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문제 정의
- 본 연구에서는 양송이 육종에 필요한 기본 정보를 얻고자 다양한 출처의 양송이 이핵균주를 대상으로 생육 및 생화학적 특성을 비교 검정하였다. 시험한 31균주 중 대부분 의 균주가 Oatmeal agar에서 MEA나 PDA에서 보다 균사 생장이 우수하였다.
- 현재 국내의 양송이 육종 기반은 매우 미진한 실정이며 육종소재에 대한 기본정보마저 부족한 상황이다. 이에 따라 본 연구에서는 양송이 육종에 필요한 기본 자료를 얻고자 다양한 출처의 양송이 이핵균주를 대상으로 생육 및 생화학적 특성을 비교 검정하였다. 실험에 사용된 이핵균주는 총 31균주로서 농촌진흥청 국립원예특작과학원 인삼특작부 버섯과에서 분양을 받아 실험을 진행하였다.
제안 방법
- β-glucosidase를 제외한 congo red를 사용하는 나머지 다섯가지 세포외효소 검정시험에서는 시험균주에 의해 분비된 세포외효소에 의해서 붉은 배지색이 오렌지색으로 바뀌거나 투명해지는 지점까지 측정하였다.
- β-glucosidase를 제외한 congo red를 사용하는 나머지 다섯가지 세포외효소 검정시험에서는 시험균주에 의해 분비된 세포외효소에 의해서 붉은 배지색이 오렌지색으로 바뀌거나 투명해지는 지점까지 측정하였다. Protease를 검정하는 시험에서는 시험균주가 분비한 세포외효소에 의해서 배지의 색이 투명하게 바뀌는 지점까지 측정하였다. 검정한 7가지 세포외 효소 중에서 protease의 활성은 모든 실험균주가 지니고 있었고, 7개 균주를 제외한 31개 균주가 β-glucosidase 활성을 보이는 것을 알 수 있었다(Fig.
- 활성 검정을 위해서 PDA에서 배양된 이핵균주를 발색반응 배지로 옮겼다. 발색반응 배지에로는 0.1%의 yeast nitrogen base (Difco, USA), 효소반응을 위한 탄소원으로는 0.5%의 D-cellobiose (Sigma, USA), Avicel PH-101 (Fluka, Switzerland), CMcellulose (Sigma, USA), Polygalacturonic acid (MP Biomedical, France), Xylan oat spelts (Sigma, USA) 등을 각각 사용하였으며, 발색반응을 위해서는 0.5%의 Congo Red dye (Sigma, USA)를 그리고 1.5%의 agar powder를 넣어주었다[9]. 시험균주가 접종된 chromogenic media를 25℃에 서 약 14일 간 배양 후 분해환(clear zone)의 길이를 측정하였다.
- 시험균주가 접종된 chromogenic media를 25℃에 서 약 14일 간 배양 후 분해환(clear zone)의 길이를 측정하였다. 분해환의 길이는 시험균주가 접종된 곳부터 환이 형성된 곳까지를 측정하였다. 분해환의 색은 congo red를 발색시약으로 사용한 β-glucosidase, avicelase, CM-cellulase, amylase, pectinase, xylanase를 검정한 시험에서 β-glucosidase의 검정 시험에서는 시험균주에 의해 분비된 세포외 효소에 의해서 붉은 배지색이 검은색으로 변한 지점까지 측정을 하였다.
- 분해환의 색은 congo red를 발색시약으로 사용한 β-glucosidase, avicelase, CM-cellulase, amylase, pectinase, xylanase를 검정한 시험에서 β-glucosidase의 검정 시험에서는 시험균주에 의해 분비된 세포외 효소에 의해서 붉은 배지색이 검은색으로 변한 지점까지 측정을 하였다.
- 조금 더 정확한 기질 선호도를 알아보기 위해 세포외효소의 활성을 검정하였다. 세포외 효소의 활성 정도를 비교하기 위해서 주요 탄소원이 포함된 평판배지에 접종하여 발생반응의 결과로 생성된 분해환의 크기를 비교하여 평가하였다. 검정한 세포외효소는 β-glucosidase, avicellase, CM-cellulase, amylase, pectinase, xylanase, proteinase 총 7가지 였다.
- 검정한 세포외효소는 β-glucosidase, avicellase, CM-cellulase, amylase, pectinase, xylanase, proteinase 총 7가지 였다. 세포외효소의 활성정도 비교는 발색배지에 형성된 분해 환의 크기를 이용하여 비교하였다. 활성 검정을 위해서 PDA에서 배양된 이핵균주를 발색반응 배지로 옮겼다.
- 5%의 agar powder를 넣어주었다[9]. 시험균주가 접종된 chromogenic media를 25℃에 서 약 14일 간 배양 후 분해환(clear zone)의 길이를 측정하였다. 분해환의 길이는 시험균주가 접종된 곳부터 환이 형성된 곳까지를 측정하였다.
