$\require{mediawiki-texvc}$

연합인증

연합인증 가입 기관의 연구자들은 소속기관의 인증정보(ID와 암호)를 이용해 다른 대학, 연구기관, 서비스 공급자의 다양한 온라인 자원과 연구 데이터를 이용할 수 있습니다.

이는 여행자가 자국에서 발행 받은 여권으로 세계 각국을 자유롭게 여행할 수 있는 것과 같습니다.

연합인증으로 이용이 가능한 서비스는 NTIS, DataON, Edison, Kafe, Webinar 등이 있습니다.

한번의 인증절차만으로 연합인증 가입 서비스에 추가 로그인 없이 이용이 가능합니다.

다만, 연합인증을 위해서는 최초 1회만 인증 절차가 필요합니다. (회원이 아닐 경우 회원 가입이 필요합니다.)

연합인증 절차는 다음과 같습니다.

최초이용시에는
ScienceON에 로그인 → 연합인증 서비스 접속 → 로그인 (본인 확인 또는 회원가입) → 서비스 이용

그 이후에는
ScienceON 로그인 → 연합인증 서비스 접속 → 서비스 이용

연합인증을 활용하시면 KISTI가 제공하는 다양한 서비스를 편리하게 이용하실 수 있습니다.

Microsatellite Marker를 사용한 재래 닭 품종 유전적 특성 및 개체 식별력 분석
Estimation of Genetic Characteristic and Cumulative Power of Discrimination using the Microsatellite Markers in Korean Native Chicken 원문보기

한국가금학회지 = Korean journal of poultry science, v.37 no.1, 2010년, pp.81 - 87  

이건우 (한경대학교 유전정보연구소) ,  오재돈 (한경대학교 유전정보연구소) ,  이진아 (한경대학교 유전정보연구소) ,  조규호 (축산과학원) ,  남인식 (축산물 위해요소중점관리기준원) ,  이준헌 (충남대학교) ,  서옥석 (축산과학원) ,  전광주 (한경대학교 유전정보연구소) ,  이학교 (한경대학교 유전정보연구소) ,  공홍식 (한경대학교 유전정보연구소)

초록
AI-Helper 아이콘AI-Helper

본 연구는 10종의 MS(microsatellite) Marker를 이용하여 한국 재래닭 품종 내 외모 특성에 의해 구분되는 3계통(적갈색: 60수, 황갈색: 46수, 흑색: 40수)과 오골계 집단(49수), 총 4계통(총 195수)에 대한 유전 특성을 분석하고, 이를 활용하여 동일성 검정을 실시할 경우 개체 식별에 대한 신뢰도를 검정하기 위해 실시하였다. 집단 간의 유전적 유연관계를 알아보기 위해 각 MS marker별 대립 유전자의 빈도를 산출하여 이를 근거로 집단간의 보정을 통한 방법을 이용하는 DISPAN program을 활용하여 유전적 거리에 대한 추정 결과 R(적갈색 계통)과 L(흑색 계통)간의 유전적 거리는 0.05로 가장 가까운 것으로 나타났으며, R과 Y(황갈색 계통, 0.073), Y과 L(0.083) 역시 가까운 유전적 거리를 나타내고 있음을 확인하였다. 반면, 재래닭 집단과 오골계 집단(S) 간의 유전적 거리는 0.149(R과 S), 0.144(Y과 S) 그리고 0.158(L과 S)으로 비교적 먼 것으로 나타나 재래닭 집단과 오골계 집단 간의 유전적 차별성을 확인할 수 있었다. 10종의 MS marker를 대상으로 누적 개체 식별력을 계산한 결과 99.999%로 확인되었고 $0.255{\times}10^{-7}$의 짝확률 값이 추정되었다.

Abstract AI-Helper 아이콘AI-Helper

To estimate the genetic characteristics and cumulative power of discrimination (CPD) Korean Native Chicken. We used a total of 195 genomic DNAs from four breeds population (Korean Native Red chicken: R, Korean Native Yellow chicken: Y, Korean Native Black chicken: L, Ogal chicken: S). Frequencies of...

