[논문]국내 양돈장에서 분리한 G9형 돼지로타바이러스의 특성

왕쥔후이; 이승철; 강신영

doi:10.7853/kjvs.2012.35.2.083

국내 양돈장에서 분리한 G9형 돼지로타바이러스의 특성
Characterization of G9 genotype porcine rotavirus isolated in Korea 원문보기

韓國家畜衛生學會誌 = Korean journal of veterinary service, v.35 no.2, 2012년, pp.83 - 90

왕쥔후이 (충북대학교 수의과대학) , 이승철 ((주)중앙백신연구소) , 강신영 (충북대학교 수의과대학)

Abstract ▼ AI-Helper

Porcine rotaviruses are the most common causes of viral gastroenteritis in piglets around the world. The major G genotypes of porcine rotaviruses causing diarrhea were G4, G5 and G11 genotypes. Recently, G9 genotype rotaviruses were problemed at swine farms and frequently recognized from diarrheic piglets. In this study, a porcine rotavirus (PoRV-1) was isolated from piglet showing diarrhea using MA104 cells and confirmed as rotavirus by electron microscopy, genomic RNA electropherotyping and indirect immunofluorescence antibody tests. The nucleotide sequence of the VP7 gene of PoRV-1 was determined and compared with those of other genotype rotavirus strains from other parts of the world. Also, the nucleotide sequences of VP4, VP6 and NSP4 genes of PoRV-1 were determined and compared with those of other rotavirus strains from other countries. The results showed that the PoRV-1 isolate belonged to the G9 genotype and the P, I and E genotypes of PoRV-1 were P[23], I5 and E1, respectively. The Korean G9 PoRV-1 isolate and its nucleotide sequence data would be usefully used for the development of porcine rotavirus vaccines in near future.

주제어

AI 본문요약
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문제 정의

이번 연구에서는 최근 미국 등 선진국에서 주요한 혈청형으로 보고되고 있는 G9형 돼지로타바이러스를 MA104 세포를 이용하여 순수 분리한 후, 분리된 G9형 로타바이러스의 분자생물학적 특성을 규명하고 외국에서 보고된 동일 혈청형의 로타바이러스와의 유전자 비교분석을 통해 국내 분리 돼지로타바이러스의 분자역학적 자료 확보 및 차후 G9형 돼지로타바이러스의 백신주를 확보하고자 하였다.

