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SSR 마커를 이용한 배 유전자원의 유연관계
Genetic relationships of pear germplasms using simple sequence repeat marker 원문보기

Journal of plant biotechnology = 식물생명공학회지, v.43 no.4, 2016년, pp.466 - 472  

천재안 (농촌진흥청 국립원예특작과학원 과수과) ,  조강희 (농촌진흥청 국립원예특작과학원 과수과) ,  김세희 (농촌진흥청 국립원예특작과학원 과수과) ,  이한찬 (농촌진흥청 국립원예특작과학원 과수과) ,  최인명 (농촌진흥청 국립원예특작과학원 과수과) ,  박서준 (농촌진흥청 국립원예특작과학원 과수과)

초록
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본 연구는 15개의 SSR 마커를 이용하여 배 유전자원 115점에 대한 유전적 다양성을 분석하였다. 분석된 마커당 대립유전자수는 3 ~ 41개로 평균 16개였으며, 마커의 이용도는 평균 0.966이었다. $H_{obs}$는 0.140 ~ 0.929로 평균 0.603이었으며 $H_{exp}$는 0.463~0.904로 평균 0.718로 분석되었다. PIC 값은 0.403 ~ 0.897의 범위에 속하였으며 평균값은 0.692 이었다. 배 유전자원의 유전적 거리에 따라 계통간 유연관계를 분석한 결과 지리적 분포와 유전적 특성에 의해 크게 2개의 그룹으로 구분되었다. 첫 번째 그룹은 유럽종 P. communis에 속하는 품종으로 구성되었으며 두 번째 그룹은 동양배 그룹으로 P. pyrifolia, P. ussuriensis, P. bretschneideri, P. betulaefolia, P. calleryana와 교잡종 및 종의 분류가 명확하지 않은 유전자원이 포함되었다. 본 연구는 배 유전자원의 유전자형 분석을 통하여 유전적 다양성을 가지는 품종들을 분류하였으며, 육종을 위한 기초자료로 활용 가능할 것으로 사료된다.

Abstract AI-Helper 아이콘AI-Helper

This study analyzed the genetic diversity of 115 pear germplasms using 15 SSR markers. Three to forty-one SSR alleles were detected for each locus with an average of 16 alleles per locus. The average availability of markers was 0.966. The average observed heterozygosity ($H_{obs}$) was 0....

주제어

AI 본문요약
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문제 정의

  • 본 연구는 15개의 SSR 마커를 이용하여 배 유전자원 115점에 대한 유전적 다양성을 분석하였다. 분석된 마커당 대립유전자수는 3 ~ 41개로 평균 16개였으며, 마커의 이용도는 평균 0.
  • 본 연구에서는 SSR 마커를 이용하여 국내외에서 수집된 배 유전자원 115점의 유전적 다양성을 분석하여 유전자원을 이용한 육종의 기초 자료로 활용하고자 수행하였다.
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질의응답

핵심어 질문 논문에서 추출한 답변
배는 어떻게 유전적 다양성을 가지게 되었는가? 1996). 배는 자가불화합성으로 오랜 기간 진화를 거쳐 유전적 다양성을 가지게 되었다. 따라서 유전적 다양성을 가지는 배 유전자원을 분류하기 위해 형태학적 특징과 생리학적 특징 및 동질효소 분석이 이용되었으나, 환경 조건에 의한 영향, 종간 차이를 나타내는 형태학적 다양성 부족, 널리 퍼져있는 교잡으로 인해 많은 한계를 가지고 있었다(Yamamoto et al.
배는 어떻게 구분되는가? 배(Pyrus spp.)는 2000년 전부터 재배되어 온 주요 온대 과수로서 남방형 동양배(P. pyrifolia Nakai)와 북방형 동양배 (P. bretschneider Rehd., P. ussuriensis Maxim.) 그리고 유럽과 미국에서 재배되고 있는 서양배(P. communis L.)로 구분된다(Bell 1990). 배는 현재 22종이 분류되었으며, 상업적으로 중요한 일부만이 50개 이상의 나라에서 재배되고 있다(Bell et al.
배의 유전적 다양성으로 인해 발생하는 한계를 극복하기 위해 무엇이 개발되었는가? 2002a). 이러한 한계를 극복하기 위해 DNA를 바탕으로 하는 restriction fragment length polymorphisms (RFLPs), amplified fragment length polymorphisms (AFLPs), random amplified polymorphic DNA (RAPD), simple sequence repeats (SSRs) 등의 분자 마커가 개발되었으며, 유전자원의 유전적 다양성 분석과 품종 구분에 이용되어져 왔다(Powell et al. 1996; Phillips and Vasil 2001).
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참고문헌 (25)

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  25. Yamamoto T, Kimura T, Shoda M, Ban Y, Hayashi T, Matsuta N (2002b) Development of microsatellite markers in the Japanese pear (Pyrus pyrifolia Nakai). Mol Ecol Not 2:14-16 

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