돼지는 인간의 주요 단백질 공급원으로써 인간의 삶과 밀접한 관계를 갖는다. 우리나라는 구어 먹는 식습관 때문에 고지방 부위를 선호하여 저지방 부위와의 소비불균형이 초래되어 이를 최소화하는 방안으로 근내지방함량이 높아 부드러운 육질을 가지는 버크셔 품종을 이용하는 방법이 제시되고 있다.
90년대 후반부터 가축에서 양적형질유전좌위를 밝히기 위한 연구가 활발히 진행되었으며, 돼지의 6번 염색체에 존재하는 근내지방함량 및 등지방두께와 관련된 양적형질유전자좌위가 선행 연구를 통해 밝혀졌고, 6번 염색체 양적형질유전좌위에 존재하는 유전자들 중 GADD45A 유전자가 근내지방함량과 등지방두께의 조절에 관여하는 강력한 후보유전자로 제시되었다. 따라서 본 연구에서는 GADD45A 유전자가 근내지방함량 등 육질형질에 영향을 미치는지에 대해 알아보고자 수행하였다. 먼저 GADD45A 유전자의 ...
돼지는 인간의 주요 단백질 공급원으로써 인간의 삶과 밀접한 관계를 갖는다. 우리나라는 구어 먹는 식습관 때문에 고지방 부위를 선호하여 저지방 부위와의 소비불균형이 초래되어 이를 최소화하는 방안으로 근내지방함량이 높아 부드러운 육질을 가지는 버크셔 품종을 이용하는 방법이 제시되고 있다.
90년대 후반부터 가축에서 양적형질유전좌위를 밝히기 위한 연구가 활발히 진행되었으며, 돼지의 6번 염색체에 존재하는 근내지방함량 및 등지방두께와 관련된 양적형질유전자좌위가 선행 연구를 통해 밝혀졌고, 6번 염색체 양적형질유전좌위에 존재하는 유전자들 중 GADD45A 유전자가 근내지방함량과 등지방두께의 조절에 관여하는 강력한 후보유전자로 제시되었다. 따라서 본 연구에서는 GADD45A 유전자가 근내지방함량 등 육질형질에 영향을 미치는지에 대해 알아보고자 수행하였다. 먼저 GADD45A 유전자의 변이를 탐색하기 위하여 GADD45A 유전자의 전사조절영역에 해당하는 약 2kb 영역과 유전자 영역에 대하여 버크셔 돼지 품종에 대하여 염기서열 분석을 실시하여, 전사조절영역에서 3개 SNPs와 유전자 영역에서 5개의 SNPs 등 총 8개의 SNP를 발굴하였다. 발굴된 SNP에 대하여 근내지방함량 등 육질형질 정보가 있는 버크셔 품종 694두에 대하여 유전자형을 결정했으며, 형질과의 연관성 분석을 실시한 결과 SNPs 8개중 4개가 육질형질과 통계적 유의성이 있는 것으로 확인되었다.
Exon 1에 위치한 g.196A>G는 보수력 (P<0.05), 유즙손실 (P<0.0001), 가열감량 (P<0.005), 육색의 명도 (P<0.005), 전단력 (P<0.05) 등에서 유의적인 관련성을 보였고, Intron 1번에 위치한 g.392C>A는 보수력 (P<0.01), 유즙손실 (P<0.0001), 가열감량 (P<0.005), 육색의 명도 (P<0.005), 육색의 황색도 (P<0.05), 전단력 (P<0.05) 등에서 유의적인 관련성을 보였다. Exon 2번에 위치한 g.955T>C는 유즙손실 (P<0.0001), 가열감량 (P<0.005), 육색의 명도 (P<0.005), 육색의 황색도 (P<0.05), 전단력 (P<0.05) 등에서 유의적인 관련성을 보였다. 마지막으로 Exon 4번에 위치한 g.3247A>T는 유즙손실 (P<0.05), 육색의 명도 (P<0.05), 등지방두께 (P<0.005), 수분 (P<0.05), 근내지방함량 (P<0.005) 등과 유의적인 관련성을 보였다. 이 결과 GADD45A 유전자는 근내지방함량 및 등지방두께 형질과 고도의 유의성이 인정되었을 뿐 아니라 보수력 및 육색 등의 경제형질에도 큰 영향을 미치고 있다는 것을 확인할 수 있었다.
따라서 본 연구를 통해 GADD45A 유전자는 돼지의 근내지방함량 및 등지방두께 형질 등에 관여하는 것으로 확인되었고, 더 나아가 GADD45A 유전자에서 확인된 형질과 연관된 SNPs는 분자마커로 활용이 가능할 것으로 사료되며, 특히 g.3247A>T는 근내지방함량 및 등지방두께를 개량하기 위한 분자표지인자로 활용이 가능할 것으로 사료된다.
