한강물로부터 분리된 방사선 내성 세균들의 계통학적 다양성 및 UV 내성 분석 Phylogenetic diversity and UV resistance analysis of radiation-resistant bacteria isolated from the water in Han River원문보기
이 논문은 서울 한강물에서 분리한 방사선 내성 세균군집과 분리된 신종 세균의 UV 내성 특성에 관한 내용이다. 세균은 R2A agar와 1/10 R2A agar를 사용하여 3 kGy가 조사된 한강물에서 분리되었다. 그 결과 방사선에 내성을 가지는 것으로 추측되는 균주를 60주 분리하였고, 본 연구 분석 자료로 사용하였다. 16S rRNA 유전자 염기서열 분석을 통해 분리균주 60개의 계통수를 파악한 결과, 3개의 문(4개의 속)이 확인되었고, Deinococcus-Thermus (Deinococcus)가 61.7%, Firmicutes(Exiguobacterium)는 15%, Bacteroidetes (Hymenobacter, Spirosoma)는 23.4%의 비중을 나타냈다. 분리균주 중 29개 균주가 Deinococcus, Hymenobacter, Spirosoma에 속하는 신종 또는 다른 신속으로 분류될 가능성을 보였으며, 앞으로 추가적인 신종 실험이 진행될 예정이다. 그리고 신종 예상균주를 9개 선정하여 UV 내성 실험을 진행한 결과, 9개 균주 모두 D. radiodurans $R1^T$ 균주 만큼 높은 UV 내성을 가지는 것으로 나타났다. 또한 분리된 Firmicutes (Exiguobacterium) 균주는 아직까지 방사선 내성 연구 보고가 되어 있지 않아서 추가적인 방사선 내성 연구가 필요하다.
이 논문은 서울 한강물에서 분리한 방사선 내성 세균군집과 분리된 신종 세균의 UV 내성 특성에 관한 내용이다. 세균은 R2A agar와 1/10 R2A agar를 사용하여 3 kGy가 조사된 한강물에서 분리되었다. 그 결과 방사선에 내성을 가지는 것으로 추측되는 균주를 60주 분리하였고, 본 연구 분석 자료로 사용하였다. 16S rRNA 유전자 염기서열 분석을 통해 분리균주 60개의 계통수를 파악한 결과, 3개의 문(4개의 속)이 확인되었고, Deinococcus-Thermus (Deinococcus)가 61.7%, Firmicutes(Exiguobacterium)는 15%, Bacteroidetes (Hymenobacter, Spirosoma)는 23.4%의 비중을 나타냈다. 분리균주 중 29개 균주가 Deinococcus, Hymenobacter, Spirosoma에 속하는 신종 또는 다른 신속으로 분류될 가능성을 보였으며, 앞으로 추가적인 신종 실험이 진행될 예정이다. 그리고 신종 예상균주를 9개 선정하여 UV 내성 실험을 진행한 결과, 9개 균주 모두 D. radiodurans $R1^T$ 균주 만큼 높은 UV 내성을 가지는 것으로 나타났다. 또한 분리된 Firmicutes (Exiguobacterium) 균주는 아직까지 방사선 내성 연구 보고가 되어 있지 않아서 추가적인 방사선 내성 연구가 필요하다.
The aim of this study was to investigate the UV-resistance of radiation-resistant bacteria isolated from the water of Han River, South Korea. The water sample was irradiated with 3 kGy gamma radiation prior to isolation. Radiation-resistant bacterial strains were isolated by standard serial dilution...
The aim of this study was to investigate the UV-resistance of radiation-resistant bacteria isolated from the water of Han River, South Korea. The water sample was irradiated with 3 kGy gamma radiation prior to isolation. Radiation-resistant bacterial strains were isolated by standard serial dilution method on R2A and 1/10 diluted R2A agar. The resulting purely isolated 60 cultures of bacteria were analysed for UV resistance and used in further studies. Based on the comparative analyses of 16S rRNA gene sequences, the bacterial isolates were divided into 3 phyla (4 genera): the phylum Deinococcus-Thermus (the genus Deinococcus) was 61.7%, Bacteroidetes (Hymenobacter and Spirosoma) was 23.4%, and Firmicutes (Exiguobacterium) was 15%. The results suggested that twenty-nine isolates are candidates new species belonging to Deinococcus, Hymenobacter, and Spirosoma, or other new genera. Nine bacterial strains were selected among the novel candidates and the UV-resistance analysis was conducted. All the candidate bacterial strains showed high UV resistance, similar to that of D. radiodurans R1.
