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단백질 2차원 전기영동 실험 영상 자동분석 소프트웨어 기술 원문보기

보고서 정보
주관연구기관 (주)바이오정보기술
연구책임자 박창범
참여연구자 박수현 , 강태구 , 유혜경 , 박수경 , 우선경
보고서유형최종보고서
발행국가대한민국
언어 한국어
발행년월2004-09
과제시작연도 2003
주관부처 정보통신부
사업 관리 기관 정보통신연구진흥원
Institute for Information Technology Advancement
등록번호 TRKO201000016645
과제고유번호 1440001253
사업명 정보통신산업기술개발(기금)
DB 구축일자 2013-04-18

초록

가. 연구 개발 내용
본 연구 개발의 목적은 영상 분야의 초보자도 쉽게 접근 및 사용할 수 있는 인터페이스를 가진 특정 하드웨어에 종속되지 않는 범용적 단백질 2차원 전기영동 실험 영상 자동 분석 기술을 개발하는 것이다.
나. 연구 개발 범위
(1) 단백질 2차원 전기영동 실험 영상 필터링 기술
스팟 검출 단계의 효율적인 처리를 위한 전처리 단계 기술 개발을 목표로 2차원 전기영동 영상의 최적화된 전처리 기술 개발
(2) 단백질 스팟 검출 및 판별 기술
입력 영상에서 스팟 후보 영역을 추출한 후 스팟

목차 Contents

  • 표지 ...1
  • 제출문 ...4
  • 요약문 ...5
  • 목차 ...11
  • 제1장 서 론 ...15
  • 제1절 연구 개발의 배경 및 필요성 ...15
  • 1. 연구 개발 배경 ...15
  • 2. 연구 개발의 필요성 ...23
  • 제2절 국내외 관련 기술 동향 ...25
  • 1. 관련 기술 수준 ...25
  • 2. 국내외 사업화 현황 ...27
  • 3. 기존 기술의 문제점 ...28
  • 4. 상용화된 제품 소개 ...29
  • 제3절 단백질 2차원 전기영동 실험 영상 자동 분석 기술 ...32
  • 1. 기술 연구 동기 ...32
  • 2. 기술 개발 목표 ...32
  • 3. 기술 개발 범위 ...33
  • 제4절 시장 현황 및 전망 ...40
  • 1. 국내외 시장 규모 예측 ...40
  • 2. 국내 시장 규모 ...43
  • 3. 국내외 주요 수요처 ...44
  • 4. 국내 수요처 현황 ...44
  • 5. 국외 수요처 현황 ...47
  • 6. 주요 수요처의 요구사항 ...51
  • 제2장 기술 개발 내용 ...52
  • 제1절 최종 기술 개발 내용 ...52
  • 제2절 세부 기술 개발 내용 ...55
  • 1. 영상 필터링 기술 ...55
  • 2. 스팟 검출 및 판별 기술 ...56
  • 3. 단백질 스팟 매칭 기술...57
  • 4. 실험 데이터 정규화 기술 ...58
  • 5. 데이터베이스 연동 기술...60
  • 6. 데이터베이스 연동 기술 ...61
  • 7. 2D/3D를 이용한 가시화 기술 ...62
  • 제3장 단백질 스팟 자동 검출 기술 ...63
  • 제1절 워터쉐드를 이용한 스팟 후보 영역 추출 ...64
  • 1. 워터쉐드 알고리즘 소개 ...64
  • 제2절 스팟 윤곽의 기울기 정보 추출 ...79
  • 제3절 스팟의 개수 추정 및 겹친 스팟 분리 ...82
  • 1. 기울기 분석 ...82
  • 2. 겹친 스팟의 분리 ...84
  • 제4절 개발된 단백질 스팟 자동 검출 기술 전체 구성도 ...86
  • 제4장 단백질 스팟 자동 매칭 기술 ...87
  • 제1절 표지점 자동 추출 기술 ...92
  • 1. Delaunay Triangulation을 이용한 패턴 형성 ...94
  • 2. 제한된 부분 Hausdorff 거리를 이용한 표지점 추출 ...96
  • 제2절 표지점 정보를 이용한 영역별 매칭 ...100
  • 1. 영역 분할을 위한 Delaunay Triangulation ...101
  • 2. Affine 변환에 의한 잔여 스팟 위치 변환 및 매칭 ...103
  • 제3절 개발된 단백질 스팟 자동 검출 기술 전체 구성도 ...105
  • 제5장 단백질 발현데이터 분석 기술 ...108
  • 제1절 발현데이터 분석 기법 조사 ...109
  • 제2절 서포트 벡터 머신 (SVM) ...113
  • 제6장 주요 기능 소개 ...119
  • 제1절 영상 필터링 기술 ...119
  • 제2절 스팟 검출 및 판별 기술 ...143
  • 제3절 스팟 및 영상 매칭 기술 ...148
  • 제4절 실험 데이터 정규화 기술 ...153
  • 제5절 데이터베이스 연동 기술 ...155
  • 제6절 발현 데이터 분석 기술 ...159
  • 제7절 2D/3D를 이용한 가시화 기술 ...160
  • 제7장 결론 ...168
  • 제1절 기술 개발 결과 정리 ...168
  • 1. 개발된 기술 소개 ...168
  • 2. 개발된 기능 정리 ...171
  • 제2절 양산사업화 추진내용 ...174
  • 1. 사업화 추진 현황 ...174
  • 2. 상품화 및 사업화 전략 ...178
  • 제3절 기대 효과 ...181
  • 1. 기술적 기대 효과 ...181
  • 2. 경제적 기대 효과 ...183
  • 참고 문헌 ...187

참고문헌 (25)

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