$\require{mediawiki-texvc}$

연합인증

연합인증 가입 기관의 연구자들은 소속기관의 인증정보(ID와 암호)를 이용해 다른 대학, 연구기관, 서비스 공급자의 다양한 온라인 자원과 연구 데이터를 이용할 수 있습니다.

이는 여행자가 자국에서 발행 받은 여권으로 세계 각국을 자유롭게 여행할 수 있는 것과 같습니다.

연합인증으로 이용이 가능한 서비스는 NTIS, DataON, Edison, Kafe, Webinar 등이 있습니다.

한번의 인증절차만으로 연합인증 가입 서비스에 추가 로그인 없이 이용이 가능합니다.

다만, 연합인증을 위해서는 최초 1회만 인증 절차가 필요합니다. (회원이 아닐 경우 회원 가입이 필요합니다.)

연합인증 절차는 다음과 같습니다.

최초이용시에는
ScienceON에 로그인 → 연합인증 서비스 접속 → 로그인 (본인 확인 또는 회원가입) → 서비스 이용

그 이후에는
ScienceON 로그인 → 연합인증 서비스 접속 → 서비스 이용

연합인증을 활용하시면 KISTI가 제공하는 다양한 서비스를 편리하게 이용하실 수 있습니다.

[해외논문] Estimating signal and noise of time-resolved X-ray solution scattering data at synchrotrons and XFELs 원문보기

Journal of synchrotron radiation : JSR, v.27 no.3, 2020년, pp.633 - 645  

Kim, Jungmin (Department of Chemistry and KI for the BioCentury, Korea Advanced Institute of Science and Technology (KAIST) , 291 Daehak-ro, Yuseong-gu, Daejeon 34141, Republic of Korea) ,  Kim, Jong Goo (Department of Chemistry and KI for the BioCentury, Korea Advanced Institute of Science and Technology (KAIST) , 291 Daehak-ro, Yuseong-gu, Daejeon 34141, Republic of Korea) ,  Ki, Hosung (Department of Chemistry and KI for the BioCentury, Korea Advanced Institute of Science and Technology (KAIST) , 291 Daehak-ro, Yuseong-gu, Daejeon 34141, Republic of Korea) ,  Ahn, Chi Woo (Department of Chemistry and KI for the BioCentury, Korea Advanced Institute of Science and Technology (KAIST) , 291 Daehak-ro, Yuseong-gu, Daejeon 34141, Republic of Korea) ,  Ihee, Hyotcherl (Department of Chemistry and KI for the BioCentury, Korea Advanced Institute of Science and Technology (KAIST) , 291 Daehak-ro, Yuseong-gu, Daejeon 34141)

Abstract ▼ AI-Helper 아이콘AI-Helper

The simulation of a signal and signal-to-noice ratio for time-resolved X-ray solution scattering data is presented.Elucidating the structural dynamics of small molecules and proteins in the liquid solution phase is essential to ensure a fundamental understanding of their reaction mechanisms. In this...

Keyword

#time-resolved X-ray solution scattering   #time-resolved X-ray liquidography   #simulation   #signal-to-noise ratio   #solvent cage  

참고문헌 (63)

  1. Ahn, C. W., Ki, H., Kim, J., Kim, J., Park, S., Lee, Y., Kim, K. H., Kong, Q., Moon, J., Pedersen, M. N., Wulff, M. & Ihee, H. (2018). J. Phys. Chem. Lett. 9 , 647？653. 

  2. Andersson, M., Malmerberg, E., Westenhoff, S., Katona, G., Cammarata, M., Wohri, A. B., Johansson, L. C., Ewald, F., Eklund, M., Wulff, M., Davidsson, J. & Neutze, R. (2009). Structure , 17 , 1265？1275. 

  3. Andersson, M., Vincent, J., van der Spoel, D., Davidsson, J. & Neutze, R. (2008). Structure , 16 , 21？28. 

  4. Arnlund, D., Johansson, L. C., Wickstrand, C., Barty, A., Williams, G. J., Malmerberg, E., Davidsson, J., Milathianaki, D., DePonte, D. P., Shoeman, R. L., Wang, D. J., James, D., Katona, G., Westenhoff, S., White, T. A., Aquila, A., Bari, S., Berntsen, P., Bogan, M., van Driel, T. B., Doak, R. B., Kjaer, K. S., Frank, M., Fromme, R., Grotjohann, I., Henning, R., Hunter, M. S., Kirian, R. A., Kosheleva, I., Kupitz, C., Liang, M. N., Martin, A. V., Nielsen, M. M., Messerschmidt, M., Seibert, M. M., Sjohamn, J., Stellato, F., Weierstall, U., Zatsepin, N. A., Spence, J. C. H., Fromme, P., Schlichting, I., Boutet, S., Groenhof, G., Chapman, H. N. & Neutze, R. (2014). Nat. Methods , 11 , 923？926. 