제안 방법

배양 7일 동안 세포변성효과(cytopathic effect, CPE)가 나타나는지를 관찰하고 CPE가 나타나지 않을 때 감염세포를 3회 얼리고 녹이는 과정 후, 위와 같은 방법으로 blind passage를 수행하였다. CPE가 확인된 바이러스는 plaque assay법을 3회 연속 실시하여 로타바이러스를 순수 분리하였다. 순수 분리된 바이러스는 단크론항체를 이용한 간접형광항체법(indirect fluorescent antibody technique, IFA) (Shaw 등, 1992), 전자현미경(Carl Zeiss, Libra 120, Germany) 관찰 및 RNA electropherotyping법을 이용하여 로타바이러스로 최종적으로 확인하였으며, VP4, VP6, VP7 및 NSP4 유전자 염기서열 확인에 사용하였다.
VP4 유전자 염기서열: 국내 분리 PoRV-1 로타바이러스 VP4 유전자를 분석한 결과, VP4 ORF는 모두 2,334개의 염기서열로 구성되었으며 777개의 아미노산을 encode하는 것으로 확인되었다. Genotype G9으로 확인된 PoRV-1에 대한 VP4 유전자 염기서열과 다른 P 유전자형과의 유전적 상관성을 조사하기 위하여 VP7 유전자 분석과 같은 방법으로 조사하였다. Group A 로타바이러스의 P 유전자형과 유사성을 비교 분석한 결과, PoRV-1의 유전자형은 P[23]로 확인되었으며 같은 P 유전자형간의 상동성은 88.
VP6 유전자와 NSP4 유전자의 경우, PCR 반응 조건 중 annealing 온도만 VP6 유전자는 57℃ 그리고 NSP4 유전자는 53℃로 수행하고 다른 조건은 모두 VP4와 VP7 유전자의 증폭과 같은 방법으로 수행하였다. PCR 반응 후, 증폭한 반응산물은 1.5% agarose gel에서 전기영동한 후 증폭 유무를 확인하였다.
VP4와 VP7 유전자를 증폭하기 위하여 각각의 유전자에 대하여 합성된 cDNA 5 μl에 10× ExTaq buffer(Takara, Japan) 4 μl, Taq DNA polymerase (5 U/μl; Takara, Japan) 1 μl, VP4와 VP7 유전자에 특이적인 sense 및 antisense primer (10 pM/μl) 각각 1 μl, 2.5 mM dNTP 3 μl 그리고 RNase free 증류수 25 μl를 넣어 전체 반응용량 40 μl를 핵산증폭기(Takara, Japan)를 사용하여 95℃에서 5분간 denaturation하였다.
VP6 유전자와 NSP4 유전자의 경우, PCR 반응 조건 중 annealing 온도만 VP6 유전자는 57℃ 그리고 NSP4 유전자는 53℃로 수행하고 다른 조건은 모두 VP4와 VP7 유전자의 증폭과 같은 방법으로 수행하였다. PCR 반응 후, 증폭한 반응산물은 1.
유전자 염기서열 분석: 국내 분리 로타바이러스 VP4, VP6, VP7 그리고 NSP4 유전자의 염기서열을 결정하기 위하여 PCR 반응산물을 QIAquick gel extraction kit (Qiagen, Germany)를 이용하여 제조사의 방법에 따라 정제하여 염기서열분석회사(Cosmogenetec, Korea)에 염기서열 분석을 의뢰하였다. 결정된 PoRV-1 strain의 VP4, VP6, VP7 그리고 NSP4 유전자의 염기서열은 Clustal_X (1.7) program을 이용하여 NCBI GenBank data bases에 등록된 group A 로타바이러스들의 유전자 염기서열과 다중 정렬하여 유사성 행렬을 구하였다. 다중정렬한 염기서열은 PHYLIP package를 이용하여 계통수를 작성하여 phylogenetic tree는 neighbour-joining algorithm을 이용하여 작성하였다(DNASTAR, Madison, USA).
흡착 후 α-MEM으로 1회 세척하고 1 μg/ml의 trypsin이 첨가된 α-MEM을 넣고 37℃ CO₂ 배양기에서 7일간 회전 배양하였다. 배양 7일 동안 세포변성효과(cytopathic effect, CPE)가 나타나는지를 관찰하고 CPE가 나타나지 않을 때 감염세포를 3회 얼리고 녹이는 과정 후, 위와 같은 방법으로 blind passage를 수행하였다. CPE가 확인된 바이러스는 plaque assay법을 3회 연속 실시하여 로타바이러스를 순수 분리하였다.
유전자 염기서열 분석: 국내 분리 로타바이러스 VP4, VP6, VP7 그리고 NSP4 유전자의 염기서열을 결정하기 위하여 PCR 반응산물을 QIAquick gel extraction kit (Qiagen, Germany)를 이용하여 제조사의 방법에 따라 정제하여 염기서열분석회사(Cosmogenetec, Korea)에 염기서열 분석을 의뢰하였다. 결정된 PoRV-1 strain의 VP4, VP6, VP7 그리고 NSP4 유전자의 염기서열은 Clustal_X (1.
최근에는 G9 유전자형 로타바이러스가 돼지에서도 빈번히 검출되고 있다(Collins 등, 2010, Okitsu 등, 2011; Teodoroff 등, 2005). 이 연구에서는 2010년 로타바이러스 양성으로 확인된 돼지 분변샘플을 이용하여 조직배양법을 통해 돼지로타바이러스를 순수분리하고, 분리된 로타바이러스의 주요 유전자인 VP4, VP6, VP7 및 NSP4의 염기서열을 확인하여 기존에 보고된 사람을 포함한 여러 동물유래 로타바이러스들의 염기서열 간에 유전적 상관관계를 조사하였다.
5 mM dNTP 3 μl 그리고 RNase free 증류수 25 μl를 넣어 전체 반응용량 40 μl를 핵산증폭기(Takara, Japan)를 사용하여 95℃에서 5분간 denaturation하였다. 이어 95℃에서 1분, 51℃에서 1분, 72℃에서 1분 30초간 35회의 cycle로 증폭하고 72℃에서 10분간 extension을 실시하였다.
즉, 추출한 viral RNA 5μl에 dNTP mixture (10 mM) 1 μl, 각각의 유전자 sense 및 antisense primer (10 pM/μl) 1 μl, 5× PrimeScript buffer 4 μl, RNase inhibitor (40 U/μl) 0.5μl, PrimeScript RT (200 U/μl) 1 μl, 그리고 RNase free 증류수 6.5 μl를 넣어 전체 반응용량 20 μl를 42℃에서 60분 그리고 70℃에서 15분간 반응시켜 cDNA를 합성하였으며 합성된 cDNA는 VP4, VP6, VP7 그리고 NSP4 유전자 증폭을 위해 사용하였다.
즉, 항생제가 첨가된 α-MEM으로 설사분변을 10% (w/v) 희석하여 3,000 rpm에서 10분간 원심한 후, 상층액만을 취하여 0.2 μm syringe filter로 여과하였다.