The aim of this study was to investigate the UV-resistance of radiation-resistant bacteria isolated from the water of Han River, South Korea. The water sample was irradiated with 3 kGy gamma radiation prior to isolation. Radiation-resistant bacterial strains were isolated by standard serial dilution method on R2A and 1/10 diluted R2A agar. The resulting purely isolated 60 cultures of bacteria were analysed for UV resistance and used in further studies. Based on the comparative analyses of 16S rRNA gene sequences, the bacterial isolates were divided into 3 phyla (4 genera): the phylum Deinococcus-Thermus (the genus Deinococcus) was 61.7%, Bacteroidetes (Hymenobacter and Spirosoma) was 23.4%, and Firmicutes (Exiguobacterium) was 15%. The results suggested that twenty-nine isolates are candidates new species belonging to Deinococcus, Hymenobacter, and Spirosoma, or other new genera. Nine bacterial strains were selected among the novel candidates and the UV-resistance analysis was conducted. All the candidate bacterial strains showed high UV resistance, similar to that of D. radiodurans R1.
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문제 정의
이 논문은 서울 한강물에서 분리한 방사선 내성 세균군집과 분리된 신종 세균의 UV 내성 특성에 관한 내용이다. 세균은 R2A agar와 1/10 R2A agar를 사용하여 3 kGy가 조사된 한강물에서 분리되었다.
이렇게 방사선 내성 균주가 분리되었던 다양한 환경들 중에서 물에서 분리된 방사선 내성 미생물의 보고가 상당 수 이루어 짐에 따라(Im et al., 2008; Kämpfer et al., 2008; Asker et al., 2009;2011), 우리나라 서울 한강물에서 방사선 내성을 가지는 것으로 추측되는 미생물을 분리 및 탐색 하고, 16S rDNA 유전자 염기서열을 비교하여 한강에서의 방사선 내성 미생물의 계통수를 분석하고자 하였다.
제안 방법
16S rRNA 유전자를 증폭하기 위해 27F (5′-AGAGTTTGATCM TGGCTCAG-3′) primer와 1492R (5′-TACGGYTACCTTG TTACGACTT-3′) primer를 사용하였고, MJ Research 사의 PTC-225 Peltier Thermal Cycler를 사용하여 PCR 반응은 초기변성(95°C, 5분), 변성(95°C, 1분), 냉각(55°C, 1분), 신장 (72°C, 1분)을 35회 반복한 후 마지막 신장(72°C, 5분)을 실시 하였다.
균질화된 시료에 3 kGy의 감마선(gamma-ray)을 조사하고 연속희석법으로 희석한 후, 현탁액을 R2A agar (Difco) 및 1/10로 희석된 R2A agar (Difco) 배지에 각각 도말하여 25°C에 7일간 배양하였다. 3 kGy 방사선에 견디고 자라난 군락(colony)을 군락의 모양, 크기, 색깔 등에 따라 선별하여 처음에 도말했던 평판배지에 계대 배양하여 순수분리 하였다. 분리된 미생물은 20% (v/v) glycerol에 현탁하여 초저온 냉동고(-80°C)에 동결보관하였다.
16S rRNA 유전자를 증폭하기 위해 27F (5′-AGAGTTTGATCM TGGCTCAG-3′) primer와 1492R (5′-TACGGYTACCTTG TTACGACTT-3′) primer를 사용하였고, MJ Research 사의 PTC-225 Peltier Thermal Cycler를 사용하여 PCR 반응은 초기변성(95°C, 5분), 변성(95°C, 1분), 냉각(55°C, 1분), 신장 (72°C, 1분)을 35회 반복한 후 마지막 신장(72°C, 5분)을 실시 하였다. Applied Biosystems 사의 ABI 3730XL DNA analyzer 를 이용하여 유전자 염기서열 결과를 얻었다. 이러한 유전자 염기서열 분석은 ㈜마크로젠(Macrogen)을 통해 이루어졌다.