  5. Bandara, H. M. & Burdette, S. C. (2012). Chem. Soc. Rev. 41 , 1809？1825. 

  6. Bernado, P., Mylonas, E., Petoukhov, M. V., Blackledge, M. & Svergun, D. I. (2007). J. Am. Chem. Soc. 129 , 5656？5664. 

  7. Berntsson, O., Diensthuber, R. P., Panman, M. R., Bjorling, A., Hughes, A. J., Henry, L., Niebling, S., Newby, G., Liebi, M., Menzel, A., Henning, R., Kosheleva, I., Moglich, A. & Westenhoff, S. (2017). Structure , 25 , 933？938. 

  8. Biasin, E., van Driel, T. B., Levi, G., Laursen, M. G., Dohn, A. O., Moltke, A., Vester, P., Hansen, F. B. K., Kjaer, K. S., Harlang, T., Hartsock, R., Christensen, M., Gaffney, K. J., Henriksen, N. E., Møller, K. B., Haldrup, K. & Nielsen, M. M. (2018). J. Synchrotron Rad. 25 , 306？315. 

  9. Bortolus, P. & Monti, S. (1979). J. Phys. Chem. 83 , 648？652. 

  10. Brandt van Driel, T., Kjaer, K. S., Biasin, E., Haldrup, K., Lemke, H. T. & Nielsen, M. M. (2015). Faraday Discuss. 177 , 443？465. 

  11. Cammarata, M., Levantino, M., Schotte, F., Anfinrud, P. A., Ewald, F., Choi, J., Cupane, A., Wulff, M. & Ihee, H. (2008). Nat. Methods , 5 , 988. 

  12. Cammarata, M., Lorenc, M., Kim, T. K., Lee, J. H., Kong, Q. Y., Pontecorvo, E., Lo Russo, M., Schiro, G., Cupane, A., Wulff, M. & Ihee, H. (2006). J. Chem. Phys. 124 , 124504. 

  13. Canton, S. E., Kjaer, K. S., Vanko, G., van Driel, T. B., Adachi, S. I., Bordage, A., Bressler, C., Chabera, P., Christensen, M., Dohn, A. O., Galler, A., Gawelda, W., Gosztola, D., Haldrup, K., Harlang, T., Liu, Y. Z., Moller, K. B., Nemeth, Z., Nozawa, S., Papai, M., Sato, T., Sato, T., Suarez-Alcantara, K., Togashi, T., Tono, K., Uhlig, J., Vithanage, D. A., Warnmark, K., Yabashi, M., Zhang, J. X., Sundstrom, V. & Nielsen, M. M. (2015). Nat. Commun. 6 , 1？10. 

  14. Cho, H. S., Dashdorj, N., Schotte, F., Graber, T., Henning, R. & Anfinrud, P. (2010). Proc. Natl Acad. Sci. USA , 107 , 7281？7286. 

  15. Christensen, M., Haldrup, K., Bechgaard, K., Feidenhans’l, R., Kong, Q. Y., Cammarata, M., Russo, M. L., Wulff, M., Harrit, N. & Nielsen, M. M. (2009). J. Am. Chem. Soc. 131 , 502？508. 

  16. Davidsson, J., Poulsen, J., Cammarata, M., Georgiou, P., Wouts, R., Katona, G., Jacobson, F., Plech, A., Wulff, M., Nyman, G. & Neutze, R. (2005). Phys. Rev. Lett. 94 , 245503. 

  17. Dohn, A. O., Biasin, E., Haldrup, K., Nielsen, M. M., Henriksen, N. E. & Møller, K. B. (2015). J. Phys. B At. Mol. Opt. Phys. 48 , 244010. 

  18. Forster, F., Webb, B., Krukenberg, K. A., Tsuruta, H., Agard, D. A. & Sali, A. (2008). J. Mol. Biol. 382 , 1089？1106. 