대상 데이터

2010년 충남 홍성에 있는 돼지농장에서 심한 설사 증상을 보이는 28일령의 어린 돼지로부터 분변을 채취하여 바이러스 분리에 사용하였다. 원숭이신장세포 유래인 MA104 세포는 5% 소태아 혈청(fetal bovine serum; FBS)(Invitrogen, USA)과 gentamycin sulfate(KukJe, South Korea)가 첨가된 α-minimum essential medium (α-MEM)(Invitrogen, USA)을 사용하여 배양하였으며 돼지로타바이러스 분리는 Sato 등(1981)과 Kang 등(1986)의 방법에 따라 다음과 같은 방법으로 수행하였다.
국내 분리 로타바이러스 PoRV-1 strain의 VP4, VP6, VP7 그리고 NSP4 유전자의 전체 염기서열을 결정하여 NCBI GenBank에 등록한 후, 각각 accession number JQ343833, JQ343834, JQ343835, 그리고 JQ343832로 지정받았다.

이론/모형

7) program을 이용하여 NCBI GenBank data bases에 등록된 group A 로타바이러스들의 유전자 염기서열과 다중 정렬하여 유사성 행렬을 구하였다. 다중정렬한 염기서열은 PHYLIP package를 이용하여 계통수를 작성하여 phylogenetic tree는 neighbour-joining algorithm을 이용하여 작성하였다(DNASTAR, Madison, USA).
로타바이러스 진단용 rapid 진단킷트를 사용하여 로타바이러스로 확인된 분변시료를 MA104 세포에 접종하여 바이러스 순수 분리를 시도한 결과, 로타바이러스를 분리할 수 있었다. 분리된 바이러스는 MA104 세포에서 2번째 계대배양에서 로타바이러스 특유의 CPE를 나타냈으며 plague purification 법으로 순수 분리된 바이러스를 PoRV-1 strain으로 명명하였다.
CPE가 확인된 바이러스는 plaque assay법을 3회 연속 실시하여 로타바이러스를 순수 분리하였다. 순수 분리된 바이러스는 단크론항체를 이용한 간접형광항체법(indirect fluorescent antibody technique, IFA) (Shaw 등, 1992), 전자현미경(Carl Zeiss, Libra 120, Germany) 관찰 및 RNA electropherotyping법을 이용하여 로타바이러스로 최종적으로 확인하였으며, VP4, VP6, VP7 및 NSP4 유전자 염기서열 확인에 사용하였다.
원숭이신장세포 유래인 MA104 세포는 5% 소태아 혈청(fetal bovine serum; FBS)(Invitrogen, USA)과 gentamycin sulfate(KukJe, South Korea)가 첨가된 α-minimum essential medium (α-MEM)(Invitrogen, USA)을 사용하여 배양하였으며 돼지로타바이러스 분리는 Sato 등(1981)과 Kang 등(1986)의 방법에 따라 다음과 같은 방법으로 수행하였다.

