 0.588로 높게 나타나고 있음을 확인할 수 있었으며 BB 유전자형의 빈도는 0.039로 상당히 낮게 나타났다. Nechtelberger 등(2001)의 보고에 따르면 Large White 품종의 경우 AA 유전자형의 빈도가 0.
- FABP3 유전자의 변이 효과는 듀록 품종에서는 등지 방 두께에 대해 유의 한 차이 가 나타났으며, 일당증체량은 재래 돼지에서만 유의한 결과가 검출되었다. 듀록 품종의 등지방 두께에서 FABP3 유전자의 AA 유전자형(1.339±0.05)과 AB(1.207±0.03), BB(1.146±0.02) 유전자형간의 차이가 유의한 것으로 나타났다. 재래 돼지 집단에서는 일당 증체량에서 AA(0.
- 04) 유전자형간의 차이가 유의한 것으로 나타났다. 따라서 FABP3 유전자의 A 대립 유전자는 듀록 품종에서는 등지방 두께가 두꺼운 것과 재래 돼지 집단에서는 일당 증체량이 높은 것에 영향을 미치고 있음을 확인하였다. FABP3 유전자의 변이 효과분석 결과에 따르면 같은 유전자내의 변이가 품종이나 집단간에 영향력을 미치는 형질이 차이가 있을 수 있음을 확인하였다.
- 05) 것으로 검출되었다. 또한 등지방 두께에 있어서도 AA 유전자형(1.288 ±0.038)은 AB, BB 유전자형의 값보다 두꺼운 것으로 나타났고, 이러한 차이는 통계적으로 유의한것으로 검출되었다. 재래 돼지 집단의 분석결과 MC4R 유전자 변이 효과는 일당 증체량과 70 kg 도달 일령에서 유의성이 발견되었다.
- 본 연구의 FABP3 유전자의 대립 유전자 빈도와 비교하였을 때 듀록 품종과는 매우 상이한 양상을 나타내고 있는 반면 재래 돼지와는 비교적 유사한 양상을 보이고 있음을 확인할 수 있었다. 마지막으로 ESR 유전자의 유전자형빈도는 듀록 품종에서 AA 유전자형만이 발현을 하였으며 재래 돼지에서는 AA, AB 그리고 BB 유전자형의 빈도가 각각 0.134, 0.519 그리고 0.346으로 나타난 것을 확인할 수 있었다. 듀록 품종의 AA 유전자형이 100%로 조사된 반면, 재래 돼지에서는 0.
- PRKAG3 유전자의 변이 효과는 듀록 품종에서는 등지방 두께에서 유의한 것으로 검출되었고, 재래 돼지에서는 일당 증체 량과 70 kg 도달 일령에서 유의한 차이를 보였다. 먼저 듀록품종에서는 BB(1.218±0.026)과 AA(1.024±0.078) 유전자형 간의 등지방 두께 차이가 유의한 것으로 나타났다. 재래 돼지의 경우, 일당 증체량에 있어 BB유전자형(0.
- 635로 매우 높게 나타났다. 반면 한국 재래돼지는 AA, AB 및 BB 각각의 유전자형 빈도가 0.294, 0.529 및 0.176으로 나타나 두 품종 간에 상당히 상이한 양상을 보이고 있음을 확인하였다. FABP3 유전자의 대립 유전자 빈도 역시 듀록 품종과 재래 돼지 품종간의 차이가 확연하게 나타나고 있다.
- 011 로 보고되었다. 본 연구의 FABP3 유전자의 대립 유전자 빈도와 비교하였을 때 듀록 품종과는 매우 상이한 양상을 나타내고 있는 반면 재래 돼지와는 비교적 유사한 양상을 보이고 있음을 확인할 수 있었다. 마지막으로 ESR 유전자의 유전자형빈도는 듀록 품종에서 AA 유전자형만이 발현을 하였으며 재래 돼지에서는 AA, AB 그리고 BB 유전자형의 빈도가 각각 0.