  19. Haldrup, K. (2014). Philos. Trans. R. Soc. B , 369 , 20130336. 

  20. Haldrup, K., Christensen, M., Cammarata, M., Kong, Q. Y., Wulff, M., Mariager, S. O., Bechgaard, K., Feidenhans’l, R., Harrit, N. & Nielsen, M. M. (2009). Angew. Chem. Int. Ed. 48 , 4180？4184. 

  21. Haldrup, K., Christensen, M. & Meedom Nielsen, M. (2010). Acta Cryst. A 66 , 261？269. 

  22. Haldrup, K., Levi, G., Biasin, E., Vester, P., Laursen, M. G., Beyer, F., Kjaer, K. S., Brandt van Driel, T., Harlang, T., Dohn, A. O., Hartsock, R. J., Nelson, S., Glownia, J. M., Lemke, H. T., Christensen, M., Gaffney, K. J., Henriksen, N. E., Møller, K. B. & Nielsen, M. M. (2019). Phys. Rev. Lett. 122 , 063001. 

  23. Haldrup, K., Vanko, G., Gawelda, W., Galler, A., Doumy, G., March, A. M., Kanter, E. P., Bordage, A., Dohn, A., van Driel, T. B., Kjaer, K. S., Lemke, H. T., Canton, S. E., Uhlig, J., Sundstrom, V., Young, L., Southworth, S. H., Nielsen, M. M. & Bressler, C. (2012). J. Phys. Chem. A , 116 , 9878？9887. 

  24. Ihee, H. (2009). Acc. Chem. Res. 42 , 356？366. 

  25. Ihee, H., Lorenc, M., Kim, T. K., Kong, Q. Y., Cammarata, M., Lee, J. H., Bratos, S. & Wulff, M. (2005). Science , 309 , 1223？1227. 

  26. Ihee, H., Wulff, M., Kim, J. & Adachi, S. (2010). Int. Rev. Phys. Chem. 29 , 453？520. 

  27. Josts, I., Niebling, S., Gao, Y., Levantino, M., Tidow, H. & Monteiro, D. (2018). IUCrJ , 5 , 667？672. 

  28. Kang, H. S., Min, C. K., Heo, H., Kim, C., Yang, H., Kim, G., Nam, I., Baek, S. Y., Choi, H. J., Mun, G., Park, B. R., Suh, Y. J., Shin, D. C., Hu, J., Hong, J., Jung, S., Kim, S. H., Kim, K., Na, D., Park, S. S., Park, Y. J., Han, J. H., Jung, Y. G., Jeong, S. H., Lee, H. G., Lee, S., Lee, S., Lee, W. W., Oh, B., Suh, H. S., Parc, Y. W., Park, S. J., Kim, M. H., Jung, N. S., Kim, Y. C., Lee, M. S., Lee, B. H., Sung, C. W., Mok, I. S., Yang, J. M., Lee, C. S., Shin, H., Kim, J. H., Kim, Y., Lee, J. H., Park, S. Y., Kim, J., Park, J., Eom, I., Rah, S., Kim, S., Nam, K. H., Park, J., Park, J., Kim, S., Kwon, S., Park, S. H., Kim, K. S., Hyun, H., Kim, S. N., Kim, S., Hwang, S. M., Kim, M. J., Lim, C. Y., Yu, C. J., Kim, B. S., Kang, T. H., Kim, K. W., Kim, S. H., Lee, H. S., Lee, H. S., Park, K. H., Koo, T. Y., Kim, D. E. & Ko, I. S. (2017). Nat.？Photon. 11 , 708？713. 

  29. Ki, H., Lee, Y., Choi, E. H., Lee, S. & Ihee, H. (2019). Struct. Dyn. 6 , 024303. 

  30. Ki, H., Oang, K. Y., Kim, J. & Ihee, H. (2017). Annu. Rev. Phys. Chem. 68 , 473？497. 

  31. Kim, J., Lee, J. H., Kim, J., Jun, S., Kim, K. H., Kim, T. W., Wulff, M. & Ihee, H. (2012). J. Phys. Chem. A , 116 , 2713？2722. 

  32. Kim, J. G., Muniyappan, S., Oang, K. Y., Kim, T. W., Yang, C., Kim, K. H., Kim, J. & Ihee, H. (2016). Struct. Dyn. 3 , 023610. 

  33. Kim, K. H., Kim, J. G., Oang, K. Y., Kim, T. W., Ki, H., Jo, J., Kim, J., Sato, T., Nozawa, S., Adachi, S. & Ihee, H. (2016). Struct. Dyn. 3 , 043209. 