주제어

AI 본문요약
AI-Helper 아이콘 AI-Helper

* AI 자동 식별 결과로 적합하지 않은 문장이 있을 수 있으니, 이용에 유의하시기 바랍니다.

문제 정의

  • 2009) 있으나, 재래닭의 경우 다소 부족한 실정이다. 따라서 본 연구는 국내 재래닭 집단에서 동일성 검사를 시행하였을 경우 일련의 출현 유전자형 빈도를 통해 개체 식별력(Power of discrimination: PD)과 누적 개체 식별력(Cumulative power of discrimination: CPD)를 산출하여 유전자 표지에 따른 오류 확률을 통계적으로 해석하여 보다 효율적인 개체 식별 체계 검증을 위한 유전자 감식 시스템의 적용 모델 설정에 활용하고자 실시하였다.
  • 본 연구는 10종의 MS(microsatellite) Marker를 이용하여 한국 재래닭 품종 내 외모 특성에 의해 구분되는 3계통(적갈색: 60수, 황갈색: 46수, 흑색: 40수)과 오골계 집단(49수), 총 4계통(총 195수)에 대한 유전 특성을 분석하고, 이를 활용하여 동일성 검정을 실시할 경우 개체 식별에 대한 신뢰도를 검정하기 위해 실시하였다.
본문요약 정보가 도움이 되었나요?

질의응답

핵심어 질문 논문에서 추출한 답변
한국의 재래닭 3계통에는 무엇이 있는가? 최근 조류인플루엔자 발생과 광우병 등과 같이 축산물 안전성에 대하여 국민적 관심이 어느 때보다 높아지면서 외래종보다는 재래종의 선호도가 높아지고 있다. 또한 전 세계적으로 재래가축 유전자원의 중요성이 부각되었고 (Notter, 1999), 이에 농촌진흥청 축산과학원은 멸종위기에 처해 있던 한국의 재래닭 3계통(적갈색, 황갈색 그리고 흑색)을 복원하였다. 국내 토종닭 시장의 유통량은 연간 6천만수 내외로 전체 닭고기 소비량의 10% 정도를 차지하고 있으나, 각종 유사 닭의 둔갑 판매로 그 동안 문제점을 안고 있었다.
한국 재래닭 순수 계통의 지속적인 품종 특성 유지 및 개량을 위한 노력이 필요한 이유는? 이로 인해 우리는 해마다 미국, 영국 등 해외 여러 나라로부터 비싼 값(56억원/년)을 치르고 40만수 이상의 외국 종자를 수입하고 있다. 최근 조류인플루엔자 발생과 광우병 등과 같이 축산물 안전성에 대하여 국민적 관심이 어느 때보다 높아지면서 외래종보다는 재래종의 선호도가 높아지고 있다. 또한 전 세계적으로 재래가축 유전자원의 중요성이 부각되었고 (Notter, 1999), 이에 농촌진흥청 축산과학원은 멸종위기에 처해 있던 한국의 재래닭 3계통(적갈색, 황갈색 그리고 흑색)을 복원하였다. 국내 토종닭 시장의 유통량은 연간 6천만수 내외로 전체 닭고기 소비량의 10% 정도를 차지하고 있으나, 각종 유사 닭의 둔갑 판매로 그 동안 문제점을 안고 있었다. 축산과학원은 재래닭의 순수화 복원에 의한 순수 계통 육성 및 생산성이 증대된 실용 재래닭 개발로 농가 보급을 수행하고 있어 소비자들에게는 안전성에 대한 신뢰도 향상과 생산자에게는 경영 환경 구축에 도움이 되고 있다(농촌진흥청, 2009). 따라서 고유 가금 유전자원인 복원된 한국 재래닭 순수 계통의 지속적인 품종 특성 유지 및 개량을 위한 노력이 필요한 실정이다.
외래종보다 재래종의 선호도가 높아지고 있는 이유는? 이로 인해 우리는 해마다 미국, 영국 등 해외 여러 나라로부터 비싼 값(56억원/년)을 치르고 40만수 이상의 외국 종자를 수입하고 있다. 최근 조류인플루엔자 발생과 광우병 등과 같이 축산물 안전성에 대하여 국민적 관심이 어느 때보다 높아지면서 외래종보다는 재래종의 선호도가 높아지고 있다. 또한 전 세계적으로 재래가축 유전자원의 중요성이 부각되었고 (Notter, 1999), 이에 농촌진흥청 축산과학원은 멸종위기에 처해 있던 한국의 재래닭 3계통(적갈색, 황갈색 그리고 흑색)을 복원하였다.
질의응답 정보가 도움이 되었나요?

