2009년 4월 제주도의 운진항에서 채집한 해양 해면 Spirastrella abata와 Cinachyrella sp.의 공생 세균의 주요 군집구조를 16SrDNA-denaturing gradient gel electrophoresis (DGGE) 방법을 이용하여 비교 분석하였다. S. abata와 Cinachyrella sp.는 각각 7개와 8개의 DGGE 밴드를 나타내었으며 이들을 적출하여 염기서열을 분석한 결과, NCBI에 등록된 서열들과 92-100%의 유사도를 나타내었다. S. abata의 주요 공생세균은 Alphaproteobacteria와 Deltaproteobacteria에 속하였으며, Cinachyrella sp.의 경우 Alphaproteobacteria, Gammaproteobacteria와 Actinobacteria에 속하는 세균으로 구성되었다. 두 종의 해면에서 공통되는 공생세균 그룹은 Alphaproteobacteria였으며 이 세균 그룹은 두 종의 해면 모두에서 우점하였다. Deltaproteobacteria는 S. abata에서, Actinobacteria와 Gammaproteobacteria는 Cinachyrella sp.에서만 관찰되었다. 동일지역에서 채집한 서로 다른 두 종의 해면은 각각 다른 공생세균 군집구조를 나타내었다.
2009년 4월 제주도의 운진항에서 채집한 해양 해면 Spirastrella abata와 Cinachyrella sp.의 공생 세균의 주요 군집구조를 16SrDNA-denaturing gradient gel electrophoresis (DGGE) 방법을 이용하여 비교 분석하였다. S. abata와 Cinachyrella sp.는 각각 7개와 8개의 DGGE 밴드를 나타내었으며 이들을 적출하여 염기서열을 분석한 결과, NCBI에 등록된 서열들과 92-100%의 유사도를 나타내었다. S. abata의 주요 공생세균은 Alphaproteobacteria와 Deltaproteobacteria에 속하였으며, Cinachyrella sp.의 경우 Alphaproteobacteria, Gammaproteobacteria와 Actinobacteria에 속하는 세균으로 구성되었다. 두 종의 해면에서 공통되는 공생세균 그룹은 Alphaproteobacteria였으며 이 세균 그룹은 두 종의 해면 모두에서 우점하였다. Deltaproteobacteria는 S. abata에서, Actinobacteria와 Gammaproteobacteria는 Cinachyrella sp.에서만 관찰되었다. 동일지역에서 채집한 서로 다른 두 종의 해면은 각각 다른 공생세균 군집구조를 나타내었다.
The bacterial community structure of two marine sponges, Spirastrella abata and Cinachyrella sp. collected from Jeju Island, in April 2009, was analyzed by 16S rDNA-denaturing gradient gel electrophoresis (DGGE). DGGE banding patterns indicated 8 and 7 bands for Spirastrella abata and Cinachyrella s...
The bacterial community structure of two marine sponges, Spirastrella abata and Cinachyrella sp. collected from Jeju Island, in April 2009, was analyzed by 16S rDNA-denaturing gradient gel electrophoresis (DGGE). DGGE banding patterns indicated 8 and 7 bands for Spirastrella abata and Cinachyrella sp., respectively. Comparative sequence analysis of variable DGGE bands revealed from 92% to 100% similarity to the known published sequences. The bacterial groups associated with Spirastrella abata were Alphaproteobacteria and Deltaproteobacteria. The bacterial community of Cinachyrella sp. consisted of Alphaproteobacteria, Gammaproteobacteria, and Actinobacteria. Alphaproteobacteria was common and predominant in both the sponge species. Deltaproteobacteria was found only in Spirastrella abata while Actinobacteria and Gammaproteobacteria were found only in Cinachyrella sp. The results revealed that though the common bacterial group was found in both the sponges, the bacterial community profiles differed between the two sponge species obtained from the same geographical location.