UV 조사 후, 25°C에서 3일간 배양한 다음 colony를 계수하였다.
균질화된 시료에 3 kGy의 감마선(gamma-ray)을 조사하고 연속희석법으로 희석한 후, 현탁액을 R2A agar (Difco) 및 1/10로 희석된 R2A agar (Difco) 배지에 각각 도말하여 25°C에 7일간 배양하였다.
분석된 염기서열은 EzBioCloud의 database (http://www. ezbiocloud.net/eztaxon/)를 이용해서 GenBank로부터 유사성이 높은 염기서열을 비교하여 가장 가까운 종으로 나타나는 서열을 확인하였다. 본 연구에 선택된 균주들의 16S rRNA 염기서열 alignment는 BioEdit (Hall, 1999)으로 수집, Clustal_X (Thompson et al.
신종 가능성을 가지는 분리 균주들 중에서 9개의 신종 균주들을 선정하여 실제 UV 세기에 따른 생장여부를 확인하기 위해서 UV 내성 실험을 진행하였다. Deinococcus 속에 속하는 신종 후보 균주인 16F1E, 16F3H, 16F3J 등 3균주는 D10값(미생물의 개체수가 10분의 1로 줄어들 때 방사선 조사량)이 600 J/m2 이하이며, 이 균주들은 방사선 내성이 높다고 알려진 positive control로 사용한 Deinococcus radiodurans R1T 균주만큼 높은 UV 내성 결과를 보였고, 16F7B 균주는 D10값이 300 J/m2이하로 나타났다.
Applied Biosystems 사의 ABI 3730XL DNA analyzer 를 이용하여 유전자 염기서열 결과를 얻었다. 이러한 유전자 염기서열 분석은 ㈜마크로젠(Macrogen)을 통해 이루어졌다.
이러한 연구를 통해 지금까지 한강물에서 밝혀지지 않았던 다수의 신속 및 신종 미생물 연구를 진행할 수 있을 것으로 기대된다. 이렇게 분리된 균주(60개) 중에서 신종 가능성이 있는 균주(29개 중에서) 11개(Fig. 1-붉은색)와 기존에 밝혀진 종과 유사도가 높은 균주(31개 중에서) 13개(Fig. 1-녹색)를 선정하여, 이들 총 24개 균주를 NCBI의 GenBank에 등록하고(Table 2), 계통학적 분석을 통하여 계통수를 작성한 결과 Fig. 1과 같다.
, 1999)을 사용하였다. 접종된 R2A agar plate의 뚜껑을 열고 UVC ultraviolet crosslinker (UVP, CX-2000)를 사용하여 254 nm의 파장으로 UV를 조사하였다. 선량률(dose rate)는 50 J/m2/sec이며, 노출 시간을 조정함에 따라 전체 UV 조사량이 달라진다.
튜브를 10초 동안 빠른 속도로 vortexing하고 10분 동안 100°C에 끓인 후, 다시 튜브를 10초 동안 빠른 속도로 vortexing하고 원심분리(10,000–12,000 rpm, 3분)하여 16S rRNA 유전자 분석을 위한 genomic DNA를 추출하였다.
대상 데이터
2016년 1월에 여의도 공원 근처의 한강 상층수를 멸균된 병에 1 L 담아서 채집한 후, Hydrophilic membrane filter (Mixed Cellulose ester 02047A, 0.20 μm, Hyundai Micro.)로 여과하여 10 ml 증류수에 여과된 필터지를 넣어 균질화 하였다.