  34. Kim, S., Kim, S., Kim, M., Hwang, S., Hyun, H., Eom, I., Park, K., Park, J., Park, J., Kim, K., Kim, S., Kim, S., Lee, C. & Nah, S. (2018). Proceedings of the 10th Mechanical Engineering Design of Synchrotron Radiation Equipment and Instrumentation (MEDSI2018) , 25？29 June 2018, Paris, France, pp. 397？399. THPH28. 

  35. Kim, T. K., Lee, J. H., Wulff, M., Kong, Q. Y. & Ihee, H. (2009). ChemPhysChem , 10 , 1958？1980. 

  36. Kim, T. W., Yang, C., Kim, Y., Kim, J. G., Kim, J., Jung, Y. O., Jun, S., Lee, S. J., Park, S., Kosheleva, I., Henning, R., van Thor, J. J. & Ihee, H. (2016). Phys. Chem. Chem. Phys. 18 , 8911？8919. 

  37. Kim, Y., Ganesan, P., Jo, J., Kim, S. O., Thamilselvan, K. & Ihee, H. (2018). J. Phys. Chem. B , 122 , 4513？4520. 

  38. Kirian, R. A., Schmidt, K. E., Wang, X. Y., Doak, R. B. & Spence, J. C. H. (2011). Phys. Rev. E , 84 , 011921. 

  39. Kjaer, K. S., Van Driel, T. B., Harlang, T. C. B., Kunnus, K., Biasin, E., Ledbetter, K., Hartsock, R. W., Reinhard, M. E., Koroidov, S., Li, L., Laursen, M. G., Hansen, F. B., Vester, P., Christensen, M., Haldrup, K., Nielsen, M. M., Dohn, A. O., Papai, M. I., Møller, K. B., Chabera, P., Liu, Y. Z., Tatsuno, H., Timm, C., Jarenmark, M., Uhlig, J., Sundstom, V., Warnmark, K., Persson, P., Nemeth, Z., Szemes, D. S., Bajnoczi, E., Vanko, G., Alonso-Mori, R., Glownia, J. M., Nelson, S., Sikorski, M., Sokaras, D., Canton, S. E., Lemke, H. T. & Gaffney, K. J. (2019). Chem. Sci. 10 , 5749？5760. 

  40. Kong, Q. Y., Laursen, M. G., Haldrup, K., Kjaer, K. S., Khakhulin, D., Biasin, E., van Driel, T. B., Wulff, M., Kabanova, V., Vuilleumier, R., Bratos, S., Nielsen, M. M., Gaffney, K. J., Weng, T. C. & Koch, M. H. J. (2019). Photochem. Photobiol. Sci. 18 , 319？327. 

  41. Kong, Q. Y., Wulff, M., Lee, J. H., Bratos, S. & Ihee, H. (2007). J. Am. Chem. Soc. 129 , 13584？13591. 

  42. Konuma, T., Kimura, T., Matsumoto, S., Goto, Y., Fujisawa, T., Fersht, A. R. & Takahashi, S. (2011). J. Mol. Biol. 405 , 1284？1294. 

  43. LCLS (2018). LCLS Strategic Facility Development Plan , https://lcls.slac.stanford.edu/sites/lcls.slac.stanford.edu/files/LCLS_Strategic_Development_Plan.pdf. 

  44. LCLS-II (2018). LCLS-II Design and Performance , https://lcls.slac.stanford.edu/lcls-ii/design-and-performance. 

  45. Leshchev, D., Harlang, T. C. B., Fredin, L. A., Khakhulin, D., Liu, Y., Biasin, E., Laursen, M. G., Newby, G. E., Haldrup, K., Nielsen, M. M., Warnmark, K., Sundstrom, V., Persson, P., Kjaer, K. S. & Wulff, M. (2018). Chem. Sci. 9 , 405？414. 

  46. Malmerberg, E., Bovee-Geurts, P. H. M., Katona, G., Deupi, X., Arnlund, D., Wickstrand, C., Johansson, L. C., Westenhoff, S., Nazarenko, E., Schertler, G. F. X., Menzel, A., de Grip, W. J. & Neutze, R. (2015). Sci. Signal. 8 , ra26. 