The bacterial community structure of two marine sponges, Spirastrella abata and Cinachyrella sp. collected from Jeju Island, in April 2009, was analyzed by 16S rDNA-denaturing gradient gel electrophoresis (DGGE). DGGE banding patterns indicated 8 and 7 bands for Spirastrella abata and Cinachyrella sp., respectively. Comparative sequence analysis of variable DGGE bands revealed from 92% to 100% similarity to the known published sequences. The bacterial groups associated with Spirastrella abata were Alphaproteobacteria and Deltaproteobacteria. The bacterial community of Cinachyrella sp. consisted of Alphaproteobacteria, Gammaproteobacteria, and Actinobacteria. Alphaproteobacteria was common and predominant in both the sponge species. Deltaproteobacteria was found only in Spirastrella abata while Actinobacteria and Gammaproteobacteria were found only in Cinachyrella sp. The results revealed that though the common bacterial group was found in both the sponges, the bacterial community profiles differed between the two sponge species obtained from the same geographical location.
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문제 정의
는 지금까지 우리나라에서는 거의 보고된 바가 없는 미기록 종으로 알려져 있다. 본 연구에서는 분포 특성이 다른 두 종의 해면이 동일 지역에 서식하는 경우에 있어 공생세균 군집 구조의 차이를 파악하고자 하였다.
제안 방법
1.5 ml tube의 100 μl선까지 분쇄된 시료를 넣고 CTAB buffer 800 μl을 첨가하여 섞은 후 동결(-70℃)과 융해(60℃)를 각각 10분씩 5회 반복 한 후, 50 μl proteinase K (10 mg/ml, Biosesang, Korea)와 50 μl lysozyme (50 mg/ml, Sigma, USA)을 첨가하여 37℃에서 2시간 처리하였다.
DGGE로부터 확인된 각각의 band는 적출하여 50 μl의 DW로 DNA를 추출한 후 이것을 PCR 반응의 주형으로 사용하였다.
GC clamp가 추가된 341f와 518r primer쌍을 이용하여 16S rRNA gene의 V3 영역을 증폭하였다. PCR 반응은 GeneAmp PCR system 2700 thermal cycler (Applied Biosystems, Version 2.
DGGE로부터 확인된 각각의 band는 적출하여 50 μl의 DW로 DNA를 추출한 후 이것을 PCR 반응의 주형으로 사용하였다. GC가 제거된 341f와 518r primer 쌍을 이용하여 DGG-PCR과 동일한 조건으로 PCR을 수행하였다. PCR증폭 산물은 PCR-purification kit (Solgent, Korea)를 이용하여 정제 후 염기서열 분석(Macrogen, Korea)을 의뢰하였다.
PCR 반응 혼합물의 조성은 5 μl의 10× reaction buffer, 1 μl의 dNTPs, 5 unit/μl Taq polymerase(Solgent, Korea), 각각 10 pmol, 그리고 30 ng의 시료 DNA를 1 μl첨가하여 최종부피가 50 μl가 되도록 하였다.
GC clamp가 추가된 341f와 518r primer쌍을 이용하여 16S rRNA gene의 V3 영역을 증폭하였다. PCR 반응은 GeneAmp PCR system 2700 thermal cycler (Applied Biosystems, Version 2.0, USA)을 이용하였다. PCR 반응 혼합물의 조성은 5 μl의 10× reaction buffer, 1 μl의 dNTPs, 5 unit/μl Taq polymerase(Solgent, Korea), 각각 10 pmol, 그리고 30 ng의 시료 DNA를 1 μl첨가하여 최종부피가 50 μl가 되도록 하였다.
GC가 제거된 341f와 518r primer 쌍을 이용하여 DGG-PCR과 동일한 조건으로 PCR을 수행하였다. PCR증폭 산물은 PCR-purification kit (Solgent, Korea)를 이용하여 정제 후 염기서열 분석(Macrogen, Korea)을 의뢰하였다. 염기서열은 DNA-star program을 이용하여 편집하였으며 National Center for Biotechnology Information (NCBI)의 Basic Local Alignment Search Tool (BLAST)를 이용하여 염기서열의 상동성을 검색하였다.
