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NTIS 바로가기생명과학회지 = Journal of life science, v.21 no.3 = no.131, 2011년, pp.468 - 472
이선영 (동국대학교 생명과학과) , 정상민 (동국대학교 생명과학과)
DNA marker is a powerful tool for plant genetics and breeding. In this study, 995 SSR markers were employed with chilling resistant cucumber, known as 'NC76', and chilling susceptible cucumber, known as 'GY14'. Using 2% agarose gel electrophoresis, 145 SSR markers were identified as length variation...
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핵심어 | 질문 | 논문에서 추출한 답변 |
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SSR 마커의 한계는 무엇인가? | 이 중 SSR 마커는 다형성을 보이는 비율이 상대적으로 높은 마커로 여러 작물에서 주요 형질과 연관된 마커가 개발되었고 또한 유전자원 분석에도 많이 사용되어 왔다[1]. 하지만 SSR 마커의 다형성은 증폭된 DNA 크기 차이를 비교하는 분석이 필요한 방법이므로 1-2 염기서열 크기 차이는 아가로스 젤에서는 분석이 어렵다. 또한 증폭된 DNA 서열 중 크기차이가 아닌 염기서열 치환 다형성은 아가로스 젤 에서는 구분이 가능하지 않은 단점을 가진다. | |
high resolution melting analysis 기술이란 무엇인가? | 최근 많이 주목 받는 SNP (single nucleotide polymorphism) 마커는 다른 분자 마커에 비해 상대적으로 많은 다형성 유전자좌를 제공해 줌으로써 연구자들에게 유용한 도구로 활발하게 이용되고 있다[3]. 이러한 SNP 마커를 분석하는 기술들의 발달 또한 빠르게 이루어 지고 있고 그 중 하나인 high resolution melting analysis (HRM) 기술은 sequencing을 통한 직접적인 염기서열변이 분석 방법과는 달리 DNA 조각의 melting (denaturation) 온도 차이를 비교하여 염기서열 다형성을 추정하거나 판별하는 효과적인 기술이다[11]. 이 기술은 상보적 이중가닥 DNA가 변성(denaturation)되어 단일 가닥 DNA로 나뉘어질 때 이중가닥 DNA 특이적으로 결합하고 있던 형광염료의 결합이 줄어들면서 점점 형광이 약해지는 것을 계속적으로 측정해 그래프(변이곡선)로 제공한다. | |
최근 여러 주요 작물의 유연관계분석에 이용되어 온 분자 마커 기술에는 무엇이 있는가? | 최근 분자 마커 기술은 작물의 유전 현상 연구 및 육종에 널리 이용되고 있다. DNA를 제한효소에 의해 절단된 단편의 크기 비교를 통하여 다형성을 확인하는 RFLP (restriction fragment length polymorphisms)와 PCR 증폭을 이용한 DNA 단편 길이 다형성을 보이는 AFLP (amplified fragment length polymorphisms), RAPD (random amplified polymorphic DNA), SSR (simple sequence repeat) 등이 여러 주요 작물의 유연관계분석에 이용되어 왔다[1,7,9]. 이 중 SSR 마커는 다형성을 보이는 비율이 상대적으로 높은 마커로 여러 작물에서 주요 형질과 연관된 마커가 개발되었고 또한 유전자원 분석에도 많이 사용되어 왔다[1]. |
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