- 이 시험 균주들은 총 17개국에서 수집되었으며 대한민국을 포함한 아시아 4개국에서 수집된 11균주, 캐나다를 포함한 북미 2개국에서 수집된 6균주, 남미인 브라질에서 수입된 2균주, 프랑스를 포함한 유럽 5개국에서 수집된 8균 주, 호주를 포함한 오세아니아 2개국에서 수집된 4균주로 구성되어있다(Table 1). 시험균주들을 potato dextrose agar (Difco, USA), malt extract agar (BD, USA), oatmeal agar (Difco, USA)에 접종하여 25℃에서 14일간 배양하며 시험균주들의 기질선호도를 평가하였다(Table 1).
- 조금 더 정확한 기질 선호도를 알아보기 위해 세포외효소의 활성을 검정하였다. 세포외 효소의 활성 정도를 비교하기 위해서 주요 탄소원이 포함된 평판배지에 접종하여 발생반응의 결과로 생성된 분해환의 크기를 비교하여 평가하였다.
- 세포외효소의 활성정도 비교는 발색배지에 형성된 분해 환의 크기를 이용하여 비교하였다. 활성 검정을 위해서 PDA에서 배양된 이핵균주를 발색반응 배지로 옮겼다. 발색반응 배지에로는 0.
대상 데이터
- 검정한 세포외효소는 β-glucosidase, avicellase, CM-cellulase, amylase, pectinase, xylanase, proteinase 총 7가지 였다.
- 1G). 또한 4개 균주를 제외한 34개 균주가 xylanase 활성을 보였다(Fig. 1F). 그러나 실험균주 중에서 절반 이하의 균주에서만 avicelase, CM-cellulase, amylase, pectinase 활성을 보였다(Fig 1B, C, D, E).
- 이에 따라 본 연구에서는 양송이 육종에 필요한 기본 자료를 얻고자 다양한 출처의 양송이 이핵균주를 대상으로 생육 및 생화학적 특성을 비교 검정하였다. 실험에 사용된 이핵균주는 총 31균주로서 농촌진흥청 국립원예특작과학원 인삼특작부 버섯과에서 분양을 받아 실험을 진행하였다. 이 시험 균주들은 총 17개국에서 수집되었으며 대한민국을 포함한 아시아 4개국에서 수집된 11균주, 캐나다를 포함한 북미 2개국에서 수집된 6균주, 남미인 브라질에서 수입된 2균주, 프랑스를 포함한 유럽 5개국에서 수집된 8균 주, 호주를 포함한 오세아니아 2개국에서 수집된 4균주로 구성되어있다(Table 1).
- 실험에 사용된 이핵균주는 총 31균주로서 농촌진흥청 국립원예특작과학원 인삼특작부 버섯과에서 분양을 받아 실험을 진행하였다. 이 시험 균주들은 총 17개국에서 수집되었으며 대한민국을 포함한 아시아 4개국에서 수집된 11균주, 캐나다를 포함한 북미 2개국에서 수집된 6균주, 남미인 브라질에서 수입된 2균주, 프랑스를 포함한 유럽 5개국에서 수집된 8균 주, 호주를 포함한 오세아니아 2개국에서 수집된 4균주로 구성되어있다(Table 1). 시험균주들을 potato dextrose agar (Difco, USA), malt extract agar (BD, USA), oatmeal agar (Difco, USA)에 접종하여 25℃에서 14일간 배양하며 시험균주들의 기질선호도를 평가하였다(Table 1).
성능/효과
- β-glucosidase 활성 검정용 배지에서의 균사생장은 avicelase를 포함한 다른 5개 배지에 비해서 조금 더 많이 일어났으며, 균사의 밀도 역시 상대적으로 높은 양상을 보였다.
- 7가지 세포외효소 활성 비교에서 양송이 균주는 대체로 β-glucosidase가 가장 뚜렷한 활성을 나타내었으며 protease의 활성은 모든 균주가 지니고 있었다.
- 흥미롭게도 같은 균주이지만 배지에 따라 생육정도가 같은 정도를 나타내는 균주(예, ASI1146, ASI1098, ASI 11389)도 존재하였다. ASI1146 균주의 경우는 유일하게 비교 평가한 3개 배지에서 모두 생장이 우수하였다. 이러한 결과는 배지에 따라 양송이 균주 간에 균사 생장특성에 차이가 존재할 수 있음을 보여준다.
- ASI1146균주의 경우에는 β-glucosidase 이외에도 avicelase와 amylase에서 다른 균주에 비해서 강한 활성을 보였으며, 균사 생육배지인 PDA, MEA, OA에서도 우수한 생장을 보였다.
- β-glucosidase 활성 검정용 배지에서의 균사생장은 avicelase를 포함한 다른 5개 배지에 비해서 조금 더 많이 일어났으며, 균사의 밀도 역시 상대적으로 높은 양상을 보였다. Protease 활성 검정용 배지에서의 균사 생장이 가장 좋았고 생장한 균사의 밀도 역시 가장 높게 나타났다.