각각의 해면 종의 다른 개체에서 주요 DGGE band 패턴은 동일하였으며, 이는 동일지역에서 채취한 동일 해면 종의 다른 개체인 경우, 동일한 밴드패턴을 나타내는 것으로 보고한 연구(15) 결과와 유사한 것이었다. 두 해면 종의 주요 DGGE band들이 나타내는 세균 군집 다양성을 파악하기 위하여 16S rDNA의 부분 염기서열을 분석하였다.
세균 군집의 다양성을 분석하기 위하여 DGGE band로부터 DNA를 추출하여 341f와 518r을 이용하여 재 증폭하여 염기서열을 분석하였다. 15개의 DGGE band에 대하여 염기 서열을 결정한 결과, Table 1에 보는 바와 같이 S.
여기에 70% 에탄올 500 μl를 넣어 같은 조건으로 원심 분리하여 상등액을 제거한 후 공기 중에서 건조하여 50 μl의 DW에 녹여 DGGE를 위한 PCR 반응의 주형으로 사용하였다.
PCR증폭 산물은 PCR-purification kit (Solgent, Korea)를 이용하여 정제 후 염기서열 분석(Macrogen, Korea)을 의뢰하였다. 염기서열은 DNA-star program을 이용하여 편집하였으며 National Center for Biotechnology Information (NCBI)의 Basic Local Alignment Search Tool (BLAST)를 이용하여 염기서열의 상동성을 검색하였다. 계통수는 Molecular Evolutionary Genetics Analysis (MEGA) software version 4.
에서 8개, 총 15개의 주요 band들에 대하여 부분 염기서열을 확인할 수 있었다. 이 서열들을 Blast search를 통하여 기존의 보고된 서열들과 상동성(similarity)을 검색하였다. 각각의 DGGE band에서 유래한 염기서열을 이용하여 계통수를 작성한 결과는 Fig.
0)에서 전기 영동하였다. 전기 영동 후 Ethidium Bromide (50 ng/ml)로 염색하여 Gel Logic 200(Kodak, USA)을 이용, 자외선 조사로 확인하였다. 증폭된 DNA의 크기를 확인하기 위한 marker로는 100 bp ladder(Intron, Korea)를 사용하였다.
1× TAE buffer 를 사용하여 60℃, 30 V에서 30분간 안정화한 후 60 V로 전압을 올려 16시간 전기 영동을 수행하였다. 전기영동 후 DGGE gel은 ethidium bromide로 1시간 염색 후 Gel Logic 200 (Kodak, USA)을 이용, 자외선 조사로 확인하였다.
증폭된 DNA의 확인을 위해서 PCR 반응액 2 μl를 취하여 2% agarose gel (Bio-Rad, USA)을 이용하여 Mupid-ex (ADVANCE, Japan)로 100 V에서 25분간 1× TAE buffer (40 mM Tris, 20 mM acetic acid, 50 mM EDTA, pH 8.0)에서 전기 영동하였다.
DGGE는 Bio-Rad Dcode system (Bio-Rad, USA)을 이용하여 수행하였다(15). 증폭된 PCR 산물은 bis acrylamide (Bio-Rad, USA)를 포함한 10% polyacrylamide를 이용하여 35%에서 65%의 농도 구배 조성(7 M urea, 40% formamide)으로 전기영동을 수행하였다. Polyacrylamide gel은 크기 20×13 (W×H cm), 두께 1 mm로 작성하여 PCR 시료는 2× loading dye와 혼합하여 40 μl의 시료를 loading 하였다.
대상 데이터
abata와 Cinachyrella sp.에 공생하는 세균의 다양성 조사를 위하여 2009년 4월, 제주도의 운진항에서 스쿠버 다이빙을 이용하여 25 m깊이의 바다에서 각각의 해면을 2개체씩 채집하였다. 채집한 해면은 멸균된 인공해수(ASW)로 3회 세척 후 -20℃에서 동결하여 운반하였다.
전기 영동 후 Ethidium Bromide (50 ng/ml)로 염색하여 Gel Logic 200(Kodak, USA)을 이용, 자외선 조사로 확인하였다. 증폭된 DNA의 크기를 확인하기 위한 marker로는 100 bp ladder(Intron, Korea)를 사용하였다.
