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Practical Guide to NMR-based Metabolomics - III : NMR Spectrum Processing and Multivariate Analysis 원문보기

Journal of the Korean magnetic resonance society, v.22 no.3, 2018년, pp.46 - 53  

Jung, Young-Sang (Chong Kun Dang Research Institute, Chong Kun Dang Pharmaceutical Corp.)

Abstract AI-Helper 아이콘AI-Helper

NMR-based metabolomics needs various knowledge to elucidate metabolic perturbation such as NMR experiments, NMR spectrum processing, raw data processing, metabolite identification, statistical analysis, and metabolic pathway analysis regarding technical aspects. Among them, some concepts of raw data...

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문제 정의

  • 특히 통계 분석은 대사체학 연구에 쉽지 않은 장애물로 느껴지기 쉽다. 그래서 본 논문에서는 각 단계에 어떤 과정들이 있고 어떻게 수행하는지 간단히 살펴 보도록 하겠다.
  • 먼저 NMR spectrum processing 을 위한 zero-filing, window function multiplication, Fourier transformation, phase correction, baseline correction 등의 일련의 과정이(Figure 1) NMR 연구자들에게는 익숙한 일일 것이다. 그럼에도 불구하고 각 단계에서 고려해야 할 것들을 간단하게 논의하고자 한다.
  • Binning 을 하는 이유는 두 가지이다. 첫 번째는 다변량 분석의 초기 자료가 (raw data) 되는 spectrum table 의 data 크기를 줄이는 것이 목적이다. 예를 들어 설명하자면, 앞에서 언급한 zero-filing 후, NMR spectrum 이 10,000 data points 갖게 되었고, 함께 비교 분석해야 할 spectrum 이 50 개가 있다면, spectrum table 은 50 × 10,000 크기의 행렬(matrix)이 된다.
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참고문헌 (20)

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  20. Y.-S. Jung, J. Kor. Magn. Reson. Soc. 22, 10 (2018) 

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