성능/효과

Group A 로타바이러스의 P 유전자형과 유사성을 비교 분석한 결과, PoRV-1의 유전자형은 P[23]로 확인되었으며 같은 P 유전자형간의 상동성은 88.4∼94.9%로 나타났고, 서로 다른 P 유전자형간의 상동성은 62.5∼75.3%로 나타났다.
NSP4 유전자 염기서열: 국내 분리 PoRV-1 로타바이러스 NSP4 유전자를 분석한 결과, NSP4 ORF는 모두 528개의 염기서열로 구성되어 있으며 175개의 아미노산을 encoding 하였다. PoRV-1 strain NSP4 유전자와 국내 및 국외에서 보고된 동물 및 사람로타바이러스 NSP4 유전자의 염기서열을 다중 정렬하여 비교한 결과, 같은 유전자형 E1에 속하는 바이러스의 유전자와는 90.
PoRV-1 VP6 유전자를 GenBank에 보고된 동물과 사람 로타바이러스 VP6 유전자의 염기서열과 다중 정렬하여 비교한 결과, 같은 유전자형 I5에 속하는 바이러스의 유전자와는 89.9∼96.3%의 상동성을 보였으며, 다른 유전자형과는 66.9∼84.68%의 상동성을 보였다.
PoRV-1 strain NSP4 유전자와 국내 및 국외에서 보고된 동물 및 사람로타바이러스 NSP4 유전자의 염기서열을 다중 정렬하여 비교한 결과, 같은 유전자형 E1에 속하는 바이러스의 유전자와는 90.5∼94.5%의 상동성을 보였으며, 다른 유전자형과는 55.3∼85.8%의 상동성을 보였다.
VP4 유전자 염기서열: 국내 분리 PoRV-1 로타바이러스 VP4 유전자를 분석한 결과, VP4 ORF는 모두 2,334개의 염기서열로 구성되었으며 777개의 아미노산을 encode하는 것으로 확인되었다. Genotype G9으로 확인된 PoRV-1에 대한 VP4 유전자 염기서열과 다른 P 유전자형과의 유전적 상관성을 조사하기 위하여 VP7 유전자 분석과 같은 방법으로 조사하였다.
VP6 유전자 염기서열: 국내 분리 PoRV-1 로타바이러스 VP6 유전자를 분석한 결과, VP6 ORF는 모두 1,191개의 염기서열로 구성되어 있으며 396개의 아미노산을 encoding하고 있었다. PoRV-1 VP6 유전자를 GenBank에 보고된 동물과 사람 로타바이러스 VP6 유전자의 염기서열과 다중 정렬하여 비교한 결과, 같은 유전자형 I5에 속하는 바이러스의 유전자와는 89.
VP7 유전자 염기서열: 국내 분리 PoRV-1 로타바이러스 VP7 유전자를 분석한 결과, VP7 open reading frame (ORF)는 모두 981개의 염기서열로 구성되었으며 326개의 아미노산을 encode하는 것으로 확인되었다. 또한, PoRV-1의 VP7 유전자 염기서열과 GenBank에 등록된 외국분리주의 VP7 유전자와 상관성을 조사한 결과, PoRV-1과 group A에 속하는 로타바이러스의 상동성의 범위는 61.
같은 유전자형(E1) 내의 로타바이러스 NSP4 유전자의 염기서열 상동성을 확인한 결과, 같은 G9 유전자형인 A34, NMTL PRG9121, PRG921 그리고 PRG942와 90.5∼94.5%, G1 유전자형인 Wa와 G5 유전자형인 OSU와는 93.7%와 91.2%로 높은 상동성을 보여 NSP4 유전자그룹이 G 유전자형과는 상관성이 없는 것으로 나타났다.