돼지는 인간의 주요 단백질 공급원으로써 인간의 삶과 밀접한 관계를 갖는다. 우리나라는 구어 먹는 식습관 때문에 고지방 부위를 선호하여 저지방 부위와의 소비불균형이 초래되어 이를 최소화하는 방안으로 근내지방함량이 높아 부드러운 육질을 가지는 버크셔 품종을 이용하는 방법이 제시되고 있다.
90년대 후반부터 가축에서 양적형질유전좌위를 밝히기 위한 연구가 활발히 진행되었으며, 돼지의 6번 염색체에 존재하는 근내지방함량 및 등지방두께와 관련된 양적형질유전자좌위가 선행 연구를 통해 밝혀졌고, 6번 염색체 양적형질유전좌위에 존재하는 유전자들 중 GADD45A 유전자가 근내지방함량과 등지방두께의 조절에 관여하는 강력한 후보유전자로 제시되었다. 따라서 본 연구에서는 GADD45A 유전자가 근내지방함량 등 육질형질에 영향을 미치는지에 대해 알아보고자 수행하였다. 먼저 GADD45A 유전자의 변이를 탐색하기 위하여 GADD45A 유전자의 전사조절영역에 해당하는 약 2kb 영역과 유전자 영역에 대하여 버크셔 돼지 품종에 대하여 염기서열 분석을 실시하여, 전사조절영역에서 3개 SNPs와 유전자 영역에서 5개의 SNPs 등 총 8개의 SNP를 발굴하였다. 발굴된 SNP에 대하여 근내지방함량 등 육질형질 정보가 있는 버크셔 품종 694두에 대하여 유전자형을 결정했으며, 형질과의 연관성 분석을 실시한 결과 SNPs 8개중 4개가 육질형질과 통계적 유의성이 있는 것으로 확인되었다.
Exon 1에 위치한 g.196A>G는 보수력 (P<0.05), 유즙손실 (P<0.0001), 가열감량 (P<0.005), 육색의 명도 (P<0.005), 전단력 (P<0.05) 등에서 유의적인 관련성을 보였고, Intron 1번에 위치한 g.392C>A는 보수력 (P<0.01), 유즙손실 (P<0.0001), 가열감량 (P<0.005), 육색의 명도 (P<0.005), 육색의 황색도 (P<0.05), 전단력 (P<0.05) 등에서 유의적인 관련성을 보였다. Exon 2번에 위치한 g.955T>C는 유즙손실 (P<0.0001), 가열감량 (P<0.005), 육색의 명도 (P<0.005), 육색의 황색도 (P<0.05), 전단력 (P<0.05) 등에서 유의적인 관련성을 보였다. 마지막으로 Exon 4번에 위치한 g.3247A>T는 유즙손실 (P<0.05), 육색의 명도 (P<0.05), 등지방두께 (P<0.005), 수분 (P<0.05), 근내지방함량 (P<0.005) 등과 유의적인 관련성을 보였다. 이 결과 GADD45A 유전자는 근내지방함량 및 등지방두께 형질과 고도의 유의성이 인정되었을 뿐 아니라 보수력 및 육색 등의 경제형질에도 큰 영향을 미치고 있다는 것을 확인할 수 있었다.
따라서 본 연구를 통해 GADD45A 유전자는 돼지의 근내지방함량 및 등지방두께 형질 등에 관여하는 것으로 확인되었고, 더 나아가 GADD45A 유전자에서 확인된 형질과 연관된 SNPs는 분자마커로 활용이 가능할 것으로 사료되며, 특히 g.3247A>T는 근내지방함량 및 등지방두께를 개량하기 위한 분자표지인자로 활용이 가능할 것으로 사료된다.
The pig is one of the world’s most important livestock and pork is the major animal protein resource for human. Meat quality, which is one of the most important economic traits in farm animals, is controlled by multiple genes as quantitative trait loci. Meat quality is affected by many factors such ...
