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이노폴리스 대학교 야로슬라프 홀로도프 교수가 연산을 병행해서 수행할 수 있는, 단백질 상호작용 시뮬레이션의 초고속 알고리즘을 개발했다. 이 알고리즘을 사용하면 고비용이 드는 실험실 연구를 하지 않고 100% 시뮬레이션을 사용하여, HIV, 암 및 모든 종류의 질병 치료 신약을 수백 배나 빨리 개발할 수 있다. 또한 상호 독립적인 사양들을 순차적으로 모니터링하는 것만이 가능한 기존 프로그램과는 달리, 이 알고리즘을 사용하면 시뮬레이션을 병행할 수 있다. 따라서 현재까지 대형 슈퍼 컴퓨터를 사용해도 수 일이 걸리던 연구를 새로운 알고리즘을 사용하면 15분에 수행할 수 있다. 또한, 새로운 알고리즘을 사용하면 병렬 연산을 통해 다양한 단백질들의 상호작용의 추가적인 상호연관된 기능들을 발견할 수 있다.
새로운 알고리즘은 상호작용 분자들의 검색 영역을 수십배 확장시켜 주며 여러 옵션들을 정렬하는 과정을 훨씬 더 빨리 수행할 수 있게 해 주고 예측의 정확성을 향상시켜 준다. 이 알고리즘의 개발로 암을 비롯한 여러 중증 질환의 치료제 개발이 훨씬 더 앞당겨질 것으로 기대되고 있다.
관련연구자 | Yaroslav Kholodov |
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관련기관 | 이노폴리스 대학교 |
과학기술분류 | 정보/통신 |
본문키워드(한글) | 단백질 상호작용, 시뮬레이션, 알고리즘, 병렬 연산 |
본문키워드(영문) | Protein interaction, simulation, algorithm, parallel computing |
원문언어 | 러시아어 |
국가 | 러시아 |
원문출판일 | 2016-08-09 |
출처 | http://riaami.ru/read/novyj-algoritm-modelirovaniya-pozvolit-izobresti-lekarstvo-v-sotni-raz-bystree |
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