계통유전학적 분석결과, PoRV-1은 국내에서 보고된 돼지로타바이러스 PRG921과 PRG942과 각각 95.0%와 94.9%의 상동성을 나타내지만, 일본과 중국에서 분리된 돼지로타바이러스 34461-4, A34 그리고 NMTL과는 88.4∼90.1%의 상동성을 보여 P[23] 유전자형 내에 서로 다른 cluster를 이루고 있었다(Fig. 5).
국내에서 분리된 PoRV-1 strain 로타바이러스는 국내에서 보고된 PRG9121 (91.2%)과 중국에서 보고된 NMTL (90.7%) 보다 국내에서 분리 보고된 다른 로타바이러스주인 PRG921 그리고 PRG942 (90.5∼90.9%)과 유전자의 유사성이 높은 것으로 나타났다(Fig. 6).
또한, PoRV-1의 VP7 유전자 염기서열과 GenBank에 등록된 외국분리주의 VP7 유전자와 상관성을 조사한 결과, PoRV-1과 group A에 속하는 로타바이러스의 상동성의 범위는 61.4∼92.3% 범위로 나타났다.
2와 같이 로타바이러스 특유의 11개 band를 관찰할 수 있었으며 돼지로타바이러스 표준주로 사용한 Gottfried와 OSU strain과는 달리 10번과 11번째 유전자는 short pattern을 보였다. 또한, 로타바이러스 특이 단크론항체를 이용하여 간접형광항체법으로 확인한 결과, 순수 분리된 바이러스가 감염된 MA104 세포에서 세포질 내에 특이적인 형광을 나타내어 로타바이러스로 확인할 수 있었다(Fig. 3).
이번 연구에서도 Sato 등(1981)과 Kang 등(1986)의 방법으로 바이러스 분리를 시도한 결과, 분변으로부터 바이러스를 직접 순수 분리하였으며, 단층배양된 조직배양상에서 로타바이러스 특유의 세포변성효과를 관찰할 수 있었다. 또한, 전자현미경으로 조직배양액을 검사하였을 때 로타바이러스 입자를 확인할 수 있었다. 현재까지 국내에서 G9 유전자형 돼지로타바이러스의 감염을 확인하여 보고된 적은 있으나(Kim 등, 2010) 매우 제한적이다.
로타바이러스 진단용 rapid 진단킷트를 사용하여 로타바이러스로 확인된 분변시료를 MA104 세포에 접종하여 바이러스 순수 분리를 시도한 결과, 로타바이러스를 분리할 수 있었다. 분리된 바이러스는 MA104 세포에서 2번째 계대배양에서 로타바이러스 특유의 CPE를 나타냈으며 plague purification 법으로 순수 분리된 바이러스를 PoRV-1 strain으로 명명하였다.
Group A 로타바이러스는 VP6의 항원성에 따라 subgroup (subgroup I, II, I+II, non-I/II)으로 구분되었으나 최근에는 VP6 유전자의 염기서열 차이에 따라 16개의 I 유전자형으로 구분하고 있다(Matthijnssens 등, 2008). 분리된 PoRV-1은 G5 유전자형에 속하는 돼지로타바이러스 OSU (subgroup I)와 G11 유전자형인 돼지로타바이러스 YM (subgroup I)과 함께 I5 유전자형에 속하였으나 G4 유전자형 돼지로타바이러스 Gottfried (subgroup II)와는 다른 I 유전자형에 속하였다.
1과 같이 로타바이러스 특유의 수레바퀴 모양인 직경 70 nm 크기의 바이러스 입자를 관찰할 수 있었다. 분리한 바이러스의 RNA 전기영동 pattern을 확인하기 위하여 RNA electropherotyping을 실시한 결과, Fig. 2와 같이 로타바이러스 특유의 11개 band를 관찰할 수 있었으며 돼지로타바이러스 표준주로 사용한 Gottfried와 OSU strain과는 달리 10번과 11번째 유전자는 short pattern을 보였다. 또한, 로타바이러스 특이 단크론항체를 이용하여 간접형광항체법으로 확인한 결과, 순수 분리된 바이러스가 감염된 MA104 세포에서 세포질 내에 특이적인 형광을 나타내어 로타바이러스로 확인할 수 있었다(Fig.