에 공생하는 세균의 다양성 조사를 위하여 2009년 4월, 제주도의 운진항에서 스쿠버 다이빙을 이용하여 25 m깊이의 바다에서 각각의 해면을 2개체씩 채집하였다. 채집한 해면은 멸균된 인공해수(ASW)로 3회 세척 후 -20℃에서 동결하여 운반하였다.
이론/모형
DGGE는 Bio-Rad Dcode system (Bio-Rad, USA)을 이용하여 수행하였다(15). 증폭된 PCR 산물은 bis acrylamide (Bio-Rad, USA)를 포함한 10% polyacrylamide를 이용하여 35%에서 65%의 농도 구배 조성(7 M urea, 40% formamide)으로 전기영동을 수행하였다.
염기서열은 DNA-star program을 이용하여 편집하였으며 National Center for Biotechnology Information (NCBI)의 Basic Local Alignment Search Tool (BLAST)를 이용하여 염기서열의 상동성을 검색하였다. 계통수는 Molecular Evolutionary Genetics Analysis (MEGA) software version 4.0의 neighbor-joining 방법을 이용하였고, 1,000회 반복 bootstrap 분석에 의해 계통수의 안정성을 조사하였다.
033 M bar기압으로 14시간 건조하였다. 동결 건조된 해면은 멸균된 막자 사발에 넣고 액체질소를 부은 후 분쇄하였으며 CTAB 방법을 이용하여 total genomic DNA를 추출하였다(25). 1.
2009년 4월 제주도의 운진항에서 채집한 해양 해면 Spirastrella abata와 Cinachyrella sp.의 공생 세균의 주요 군집구조를 16S rDNA-denaturing gradient gel electrophoresis (DGGE) 방법을 이용하여 비교 분석하였다. S.
의 공생 세균의 주요 군집구조를 비배양법(culture-independent methods)에 기초한 16S rDNA- denaturing gradient gel electrophoresis (DGGE) 방법을 이용하여 비교·분석하였다.
abata와 Cinachyrella sp.의 해면 공생세균의 계통학적 다양성을 알아보기 위하여 비 배양 지문법인 16S rDNA의 PCR-DGGE를 수행하였다. 해면 시료로부터 추출한 gDNA를 주형으로 16S rRNA gene의 V3 영역을 증폭한 결과, 194 bp의 예상된 크기의 PCR 산물을 얻었다.
성능/효과
의 주요 공생세균 그룹은 uncultured Gammaproteobacteria로 나타났으며 기존의 서열과 93%에서 100%의 상동성을 보였다. DGGE band C-1, C-4와 C-6는 uncultured Gammaproteobacteria (EU571964, GU317736, EU050785)와 93% 이상의 상동성을 나타내었으며, C-2, C-5와 C-8은 uncultured Alphaproteobacteria (EF105800, GU992436) 와 95%에서 100%의 상동성을 나타내었고, C-3과 C-7은 uncultured Actinobacteria (EU670873, GU227571)과 94%와 100%의 상동성을 각각 나타내었다(Table 1).
abata의 주요 공생세균 그룹은 해수 유래의 uncultured Alphaproteobacteria로 밝혀졌으며, 기존의 서열과 93%에서 100%의 상동성을 나타내었다. DGGE band S-1은 uncultured Deltaproteobacteria (FJ215406)와 98%의 상동성을 나타내었으며, S-2, S-3, S-4, S-5, S-6 그리고 S-7은 uncultured Alphaproteobacteria (FJ156364, AB234169)와 97%에서 98%의 상동성을 나타내었다. Cinachyrella sp.
두 해면의 DGGE band로부터 결정된 서열들은 기존의 서열들과 93%에서 100%의 상동성을 나타내었다. DGGE band의 패턴은 다양하였으며, band로부터 밝혀진 모든 서열들은 배양 되지 않은 세균 클론(uncultured bacterial clone)들과 높은 상동성을 나타내었다. 일반적으로 자연계의 미생물 중 실제 배양 가능한 종은 전체 자연계 미생물 군집의 1% 이하인 것으로 알려져 있는 바(15)와 같이 본 연구에서 조사된 해면에 존재하는 세균 군집 역시 배양되지 않는 세균 군집이 높은 비율로 존재함을 알 수 있었다.
