초록 ▼

식물 기주에 병증을 유발하지 않는 식물바이러스인 엔도나바이러스(Endornavirus)를 동정하여, 엔도나바이러스에 의한 식물의 스트레스 저항성이라는 주제를 가지고 기초 기반 연구를 수행하였다. 연구 수행을 위해 모델 식물로서 파프리카와 파프리카 엔도나바이러스를 선정하였다. 기존 파프리카 또는 고추 품종들중 얼마나 많은 품종들이 엔도나바이러스에 감염되어 있는지를 알기 위하여 기존에 발표된 고추 전사체 데이터를 이용하였다. 총 77개의 고추 전사체 중 9개가 엔도나바이러스에 감염되어 있는지를 확인하였다.

동정된 파프리카

식물 기주에 병증을 유발하지 않는 식물바이러스인 엔도나바이러스(Endornavirus)를 동정하여, 엔도나바이러스에 의한 식물의 스트레스 저항성이라는 주제를 가지고 기초 기반 연구를 수행하였다. 연구 수행을 위해 모델 식물로서 파프리카와 파프리카 엔도나바이러스를 선정하였다. 기존 파프리카 또는 고추 품종들중 얼마나 많은 품종들이 엔도나바이러스에 감염되어 있는지를 알기 위하여 기존에 발표된 고추 전사체 데이터를 이용하였다. 총 77개의 고추 전사체 중 9개가 엔도나바이러스에 감염되어 있는지를 확인하였다.

동정된 파프리카 엔도나바이러스 (Bell pepper endornavirus)의 경우 기주 전사체에서 0.01%에서 0.18%의 적은 양으로 존재하였다. 전사체 데이터를 이용하여 Maor 품종으로부터 BPEV isolate Maor의 전체 바이러스 염기서열을 조립하였다. 전사체 조립을 통해 얻어진 BPEV 부분 염기서열들을 바탕으로 계통학 분석한 결과 지금까지 알려진 BPEV 분리주들은 총 2개의 그룹으로 나누어지는 것을 확인하였다. 염기서열 분석을 통해 5’과 3‘ untranslated region이 잘 보존되었다는 것을 확인하였다. 재조합 분석을 통해 기존의 Yolo Wonder 분리주가 두 개의 재조합 event가 일어난 것을 확인하였다. 단일 염기서열 변이 연구를 통해 하나의 고추 또는 파프리카 품종에 BPEV변이체가 존재하는 것을 확인하였다. 본 연구를 통해 엔도나바이러스에 의해 조절되는 기주 스트레스 저항성 연구를 위한 기초적인 바이러스와 기주에 연구 기반을 확립하였다. 또한 생물정보학 분석 파이프라인 구축을 통해 식물 전사체로부터 알려진 식물 바이러스 유전체를 조립하였고, 조립된 바이러스 염기서열을 바탕으로 BPEV의 유전체, 변이 및 계통학 연구를 수행할 수 있었다.

( 출처 : Ⅰ. 연구결과 요약문 4p )

목차 Contents

• 표지 ... 1
• 목차 ... 3
• Ⅰ. 연구결과 요약문 ... 4
• Ⅱ. 연구내용 및 결과 ... 5
• 1. 연구과제의 개요 ... 5
• 2. 국내외 기술개발 현황 ... 5
• 3. 연구수행 내용 및 결과 ... 7
• 4. 목표 달성도 및 관련 분야에의 기여도 ... 11
• 5. 연구결과의 활용계획 ... 12
• 6. 연구과정에서 수집한 해외과학기술정보 ... 12
• Ⅲ. 연구성과 ... 13
• 끝페이지 ... 13