- 듀록 품종과 재래 돼지 모두에서 일당 증체 량에 있어 MC4R 유전자 변이 효과가 유의한 것으로 나타났으며, 등 지방 두께는 듀록 품종에서만 유의한 결과가 검출되었고, 재래 돼지에서 70 kg 도달 일령에 대한 유의한 차이가 나타났다. 분석 결과 AA 유전자형이 성장 형질에 있어 듀록과 재래 돼지 집단 모두에서 우수한 연관성을 나타내고 있으며 유전자형 빈도는 각각 0.239, 0.019로 검출되었다. 이는 A 대립유전자가 성장 형질과 유의적인 연관성을 지니고 있음을 추정할 수 있었다.
- 재래 돼지 집단의 분석결과 MC4R 유전자 변이 효과는 일당 증체량과 70 kg 도달 일령에서 유의성이 발견되었다. 일당 증체량에 있어 재래 돼지의 AA 유전자형(0.579±0.056)과 AB(0.510±0.011), BB(0.449±0.012) 유전자형 간에 유의적 인 차이가 측정되었다. 또한 70 kg 도달일령에서 AA(160.
- 038)은 AB, BB 유전자형의 값보다 두꺼운 것으로 나타났고, 이러한 차이는 통계적으로 유의한것으로 검출되었다. 재래 돼지 집단의 분석결과 MC4R 유전자 변이 효과는 일당 증체량과 70 kg 도달 일령에서 유의성이 발견되었다. 일당 증체량에 있어 재래 돼지의 AA 유전자형(0.
- 43) 유전자형간의 차이가 유의성 있게 나타났다. 재래 돼지에서 성장 형질과 관련하여 높은 일당 증체량과의 연관성을 나타낸 BB 유전자형의 발현 빈도는 0.176으로 듀록 품종에 비해 상당히 낮은 빈도를 보이고 있었다. PRKAG3 유전자의 B 대립 유전자는 듀록 품종에서 등 지방 두께가 두꺼운 것에 유의한 영향력이 발견되었으며, 성장 형질에서도 유의한 결과는 검출되지 않았지만 일정한 경향치를 보이고 있으므로 성장 형질에 있어서도 연관성이 있을 것으로 추정되어진다.
후속연구
- 하지만 본 연구에서 일당 증체량, 등지방 두께 그리고 90(70) kg 도달 일령을 활용하여 검증한 결과 유의한 변이 효과를 검출하지 못하였다. 그러나 보다 많은 대상축을 이용한다면 ESR 유전자와 경제형질간의 연관성 분석이 가능할 것으로 예상된다.
- FABP3 유전자의 A 대립 유전자는 듀록 품종에서 등지방 두께, 재래 돼지 집단에서 성장 형질과의 유의한 연관성을 발견하였다. 본 연구를 통해 얻어진 결과는 추가적인 분석을 통하여 선발 지수식에 적용을 한다면 우수한 개체를 선발하는데 있어 정확도를 높이는데 유용하게 활용될 것으로 사료되며, 국내의 재래품종들에 대한 유전자원 보존과 개량을 위한 기초자료로 유용하게 활용될 것으로 기대된다.
- FABP3 유전자의 A 대립 유전자는 듀록 품종에서 등지방 두께, 재래 돼지 집단에서 성장 형질과의 유의한 연관성을 발견하였다. 본 연구를 통해 얻어진 결과는 추가적인 분석을 통하여 선발 지수식에 적용을 한다면 우수한 개체를 선발하는데 있어 정확도를 높이는데 유용하게 활용될 것으로 사료되며, 국내의 재래품종들에 대한 유전자원 보존과 개량을 위한 기초자료로 유용하게 활용될 것으로 기대된다.
- ESR 유전자는 산자수와 관련이 있는 후보 유전자로서 많은 연구가 보고되었으며(Kaminski 등, 2002; van Rens 등, 2000) 여러 경제형질과도 영향을 미치는 것으로 보고되었다 (Short 등, 1997). 하지만 본 연구에서 일당 증체량, 등지방 두께 그리고 90(70) kg 도달 일령을 활용하여 검증한 결과 유의한 변이 효과를 검출하지 못하였다. 그러나 보다 많은 대상축을 이용한다면 ESR 유전자와 경제형질간의 연관성 분석이 가능할 것으로 예상된다.
※ AI-Helper는 부적절한 답변을 할 수 있습니다.