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[국내논문] DNA 해프로트리와 유전적거리에 의한 가계족보의 계층화
Genealogical Stratification by Genetic Distance and DNA Haplotrees 원문보기

한국정보통신학회논문지 = Journal of the Korea Institute of Information and Communication Engineering, v.24 no.1, 2020년, pp.65 - 70  

류광렬 (Department of Electronic Engineering, Mokwon University)

초록
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본 논문은 유전자가계족보 작성을 위해 인체세포의 Y염색체와 X염색체의 DNA에서 해프로코드로 부터 해프로 그룹의 해프로트리, 유전적거리 및 전통가계족보를 결합하고 계층구조화한다. 적용지역은 충청지방으로 부계의 Y-DNA는 O그룹에서 O3a∗ 및 O2b∗ 그룹의 빈도가 높고, 모계의 mtDNA는 L3그룹의 D∗와 M∗그룹의 빈도가 비교적 높다. 유전자 거리 산정은 니의 표준유전적거리법을 적용한다. 실험결과 0.1는 바로 직계가족, 0.1에서 0.8은 근친이며, 1.0 이상은 친족으로 추정하기 어렵다. DNA의 해프로그룹과 해프로트리에 의해 STR은 친족 확인에 적합하고 SNP는 개인유전적식별이 정확하므로 한국전통 족보는 3가지 인수를 추가하므로 더 과학적인 계층화가 구현된다.

Abstract ▼ AI-Helper 아이콘AI-Helper

This paper describes hierarchically stratifying and analyzing haplotrees of haplogroups from haplotypes on the Y and X chromosomes of human cells for genetic and Korean traditional and genealogical trees. The specific region is Chungcheong province, and the Y-DNA of the paternal lines has high frequ...

Keyword

#족보계층화   #유전적거리   #해프로트리   #해프로그룹  

표/그림 (7)

AI 본문요약
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제안 방법

  • 본 연구는 유전자정보코드로 부계와 모계의 DNA의 염기서열의 해프로타입과 해프로그룹에 의한 해 프로트리의 구축과 STR, SNP 및 유전적거리 등 3 요소를 적용하여 한국의 전통족보체계와 결합하여 고유의 과학적 유전자 가계 족보의 계층화를 구현한다.
  • 대립유전자 빈도수 [10]와 비교할 빈도수 의 차이에 의해서 계산된다. 실험은 조부(GF), 부(SA)와 부의 형제 형제(SB), 자녀 (GSA, GSB, GSC)와 별개인 (RYU)을 대상으로 표 1 의 해프로타입과 대립유전자 빈도수를 적용한다. GF와 RYU의 예는 그 결과 식 1의 분모가 0.
  • 머리카락, 타액, 혈흔, 손톱, 체액 등에서 DNA를 추출하고 PCR(polymerase chain reaction)에 의해 DNA가 증폭되어 분석 판독한다. Y-DNA의 Y-STR 마커는 친족 관계에 있는 남성간의 혈연관계를 확인하거나 부계혈통의 검사 및 추적하는 방법으로 이용된다.
  • 본 연구는 전통가계족보와 결합하기 위해 유전적 거리와 Y염색체와 X염색체의 DNA에서 STR과 SNP를 기반으로 해프로타입과 해프로그룹 등의 요인을 계층 구조화에 적용하였다. 유전적거리 산정은 니의 표준 유전적 거리 법을 적용했다.

대상 데이터

  • DNA는 세포분열시 자신과 동일한 DNA를 복제하여 유전자 정보를 보존하는 기능을 하고 동시에 유전자 정보를 발현시킬 수 있는 단백질 합성을 지시하고 조절한다. 단백질을 구성하는 기본물질은 20 종류의 아미노산이다. DNA는 유전정보만을 저장하고, RNA는 유전정보를 전달하고 단백질을 합성한다.
  • 일치 여부를 판정한다. 대상간의 거리차는 니 (Nei) 유전적포준거리를 사용한다. 대립유전자 빈도수 [10]와 비교할 빈도수 의 차이에 의해서 계산된다.
  • 변이이다. 예로 STR-DYS449의 반복염기는 TTTC이며 반복수는 27이다. SNP는 STR보다 변이율이 낮지만 부계 간에 동일한 유전자형을 갖기 때문에 분별력 문제가 있다.
  • 즉, O2b1a2와 같이 문자-숫자의 조합이다. 그룹명의 대문자는 서양 인류의 시조인 아담(Adam) A를 시작으로 A0부터 R까지이며, 인류의 이동루트에 따라 Y-DNA그룹명이 정해진다.
  • 세는 조, 부, 기, 자, 손 등을 년대 순차로 계열된다. 대는 출생에서부터 30년을 1대로 시간적 영역이다.

이론/모형

  • 적용하였다. 유전적거리 산정은 니의 표준 유전적 거리 법을 적용했다. 실험결과 0.
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참고문헌 (16)

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