세균은 R2A agar와 1/10 R2A agar를 사용하여 3 kGy가 조사된 한강물에서 분리되었다. 그 결과 방사선에 내성을 가지는 것으로 추측되는 균주를 60주 분리하였고, 본 연구 분석 자료로 사용 하였다. 16S rRNA 유전자 염기서열 분석을 통해 분리균주 60개의 계통수를 파악한 결과, 3개의 문(4개의 속)이 확인되었고, Deinococcus-Thermus (Deinococcus)가 61.
이론/모형
Negative control로는 Escherichia coli K-12 (=KCTC 1116) (Kämpfer et al., 2008), Positive control로는 Deinococcus radiodurans R1T (=DSM 20539T ) (Brooks and Murray, 1981; White et al., 1999)을 사용하였다.
net/eztaxon/)를 이용해서 GenBank로부터 유사성이 높은 염기서열을 비교하여 가장 가까운 종으로 나타나는 서열을 확인하였다. 본 연구에 선택된 균주들의 16S rRNA 염기서열 alignment는 BioEdit (Hall, 1999)으로 수집, Clustal_X (Thompson et al., 1997)를 이용하여 정렬 한 후에 MEGA 5.0 software (Molecular Evolutionary Gnetics Analysis; Tamura et al., 2011)을 이용하여 neighbor-joining 방법(Saitou and Nei, 1987)에 의해 계통수를 추론하였다.
성능/효과
16S rRNA 유전자 염기서열 분석에 따르면 DeinococcusThermus 문인 Deinococcus 속에 속하는 균주는 기존의 염기 서열과 97.2–99.5%의 상동성을 나타내었고, D. aquaticus PB314T , D. aquatilis DSM 23025T , D. daejeonensis MJ27T , D. grandis DSM 3963T와 각각 97.2–99.5, 98.6–99.2, 98.4–99.2, 98.7-99.0%의 유사성을 보여주었다.
그 결과 방사선에 내성을 가지는 것으로 추측되는 균주를 60주 분리하였고, 본 연구 분석 자료로 사용 하였다. 16S rRNA 유전자 염기서열 분석을 통해 분리균주 60개의 계통수를 파악한 결과, 3개의 문(4개의 속)이 확인되었고, Deinococcus-Thermus (Deinococcus)가 61.7%, Firmicutes (Exiguobacterium)는 15%, Bacteroidetes (Hymenobacter, Spirosoma)는 23.4%의 비중을 나타냈다. 분리균주 중 29개 균주가 Deinococcus, Hymenobacter, Spirosoma에 속하는 신종 또는 다른 신속으로 분류될 가능성을 보였으며, 앞으로 추가적인 신종 실험이 진행될 예정이다.
Bacteroidetes 문의 Hymenobacter 속 분리균주들은 H. algoricola VUG-A23aT , H. elongatus VUG-A112T , H. gelipurpurascens Txg1T , H. rigui WPCB131T , H. terrae DG7AT 와 각각 97.2–98.1%, 98.5–99.4%, 99.4%, 97.4%, 97.7%의 상동성이 확인되었다.
신종 가능성을 가지는 분리 균주들 중에서 9개의 신종 균주들을 선정하여 실제 UV 세기에 따른 생장여부를 확인하기 위해서 UV 내성 실험을 진행하였다. Deinococcus 속에 속하는 신종 후보 균주인 16F1E, 16F3H, 16F3J 등 3균주는 D10값(미생물의 개체수가 10분의 1로 줄어들 때 방사선 조사량)이 600 J/m2 이하이며, 이 균주들은 방사선 내성이 높다고 알려진 positive control로 사용한 Deinococcus radiodurans R1T 균주만큼 높은 UV 내성 결과를 보였고, 16F7B 균주는 D10값이 300 J/m2이하로 나타났다. Hymenobactr 신종의 경우, 3개의 16F3P, 16F7C, 16F7G 균주는 D10값이 600 J/m2 이하이며, 이 균주들도 D.
Firmicutes 문인 Exiguobacterium 속에 속해 있는 균주는 대부분 기존 종의 표준균주 염기서열과 99.1–99.7%의 높은 상동성을 보여주었으며, 16F3E, 16F3I는 E. acetylicum DSM 20416T과 99.6%, 16F1F, 16F5B, 16F5C는 E. sibiricum 255-15T와 99.5–99.6%의 높은 유사도를 나타내었다(Table 2).