순수 분리된 PoRV-1 바이러스를 MA104 세포에서 배양한 후 바이러스를 농축 정제하여 negative staining하여 전자현미경으로 관찰한 결과, Fig. 1과 같이 로타바이러스 특유의 수레바퀴 모양인 직경 70 nm 크기의 바이러스 입자를 관찰할 수 있었다. 분리한 바이러스의 RNA 전기영동 pattern을 확인하기 위하여 RNA electropherotyping을 실시한 결과, Fig.
이 연구에서 분리된 PoRV-1 strain은 G9 유전자형으로 확인되었다. G9 유전자형 로타바이러스는 임상적으로 중요한 G 유전자형(G1-4 그리고 G9)의 하나로 전 세계적으로 지속적인 특별한 관심을 끌고 있다.
이 연구에서 분리된 PoRV-1 strain의 VP4의 유전자형을 확인하기 위해 이미 P 유전자형이 확인된 reference strain과의 계통학적 분석을 수행한 결과, P[23]유전자형로 확인된 34461-4, A34, NMTL, PRG921 그리고 PRG942와 같은 cluster에 포함되어 PoRV-1도 P[23] 유전자형일 것으로 추정된다. 돼지로타바이러스에서 P[23] 유전자형은 스페인, 태국, 일본 그리고 국내에서도 보고되었다(Kim 등, 2010; Liprandi 등, 2003; Okitsu 등, 2011; Teodoroff 등, 2005).
사람과 동물에서 분리되는 로타바이러스의 NSP4 유전자는 염기서열 상동성에 따라 A, B, C 그리고 D 유전자그룹이 존재한다고 보고되었으며(Kirkwood와 Palombo, 1997), 최근에는 Matthijnssens 등(2008)이 NSP4 유전자의 염기서열 차이에 따라 14개의 E 유전자형으로 분류하였다. 이번 연구에서 분리한 PoRV-1 strain의 NSP4 유전자 계통수를 분석한 결과, 모두 E1 유전자형으로 확인되었다. 같은 유전자형(E1) 내의 로타바이러스 NSP4 유전자의 염기서열 상동성을 확인한 결과, 같은 G9 유전자형인 A34, NMTL PRG9121, PRG921 그리고 PRG942와 90.
최근 국내 양돈장에서 설사를 주 증상으로 하는 장염에 감염된 자돈에서 G9 유전자형 돼지로타바이러스가 분리되었다. 이번 연구에서는 조직배양법을 이용하여 설사분변으로부터 돼지로타바이러스 1주를 세포배양을 이용하여 순수 분리하였으며, 분리된 바이러스(PoRV-1)의 VP7, VP4, VP6 그리고 NSP4 유전자의 염기서열을 확인하여 유전자형이 각각 G9, P[23], I5 그리고 E1임을 확인하였다. 이번 연구에서 분리된 돼지로타바이러스와 확인된 염기서열 결과는 앞으로 G9 유전자형 돼지로타바이러스 백신개발에 유용하게 활용될 수 있을 것으로 생각한다.
특히, G9 genotype에 속하는 사람과 돼지로타바이러스와는 각각 86.7∼87.1%와 90.7∼92.3%의 비교적 높은 상동성을 나타냈으나 G7 genotype에 속하는 조류로타바이러스 Ch-2와는 61.4%의 낮은 상동성을 나타내었다(Fig. 4).