S. abata의 주요 공생세균 그룹은 해수 유래의 uncultured Alphaproteobacteria로 밝혀졌으며, 기존의 서열과 93%에서 100%의 상동성을 나타내었다. DGGE band S-1은 uncultured Deltaproteobacteria (FJ215406)와 98%의 상동성을 나타내었으며, S-2, S-3, S-4, S-5, S-6 그리고 S-7은 uncultured Alphaproteobacteria (FJ156364, AB234169)와 97%에서 98%의 상동성을 나타내었다.
abata와 Cinachyrella sp.는 각각 7개와 8개의 DGGE 밴드를 나타내었으며 이들을 적출하여 염기서열을 분석한 결과, NCBI에 등록된 서열들과 92-100%의 유사도를 나타내었다. S.
에서는 Alphaproteobacteria, Gammaproteobacteria 그리고 Actinobacteria를 포함하는 것으로 나타났다. 두 종의 해면에서 공통되는 공생세균 그룹은 Alphaproteobacteria였으며 이 세균 그룹은 두 종의 해면 모두에서 우점하는 것으로 나타났다. 두 해면 종의 공생세균 군집 구조에서 우점하는 그룹으로 나타난 Proteobacteria 문(phylum)의 세균은 해양환경에서 일반적으로 서식하며, 해양 해면에서도 높은 비율로 분포하는 것으로 알려져 있다(9).
의 경우 Alphaproteobacteria, Gammaproteobacteria와 Actinobacteria에 속하는 세균으로 구성되었다. 두 종의 해면에서 공통되는 공생세균 그룹은 Alphaproteobacteria였으며 이 세균 그룹은 두 종의 해면 모두에서 우점하였다. Deltaproteobacteria는 S.
두 해면의 DGGE band로부터 결정된 서열들은 기존의 서열들과 93%에서 100%의 상동성을 나타내었다. DGGE band의 패턴은 다양하였으며, band로부터 밝혀진 모든 서열들은 배양 되지 않은 세균 클론(uncultured bacterial clone)들과 높은 상동성을 나타내었다.
abata와 Cinachyrella sp.의 공생세균 군집은 Alphaproteobacteria를 공통의 우점 세균 군집으로 포함하나 해면 종에 따라 서로 다른 공생세균 군집을 나타내어 숙주 특이적 분포를 보이는 것으로 나타났다. 이는 해면 종에 따라 해면에 서식하는 공생세균의 군집 구조가서로 다르다는 보고(7, 8)와 일치하는 결과로써 해면 종에 따른 해양 환경에서의 생태적 기능에 따른 결과로 생각된다.
Cinachyrella sp.의 주요 공생세균 그룹은 uncultured Gammaproteobacteria로 나타났으며 기존의 서열과 93%에서 100%의 상동성을 보였다. DGGE band C-1, C-4와 C-6는 uncultured Gammaproteobacteria (EU571964, GU317736, EU050785)와 93% 이상의 상동성을 나타내었으며, C-2, C-5와 C-8은 uncultured Alphaproteobacteria (EF105800, GU992436) 와 95%에서 100%의 상동성을 나타내었고, C-3과 C-7은 uncultured Actinobacteria (EU670873, GU227571)과 94%와 100%의 상동성을 각각 나타내었다(Table 1).
DGGE band의 패턴은 다양하였으며, band로부터 밝혀진 모든 서열들은 배양 되지 않은 세균 클론(uncultured bacterial clone)들과 높은 상동성을 나타내었다. 일반적으로 자연계의 미생물 중 실제 배양 가능한 종은 전체 자연계 미생물 군집의 1% 이하인 것으로 알려져 있는 바(15)와 같이 본 연구에서 조사된 해면에 존재하는 세균 군집 역시 배양되지 않는 세균 군집이 높은 비율로 존재함을 알 수 있었다.