Deinococcus 속에 속하는 신종 후보 균주인 16F1E, 16F3H, 16F3J 등 3균주는 D10값(미생물의 개체수가 10분의 1로 줄어들 때 방사선 조사량)이 600 J/m2 이하이며, 이 균주들은 방사선 내성이 높다고 알려진 positive control로 사용한 Deinococcus radiodurans R1T 균주만큼 높은 UV 내성 결과를 보였고, 16F7B 균주는 D10값이 300 J/m2이하로 나타났다. Hymenobactr 신종의 경우, 3개의 16F3P, 16F7C, 16F7G 균주는 D10값이 600 J/m2 이하이며, 이 균주들도 D. radiodurans R1T 균주와 비슷하게 높은 UV 내성 결과를 보였고, 그 중 16F7G 균주는 전체적인 그래프가 D. radiodurans R1T 균주보다 더 높은 UV 내성 결과를 보였다. 16F3Y 균주는 D10값이 500 J/m2 이하로 나타났다.
16F3Y 균주는 D10값이 500 J/m2 이하로 나타났다. Spirosoma 신종 균주 16F6E는 D10값이 900 J/m2 이하이며 D. radiodurans R1T 균주보다 전체적으로 더 높은 UV 내성 결과를 보였다(Fig. 2). 결론적으로, 9개의 신종 균주 모두UV 내성을 가지는 것으로 나타났고, 대부분은 방사선 내성이 높다고 알려진 D.
2). 결론적으로, 9개의 신종 균주 모두UV 내성을 가지는 것으로 나타났고, 대부분은 방사선 내성이 높다고 알려진 D. radiodurans R1T 균주만큼 높은 UV 내성 결과를 보였고, Hymenobacter sp. 16F7G와 Spirosoma sp.
그리고 Bacteroidetes 문에 속하는 균주는 기존 종의 표준균주 염기서열과 92.8–99.9%의 상동성을 보여주었는데, Bacteroidetes 문의 Spirosoma 속에 속하는 16F3U, 16F6E는 S. endophyticum EX36T 와 92.8–92.9%의 낮은 염기서열 유사도를 보여주었고, 163V는 Spirosoma rigui WPCB118T와 99.9%의 높은 유사도를 나타내었다(Table 2).
분리균주 중 29개 균주가 Deinococcus, Hymenobacter, Spirosoma에 속하는 신종 또는 다른 신속으로 분류될 가능성을 보였으며, 앞으로 추가적인 신종 실험이 진행될 예정이다. 그리고 신종 예상균주를 9개 선정하여 UV 내성 실험을 진행한 결과, 9개 균주 모두 D. radiodurans R1T 균주 만큼 높은 UV 내성을 가지는 것으로 나타났다. 또한 분리된 Firmicutes (Exiguobacterium) 균주는 아직까지 방사선 내성 연구 보고가 되어 있지 않아서 추가적인 방사선 내성 연구가 필요하다.
방사선이 조사된 한강물에서 순수 분리된 60개 균주의 16S rRNA 유전자 염기서열을 가지고 EzbioCloud를 이용하여 계 통학적 다양성을 분석해 본 결과, Deinococcus-Thermus 문(Deinococcus 속), Firmicutes 문(Exiguobacterium 속), Bacteroidetes 문(Hymenobacter, Spirosoma 속)의 3개의 문, 4개의 속, 13개의 종으로 동정되었다. 이 중 Deinococcus-Thermus 문이 총 37개(61.
본 연구를 통하여 분리된 균주들 중에서 Deinococcus 균주가 절반 이상을 차지하는 결과와 현재까지 밝혀진 방사선 내성 표준 균주들이 물에서 분리된 경우가 많은 것으로 볼 때 (Gabani and Singh, 2013), 한강물에서도 방사선 내성 균주가 많이 존재할 가능성이 있다고 보여진다. 그리고 본 연구에서 신종균주는 아니었지만 분리 균주인 Firmicutes 문에 속한 Exiguobacterium 속의 균주는 아직까지 방사선 내성 연구 보고가 되어 있지 않아서 이에 대한 연구가 더욱 필요하며, 특히 우리나라의 한강물에 서식하는 세균의 군집구조에 관한 보고는 거의 없기 때문에 이에 관한 연구가 필요한 실정이다.