참고문헌 (33)

  1. Arranz JJ, Bayon Y, San Primitivo F 1996 Comparison of pro- tein markers and microsatellites in differentiation of cattle populations. Anim Genet 27:415-419. 

  2. Barker JSF, Tan SG, Selvaraj OS, Mukherjee TK 1997 Genetic variation within and relationships among populations of Asian water buffalo (Bubalus bubalis). Anim Genet 28:1-13. 

  3. Bjornstad G, Nilsen NO, Roed KH 2003 Genetic relationship between Mongolian and Norwegian horses. Anim Genet 34:55-58. 

  4. Blott SC, Williams JL, Haley CS 1999 Discriminating among cattle breeds using genetic markers. Heredity 82:613-619. 

  5. Buchanan FC, Adams LJ, Littlejohn RP, Maddox JF, Cranford AM 1994 Determination of evolutionary relationships among sheep breeds using microsatellites. Genomics 22:397-403. 

  6. Chen GH, Wu XS, Wang DQ, Qin J, Wu SL, Zhou QL, Xie F, Cheng R, Xu Q, Liu B, Zhang XY, Olowofeso O 2004 Cluster analysis of 12 Chinese Native Chicken populations using microsatellite markers. Asian-Aust J Anim Sci 17:1047-1052. 

  7. Cho GJ, Cho BW 2004 Microsatellite DNA typing using 16 markers for parentage verification of the Korean Native Horse. Asian-Aust J Anim Sci 17:750-754. 

  8. Fan B, Wang ZG, Li YJ, Zhao XL, Liu B, Zhao SH, YU M, Li MH, Chen SL, Xiong TA, Li K 2002 Genetic variation analysis within and among Chinese indigenous swine populations using microsatellite markers. Anim Genet 33:422-427. 

  9. Fries R, Durstewitz G 2001 Digital DNA signatures: SNPs for animal tagging. Nat Biotechnol 19:508. 

  10. Jin HG, Zhao YM, Zhou GL 2005 Analysis of microsatellite DNA polymorphisms in five China Native Cattle breeds and application to population genetics studies. Asian-Aust J Anim Sci 18:1696-1700. 

  11. Kim MJ, Li GH, Oh JD, Cho KH, Jeon GJ, Choi BH, Lee JH, Kong HS, Lee HK 2007 Characterization of a Korean traditional porcine breed using microsatellite markers and the establishment of an individual identification system. Korean J Food Sci Ani Resour 27:150-156. 

  12. Lee C, Pollak EJ 2002 Genetic antagonism between body weight and milk production beef cattle. J Anim Sci 80:316-321. 

  13. Li K, Chen Y, Moran C, Fan B, Zhao S, Peng Z 2000 Analysis of diversity and genetic relationships between four Chinese indigenous pig breeds and one Australian commercial pig breed. Anim Genet 31:322-325. 

  14. Martin-Burriel I, Garcia-Muro E, Zaragoza P 1999 Genetic diversity analysis of six Spanish native cattle breeds using microsatellite. Anim Genet 30:177-182. 

  15. Miller SA, Kykes DD, Polesky HF 1998 A simple salting out procedure for extracting DNA from human nucleated cells. Nucl Acids Reg 16:1215. 