The pig is one of the world’s most important livestock and pork is the major animal protein resource for human. Meat quality, which is one of the most important economic traits in farm animals, is controlled by multiple genes as quantitative trait loci. Meat quality is affected by many factors such as genetic effects of animal, production and environmental conditions. Specially, fatness is one of the most crucial parameters determining meat quality. Quantitative trait loci (QTL) related to fatness and meat quality traits, such as intramuscular fat content (IMF) and backfat thickness (BFT) have been identified on pig chromosome 6 (SSC6). Moreover, LEPR and FABP were considered as potential candidate genes for controlling these QTL. Recently, Growth arrest and DNA damage inducible protein 45 alpha gene (GADD45A) was reported as a powerful candidate gene for QTL of BFT and IMF on SSC6. Thus this study was conducted to identify molecular markers associated with meat traits. Porcine GADD45A gene including 2Kb of 5’ regulatory region was amplified and sequenced to detect polymorphisms. Initially, a total of 8 SNP sites were found at g.-205T>C, g.-930T>G, g.-1622A>G, g.196A>G, g.392C>A, g.955T>C, g.2580delT and g.3247A>T in the porcine GADD45A. Subsequently association study was carried out on a total of 694 Berkshire pigs. Among 8 SNPs, 4 SNPs showed significant associations with multiple meat quality traits in the Berkshire population. In g.196 A>G SNP, animals with the AA genotype had significantly higher least square mean values of driploss, cookingloss and shear force (SF) than animals with the GG genotype (P = 0.0001, 0.0017 and 0.0295, respectively). Conversely, pigs with the GG genotype showed significantly higher least square mean values of CIE_lightness (MC_L) than pigs with the AA genotype (P = 0.0043). In g.329C>A, animals with the AA genotype had significantly higher least square mean values of water holding capacity (WHC), driploss, cookingloss, CIE_yellowness(MC_b) and shear force (SF) than animals with the CC genotype (P = 0.0064, 0.0001, 0.0019, 00240 and 0.0383, respectively). Conversely, pigs with the CC genotype showed significantly greater least square mean values of CIE_lightness (MC_L) than pigs with the AA genotype (P = 0.0022). In g.955T>C, animals with the CC genotype had significantly higher least square mean values of driploss, cookingloss, MC_b and shear force (SF) than animals with the TT genotype (P = 0.001, 0.0022, 0.0257and 0.0351, respectively). Conversely, pigs with the TT genotype showed significantly greater least square mean values of MC_L than pigs with the CC genotype (P = 0.0027). In g.3247A>T, animals with the TT genotype had significantly higher least square mean values of driploss, MC_L and backfat (BT) than animals with the AA genotype (P = 0.0274, 0.0391 and 0.0013, respectively). Conversely, pigs with the AA genotype showed significantly greater least square mean values of MC_L and fat content than pigs with the TT genotype (P = 0.0391 and 0.0015, respectively). Also, pigs with the AT genotype showed significantly greater least square mean values of moisture than pigs with the AA and TT genotypes (P = 0.0183). These markers can potentially be applied in pig breeding program for improving IMF and BFT traits after validation in other populations.
The pig is one of the world’s most important livestock and pork is the major animal protein resource for human. Meat quality, which is one of the most important economic traits in farm animals, is controlled by multiple genes as quantitative trait loci. Meat quality is affected by many factors such as genetic effects of animal, production and environmental conditions. Specially, fatness is one of the most crucial parameters determining meat quality. Quantitative trait loci (QTL) related to fatness and meat quality traits, such as intramuscular fat content (IMF) and backfat thickness (BFT) have been identified on pig chromosome 6 (SSC6). Moreover, LEPR and FABP were considered as potential candidate genes for controlling these QTL. Recently, Growth arrest and DNA damage inducible protein 45 alpha gene (GADD45A) was reported as a powerful candidate gene for QTL of BFT and IMF on SSC6. Thus this study was conducted to identify molecular markers associated with meat traits. Porcine GADD45A gene including 2Kb of 5’ regulatory region was amplified and sequenced to detect polymorphisms. Initially, a total of 8 SNP sites were found at g.-205T>C, g.-930T>G, g.-1622A>G, g.196A>G, g.392C>A, g.955T>C, g.2580delT and g.3247A>T in the porcine GADD45A. Subsequently association study was carried out on a total of 694 Berkshire pigs. Among 8 SNPs, 4 SNPs showed significant associations with multiple meat quality traits in the Berkshire population. In g.196 A>G SNP, animals with the AA genotype had significantly higher least square mean values of driploss, cookingloss and shear force (SF) than animals with the GG genotype (P = 0.0001, 0.0017 and 0.0295, respectively). Conversely, pigs with the GG genotype showed significantly higher least square mean values of CIE_lightness (MC_L) than pigs with the AA genotype (P = 0.0043). In g.329C>A, animals with the AA genotype had significantly higher least square mean values of water holding capacity (WHC), driploss, cookingloss, CIE_yellowness(MC_b) and shear force (SF) than animals with the CC genotype (P = 0.0064, 0.0001, 0.0019, 00240 and 0.0383, respectively). Conversely, pigs with the CC genotype showed significantly greater least square mean values of CIE_lightness (MC_L) than pigs with the AA genotype (P = 0.0022). In g.955T>C, animals with the CC genotype had significantly higher least square mean values of driploss, cookingloss, MC_b and shear force (SF) than animals with the TT genotype (P = 0.001, 0.0022, 0.0257and 0.0351, respectively). Conversely, pigs with the TT genotype showed significantly greater least square mean values of MC_L than pigs with the CC genotype (P = 0.0027). In g.3247A>T, animals with the TT genotype had significantly higher least square mean values of driploss, MC_L and backfat (BT) than animals with the AA genotype (P = 0.0274, 0.0391 and 0.0013, respectively). Conversely, pigs with the AA genotype showed significantly greater least square mean values of MC_L and fat content than pigs with the TT genotype (P = 0.0391 and 0.0015, respectively). Also, pigs with the AT genotype showed significantly greater least square mean values of moisture than pigs with the AA and TT genotypes (P = 0.0183). These markers can potentially be applied in pig breeding program for improving IMF and BFT traits after validation in other populations.
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