- 검정한 7가지 세포외 효소 중에서 protease의 활성은 모든 실험균주가 지니고 있었고, 7개 균주를 제외한 31개 균주가 β-glucosidase 활성을 보이는 것을 알 수 있었다(Fig. 1G).
- 본 실험에 사용된 균주들 중에서 β-glucosidase의 활성정도가 검정한 7가지 세포외 효소 중에서 가장 강한 것을 알 수 있었다.
- 본 연구를 통하여 배지 종류에 따라 그리고 세포외효소 종류에 따라 양송이 이핵균주 간에 균사 생육 특성과 효소 특성이 다르게 나타나는 것을 알 수 있었다. 이는 여러 출처에서 수집된 양송이 육종의 모본을 평가하기 위한 간단한 방법으로서 서로 다른 생화학적 특성을 지닌 균주를 선별하기 위해 사용되는 발생반응 검정법이 이용 가능함을 제시한다.
- 특히 β-glucosidase, avicelase, CM-cellulase, amylase 등의 경우 균주간 활성이 높고 낮음 또는 활성이 있고 없고 하는 특성이 뚜렷이 확인되었다. 시험배지 위에서 균사의 생장 정도를 비교하였을 때, avicelase, CM-cellulase, amylase, pectinase, xylanase 활성 검정용 배지에서의 균사생장은 매우 적게 일어났으며, 자라난 균사의 밀도 역시 낮았다. β-glucosidase 활성 검정용 배지에서의 균사생장은 avicelase를 포함한 다른 5개 배지에 비해서 조금 더 많이 일어났으며, 균사의 밀도 역시 상대적으로 높은 양상을 보였다.
- 본 연구에서는 양송이 육종에 필요한 기본 정보를 얻고자 다양한 출처의 양송이 이핵균주를 대상으로 생육 및 생화학적 특성을 비교 검정하였다. 시험한 31균주 중 대부분 의 균주가 Oatmeal agar에서 MEA나 PDA에서 보다 균사 생장이 우수하였다. 7가지 세포외효소 활성 비교에서 양송이 균주는 대체로 β-glucosidase가 가장 뚜렷한 활성을 나타내었으며 protease의 활성은 모든 균주가 지니고 있었다.
- 한국에서 수집된 ASI1146 균주, 브라질에서 수집된 ASI1336 균주의 경우에는 다른 시험균주에 비하여 월등히 강한 β-glucosidase의 활성을 보였다.
후속연구
- 이러한 방법은 향후 균주의 보존에 사용되는 퇴비배지에서 균주 간 구분이 힘들 경우 균주간의 구분에 사용되는 생화학적 마커로 응용할 수 있을 것으로 사료된다. 또한 본 연구에 사용된 양송이 균주는 국내 연구 기관에서 분양을 받을 수 있으므로 본 연구에서 얻어진 결과는 균주를 분양 받아 양송이 육종 또는 양송이 효소특성을 연구하고자 하는 연구자들이 분양 균주 선택에 귀중한 정보를 제공할 것으로 기대된다.
- 이에 반해 avicelase, CM-cellulase, amylase, pectinase 활성은 20균주 이하에서만 나타났다. 본 연구 결과는 국내 양송이 육종을 위한 균주 선발 기준 중 하나로 이용될 수 있을 것이다.
- 본 연구를 통하여 배지 종류에 따라 그리고 세포외효소 종류에 따라 양송이 이핵균주 간에 균사 생육 특성과 효소 특성이 다르게 나타나는 것을 알 수 있었다. 이는 여러 출처에서 수집된 양송이 육종의 모본을 평가하기 위한 간단한 방법으로서 서로 다른 생화학적 특성을 지닌 균주를 선별하기 위해 사용되는 발생반응 검정법이 이용 가능함을 제시한다. 이러한 방법은 향후 균주의 보존에 사용되는 퇴비배지에서 균주 간 구분이 힘들 경우 균주간의 구분에 사용되는 생화학적 마커로 응용할 수 있을 것으로 사료된다.
- 이는 여러 출처에서 수집된 양송이 육종의 모본을 평가하기 위한 간단한 방법으로서 서로 다른 생화학적 특성을 지닌 균주를 선별하기 위해 사용되는 발생반응 검정법이 이용 가능함을 제시한다. 이러한 방법은 향후 균주의 보존에 사용되는 퇴비배지에서 균주 간 구분이 힘들 경우 균주간의 구분에 사용되는 생화학적 마커로 응용할 수 있을 것으로 사료된다. 또한 본 연구에 사용된 양송이 균주는 국내 연구 기관에서 분양을 받을 수 있으므로 본 연구에서 얻어진 결과는 균주를 분양 받아 양송이 육종 또는 양송이 효소특성을 연구하고자 하는 연구자들이 분양 균주 선택에 귀중한 정보를 제공할 것으로 기대된다.
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