후속연구

이전에는 G9 유전자형이 비정형적인 유전자형이었으나 점차 발병률이 높아지는 것으로 보고되고 있는 것을 고려할 때, G9 유전자형 로타바이러스를 MA104 세포를 통하여 처음으로 순수분리하고 이들 바이러스의 중요 유전자(VP4, VP6, VP7, NSP4)에 대한 분자생물학적인 특성 연구는 국내 발생 경향이나 향 후 분리되는 strain에 대한 분자적 그리고 임상적인 기초 자료로서 의의가 있는 것으로 생각한다. 앞으로 국내 G9 유전자형의 돼지로타바이러스에 대한 지속적인 감시를 통하여 더 많은 수의 G9 유전자형 돼지로타바이러스를 확보하여 이에 대한 분자생물학적 특성규명연구가 수행되어야 할 것이다.
현재까지 국내에서 G9 유전자형 돼지로타바이러스의 감염을 확인하여 보고된 적은 있으나(Kim 등, 2010) 매우 제한적이다. 이번 연구에서 분리된 돼지로타바이러스는 돼지에서 백신개발 및 혈청학적 검사에 유용하게 활용될 것으로 생각한다.
이번 연구에서는 조직배양법을 이용하여 설사분변으로부터 돼지로타바이러스 1주를 세포배양을 이용하여 순수 분리하였으며, 분리된 바이러스(PoRV-1)의 VP7, VP4, VP6 그리고 NSP4 유전자의 염기서열을 확인하여 유전자형이 각각 G9, P[23], I5 그리고 E1임을 확인하였다. 이번 연구에서 분리된 돼지로타바이러스와 확인된 염기서열 결과는 앞으로 G9 유전자형 돼지로타바이러스 백신개발에 유용하게 활용될 수 있을 것으로 생각한다.

질의응답

핵심어	질문	논문에서 추출한 답변
	로타바이러스란?	로타바이러스는 돼지를 포함한 어린 포유동물과 조류에서 설사를 주 증상으로 하는 급성장염의 주요 원인체로 알려졌다(Estes와 Kapikian, 2007). 로타바이러스는 Reoviridae과에 속하는 직경 70 nm 정도의 정이십면체 형태의 바이러스로 triple-layered capsid를 가지며 core에는 분절로 되어 있는 11개의 이중가닥 RNA (dsRNA)로 구성된 유전자가 존재한다.
	로타바이러스는 어떻게 분류되는가?	초기에 로타바이러스는 capsid 단백질의 항원성에 따라 군(group), 아군(subgroup) 그리고 혈청형(serotype)으로 분류되었다(Estes 등, 1983; Estes와 Kapikian, 2007). 로타바이러스 군은 혈청학적 방법에 의하여 교차반응이 있는 VP6의 항원성에 따라 7개의 군(A-G)으로 분류되며, 돼지에서는 A, B 그리고 C군이 보고되고 있으나 대부분의 로타바이러스성 설사는 A군에 의하여 일어난다(Estes와 Kapikian, 2007; Yolken 등, 1988).
	로타바이러스의 구조단백질 중 VP4는 무엇인가?	로타바이러스의 구조단백질 중 VP6는 안쪽 capsid를 구성하는 중요한 단백질로 core capsid 단백질인 VP2와 바깥쪽 capsid 단백질인 VP4/VP7과 상호작용하며, 모든 로타바이러스에는 공통 항원부위가 존재하기 때문에 항원검출을 목적으로 하는 진단에 주 표적이 되고 있다(Prasad 등, 1988; Chen 등, 1992). VP4는 바깥쪽 capsid에 존재하는 spike 단백질로 바이러스 복제 시 단백질 분해효소에 의해 VP8과 VP5로 잘려 감염력이 증가하는 것으로 알려졌다(Dormitzer 등, 2004; Monnier 등, 2006). VP7은 바깥쪽 capsid의 표면을 구성하는 당단백질로 VP4와 함께 중화항체 형성에 관여하며 로타바이러스 감염에서 방어에 중요한 역할을 한다.

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저자의 다른 논문 :

표제어: PCR

동의어: Packet Collision Rate

용어 설명 출처 목록 (6)

용어 설명: PCR은 세균 특이성이 있는 primer를 이용하여 적은 수의 세균이 있을지라도 쉽게 검출할 수 있는 유용한 방법이며, 이를 이용하여 구강 내 치면세균막이나 타액에서 직접 세균을 검출할 수 있게 되었다[8].

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