본 연구에서 분리된 균주들과 상동성이 높은 표준균주 Deinococcus aquaticus PB314T, Deinococcus aquatilis DSM 23025T 등은 강물이나 산업지역 물(industry water)에서 분리되었고 gamma선과 UV에 내성을 가지고 있는 것으로 나타났다(Im et al., 2008; Kämpfer et al., 2008).
각 배지에서 분리된 Deinococcus spp.의 수가 큰차이가 없는 것으로 보아 저영양 배지인 1/10 R2A에서 방사선 내성이 높다고 알려진 Deinococcus 균주를 분리하기가 더욱 용이함을 알 수 있었고, Deinococcus 이외의 다른 속에 속한 종들을 얻고자 할때에는 R2A 배지가 1/10 R2A 배지보다 더 용이하였다.
방사선이 조사된 한강물에서 순수 분리된 60개 균주의 16S rRNA 유전자 염기서열을 가지고 EzbioCloud를 이용하여 계 통학적 다양성을 분석해 본 결과, Deinococcus-Thermus 문(Deinococcus 속), Firmicutes 문(Exiguobacterium 속), Bacteroidetes 문(Hymenobacter, Spirosoma 속)의 3개의 문, 4개의 속, 13개의 종으로 동정되었다. 이 중 Deinococcus-Thermus 문이 총 37개(61.7%) 균주로 가장 많이 나타났고, 그 다음은 Bacteroidetes (14개; 23.4%), Firmicutes (9개; 15%) 문의 순으로 분포하였다(Table 1B).
, 2007). 이러한 결과로 보아 한강에서 분리된 균주들과 유전적 상동성이 높은 표준균주 대부분은 물이나 극한지의 빙하와 관련된 시료로부터 얻어진 것을 알 수 있었다.
R2A 보다 1/10 R2A 배지에서 세균수가 낮게 계수되었다. 이렇게 해서 방사선이 조사된 한강물로부터 순수 분리한 균주는 총 60개 였고, 각 배지 별로 얻어진 균주수를 살펴보면, R2A 평판배지에서 42개, 1/10 R2A 평판배지에서 18개 균주를 얻었다 (Table 1A).
후속연구
본 연구를 통하여 분리된 균주들 중에서 Deinococcus 균주가 절반 이상을 차지하는 결과와 현재까지 밝혀진 방사선 내성 표준 균주들이 물에서 분리된 경우가 많은 것으로 볼 때 (Gabani and Singh, 2013), 한강물에서도 방사선 내성 균주가 많이 존재할 가능성이 있다고 보여진다. 그리고 본 연구에서 신종균주는 아니었지만 분리 균주인 Firmicutes 문에 속한 Exiguobacterium 속의 균주는 아직까지 방사선 내성 연구 보고가 되어 있지 않아서 이에 대한 연구가 더욱 필요하며, 특히 우리나라의 한강물에 서식하는 세균의 군집구조에 관한 보고는 거의 없기 때문에 이에 관한 연구가 필요한 실정이다.
, 2009;2011), 우리나라 서울 한강물에서 방사선 내성을 가지는 것으로 추측되는 미생물을 분리 및 탐색 하고, 16S rDNA 유전자 염기서열을 비교하여 한강에서의 방사선 내성 미생물의 계통수를 분석하고자 하였다. 또한 2016년 2월 현재까지 우리나라 한강물에서 분리되어 신종으로 보고된 균주들은 Brevibacillus fluminis CJ71T, Chryseobacterium rigui CJ16T, Paenibacillus aestuarii CJ25T 등 총 3건(Suresh et al., 2004; Bae et al., 2010; Choi et al., 2010; Park et al., 2013)으로 더 많은 신종 미생물 보고를 위하여 신종 연구가 가능한 것으로 추정되는 신종 예상 균주를 파악하여 UV 내성 추가 실험을 통해 UV 내성 여부를 분석하고 방사선 내성 연구에 필요로 하는 유용미생물 자원을 확보하고자 하였다.
