최소 단어 이상 선택하여야 합니다.
최대 10 단어까지만 선택 가능합니다.
다음과 같은 기능을 한번의 로그인으로 사용 할 수 있습니다.
NTIS 바로가기Research in plant disease = 식물병연구, v.23 no.3, 2017년, pp.241 - 248
고형래 (국립농업과학원 작물보호과) , 김은화 (국립농업과학원 작물보호과) , 김세종 (투엠바이오) , 이재국 (국립농업과학원 작물보호과) , 이왕휴 (전북대학교 농생물학과)
The purpose of this study was to develop rapid methods for distinguishing between Heterodera schachtii and H. glycines detected from chinese cabbage fields of highland in Gangwon, Korea. To do this, we performed PCR-RFLP and PCR with the primers set developed in this study for GC147, GC408 and PM001...
* AI 자동 식별 결과로 적합하지 않은 문장이 있을 수 있으니, 이용에 유의하시기 바랍니다.
핵심어 | 질문 | 논문에서 추출한 답변 |
---|---|---|
사탕무씨스트선충은 무엇인가? | 사탕무씨스트선충(H. schachtii)은 겨자과, 명아주과 등 9과 23속 200여종의 식물이 기주로 알려져 있으며(Steele, 1965), 유럽, 중동, 미국 등 많은 나라에서 문제되고 있는 식물기생선충 가운데 하나이다(Sharma, 1998). 반면, 콩씨스트선충(H. | |
형태적 특징을 이용한 종 동정 방법의 문제점은? | Powers (2004)와 Subbotin 등(2010)에 따르면, Heterodera 속을 포함한 식물기생선충의 종 동정에는 주로 체장, 체폭, 구침과 생식기 등 각 형태에 대한 길이, 폭 등의 평균 측정치가 이용되어 왔다. 그러나, 형태적 특징을 이용한 종 동정에는 많은 시간, 노력과 노하우를 필요로 하며, 하나의 포장에 2종 이상의 씨스트선충이 혼합되어 있는 경우 종 동정에 많은 어려움이 발생한다(Powers, 2004). 따라서, 최근에는 신속하고 정확한 종 동정을 위해 제한효소절편길이다형성(Restriction fragment length polymorphism with PCR product, PCR-RFLP), SCAR (Sequence characterised amplified region) 및 다중중합효소연쇄반응(Multiplex PCR) 등과 같은 다양한 기법이 진단에 이용되고 있다. | |
사탕무씨스트선충과 콩씨스트선충의 종 동정이 어려운 이유는? | 이들은 1980년대부터 1990년대까지 미국 최대 콩 생산지인 오하이오주에서 경제적으로 큰 손실을 일으킨 바 있으며(Willson 등, 1996), 일본, 중국과 브라질 등에서도 큰 피해를 일으키고 있다(Sharma, 1998). 그러나 2종 모두 Heterodera 속의 ‘Schachtii’ 그룹(Sensu stricto group)에 속하는 씨스트선충으로 클로버씨스트선충(H. trifolii)과 같은 근연종들 간 형태적 특징이 매우 유사하여 종 동정에 많은 어려움을 겪고 있다(Starr 등, 2002; Subbotin 등, 2010). |
Amiri, S., Subbotin, S. A. and Moens, M. 2002. Identification of the beet cyst nematode Heterodera schachtii by PCR. Eur. J. Plant Pathol. 108: 497-506.
Ayyadevara, S., Thaden, J. J. and Shmookler Reis, R. J. 2000. Discrimination of primer 3'-nucleotide mismatch by taq DNA polymerase during polymerase chain reaction. Anal. Biochem. 284: 11-18.
Choi, Y. E. 2000. Economic Insects of Korea 20: tylenchida, Aphelenchida (Nematoda). Insects of Korea. Suppl. 27. National Institute of Agricultural Science & Technology. 391 pp.
Derycke, S., Remerie, T., Vierstraete, A., Backeljau, T., Vanfleteren, J., Vincx, M. and Moens, T. 2005. Mitochondrial DNA variation and cryptic speciation within the free-living marine nematode Pellioditis marina. Mar. Ecol. Prog. Ser. 300: 91-103.
Derycke, S., Vanaverbeke, J., Rigaux, A., Backeljau, T. and Moens, T. 2010. Exploring the use of cytochrome oxidase c subunit 1 (COI) for DNA barcoding of free-living marine nematodes. PLoS One 5: e13716.