  47. Malmerberg, E., Omran, Z., Hub, J. S., Li, X. W., Katona, G., Westenhoff, S., Johansson, L. C., Andersson, M., Cammarata, M., Wulff, M., van der Spoel, D., Davidsson, J., Specht, A. & Neutze, R. (2011). Biophys. J. 101 , 1345？1353. 

  48. Mathew-Fenn, R. S., Das, R. & Harbury, P. A. B. (2008). Science , 322 , 446？449. 

  49. Neutze, R., Wouts, R., Techert, S., Davidsson, J., Kocsis, M., Kirrander, A., Schotte, F. & Wulff, N. (2001). Phys. Rev. Lett. 87 , 195508. 

  50. Pinfield, V. J. & Scott, D. J. (2014). PLoS One , 9 , e95664. 

  51. Plech, A., Wulff, M., Bratos, S., Mirloup, F., Vuilleumier, R., Schotte, F. & Anfinrud, P. A. (2004). Phys. Rev. Lett. 92 , 125505. 

  52. Rimmerman, D., Leshchev, D., Hsu, D. J., Hong, J., Kosheleva, I. & Chen, L. X. (2017). J. Phys. Chem. Lett. 8 , 4413？4418. 

  53. Salassa, L., Borfecchia, E., Ruiu, T., Garino, C., Gianolio, D., Gobetto, R., Sadler, P. J., Cammarata, M., Wulff, M. & Lamberti, C. (2010). Inorg. Chem. 49 , 11240？11248. 

  54. Schindler, C. E. M., de Vries, S. J., Sasse, A. & Zacharias, M. (2016). Structure , 24 , 1387？1397. 

  55. Schneidman-Duhovny, D., Hammel, M. & Sali, A. (2010). Nucleic Acids Res. 38 , W540？W544. 

  56. Schoenlein, R., Boutet, S., Minitti, M. & Dunne, A. (2017). J. Appl. Sci. 7 , 850. 

  57. Schultz, T., Quenneville, J., Levine, B., Toniolo, A., Martinez, T. J., Lochbrunner, S., Schmitt, M., Shaffer, J. P., Zgierski, M. Z. & Stolow, A. (2003). J. Am. Chem. Soc. 125 , 8098？8099. 

  58. Sedlak, S. M., Bruetzel, L. K. & Lipfert, J. (2017). J. Appl. Cryst. 50 , 621？630. 

  59. Stovgaard, K., Andreetta, C., Ferkinghoff-Borg, J. & Hamelryck, T. (2010). BMC Bioinformatics , 11 , 429. 

  60. Stuart, C. M., Frontiera, R. R. & Mathies, R. A. (2007). J. Phys. Chem. A , 111 , 12072？12080. 

  61. Westenhoff, S., Malmerberg, E., Arnlund, D., Johansson, L., Nazarenko, E., Cammarata, M., Davidsson, J., Chaptal, V., Abramson, J., Katona, G., Menzel, A. & Neutze, R. (2010). Nat. Methods , 7 , 775？776. 

  62. Wulff, M., Kong, Q., Cammarata, M., Lo Russo, M., Anfinrud, P., Schotte, F., Lorenc, M., Ihee, H., Kim, T. K. & Plech, A. (2007). AIP？Conf. Proc. 879 , 1187？1194. 

  63. Wullf, M., Plech, A., Eybert, L., Randler, R., Schotte, F. & Anfinrud, P. (2003). Faraday Discuss. 122 , 13？26. 

LOADING...

활용도 분석정보

상세보기
다운로드
내보내기

활용도 Top5 논문

해당 논문의 주제분야에서 활용도가 높은 상위 5개 콘텐츠를 보여줍니다.
더보기 버튼을 클릭하시면 더 많은 관련자료를 살펴볼 수 있습니다.

관련 콘텐츠

오픈액세스(OA) 유형

GOLD(Hybrid)

저자가 APC(Article Processing Charge)를 지불한 논문에 한하여 자유로운 이용이 가능한, hybrid 저널에 출판된 논문

유발과제정보 저작권 관리 안내
섹션별 컨텐츠 바로가기

AI-Helper ※ AI-Helper는 오픈소스 모델을 사용합니다.

AI-Helper 아이콘
AI-Helper
안녕하세요, AI-Helper입니다. 좌측 "선택된 텍스트"에서 텍스트를 선택하여 요약, 번역, 용어설명을 실행하세요.
※ AI-Helper는 부적절한 답변을 할 수 있습니다.

선택된 텍스트

맨위로