의 해면 공생세균의 계통학적 다양성을 알아보기 위하여 비 배양 지문법인 16S rDNA의 PCR-DGGE를 수행하였다. 해면 시료로부터 추출한 gDNA를 주형으로 16S rRNA gene의 V3 영역을 증폭한 결과, 194 bp의 예상된 크기의 PCR 산물을 얻었다. 동일 지역에서 같은 시기에 채집한 해면 S.
후속연구
16S rRNA PCR-DGGE 방법은 비교적 신속하게 해면 공생 세균의 군집구조를 분석하기 위한 효과적인 방법이나 DNA 추출방법에 따라 우점 그룹이 달라진다는 연구결과도 제시되어 있어(4) 연구 방법에 따른 차이를 고려하면서 해양의 환경적 요인과 지리적 요인 등과 연계하여 해면 공생세균 다양성에 관한 더 많은 연구가 더 수행되어야 할 것으로 사료된다.
이는 해면 종에 따라 해면에 서식하는 공생세균의 군집 구조가서로 다르다는 보고(7, 8)와 일치하는 결과로써 해면 종에 따른 해양 환경에서의 생태적 기능에 따른 결과로 생각된다. 나아가 본 연구에 사용한 두 종의 해면에 대하여 공생세균 군집 구조를 보다 면밀하게 분석하기 위하여는 다양한 지역으로부터 동일한 해면 종을 채취하여 분석할 필요가 있을 것으로 사료된다.
해면 공생세균의 다양성에 관한 연구는 주로 열대와 지중해에 분포하는 해면을 중심으로 이루어져 왔으나(3, 21, 22), 최근, 중국 남지나해에 분포하는 해면에 관한 연구도 활발히 수행되고 있다(8, 9, 26). 또한 남극에 서식하는 해면에 관한 보고(11)도 이루어지고 있으나 우리나라 해역을 포함하여 보다 광범위한 지역의 다양한 해면에 관하여 연구가 수행되어야 할 것으로 사료된다. 특히 우리나라의 해양에 서식하는 해면에 관한 공생 세균의 군집구조에 관한 보고는 매우 적기 때문에 이에 관하여 많은 연구가 필요한 실정이다.
질의응답
핵심어
질문
논문에서 추출한 답변
해면이란 무엇인가?
해면은 해양에서 열대, 온대, 극지에 이르기까지 범지구적인 넓은 분포를 나타내는 여과 섭식동물로써 해면 생체량의 40% 이상에 달하는 세균을 함유하며, 해면에 서식하는 공생미생물은 해면의 표면, 혹은 해면 세포내, 혹은 mesohyl에 서식하며 일시적이거나 영구적인 공생관계를 유지하는 것으로 알려져 있다(15). 세균은 여과 섭식자인 해면동물의 먹이원이기도 하지만, 해면의 면역 반응에 중요한 역할을 하기도 한다.
본 연구에서 해양 해면 Spirastrella abata와 Cinachyrella sp.의 공생 세균의 주요 군집구조를 16SrDNA-DGGE 방법을 이용하여 비교 분석한 결과는 무엇인가?
의 공생 세균의 주요 군집구조를 16SrDNA-denaturing gradient gel electrophoresis (DGGE) 방법을 이용하여 비교 분석하였다. S. abata와 Cinachyrella sp.는 각각 7개와 8개의 DGGE 밴드를 나타내었으며 이들을 적출하여 염기서열을 분석한 결과, NCBI에 등록된 서열들과 92-100%의 유사도를 나타내었다. S. abata의 주요 공생세균은 Alphaproteobacteria와 Deltaproteobacteria에 속하였으며, Cinachyrella sp.의 경우 Alphaproteobacteria, Gammaproteobacteria와 Actinobacteria에 속하는 세균으로 구성되었다. 두 종의 해면에서 공통되는 공생세균 그룹은 Alphaproteobacteria였으며 이 세균 그룹은 두 종의 해면 모두에서 우점하였다. Deltaproteobacteria는 S. abata에서, Actinobacteria와 Gammaproteobacteria는 Cinachyrella sp.에서만 관찰되었다. 동일지역에서 채집한 서로 다른 두 종의 해면은 각각 다른 공생세균 군집구조를 나타내었다.