  16. Nei M 1972 Genetics distance between populations. Am Nat 106:283-292. 

  17. Nei M 1978 Estimation of average heterozygosity and genetic distance from a small number of individuals. Genetics 89: 583-590. 

  18. Nei M, Taima F, Tateno Y 1983 Accuracy of estimated phylogenetic trees from molecular data. J Mol Evol 19:153-170. 

  19. Notter DR 1999 The importance of genetic diversity in livestock populations of the future. J Anim Sci Jan Review 77: 61-69. 

  20. Oh JD, Kang BS, Kim HK, Park MN, Chae EJ, Seo OS, Lee HK, Jeon GJ, Kong HS 2008 Genetic relationship between populations and analysis of genetic structure in the Korean native chicken and the endemic chicken breeds. J Poult Sci (KOR) 35:361-366. 

  21. Osman SAM, Sekino M, Nishibori M, Yamamoto Y, Tsudzuki M 2005 Genetic variability and relationships of native Japanese chickens assessed by microsatellite DNA profiling - focusing on the breeds established in Kochi Prefecture Japan. Asian-Aust J Anim Sci 18:755-761. 

  22. Ota T 1993 DINPAN. Pennsylvania State University PA USA. 

  23. Park S 2000 Microsatellite Toolkit for MS Excel 97 or 2000, personnel communication. 

  24. Peelman LJ, Mortiaux F, Van Zeveren A, Dansercoer A, Mommens G, Coopman F, Bouquet Y, Burny A, Renaville R, Portetelle D 1998 Evaluation of the genetic variability of 23 bovine microsatellite markers in four Belgian cattle breeds. Anim Genet Jun 29:161-167. 

  25. Saitou N, Nei M 1987 The neighbor-joining method: A new method for reconstructing phylogenetic tree. Mol Biol Evol 4:406-425. 

  26. Sancrostoval M, Renald G, Amigues Y 2000 Tracabilite individuelle des viandes bovinew a l'aide de marqueurse genetiques. INRA Prod Anim 13:269-276. 

  27. Sneath PHA, Soka RR 1973 Numerical Taxonomy, Freeman San Francisco. 

  28. Vignal A, Milan D, SanCrostobal M, Eggen A 2002 A review on SNP and their use in animal genetics. Geeenet Sel Evol 34:275-305. 

  29. Yoon DH, Park EW, Lee SH, Oh SJ, Cheong IC, Hong KC 2005 Assessment of genetic diversity and relationships between Korean cattle and other cattle breeds by microsatellite loci. J Anim Sci & Technol(Kor) 47:341-354. 

  30. 김상욱 장희경 김관석 김종주 전진태 윤두학 강성호 정효일 정일정 2009 초위성체 DNA 표지인자를 이용한 국내 육우집단의 품종특성 및 개체 식별 체계설정. 한국동물자원과학회지 51:273-282. 

  31. 농촌진흥청 2009 토종 ‘우리맛닭’ 종자산업화 실적과 향후 비전. 

  32. 오재돈 공홍식 이제현 양대용 전광주 이학교 2008 초위성체 유전표지를 이용한 한우와 외래품종간의 유전적 변이와 유연관계 분석. 한국동물자원과학회지 50:733-740. 

  33. 임현태 서보영 정은지 유채경 종타오 조인철 윤두학 이정규 전진태 2009 돼지 브랜드 식별 및 원산지 추적에 활용 가능한 Microsatellite Marker Set의 확립. 한국동물자원과학회지 51:201-206. 

저자의 다른 논문 :

LOADING...
섹션별 컨텐츠 바로가기

AI-Helper ※ AI-Helper는 오픈소스 모델을 사용합니다.

AI-Helper 아이콘
AI-Helper
안녕하세요, AI-Helper입니다. 좌측 "선택된 텍스트"에서 텍스트를 선택하여 요약, 번역, 용어설명을 실행하세요.
※ AI-Helper는 부적절한 답변을 할 수 있습니다.

선택된 텍스트

맨위로