초록 ▼

□ 연구목적
▪ 동아시아내 Sino-Japanese 지역과 Sino-Himalaya 지역에 각각 분포하는 특산식물을 대상으로 엽록체 유전체 정보를 확보하고, 특성을 비교 분석함.
▪ 동아시아내 두 지역 간 특산식물의 계통유전체학적 비교분석을 통해서 지리학적 기원 및 분화시기, 이동경로 등 생물지리학적 역사를 규명함.

□ 연구내용
▪ 동아시아내 SJR 지역에 분포하는 특산식물중 유전체 연구가 미흡한 분류군을 대상으로 속 수준에서 선정함. 1년차에는 실꽃풀속(Chionographis ), 2년차에는 까치깨

□ 연구목적
▪ 동아시아내 Sino-Japanese 지역과 Sino-Himalaya 지역에 각각 분포하는 특산식물을 대상으로 엽록체 유전체 정보를 확보하고, 특성을 비교 분석함.
▪ 동아시아내 두 지역 간 특산식물의 계통유전체학적 비교분석을 통해서 지리학적 기원 및 분화시기, 이동경로 등 생물지리학적 역사를 규명함.

□ 연구내용
▪ 동아시아내 SJR 지역에 분포하는 특산식물중 유전체 연구가 미흡한 분류군을 대상으로 속 수준에서 선정함. 1년차에는 실꽃풀속(Chionographis ), 2년차에는 까치깨속(Corchoropsis )을 선정함.
▪ 연구대상 분류군들의 근연종들에 대한 엽록체 유전체 정보를 확보한 후, 비교 분석 함.
▪ 유전체 정보를 이용하여 대상분류군의 계통학적 유연관계를 파악함.
▪ 화석자료를 이용한 분자시계분석을 통해서 연구 대상 분류군의 분화시기를 결정하고, 생물지리학적 분석을 통해서 대상분류군의 지리학적 기원 및 이동양상을 구명함.
▪ 본 연구결과를 한-중 협력사업으로 확보될 SH지역의 연구대상 분류군과 비교 분석함.

□ 연구결과
▪ 본 과제의 대상분류군인 실꽃풀속 2종과 근연속(Chamaealirium ) 1종, 까치깨속 1종 1변종에 대해 엽록체 유전체 분석을 완료하였음.
▪ 실꽃풀속 분류군에서 rps 16 유전자 손실이 일어난 것을 확인하였음.
▪ 분자시계분석 결과, 실꽃풀족은 60.18 mya (95% HPD, 32.77-89.34 mya)에 나누어졌으며, 실꽃풀속은 21.64 mya (95% HPD, 6.91-37.03 mya)에 나누어진 것으로 분석됨.
▪ 까치깨속내 분류군에서 inf A 유전자 손실이 일어난 것을 확인하였음.
▪ 분자시계분석 결과, 까치깨속은 29.99 mya (95% HPD, 12.82-47.10 mya)에 나누어졌으며, 수까치깨(C . tomentosa )와 수까치깨(C . tomentosa var. psilocarpa )는 8.02 mya (95% HPD, 1.55-17.18 mya)에 나누어진 것으로 분석됨.

□ 연구결과의 활용계획
▪ NGS 기반 big data를 활용한 식물진화 및 지리적인 역사 구명
▪ 동아시아 식물상 기원 및 진화과정 구명
▪ 유용자원 식물의 확보 및 국제협력관계 유지

(출처 : 연구결과 요약문 3p)

Abstract ▼

□ Purpose
▪ To obtain chloroplast genomic information and to compare the characteristics of endemic plants distributed disjunctly in the Sino-Japanese region and the Sino-Himalaya region of East Asia.
▪ Based on the phylogenomic analysis of endemic plants between the two regions in East Asia,

□ Purpose
▪ To obtain chloroplast genomic information and to compare the characteristics of endemic plants distributed disjunctly in the Sino-Japanese region and the Sino-Himalaya region of East Asia.
▪ Based on the phylogenomic analysis of endemic plants between the two regions in East Asia, we assess the biogeographic history including their geographical origin, the divergence time, and dispersal pathway.

□ Contents
▪ Assemble the plastid genome sequences of two genera, Chionographis and Corchoropsis , which are insufficient in genomic research.
▪ Define the phylogenetic relationships of target species based on the plastid genome data.
▪ Infer the historical biogeography of target genera by using a fossil calibrated chronogram.

□ Results
▪ We assembled the complete plastid genome sequences of two Chionographis , one Chamaelirium , and two Corchoropsis taxa.
▪ We identified the rps 16 as a pseudogene in genus Chionographis .
▪ Tribe Chionographideae diverged at Paleocene (60.18 mya; 95% HPD, 32.77-89.34 mya) and genus Chionographis diverged at Miocene (21.64 mya; 95% HPD, 6.91-37.03 mya).
▪ We identified the inf A as a pseudogene in genus Corchoropsis .
▪ Genus Corchoropsis diverged at Oligocene (29.99 mya; 95% HPD, 32.77-89.34 mya) and both C . tomentosa and C . tomentosa var. psilocarpa diverged at Miocene (8.02 mya; 95% HPD, 6.91-37.03 mya).

□ Expected Contribution
▪ Infer the plant evolution and historical biogeography based on the big data using the NGS
▪ Investigate the origin of East Asian flora
▪ Secure the useful plants and maintaining international cooperation

(source : Summary 4p)

목차 Contents

• 표지 ... 1
• 목차 ... 2
• 연구결과 요약문 ... 3
• SUMMARY ... 4
• 연구내용 및 결과 ... 5
• 1. 과제 개요 ... 5
• 2. 수행내용 및 결과 ... 7
• 3. 자체평가 ... 15
• 4. 연구결과의 활용 계획 ... 15
• 5. 연구과정에서 수집한 해외 정보 ... 16
• 6. 참고문헌 ... 16
• 7. 연구성과 ... 17
• 8. 기타사항 ... 17
• 붙임 대표성과 ... 18
• 끝페이지 ... 18