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Phytophthora species의 분자유전학적 분류 및 RAPD fingerprinting을 이용한 P. infestans-specific 분자마커의 선발
Molecular Genetic Classification of Phytophthora Species and P. infestans-specific Marker Selection by RAPD Fingerprinting 원문보기

한국균학회지 = The Korean journal of mycology, v.27 no.6 = no.93, 1999년, pp.394 - 398  

김경수 (강원대학교 식물응용과학부) ,  신환성 (강원대학교 식물응용과학부) ,  김희종 (강원대학교 식물응용과학부) ,  우수진 (강원대학교 식물응용과학부) ,  함영일 (농촌진흥청 고령지시험장) ,  신관용 (농촌진흥청 고령지시험장) ,  이정운 (농촌진흥청 고령지시험장) ,  김병섭 (강릉대학교 원예학과) ,  심재욱 (동국대학교 응용생물학과) ,  이민웅 (동국대학교 응용생물학과) ,  이윤수 (강원대학교 식물응용과학부)

초록
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형태학적특징으로 분류된 6개의 그룹(GI, GII, GIII, GIV, GV, GVI)에 속하는 수종의 Phytophthora species 간의 RAPD fingerprinting 양상을 살펴보았다. Phytophthora의 일부 균주는 배양시 균사생장 형태가 매우 유사하며, 분리를 위한 여러 가지 특징이 중첩되기 때문에 정확한 동정이 난해하다. 본 실험결과 감자에서 분리한 균주 뿐만 아니라 토마토에서 분리한 P. infestans에서 RAED 분석을 통해서 동정이 가능함을 알 수 있었다. 증폭된 절편들은 $0.3{\sim}3.2\;kb$의 범위에 속했다. 전체 145개 밴드 중에서 109개의 polymorphic band를 얻었다. 7개의 P. infestans 간에는 최저 0.92에서 최고 0.99의 높은 유사성을 보였으며 감자를 기주로한 isolate 3 과는 $0.93{\sim}0.95$를 보였고, P. capsici 간에는 $0.77{\sim}0.86$의 유연성을 보였으며 약 80%의 수준에서 효과적으로 grouping 되었다. 특히 OPA-20를 사용하여 genus Phytophthora 내에 공통으로 존재하는 600 bp의 common band와 P. infestans에만 형성되는 680 bp의 specific band를 얻어 marker로서의 활용이 가능함을 알 수 있었다. 형태학적으로는 GVI 속하는 P. cinnamomi와 P. cryptogea간의 RAPD fingerprinting pattern에서 상이한 band 패턴을 나타냈다. 특히 OPA-04, OPA-17, OPA-18, OPA-19, OPB-12에서는 major band의 molecular weight와 생성밴드의 수에서 뚜렷한 차이를 보였다. 그리고 두 균주간의 유사성은 0.67로 나타났다. GV에 속하는 P. megasperma와 P. sojae의 경우, 유사성 정도가 0.65으로 나타났으며 이는 다른 균주와의 유사정도 보다 가장 높은 수준을 보였다. 또한 이들 균주는 OPA-08, OPA-17, OPA-19를 사용했을 때 단일 major band에서 큰 차이를 보였다.

Abstract ▼ AI-Helper 아이콘AI-Helper

Taxonomic and genetic analysis of Phytophthora species belonging to six different morphological groups (GI, GII, GIII, GIV, GV, GVI) was conducted using RAPD method. Amplified fragments ranged $0.3{\sim}3.2$ kb in their molecular weights. Among total of 145 bands, there were 109 polymorph...

주제어

#Phytophthora species   #P   #infestans   #RAPD fingerprinting   #Molecular marker  

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