radiodurans R1T 균주 만큼 높은 UV 내성을 가지는 것으로 나타났다. 또한 분리된 Firmicutes (Exiguobacterium) 균주는 아직까지 방사선 내성 연구 보고가 되어 있지 않아서 추가적인 방사선 내성 연구가 필요하다.
4%의 비중을 나타냈다. 분리균주 중 29개 균주가 Deinococcus, Hymenobacter, Spirosoma에 속하는 신종 또는 다른 신속으로 분류될 가능성을 보였으며, 앞으로 추가적인 신종 실험이 진행될 예정이다. 그리고 신종 예상균주를 9개 선정하여 UV 내성 실험을 진행한 결과, 9개 균주 모두 D.
, 2008). 이러한 연구를 통해 지금까지 한강물에서 밝혀지지 않았던 다수의 신속 및 신종 미생물 연구를 진행할 수 있을 것으로 기대된다. 이렇게 분리된 균주(60개) 중에서 신종 가능성이 있는 균주(29개 중에서) 11개(Fig.
이와 같이 16S rRNA 유전자 염기서열 비교를 통해 분리된 60개 균주 중 26개 균주는 기존 종의 표준균주와 97–98.5% 상동성을 보여 추후 신종 실험에 의해 신종 가능성을 보이며, 3개 균주는 92.8–93.0%의 상동성을 보여 신종 실험을 통해 새로운 속과 종으로서의 가능성이 있다고 판단됨으로 추가적인 신종 연구를 필요로 한다(Woo et al., 2008).
질의응답
핵심어
질문
논문에서 추출한 답변
방사선 내성이 강한 대표적인 미생물 속은 무엇인가?
Deinococcus와 Rubrobater 가 대표적으로 방사선 내성이 강한 속(genus)으로 알려져 있으며, 이보다 방사선 내성이 약한 속으로는 Acinetobacter, Chroococcidiopsis, Hymenobacter, Kineococcus, Kocuria, Methylobacterium, Pyrococcus, Thermococcus 이 있는 것으로 밝혀졌다(Rainey et al., 2005; Yu et al.
Deinococcus radiodurans 균주가 갖는 방사선 내성은 방사선 내성 미생물에 대한 어떤 연구 가능성을 제시하였는가?
Deinococcus radiodurans 균주(Brooks and Murray, 1981) 가 처음으로 발견되면서 방사선 내성 미생물에 대한 관심이 생기게 되었다. 이들이 가지고 있는 DNA 복구 효소의 활성 원리를 응용한 노화방지 연구, 암세포의 방사선 내성 감소를 위한 내성 유전자 연구, 방사선 내성 생물체 개발을 통한 오염된 환경의 생물학적 정화 등과 같은 가능성들이 밝혀지게 되면서 (Cox and Battista, 2005; Servinsky and Julin, 2007; Kwon and Seo, 2010), 이러한 방사선 내성 연구를 위한 방사선 내성 미생물 자원 확보가 더 많이 요구되고 있는 추세이다.
방사선 내성 미생물이 갖는 내성은 무엇이 있는가?
, 2015), 계속 새로운 다양한 방사선 내성 미생물이 밝혀지고 있는 중이다. 그리고 이들은 방사선뿐만이 아니라 UV와 건조한 환경에도 잘 견디는 것으로 밝혀 졌다(Mattimore and Battista, 1996; de Groot et al., 2005).
참고문헌 (37)
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Asker, D., Awad, T.S., McLandsborough, L., Beppu, T., and Ueda, K. 2011. Deinococcus depolymerans sp. nov., a gamma and UV-radiation-resistant bacterium, isolated from a naturally radioactive site. Int. J. Syst. Evol. Microbiol. 61, 1448-1453.
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