해면 공생세균에 관한 다양성 및 군집구조에 관한 연구는 주로 어떤 방법에 의해 이루어지는가?
해면 공생세균에 관한 다양성 및 군집구조에 관한 연구는 FISH (fluorescence in situ hybrydization), ARDRA (amplified rDNA restriction analysis), T-RFLP (terminal-restriction fragment length polymorphism), PCR-DGGE (polymerase chain reactiondenaturing gradient gel electrophoresis) 등을 포함하는 분자적 방법에 의해(4, 5) 활발히 이루어지고 있으며, 해면 미생물 군집과 다양성 연구에 PCR-DGGE와 PCR-RFLP 방법은 비교적 간편하며 효과적인 연구 방법으로 알려져 있다. 분자적 방법을 사용한 해면 미생물 군집의 다양성에 관한 연구는 해면 공생 세균의 산업적 응용과 해면 공생 세균의 특성 및 생태적 기능의 연구에 있어 매우 중요하다(13, 16).
참고문헌 (26)
Anderson, S.A., P.T. Northcote, and M.J. Page. 2010. Spatial and temporal variability of the bacterial community in different chemotypes of the New Zealand marine sponge Mycale hentscheli. FEMS Microb. Ecol. 72, 328-342.
Cho, H.H. and J.S. Park. 2009. Comparative analysis of the community of culturable bacteria associated with sponges, Spirastrella abata and Spirastrella panis by 16S rDNA-RFLP. Kor. J. Microbiol. 45, 155-162.
Friedrich, A.B., J. Hacker, I. Fischer, P. Proksch, and U. Hentschel. 2001. Temporal variations of the microbial community associated with the Mediterranean sponge Aplysina aerophoba. FEMS Microbiol. Ecol. 38, 105-113.
Hardoim, C.C., R. Costa, F.V. Araujo, E. Hajdu, R. Peixoto, U. Lins, A.S. Rosado, and J.D. van Elsas. 2009. Diversity of bacteria in the marine sponge Aplysina fulva in Brazilian coastal waters. Appl. Environ. Microbiol. 75, 3331-3343.
Isaacs, L.T., J. Kan, L. Nguyen, P. Videau, M.A. Anderson, T.L. Wright, and R.T. Hill. 2009. Comparison of the bacterial communities of wild and captive sponge Clathria prolifera from the Chesapeake Bay. Mar. Biotechnol. (NY) 11, 758-770.
Lafi, F.F., M.J. Garson, and J.A. Fuerst. 2005. Culturable bacterial symbionts isolated from two distinct sponge species (Pseudoceratina clavata and Rhabdastrella globostellata) from the Great Barrier Reef display similar phylogenetic diversity. Microb. Ecol. 50, 213-220.
Lee, O.O., Y.H. Wong, and P.Y. Qian. 2009. Inter- and intraspecific variations of bacterial communities associated with marine sponges from San Juan Island, Washington. Appl. Environ. Microbiol. 75, 3513-3521.
Li, Z., L. He, and X. Miao. 2007. Cultivable bacterial community from South China Sea sponge as revealed by DGGE fingerprinting and 16S rDNA phylogenetic analysis. Curr. Microbiol. 55, 465-472.
Li, Z.Y., L.M. He, J. Wu, and Q. Jiang. 2006. Bacterial community diversity associated with four marine sponges from the South China Sea based on 16S rDNA-DGGE fingerprinting. J. Exp. Mar. Biol. Ecol. 329, 75-85.
Li, Z.Y. and Y. Liu. 2006. Marine sponge Craniella austrialiensisassociated bacterial diversity revelation based on 16S rDNA library and biologically active actinomycetes screening, phylogenetic analysis. Lett. Appl. Microbiol. 43, 410-416.
Mangano, S., L. Michaud, C. Caruso, M. Brilli, V. Bruni, R. Fani, and A.L. Giudice. 2009. Antagonistic interactions between psychrotrophic cultivable bacteria isolated from Antarctic sponges: A preliminary analysis. Res. Microbiol. 160, 27-37.