Iwahori, H., Kanzaki, N. and Futai, K. 2000. A simple, polymerase chain reaction-restriction fragment length polymorphism-aided diagnosis method for pine wilt disease. For. Pathol. 30: 157-164.
Kim, S. J., Ko, H. R., Jeon, J. H., Lee, M. A., Park, B. Y. and Lee, J. K. 2015. Molecular characterization and phylogenetic analysis of the cyst nematode Heterodera schachtii isolated from chinese cabbage in Korea. Res. Plant Dis. 21: 407. (Abstract)
Kwok, S., Kellogg, D. E., McKinney, N., Spasic, D., Goda, L., Levenson, C. and Sninsky, J. J. 1990. Effects of primer-template mismatches on the polymerase chain reaction: human immunodeficiency virus type 1 model studies. Nucleic Acids Res. 18: 999-1005.
Maafi, Z. T., Subbotin, S. A. and Moens, M. 2003. Molecular identification of cyst-forming nematodes (Heteroderidae) from Iran and a phylogeny based on ITS-rDNA sequences. Nematology 5: 99-111.
Ministry of Agriculture, Food and Rural Affairs. 2013. Agriculture, Food and Rural Affairs Statistics Yearbook. 387 pp.
Powers, T. 2004. Nematode molecular diagnostics: from bands to barcodes. Annu. Rev. Phytopathol. 42: 367-383.
Prosser, S. W., Velarde-Aguilar, M. G., Leon-Regagnon, V. and Hebert, P. D. 2013. Advancing nematode barcoding: a primer cocktail for the cytochrome c oxidase subunit I gene from vertebrate parasitic nematodes. Mol. Ecol. Resour. 13: 1108-1115.
Sharma, S. B. 1998. The Cyst Nematodes. Kluwer Academic Publishers. 452 pp.
Starr, J. L., Cook, R. and Bridge, J. 2002. Plant resistance to parasitic nematodes. In: Cyst nematodes: Globodera and Heterodera species, eds. by R. Cook and G. R. Noel, pp. 73-74. CABI Publishing.
Subbotin, S. A., Waeyenberge, L. and Moens, M. 2000. Identification of cyst forming nematodes of the genus Heterodera (Nematoda: Heteroderidae) based on the ribosomal DNA-RFLP. Nematology 2: 153-164.
Subbotin, S. A., Peng, D. and Moens, M. 2001. A rapid method for the identification of the soybean cyst nematode Heterodera glycines using duplex PCR. Nematology 3: 365-371.
Subbotin, S. A., Mundo-Ocampo, M. and Baldwin, J. G. 2010. Systematics of Cyst Nematodes (Nematoda: Heteroderinae) 8B. Koninklijke Brill NV, Leiden, The Netherlands. 521 pp.
The Korean Society of Plant Pathology. 2009. List of Plant Diseases in Korea. 5th ed. Suwon, Korea. 853 pp.
Toumi, F., Waeyenberge, L., Viaene, N., Dababat, A., Nicol, J. M., Ogbonnaya, F. and Moens, M. 2013a. Development of a speciesspecific PCR to detect the cereal cyst nematode Heterodera latipons. Nematology 15: 709-717.
Toumi, F., Waeyenberge, L., Viaene, N., Dababat, A., Nicol, J. M., Ogbonnaya, F. and Moens, M. 2013b. Development of two species-specific primer sets to detect the cereal cyst nematodes Heterodera avenae and Heterodera filipjevi. Eur. J. Plant Pathol. 136: 613-624.
Vovlas, N., Vovlas, A., Leonetti, P., Leibanas, G., Castillo, P., Subbotin, S. A. and Rius, J. E. P. 2015. Parasitism effects on white clover by root-knot and cyst nematodes and molecular separation of Heterodera daverti from H. trifolii. Eur. J. Plant Pathol. 143: 833-845.
Willson, H. R., Riedel, R. M., Eisley, J. B., Young, C. E., Jasinski, J. R., Wheeler, T. A., Kauffman, P. H., Pierson, P. E. and Stuart, M. C. 1996. Distribution of Heterodera glycines in Ohio. J. Nematol. 28: 599-603.
※ AI-Helper는 부적절한 답변을 할 수 있습니다.