Mohamed, N., J.J. Enticknap, J.E. Lohr, S.M. McIntosh, and R.T. Hill 2008. Changes in bacterial communities of the marine sponge Mycale laxissima on transfer into aquaculture. Appl. Environ. Microbiol. 74, 1209-1222.
Mohamed, N.M., V. Rao, M.T. Hamann, M. Kelly, and R.T. Hill. 2008. Monitoring bacterial diversity of the marine sponge Ircinia strobilina upon transfer into aquaculture. Appl. Environ. Microbiol. 74, 4133-4143.
Muscholl-Silberhorn, A., V. Thiel, and J.F. Imhoff. 2008. Abundance and bioactivity of cultured sponge-associated bacteria from the Mediterranean Sea. Microb. Ecol. 55, 94-106.
Park, J.S., J.J. Sim, and K.D. An. 2009. Community structure of bacteria associated with two marine sponges from Juju Island based on 16S rDNA-DGGE profile. Kor. J. Microbiol. 45, 170-176.
Radwan, M., A. Hanora, J. Zan, N.M. Mohamed, D.M. Abo-Elmatty, S.H. Abou-El-Ela, and R.T. Hill. 2010. Bacterial community analyses of two Red Sea sponges. Mar. Biotechnol. 12, 350-360.
Ramm, W., W. Schatton, I. Wagner-Dobler, V. Wray, M. Nimtz, H. Tokuda, F. Enjyo, H. Nishino, W. Beil, R. Heckmann, V. Lurtz, and S. Lang. 2004. Diglucosyl-glycerolipids from the marine sponge-associated Bacillus pumilus strain AAS3: Their production, enzymatic modification and properties. Appl. Microbiol. Biotechnol. 64, 497-504.
Selvin, J. 2009. Exploring the antagonistic producer Streptomyces MSI051: Implications of polyketide synthase gene type II and a ubiquitous defense enzyme phospholipase A2 in the host sponge Dendrilla nigra. Curr. Microbiol. 58, 459-463.
Sipkema, D. and H.W. Blanch. 2009. Spatial distribution of bacteria associated with the marine sponge Tethya californiana. Mar. Biol. 157, 627-638.
Taylor, M.W., P.J. Schupp, R. de Nys, S. Kjelleberg, and P.D. Steinberg. 2005. Biogeography of bacteria associated with the marine sponge Cymbastela concentrica. Environ. Microbiol. 7, 419-433.
Thiel, V., S. Leininger, R. Schmaljohann, F. Brummer, and J.F. Imhoff. 2007. Sponge-specific bacterial associations of the Mediterranean sponge Chondrilla nucula (demospongiae, tetractinomorpha). Microb. Ecol. 54, 101-111.
Thiel, V., S.C. Neulinger, T. Staufenberger, R. Schmaljohann, and J.F. Imhoff. 2007. Spatial distribution of sponge-associated bacteria in the Mediterranean sponge Tethya aurantium. FEMS Microbiol. Ecol. 59, 47-63.
Thoms, C., M. Horn, W. Wagner, U. Hentschel, and P. Proksch. 2003. Monitoring microbial diversity and natural products profiles of the sponge Aplysina cavernicola following trasplantation. Mar. Biol. 142, 685-692.
Weisz, J.B., U. Hentschel, N. Lindquist, and C.S. Martens. 2007. Linking abundance and diversity of sponge-associated microbial communities to metabolic differences in host sponges. Mar. Biotechnol. 152, 475-483.
Wichels, A., S. Wurtz, H. Dopke, C. Schutt, and G. Gerdts. 2006. Bacterial diversity in the Breadcrumb sponge Halichondria panicea (pallas). FEMS Microbiol. Ecol. 56, 102-118.
Zhang, H., W. Zhang, Y. Jin, M. Jin, and X. Yu. 2008. A comparative study on the phylogenetic diversity of culturable actinobacteria isolated from five marine sponge species. Antonie van Leeuwenhoek 93, 241-248.
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